Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,442,757 |
C→T |
D561D (GAC→GAT) |
ydbH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,442,757 | 0 | C | T | 100.0%
| 964.6
/ NA
| 274 | D561D (GAC→GAT) | ydbH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (149/125); total (149/125) |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT > NC_000913/1442667‑1442846
|
cGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATgg < 1:2865265/93‑1 (MQ=255)
gTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGt > 2:910445/1‑93 (MQ=255)
gTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGt > 1:4342214/1‑93 (MQ=255)
tCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGCGATTAGCCCGGTTCGGGCAAATGGTCGCTGGGATGGtt > 1:8471969/1‑92 (MQ=255)
gcGAGGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGAGAGATTGGGCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTa < 2:2104606/92‑1 (MQ=255)
cGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAt < 2:4074258/93‑1 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt < 2:1505257/93‑1 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt < 1:7323575/93‑1 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt > 1:1476378/1‑93 (MQ=255)
gATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAtt > 1:8222147/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCg > 1:514374/1‑93 (MQ=255)
gggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGt > 2:3375784/1‑93 (MQ=255)
ggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTc < 1:3270751/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTc < 2:3991613/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTc < 2:4571077/93‑1 (MQ=255)
gcgcGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCt < 1:8480907/93‑1 (MQ=255)
gcgATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgc < 2:7338193/93‑1 (MQ=255)
gcgATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgc < 2:5570626/93‑1 (MQ=255)
gcgATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgc < 1:5516483/93‑1 (MQ=255)
gATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc > 1:1103381/1‑93 (MQ=255)
gATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc < 2:609830/93‑1 (MQ=255)
caTCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTgcgc < 2:4218473/92‑1 (MQ=255)
ctacctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTa > 2:1940147/1‑93 (MQ=255)
tacctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTaa > 2:8316178/1‑93 (MQ=255)
tacctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTaa < 2:5392633/93‑1 (MQ=255)
acctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAc < 2:6788666/93‑1 (MQ=255)
acctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAc < 1:699877/93‑1 (MQ=255)
ctaTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGCATTCGTCTGCGCGGTAACGc > 1:8568773/1‑93 (MQ=255)
taTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGTGCGGTAACGcc > 1:8307863/1‑93 (MQ=255)
taTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGcc > 2:3574149/1‑93 (MQ=255)
taTTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGcc < 1:2722442/93‑1 (MQ=255)
tttCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtg < 2:4639492/93‑1 (MQ=255)
ttCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtgg < 2:5493604/93‑1 (MQ=255)
ccTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCACGGTTCTGGTAAATGGTCGATGGGATGGTATTAGTGTGCGAGGGAACGCgtggtg > 1:6313148/1‑93 (MQ=255)
ctctTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtggtgg < 2:1368150/93‑1 (MQ=255)
ctctTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGGATTCGTCTGCGCGGTAACGCCtggtgc > 1:7629491/1‑92 (MQ=255)
tctTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGc > 1:6449249/1‑93 (MQ=255)
tctTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGc > 2:1892743/1‑93 (MQ=255)
tctTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGc > 1:4220101/1‑93 (MQ=255)
tttAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCt > 2:3463507/1‑93 (MQ=255)
ttcaaaGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCt < 1:1689947/90‑1 (MQ=255)
ttAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTa > 1:8751398/1‑93 (MQ=255)
ttAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTa > 2:2733555/1‑93 (MQ=255)
ttAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTa > 2:6895637/1‑93 (MQ=255)
tAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTaa > 1:890999/1‑93 (MQ=255)
tAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTaa < 2:6647829/93‑1 (MQ=255)
aaGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAAc < 2:1285625/93‑1 (MQ=255)
aaGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAAc < 2:445298/93‑1 (MQ=255)
aaGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAAc > 2:8100754/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACaa > 2:2238107/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACaa > 1:2313327/1‑93 (MQ=255)
gCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAAt < 1:6891646/93‑1 (MQ=255)
gATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCa > 1:536520/1‑93 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc < 1:1276391/93‑1 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc > 1:2968594/1‑93 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc > 1:2129864/1‑93 (MQ=255)
aTTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAc < 2:287643/93‑1 (MQ=255)
tttACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAAtacct > 1:6790011/1‑89 (MQ=255)
tttACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACt > 1:195159/1‑93 (MQ=255)
tttACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACt > 2:3761951/1‑93 (MQ=255)
tACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGa < 1:8130274/93‑1 (MQ=255)
tACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGa < 2:5018529/93‑1 (MQ=255)
tACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGa > 1:4715229/1‑93 (MQ=255)
aCATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAc > 2:5678661/1‑93 (MQ=255)
cATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAcc < 2:5581461/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTAt < 1:3066604/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTAt < 1:8510531/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTAt > 2:438395/1‑93 (MQ=255)
tGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTAtt < 2:5272886/93‑1 (MQ=255)
ggTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTc > 2:8484101/1‑93 (MQ=255)
ggTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTc > 1:162849/1‑93 (MQ=255)
gTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTcc > 1:3711772/1‑93 (MQ=255)
agaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGc < 1:620578/93‑1 (MQ=255)
agaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGc > 2:6285104/1‑93 (MQ=255)
agaTTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGAATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGc > 1:2509095/1‑93 (MQ=255)
tgggCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGc < 1:5434180/91‑1 (MQ=255)
ggCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTg > 2:3132167/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTgg < 2:3320444/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGc < 2:2779596/93‑1 (MQ=255)
ggTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGcc > 1:3920436/1‑93 (MQ=255)
cGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCAccc > 1:6966606/1‑93 (MQ=255)
ggTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGa > 2:486895/1‑93 (MQ=255)
ggTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGa > 1:5799153/1‑93 (MQ=255)
gTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAc < 1:4904526/93‑1 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCGGCCGCTGGTGCCACCCGACt > 1:7456277/1‑93 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACt < 1:1165123/93‑1 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACt > 1:8011430/1‑93 (MQ=255)
tAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCGGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGATCGTATCCCAGCCGCTGGAGGCACACGAcg > 2:7423292/1‑92 (MQ=255)
aaaTGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTg < 1:4107/93‑1 (MQ=255)
aaaTGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTg < 1:3347518/93‑1 (MQ=255)
aaTGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTgg < 2:5046908/93‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGa < 1:6093015/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGAt > 2:7950013/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATg < 2:8552614/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGa > 1:5778852/1‑93 (MQ=255)
cTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGaa > 2:5940103/1‑93 (MQ=255)
cTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGaa < 2:7612829/93‑1 (MQ=255)
tGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAAc < 2:1784174/93‑1 (MQ=255)
ggATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACtt > 2:2615678/1‑93 (MQ=255)
ggATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACtt < 2:861/93‑1 (MQ=255)
|
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT > NC_000913/1442667‑1442846
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACG > NC_000913/1442665‑1442849
|
AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATG < SRR4302541.1194741/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATG > SRR4302541.6415076/1‑94 (MQ=60)
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGT < SRR4302541.2894056/94‑1 (MQ=60)
CGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGT > SRR4302541.4385567/1‑94 (MQ=60)
GTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTA > SRR4302541.8563459/1‑94 (MQ=60)
TCGATGGGCGCTATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTAT > SRR4302541.4854483/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302541.3739962/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302541.8252992/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302541.5463722/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302541.1490865/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302541.8311815/1‑94 (MQ=60)
CGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATT > SRR4302541.5463723/1‑94 (MQ=60)
GATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTC < SRR4302541.7401782/94‑1 (MQ=60)
GATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTC > SRR4302541.7056246/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCG > SRR4302541.519186/1‑94 (MQ=60)
ATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATCCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCG > SRR4302541.519185/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGT > SRR4302541.5837840/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGT < SRR4302541.2512306/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGGTTTACATGCTGGTGAGAGTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTGGCTGGGATGGTATTCGTCT > SRR4302541.5142135/1‑94 (MQ=60)
GGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCT < SRR4302541.8787247/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCT < SRR4302541.8170516/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCT < SRR4302541.8626149/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCT < SRR4302541.3303745/94‑1 (MQ=60)
GCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTG > SRR4302541.8900982/1‑94 (MQ=60)
GCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTG < SRR4302541.8572325/94‑1 (MQ=60)
GCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTG < SRR4302541.2420177/94‑1 (MQ=60)
GCGCGATCCTACCTATTGCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTG < SRR4302541.1200033/94‑1 (MQ=60)
GCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCG < SRR4302541.5572953/94‑1 (MQ=60)
CCGATCCTACCTATTTTCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCG < SRR4302541.6078678/94‑1 (MQ=60)
CGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGC > SRR4302541.1113719/1‑94 (MQ=60)
CGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGC < SRR4302541.134303/94‑1 (MQ=60)
GATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCG > SRR4302541.8384544/1‑94 (MQ=60)
GATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCG < SRR4302541.4211124/94‑1 (MQ=60)
ATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGG > SRR4302541.2219510/1‑94 (MQ=60)
ATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGG > SRR4302541.2219511/1‑94 (MQ=60)
ATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGG < SRR4302541.6926580/94‑1 (MQ=60)
CCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTA > SRR4302541.3123654/1‑94 (MQ=60)
CTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAA > SRR4302541.1234912/1‑94 (MQ=60)
CTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAA > SRR4302541.7441932/1‑94 (MQ=60)
TACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTACATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTACGCGGTAAG > SRR4302541.2897933/1‑94 (MQ=60)
TACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAAC > SRR4302541.6373225/1‑94 (MQ=60)
TCCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACG < SRR4302541.7040186/94‑1 (MQ=60)
ACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACG > SRR4302541.2943790/1‑94 (MQ=60)
ACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACG < SRR4302541.706458/94‑1 (MQ=60)
CCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGCATTCGTCTGCGCGGTAACGC > SRR4302541.8660812/1‑94 (MQ=60)
CCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTCGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGC < SRR4302541.3360558/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACCTGCTGCTCAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACTCC < SRR4302541.3030540/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGTGCGGTAACGCC > SRR4302541.8398174/1‑94 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCC < SRR4302541.3030539/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCC < SRR4302541.8510922/94‑1 (MQ=60)
CTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCC > SRR4302541.1833837/1‑94 (MQ=60)
TATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCT < SRR4302541.2749630/94‑1 (MQ=60)
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TTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGATGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGT < SRR4302541.5310127/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCTTTAAAGGCGATTCACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGT < SRR4302541.6999421/94‑1 (MQ=60)
TCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTG > SRR4302541.89767/1‑94 (MQ=60)
TCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCACGGTTCTGGTAAATGGTCGATGGGATGGTATTAGTGTGCGAGGGAACGCGTGGTG > SRR4302541.6377697/1‑94 (MQ=57)
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CCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGGATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGC > SRR4302541.7710902/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGC > SRR4302541.6514977/1‑94 (MQ=60)
CTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGC < SRR4302541.3355620/94‑1 (MQ=60)
CTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGC > SRR4302541.4262100/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCT > SRR4302541.6253821/1‑94 (MQ=60)
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TTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTA < SRR4302541.1706543/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTA > SRR4302541.8845013/1‑94 (MQ=60)
TTCAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTA < SRR4302541.1706544/94‑1 (MQ=60)
TTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAA > SRR4302541.899186/1‑94 (MQ=60)
AAAGGCGATTTACATGGTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAAC < SRR4302541.7730147/94‑1 (MQ=60)
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GGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAAT > SRR4302541.5510637/1‑94 (MQ=60)
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CGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCA > SRR4302541.541548/1‑94 (MQ=60)
CGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCA > SRR4302541.1616469/1‑94 (MQ=60)
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GATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAC > SRR4302541.2150457/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAC > SRR4302541.6380713/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCAC > SRR4302541.4436418/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGGGGCCTAAACAATCAC > SRR4302541.7904793/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGGGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATAACT > SRR4302541.7569970/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATacct > SRR4302541.6862618/1‑90 (MQ=60)
ATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACT > SRR4302541.196636/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACT < SRR4302541.1289070/94‑1 (MQ=60)
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TTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGA > SRR4302541.6464632/1‑94 (MQ=60)
TTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGA > SRR4302541.4763296/1‑94 (MQ=60)
TACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAC < SRR4302541.8219272/94‑1 (MQ=60)
TACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAC > SRR4302541.8309828/1‑94 (MQ=60)
TACAAGCTGGGGAGAGTGGCCCGGTTGGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGAC < SRR4302541.4539396/94‑1 (MQ=60)
ACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACC > SRR4302541.5748327/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCG > SRR4302541.5219431/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGT > SRR4302541.1579344/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATT < SRR4302541.3097699/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATT < SRR4302541.8602155/94‑1 (MQ=60)
TGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTC > SRR4302541.1678411/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTC < SRR4302541.266063/94‑1 (MQ=60)
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TGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTC > SRR4302541.5084174/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTC > SRR4302541.5531600/1‑94 (MQ=60)
GGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCC > SRR4302541.3749226/1‑94 (MQ=60)
GTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCA < SRR4302541.3946361/94‑1 (MQ=60)
GGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACCCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAG < SRR4302541.6291059/94‑1 (MQ=60)
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GAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGAATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGC > SRR4302541.2534387/1‑94 (MQ=60)
AGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCC < SRR4302541.626402/94‑1 (MQ=60)
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TGGCCCGGTTCGGTTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTG < SRR4302541.8590621/94‑1 (MQ=60)
TGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTG > SRR4302541.874/1‑94 (MQ=60)
TGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTG < SRR4302541.1805175/94‑1 (MQ=60)
TGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATCGTAGTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAACCAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTG < SRR4302541.5875059/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTG > SRR4302541.2109676/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCC > SRR4302541.3959540/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCA > SRR4302541.1149118/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCA > SRR4302541.432417/1‑94 (MQ=60)
GTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCAC < SRR4302541.954047/94‑1 (MQ=60)
TTCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACC > SRR4302541.7214054/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGTAAATGGTCGCTAGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACC < SRR4302541.6954024/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCC > SRR4302541.7040862/1‑94 (MQ=60)
CGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTACCGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCG < SRR4302541.197646/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGAGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCG < SRR4302541.8571101/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAATGGTCGCTGGGATGGCATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACACTCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCG > SRR4302541.662854/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGA > SRR4302541.279706/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGA > SRR4302541.5858057/1‑94 (MQ=60)
GGTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGAC > SRR4302541.7677824/1‑94 (MQ=60)
GTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCGGCCGCTGGTGCCACCCGACT > SRR4302541.7535905/1‑94 (MQ=60)
GTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACT < SRR4302541.4954564/94‑1 (MQ=60)
GTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACT > SRR4302541.6594806/1‑94 (MQ=60)
GTAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACT > SRR4302541.8099534/1‑94 (MQ=60)
TAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTG > SRR4302541.577145/1‑94 (MQ=60)
TAAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTG < SRR4302541.1176315/94‑1 (MQ=60)
AAATGTGCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG < SRR4302541.7436728/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTCGCTGTGATGTTATTCGTCTGCGCGGTAGCGCCTGGTTGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG < SRR4302541.8531817/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG < SRR4302541.4143/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG < SRR4302541.860180/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG < SRR4302541.3380970/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGG > SRR4302541.3045298/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAA < SRR4302541.8217547/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGA < SRR4302541.3211271/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGAT < SRR4302541.6155208/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGA > SRR4302541.5837612/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGA > SRR4302541.4008326/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAA < SRR4302541.7048665/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTT < SRR4302541.4021990/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTA > SRR4302541.4872196/1‑94 (MQ=60)
GATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTAC < SRR4302541.1217198/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACG < SRR4302541.3566706/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACG < SRR4302541.1624061/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACG < SRR4302541.4187548/94‑1 (MQ=60)
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AGCGTCGATGGGCGCGATCCTACCTATTTCCTCTTTAAAGGCGATTTACATGCTGGTGAGATTGGCCCGGTTCGGGTAAATGGTCGCTGGGACGGTATTCGTCTGCGCGGTAACGCCTGGTGGCCTAAACAATCACTGACCGTATTCCAGCCGCTGGTGCCACCCGACTGGAAGATGAACTTACG > NC_000913/1442665‑1442849
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
