Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,442,757 |
C→T |
D561D (GAC→GAT) |
ydbH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,442,757 | 0 | C | T | 100.0%
| 1073.3
/ NA
| 278 | D561D (GAC→GAT) | ydbH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (162/116); total (162/116) |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT > NC_000913/1442667‑1442846
|
gTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGt > 1:1173698/1‑93 (MQ=255)
gTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGt < 1:1804217/93‑1 (MQ=255)
gTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGCTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATggg > 1:673402/1‑92 (MQ=255)
tCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTa > 1:1856943/1‑93 (MQ=255)
tCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTa > 2:393509/1‑93 (MQ=255)
tCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGCAAATGGTCGCTGGGATGGTa > 1:5739723/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt > 1:5997838/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt > 2:2048848/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt > 2:4934300/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt > 1:2567029/1‑93 (MQ=255)
aTGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTc < 1:2866095/93‑1 (MQ=255)
aTGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTc > 2:2266626/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCg > 2:867291/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCg > 1:3011478/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCg < 1:4154722/93‑1 (MQ=255)
gggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGt < 1:243588/93‑1 (MQ=255)
gggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGt < 2:261214/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTTGCTGGGATGGTATTCGTc < 2:2448604/93‑1 (MQ=255)
gcgcGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCt < 2:4513140/93‑1 (MQ=255)
gcgcGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCt < 2:6166991/93‑1 (MQ=255)
cgcgATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTg < 2:1576685/93‑1 (MQ=255)
gATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc > 2:4712178/1‑93 (MQ=255)
gATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc < 1:5435539/93‑1 (MQ=255)
gATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc > 2:138931/1‑93 (MQ=255)
caTCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc < 2:4408040/92‑1 (MQ=255)
tCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCgg > 2:2876856/1‑93 (MQ=255)
tacctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTaa > 1:2936833/1‑93 (MQ=255)
acctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAc > 1:1988911/1‑93 (MQ=255)
acctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAc > 2:3049622/1‑93 (MQ=255)
cctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACg > 2:5698234/1‑93 (MQ=255)
cctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACg > 1:2246275/1‑93 (MQ=255)
taTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGcc > 2:4604958/1‑93 (MQ=255)
taTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGcc > 1:3687039/1‑93 (MQ=255)
taTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGcc < 2:889953/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCt > 1:4803871/1‑93 (MQ=255)
tttCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtg < 2:5006633/93‑1 (MQ=255)
ttCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtgg > 1:3149169/1‑93 (MQ=255)
tCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtggt > 2:941365/1‑93 (MQ=255)
ccTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtggtg < 1:1341510/93‑1 (MQ=255)
ccTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtggtg < 1:39578/93‑1 (MQ=255)
tctTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGc < 2:3496448/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTa > 2:4313334/1‑93 (MQ=255)
aaGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAAc > 1:4293097/1‑93 (MQ=255)
aGGCTATTTACATGCTGGTGAGATTGCCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGTGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACa < 2:1225009/93‑1 (MQ=255)
aGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACa > 2:5815101/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACaa > 1:3855398/1‑93 (MQ=255)
gATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCa > 2:3722216/1‑93 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc < 2:4238211/93‑1 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc < 1:6468111/93‑1 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc > 2:3139615/1‑93 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc > 2:5592798/1‑93 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGGAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc > 1:6372707/1‑93 (MQ=255)
tttACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACt < 2:5061050/93‑1 (MQ=255)
tACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGa > 1:1002644/1‑93 (MQ=255)
tACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGa > 1:5860121/1‑93 (MQ=255)
tACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGGAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGa > 2:1947567/1‑93 (MQ=255)
aCATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAc > 2:5894759/1‑93 (MQ=255)
cATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAcc < 1:3354396/93‑1 (MQ=255)
cATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAcc < 2:2924896/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCg > 2:6088456/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCg < 2:2320955/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTa < 2:2836868/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTa < 2:3804026/93‑1 (MQ=255)
tGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTAtt < 2:5961237/93‑1 (MQ=255)
tGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTAtt < 2:511722/93‑1 (MQ=255)
ggTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTc < 2:4495813/93‑1 (MQ=255)
gTGAGATTGGCCCGGTGCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTcc < 1:4035567/93‑1 (MQ=255)
agaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGc > 1:3930549/1‑93 (MQ=255)
agaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGc > 2:4866051/1‑93 (MQ=255)
gaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGcc > 1:812858/1‑93 (MQ=255)
gaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGCATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGcc > 2:1295935/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGc < 2:1774488/93‑1 (MQ=255)
ggCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTg > 1:6142678/1‑93 (MQ=255)
ggCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTg > 1:6390956/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTgg < 2:3688128/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTgg < 1:4909003/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGTATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTg < 1:6037958/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGc > 2:365608/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCa > 1:5142006/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCa > 1:2792766/1‑93 (MQ=255)
ttCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCAc > 1:5238169/1‑93 (MQ=255)
cGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCAccc < 1:855797/93‑1 (MQ=255)
gggTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCg > 2:3228842/1‑93 (MQ=255)
ggTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGa > 2:1261715/1‑93 (MQ=255)
gTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAc > 2:2287309/1‑93 (MQ=255)
gTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAc > 1:3003311/1‑93 (MQ=255)
gTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAc < 2:5194726/93‑1 (MQ=255)
gTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAc < 2:1029053/93‑1 (MQ=255)
gTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCGGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAc < 2:5504108/93‑1 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTTGGATGGTATTCATCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACt < 1:5478208/93‑1 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACt < 1:5328971/93‑1 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAACCGCTGGTGCCACCCGACt < 1:6302806/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGaa > 1:4618561/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGaa > 1:4439248/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGAt < 2:2763852/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGa < 1:1599913/93‑1 (MQ=255)
cTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGaa < 1:2385457/93‑1 (MQ=255)
tGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAAc > 1:3082520/1‑93 (MQ=255)
tGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAAc > 2:3428260/1‑93 (MQ=255)
ggATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACtt < 1:6249419/93‑1 (MQ=255)
|
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT > NC_000913/1442667‑1442846
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACGC > NC_000913/1442664‑1442850
|
TAGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGAT > SRR4302534.630583/1‑94 (MQ=60)
TAGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGAT < SRR4302534.3053455/94‑1 (MQ=60)
TAGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGAG > SRR4302534.3308850/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATG > SRR4302534.1199374/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATG < SRR4302534.2660394/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATG > SRR4302534.2542714/1‑94 (MQ=60)
GCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGG < SRR4302534.4606483/94‑1 (MQ=60)
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGT > SRR4302534.5784598/1‑94 (MQ=60)
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGT > SRR4302534.1204551/1‑94 (MQ=60)
GTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTA < SRR4302534.1851067/94‑1 (MQ=60)
GTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTA > SRR4302534.1905270/1‑94 (MQ=60)
GTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGCAAATGGTCGCTGGGATGGTA > SRR4302534.5895285/1‑94 (MQ=60)
TCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAT < SRR4302534.4287593/94‑1 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302534.2635043/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302534.6160781/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT < SRR4302534.6526086/94‑1 (MQ=60)
GATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTC < SRR4302534.2604846/94‑1 (MQ=60)
GATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTC > SRR4302534.673349/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCG > SRR4302534.3090285/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCG < SRR4302534.2941371/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGT < SRR4302534.4266893/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTC < SRR4302534.249959/94‑1 (MQ=60)
CGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGC > SRR4302534.6633470/1‑94 (MQ=60)
CGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGC < SRR4302534.2533134/94‑1 (MQ=60)
CGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGC > SRR4302534.768903/1‑94 (MQ=60)
GATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCG > SRR4302534.2072148/1‑94 (MQ=60)
GATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCG < SRR4302534.6629710/94‑1 (MQ=60)
GATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCG < SRR4302534.5581907/94‑1 (MQ=60)
ATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGG > SRR4302534.6230336/1‑94 (MQ=60)
ATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGG > SRR4302534.3086658/1‑94 (MQ=60)
CCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAGTGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTA < SRR4302534.6132411/94‑1 (MQ=60)
CCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTA > SRR4302534.6320344/1‑94 (MQ=60)
CTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAA > SRR4302534.3013910/1‑94 (MQ=60)
CTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAA > SRR4302534.6452446/1‑94 (MQ=60)
CTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAA > SRR4302534.4600436/1‑94 (MQ=60)
CTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAA < SRR4302534.530115/94‑1 (MQ=60)
TACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAC < SRR4302534.699542/94‑1 (MQ=60)
TACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAC > SRR4302534.2040992/1‑94 (MQ=60)
ACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACG > SRR4302534.3137184/1‑94 (MQ=60)
ACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACG > SRR4302534.2305812/1‑94 (MQ=60)
ACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACG < SRR4302534.6561327/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCC > SRR4302534.3786178/1‑94 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCC > SRR4302534.4934441/1‑94 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCC > SRR4302534.662964/1‑94 (MQ=60)
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TATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCT < SRR4302534.2097436/94‑1 (MQ=60)
TATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCT < SRR4302534.3290169/94‑1 (MQ=60)
TATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCT > SRR4302534.4934305/1‑94 (MQ=60)
TATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCT > SRR4302534.2991794/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTG < SRR4302534.4103887/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGG > SRR4302534.3232023/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGT > SRR4302534.4456569/1‑94 (MQ=60)
TCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTG < SRR4302534.4430642/94‑1 (MQ=60)
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CCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGG < SRR4302534.1376876/94‑1 (MQ=60)
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CCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGG < SRR4302534.40638/94‑1 (MQ=60)
CTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGC > SRR4302534.5149055/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGC > SRR4302534.2900865/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCC > SRR4302534.2012601/1‑94 (MQ=60)
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CTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCT > SRR4302534.1423574/1‑94 (MQ=60)
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TTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTA < SRR4302534.3978401/94‑1 (MQ=60)
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TTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAA > SRR4302534.2487615/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAA < SRR4302534.3021536/94‑1 (MQ=60)
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GCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGTGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATC < SRR4302534.3965418/94‑1 (MQ=60)
CGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGGAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCA > SRR4302534.5904870/1‑94 (MQ=60)
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GATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGGAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAC > SRR4302534.6544772/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACT < SRR4302534.6642336/94‑1 (MQ=60)
ATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACT < SRR4302534.3075417/94‑1 (MQ=60)
attcCATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTG < SRR4302534.3544481/90‑1 (MQ=60)
TTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGA > SRR4302534.6019231/1‑94 (MQ=60)
TTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGA > SRR4302534.1028354/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCG > SRR4302534.4909268/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCG < SRR4302534.3444227/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGT < SRR4302534.5531412/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCC < SRR4302534.3372957/94‑1 (MQ=60)
GTGAGATTGGCCCGGTGCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCA < SRR4302534.4143756/94‑1 (MQ=60)
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TGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAG > SRR4302534.4171654/1‑94 (MQ=60)
GAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGC > SRR4302534.4035836/1‑94 (MQ=60)
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GCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGT < SRR4302534.1602166/94‑1 (MQ=60)
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GGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCA > SRR4302534.5280770/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCA > SRR4302534.2866219/1‑94 (MQ=60)
GTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCAC > SRR4302534.5379601/1‑94 (MQ=60)
TTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACC > SRR4302534.5611198/1‑94 (MQ=60)
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CGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCG > SRR4302534.6216893/1‑94 (MQ=60)
CGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCG < SRR4302534.877396/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCG > SRR4302534.2832815/1‑94 (MQ=60)
GGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAC < SRR4302534.133587/94‑1 (MQ=60)
GGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAC > SRR4302534.3081871/1‑94 (MQ=60)
GTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACT > SRR4302534.6436433/1‑94 (MQ=60)
TAAATGGTCGCTTGGATGGTATTCATCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTG < SRR4302534.5625925/94‑1 (MQ=60)
TAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTG < SRR4302534.1900821/94‑1 (MQ=60)
TAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTG < SRR4302534.5472696/94‑1 (MQ=60)
TAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAACCGCTGGTGCCACCCGACTG < SRR4302534.6473254/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG < SRR4302534.963288/94‑1 (MQ=60)
AATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGA > SRR4302534.2407460/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAA > SRR4302534.5224737/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAA > SRR4302534.4743883/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAA > SRR4302534.4559165/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAA < SRR4302534.4090678/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAG > SRR4302534.3549066/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATG < SRR4302534.6365068/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGA < SRR4302534.3209953/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAA < SRR4302534.1641709/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAA < SRR4302534.4037011/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAAC < SRR4302534.2448840/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAAC > SRR4302534.3163511/1‑94 (MQ=60)
TGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGGATTCCAGCCGCTGGTGGCACCCGACTGGAAGGTGAACT > SRR4302534.2475136/1‑94 (MQ=60)
GGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT > SRR4302534.2017465/1‑94 (MQ=60)
GGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT < SRR4302534.4213315/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTA < SRR4302534.6418888/94‑1 (MQ=60)
GATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTAC < SRR4302534.6533212/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACG > SRR4302534.3013141/1‑94 (MQ=60)
TGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACGC < SRR4302534.1214227/94‑1 (MQ=60)
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TAGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACGC > NC_000913/1442664‑1442850
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
