Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,739,051 |
A→G |
M373V (ATG→GTG) |
ydhC → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,739,051 | 0 | A | G | 100.0%
| 785.1
/ NA
| 221 | M373V (ATG→GTG) | ydhC | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (94/127); total (94/127) |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
CTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAATGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATCA > NC_000913/1738961‑1739140
|
cTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTg > 2:1065390/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCTCCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTg < 1:3857706/93‑1 (MQ=255)
tgtgCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGc < 1:2087737/93‑1 (MQ=255)
cgtgCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGc < 1:3043290/92‑1 (MQ=255)
gtgCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTTTAAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCt > 1:3407955/1‑93 (MQ=255)
gtgCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCt < 1:1922131/93‑1 (MQ=255)
gtgCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCt > 2:3914206/1‑93 (MQ=255)
cTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGt < 2:721478/93‑1 (MQ=255)
ttCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGtg > 1:5983586/1‑92 (MQ=255)
ttCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTc > 2:4726331/1‑93 (MQ=255)
ttCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTc > 1:4538402/1‑93 (MQ=255)
tCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTcg < 2:866393/93‑1 (MQ=255)
tCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTcg < 2:3885514/93‑1 (MQ=255)
tCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTcg > 2:6109212/1‑93 (MQ=255)
ccTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTcgc > 2:3999131/1‑93 (MQ=255)
ccTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTcgc > 2:1467477/1‑93 (MQ=255)
cTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTcgcg > 2:5197048/1‑93 (MQ=255)
cAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTgg > 1:6004781/1‑93 (MQ=255)
cAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTgg > 2:3157647/1‑93 (MQ=255)
cAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTgg < 1:5516898/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTggg < 1:4329114/93‑1 (MQ=255)
aaGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTggg > 2:1209573/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGt < 2:1493306/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGt > 2:5352793/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGt < 2:5115787/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGtt > 2:3480474/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGtt < 2:1606885/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGCGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGtt > 1:3283459/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTa > 1:6446210/1‑93 (MQ=255)
tGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACa > 1:174157/1‑93 (MQ=255)
tGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACa > 1:5360354/1‑93 (MQ=255)
ggTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACat > 2:467546/1‑93 (MQ=255)
gTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatg < 2:5587045/93‑1 (MQ=255)
gTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatg < 1:1811802/93‑1 (MQ=255)
tAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatga < 2:2482596/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatgat < 1:5477778/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatgat < 1:1412472/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatgat < 1:3321458/93‑1 (MQ=255)
gTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACatgatg > 1:3886502/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGc < 1:5628639/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGt < 1:3179022/93‑1 (MQ=255)
ggCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGAGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGtt < 2:5889546/93‑1 (MQ=255)
cTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTtgt < 1:3113667/93‑1 (MQ=255)
cTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCCCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTtgt < 2:2212782/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTga < 2:2870327/93‑1 (MQ=255)
tCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTgaag < 2:5156597/93‑1 (MQ=255)
cAGTATCATCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTgaaga > 1:6299564/1‑93 (MQ=255)
cAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTgaaga > 1:2921700/1‑93 (MQ=255)
gTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGaagaag < 2:1798685/93‑1 (MQ=255)
gTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGaagaag < 1:1954822/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGtt < 1:514605/93‑1 (MQ=255)
tCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTg > 2:5769433/1‑93 (MQ=255)
aGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGc > 2:186374/1‑93 (MQ=255)
aGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGc > 1:557403/1‑93 (MQ=255)
aGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGc < 1:4089813/93‑1 (MQ=255)
gCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTTCATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCt < 1:3547553/93‑1 (MQ=255)
gCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCt < 1:4724399/93‑1 (MQ=255)
gCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCt > 2:6392602/1‑93 (MQ=255)
aCGCCATTGCTCACCACCACCAGCGCGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTGGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGc > 2:3934498/1‑93 (MQ=255)
cGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGcc < 2:3629092/93‑1 (MQ=255)
ccATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAg > 2:4348261/1‑93 (MQ=255)
ccATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAg < 2:1838992/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGaa > 1:525409/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTCAACACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGaa < 1:5311762/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCa > 1:6193999/1‑93 (MQ=255)
cTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCAt < 2:3297962/93‑1 (MQ=255)
cTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCAt < 2:5701272/93‑1 (MQ=255)
atCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCAt < 1:6182825/92‑1 (MQ=255)
tCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATg > 1:186698/1‑93 (MQ=255)
caccaccacCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATgg > 1:4504553/1‑93 (MQ=255)
accaccaccAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGc < 1:2375902/93‑1 (MQ=255)
accaccaccAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGc < 2:90093/93‑1 (MQ=255)
ccactacgaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACACGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCa < 2:2083976/93‑1 (MQ=255)
ccaccaccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCa < 1:1034556/93‑1 (MQ=255)
caccaccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCaa > 2:3763321/1‑93 (MQ=255)
accaccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAAt > 2:2586473/1‑93 (MQ=255)
accaccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAAt > 2:4543030/1‑93 (MQ=255)
accaccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAAt < 2:5433635/93‑1 (MQ=255)
caccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGc < 1:4077728/93‑1 (MQ=255)
ccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCg > 1:669278/1‑93 (MQ=255)
ccaGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCg > 1:4294051/1‑93 (MQ=255)
caGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGa < 1:4985863/93‑1 (MQ=255)
gTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTc > 2:795766/1‑93 (MQ=255)
aTGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCt < 2:1241616/93‑1 (MQ=255)
aTGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCt < 1:5949502/93‑1 (MQ=255)
tGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTc > 1:91512/1‑93 (MQ=255)
tGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTc < 1:5653982/93‑1 (MQ=255)
tttATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCa < 2:1341843/92‑1 (MQ=255)
tATCGACAGGAGTGCTGGTCGCGCTGGTTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGTAATGCCGAAGGCGCTCATa < 1:1556484/93‑1 (MQ=255)
tATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATa < 2:300323/93‑1 (MQ=255)
tATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATa < 2:2155129/93‑1 (MQ=255)
tATCAACAGTAGTGCTGCTCGCGCTGGATTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTACCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATa < 1:4174855/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAg < 1:2678520/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAg < 2:5968847/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAg < 1:5700900/93‑1 (MQ=255)
aTCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAg > 1:5879216/1‑93 (MQ=255)
tCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGc > 2:2264054/1‑93 (MQ=255)
aCAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGaa > 2:4995321/1‑93 (MQ=255)
agtagtGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATc > 1:2707524/1‑93 (MQ=255)
agtagtGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATc < 1:1368906/93‑1 (MQ=255)
|
CTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAATGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATCA > NC_000913/1738961‑1739140
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAATGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATCACAC > NC_000913/1738959‑1739143
|
GTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCCCCAGCGTGATGTTATCACCAGTAGT < SRR4302534.6538446/94‑1 (MQ=60)
GTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGT < SRR4302534.4901476/94‑1 (MQ=60)
TCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTG < SRR4302534.1798976/94‑1 (MQ=60)
CTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGC > SRR4302534.2596392/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCTCCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGC < SRR4302534.3961271/94‑1 (MQ=60)
TGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTTTAAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCT > SRR4302534.3499484/1‑94 (MQ=60)
TGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCT < SRR4302534.2142451/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCT < SRR4302534.3123110/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTG < SRR4302534.6124482/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTG < SRR4302534.1972372/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTCCTCGCAAGTATGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTG < SRR4302534.1011209/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGG < SRR4302534.3490419/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTG > SRR4302534.6146121/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTC > SRR4302534.4661407/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCG > SRR4302534.2402556/1‑94 (MQ=60)
CTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGC > SRR4302534.5460020/1‑94 (MQ=60)
TCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCT < SRR4302534.5437629/94‑1 (MQ=60)
CGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTG > SRR4302534.3311984/1‑94 (MQ=60)
CGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTG < SRR4302534.3177460/94‑1 (MQ=60)
GCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGG < SRR4302534.4276771/94‑1 (MQ=60)
GCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGG > SRR4302534.6167906/1‑94 (MQ=60)
CAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGG < SRR4302534.5665756/94‑1 (MQ=60)
CAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGG < SRR4302534.5521235/94‑1 (MQ=60)
CAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGCAGTGCTGGTCGCGCTCGG > SRR4302534.5945624/1‑94 (MQ=60)
AAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGT < SRR4302534.4446201/94‑1 (MQ=60)
AAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGT < SRR4302534.6192724/94‑1 (MQ=60)
AAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGT < SRR4302534.4874880/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTT > SRR4302534.4511741/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTT < SRR4302534.6636680/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTT < SRR4302534.2986794/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTT < SRR4302534.5687731/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGCGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTT > SRR4302534.3370975/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTA > SRR4302534.6619933/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTAC < SRR4302534.5760513/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACA > SRR4302534.178745/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACA > SRR4302534.5504836/1‑94 (MQ=60)
CTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACA > SRR4302534.1959623/1‑94 (MQ=60)
TGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACAT > SRR4302534.1877967/1‑94 (MQ=60)
GTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGA < SRR4302534.1858856/94‑1 (MQ=60)
TAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCCCGCCATTGCTCCCCACCCCCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGAT < SRR4302534.6040717/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATG < SRR4302534.5625480/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATG < SRR4302534.1449626/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATG > SRR4302534.3990833/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATC < SRR4302534.3410277/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCA < SRR4302534.5780967/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAA < SRR4302534.419408/94‑1 (MQ=60)
TCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAAC < SRR4302534.5992878/94‑1 (MQ=60)
TCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAAC < SRR4302534.1350376/94‑1 (MQ=60)
TCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAAC > SRR4302534.1676482/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACG < SRR4302534.3234135/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACG > SRR4302534.4710097/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACG < SRR4302534.797852/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTT < SRR4302534.3262991/94‑1 (MQ=60)
GGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTGTCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGGTACATGATGCAACGGTG > SRR4302534.6231294/1‑94 (MQ=60)
GGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTG > SRR4302534.5345979/1‑94 (MQ=60)
GGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTG < SRR4302534.3088714/94‑1 (MQ=60)
GTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTG < SRR4302534.5135181/94‑1 (MQ=60)
CTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTG > SRR4302534.484192/1‑94 (MQ=60)
CTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTG < SRR4302534.3195555/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAG > SRR4302534.5661344/1‑94 (MQ=60)
TCAGTATCATCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGA > SRR4302534.6469933/1‑94 (MQ=60)
TCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGA > SRR4302534.2998377/1‑94 (MQ=60)
TCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGA < SRR4302534.5744898/94‑1 (MQ=60)
AGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAG > SRR4302534.3981670/1‑94 (MQ=60)
GTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGT < SRR4302534.2005986/94‑1 (MQ=60)
TATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTT < SRR4302534.6186103/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTG > SRR4302534.5799408/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTG < SRR4302534.527408/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTG < SRR4302534.6153488/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTG < SRR4302534.4659261/94‑1 (MQ=60)
CAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGC > SRR4302534.571143/1‑94 (MQ=60)
AGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCT < SRR4302534.4199677/94‑1 (MQ=60)
GCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTTCATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTG < SRR4302534.3642960/94‑1 (MQ=60)
GCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTG < SRR4302534.4852703/94‑1 (MQ=60)
GCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTG < SRR4302534.3388653/94‑1 (MQ=60)
CATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAA > SRR4302534.538463/1‑94 (MQ=60)
CATTGCTCACCACCACCAGCGCGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGCAGAAGTTTGATGCCAGAA > SRR4302534.538462/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTCAACACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAAT < SRR4302534.5455076/94‑1 (MQ=60)
TGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCA > SRR4302534.6362536/1‑94 (MQ=60)
CTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATG > SRR4302534.191601/1‑94 (MQ=60)
CTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATG > SRR4302534.3524521/1‑94 (MQ=60)
ATCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATG < SRR4302534.6351110/94‑1 (MQ=60)
TCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGG > SRR4302534.2910969/1‑94 (MQ=60)
TCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGG > SRR4302534.4626481/1‑94 (MQ=60)
ACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCA < SRR4302534.1451926/94‑1 (MQ=60)
ACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCA < SRR4302534.2438995/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAA < SRR4302534.4398433/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAA < SRR4302534.1061253/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAA < SRR4302534.2231840/94‑1 (MQ=60)
ACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATG < SRR4302534.6356380/94‑1 (MQ=60)
ACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATG < SRR4302534.1970994/94‑1 (MQ=60)
ACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATG < SRR4302534.6365311/94‑1 (MQ=60)
CCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGC > SRR4302534.1405304/1‑94 (MQ=60)
CCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGC > SRR4302534.1819978/1‑94 (MQ=60)
CACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCC < SRR4302534.3602652/94‑1 (MQ=60)
CACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCC < SRR4302534.4187169/94‑1 (MQ=60)
ACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCG > SRR4302534.685590/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCG > SRR4302534.4410405/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGA < SRR4302534.2011447/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAA > SRR4302534.1024698/1‑94 (MQ=60)
CAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAA < SRR4302534.5120788/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAG < SRR4302534.4127168/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAG > SRR4302534.6615999/1‑94 (MQ=60)
GCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGT > SRR4302534.1994757/1‑94 (MQ=60)
CGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTC < SRR4302534.4046155/94‑1 (MQ=60)
GTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCG < SRR4302534.5510849/94‑1 (MQ=60)
TGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGC > SRR4302534.3359127/1‑94 (MQ=60)
TGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGC > SRR4302534.2756198/1‑94 (MQ=60)
ATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTC > SRR4302534.93961/1‑94 (MQ=60)
ATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTC < SRR4302534.6111036/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCA < SRR4302534.5807028/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCA < SRR4302534.4369915/94‑1 (MQ=60)
TTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATA < SRR4302534.4442371/94‑1 (MQ=60)
TATCGACAGGAGTGCTGGTCGCGCTGGTTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGTAATGCCGAAGGCGCTCATAG < SRR4302534.1597236/94‑1 (MQ=60)
TATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAG > SRR4302534.6038842/1‑94 (MQ=60)
TATCAACAGTAGTGCTGCTCGCGCTGGATTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTACCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAG < SRR4302534.4287624/94‑1 (MQ=60)
ATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGC < SRR4302534.2749328/94‑1 (MQ=60)
ATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGC < SRR4302534.390087/94‑1 (MQ=60)
ATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGC < SRR4302534.5855337/94‑1 (MQ=60)
TCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCG < SRR4302534.1618001/94‑1 (MQ=60)
CAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATC > SRR4302534.2779018/1‑94 (MQ=60)
CAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATC < SRR4302534.6527897/94‑1 (MQ=60)
CAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATC > SRR4302534.5823980/1‑94 (MQ=60)
AGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATCA < SRR4302534.1404967/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGACGTCGCTCATAGCGAATCACAC < SRR4302534.6387079/94‑1 (MQ=60)
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GTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAATGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGTTGTGAAGAAGTTGGCTGCCAGAATCATGGCAATGCCGAAGTCGCTCATAGCGAATCACAC > NC_000913/1738959‑1739143
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
