Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,897,431 |
T→C |
H327H (CAT→CAC) |
b1815 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,897,431 | 0 | T | C | 95.8%
| 558.7
/ 9.9
| 167 | H327H (CAT→CAC) | b1815 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/2); new base C (71/89); total (76/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCAT > NC_000913/1897341‑1897520
|
tATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCActt < 1:1307130/93‑1 (MQ=255)
tATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCActt < 1:4038993/93‑1 (MQ=255)
tATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCActt > 1:3354707/1‑93 (MQ=255)
tATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCActt > 2:3796416/1‑93 (MQ=255)
tATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGCATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCActt < 1:2511701/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTaa > 1:2935102/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTaa > 1:36889/1‑93 (MQ=255)
ggTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGTATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAAtt > 2:1414977/1‑93 (MQ=255)
ggTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAAtt > 2:25712/1‑93 (MQ=255)
tgtAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATtgt < 2:914722/93‑1 (MQ=255)
gtAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATtgtg > 2:1846890/1‑93 (MQ=255)
gtAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATtgtg > 1:2263445/1‑93 (MQ=255)
agagATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGcc < 1:3046871/93‑1 (MQ=255)
gaTTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACt < 1:5272877/93‑1 (MQ=255)
gaTTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACt > 1:2784345/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTg < 1:6023529/93‑1 (MQ=255)
ttttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGa > 2:4990733/1‑93 (MQ=255)
ttttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGa > 2:584708/1‑93 (MQ=255)
ttttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGa > 1:4586237/1‑93 (MQ=255)
ttttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTCAATTGTGCCACTGa < 1:2208498/93‑1 (MQ=255)
tttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGAc > 1:5379221/1‑93 (MQ=255)
tgctgcGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGAccc > 1:1148380/1‑93 (MQ=255)
gctgcGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCg > 1:5173175/1‑93 (MQ=255)
ctgcGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGc < 2:96379/93‑1 (MQ=255)
tgcGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCt < 2:1375203/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTa < 2:596779/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTa < 2:667625/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGAACAATCCGCGTCAGGCCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAt < 1:3025130/93‑1 (MQ=255)
cTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAtgt > 1:2120508/1‑93 (MQ=255)
cTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAtgt < 2:5722476/93‑1 (MQ=255)
tGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAtgtg < 1:2898557/93‑1 (MQ=255)
tGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAtgtg < 2:451966/93‑1 (MQ=255)
ggAACAATCCGCGTCAGGTCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGTCCCGCTATGTGa < 2:2395072/93‑1 (MQ=255)
gAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGAt < 2:1484065/93‑1 (MQ=255)
gAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGAt < 2:1074488/93‑1 (MQ=255)
gAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGAt < 1:1905494/93‑1 (MQ=255)
gAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGAt > 1:4905927/1‑93 (MQ=255)
aTCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAg > 1:1029716/1‑93 (MQ=255)
accGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGa < 2:3939410/92‑1 (MQ=255)
cgcgTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGaaa < 1:3868727/93‑1 (MQ=255)
gcgTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAAc < 2:2595925/93‑1 (MQ=255)
gcgTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAAc < 1:5918383/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCa > 2:2355408/1‑93 (MQ=255)
gTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCa < 2:1622625/93‑1 (MQ=255)
tCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAt > 1:4552698/1‑93 (MQ=255)
tCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAt > 1:1019781/1‑93 (MQ=255)
tCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAt > 1:6123512/1‑93 (MQ=255)
cAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAtt < 2:1236899/93‑1 (MQ=255)
aGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTc < 1:1484851/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCg > 2:2012497/1‑93 (MQ=255)
tGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAg < 1:1921867/93‑1 (MQ=255)
ggATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAgc < 1:4769291/93‑1 (MQ=255)
ggATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAgc > 2:3336330/1‑93 (MQ=255)
ggATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAgc > 1:3299292/1‑93 (MQ=255)
gATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAgcg < 2:2697261/93‑1 (MQ=255)
ttCACCGAAAGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCa < 1:875192/93‑1 (MQ=255)
tCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCAt < 1:5143925/93‑1 (MQ=255)
aCCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGt < 1:3947038/93‑1 (MQ=255)
aCCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGt > 2:2056400/1‑93 (MQ=255)
ggATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGtttt < 1:4698968/93‑1 (MQ=255)
gATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTc > 2:5129086/1‑93 (MQ=255)
gATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTc < 1:3340110/93‑1 (MQ=255)
gATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTc < 2:2722622/93‑1 (MQ=255)
gATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTc > 1:3789775/1‑93 (MQ=255)
aTGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTcc < 1:4172123/93‑1 (MQ=255)
aTGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTcc < 2:3267755/93‑1 (MQ=255)
tgtgTTTATTCCTATCGCGGACGAACATAATTTAATTGTGCAACTGACCCGCTATTCGATGTCAGAACCAATTCGCAAGCGAAATGCTTcccc > 2:218707/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCg > 2:3371541/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCg > 1:801512/1‑93 (MQ=255)
tgtTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGa < 1:3619104/93‑1 (MQ=255)
gtTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAAGCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGAt > 1:3448913/1‑93 (MQ=255)
gtTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGAt < 1:1497432/93‑1 (MQ=255)
ttATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGa < 2:560442/93‑1 (MQ=255)
ttATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGa > 1:1650664/1‑93 (MQ=255)
ttATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGa < 1:4927222/93‑1 (MQ=255)
tATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGag < 1:1504347/93‑1 (MQ=255)
ttCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGagta < 2:2108097/93‑1 (MQ=255)
ttCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGagta < 1:4907323/93‑1 (MQ=255)
ttCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGagta < 1:3344573/93‑1 (MQ=255)
ttCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGagta > 1:2336440/1‑93 (MQ=255)
cTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTc > 1:5196518/1‑93 (MQ=255)
tATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGCGTAGTCa > 2:5376634/1‑93 (MQ=255)
agcgcaGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAg < 2:164205/91‑1 (MQ=255)
cgctGAAGAACATCACTTGACTGGGCCACGGACCCGCGATCTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGtt < 2:4428056/93‑1 (MQ=255)
cgcgGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGtt < 1:1408627/93‑1 (MQ=255)
cgGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTc > 2:4847140/1‑93 (MQ=255)
cgGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTc > 2:2794662/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCa > 1:2824693/1‑93 (MQ=255)
gaagaaCATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCAt > 2:2195471/1‑93 (MQ=255)
aagaaCATCTCTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATg < 2:5195238/93‑1 (MQ=255)
aagaaCATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATg > 1:2628538/1‑93 (MQ=255)
gaaCATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGtt > 2:3907855/1‑93 (MQ=255)
gaaCATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGtt < 2:3506816/93‑1 (MQ=255)
aaCATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTg > 2:3348878/1‑93 (MQ=255)
aCATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTgg < 2:5707896/93‑1 (MQ=255)
catcacTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGc < 1:736699/93‑1 (MQ=255)
catcacTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGc > 2:3129483/1‑93 (MQ=255)
catcacTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGc > 1:1276381/1‑93 (MQ=255)
atcacTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCa > 2:3759744/1‑93 (MQ=255)
tcacTTCATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGAAGCAAGTTTCATGTTGGCAt > 1:932672/1‑93 (MQ=255)
|
TATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCAT > NC_000913/1897341‑1897520
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAAC > NC_000913/1897338‑1897524
|
ATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCAC > SRR4302532.4088103/1‑94 (MQ=60)
GTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTT > SRR4302532.3466712/1‑94 (MQ=60)
GTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTT < SRR4302532.6296474/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTA < SRR4302532.4175049/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTA < SRR4302532.2595505/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTA < SRR4302532.1350883/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGCATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTA < SRR4302532.2595504/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAA > SRR4302532.38249/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAA > SRR4302532.3032633/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTAGAGATTTGGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGCCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGTACATCACTTAAT < SRR4302532.534979/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATT < SRR4302532.3651115/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATT < SRR4302532.6129417/94‑1 (MQ=60)
TGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTG > SRR4302532.2905427/1‑94 (MQ=60)
TGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTG > SRR4302532.2338558/1‑94 (MQ=60)
AGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCA > SRR4302532.691008/1‑94 (MQ=60)
AGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCA < SRR4302532.3147433/94‑1 (MQ=60)
AGAGATGTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGCCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATGGTGCCA < SRR4302532.3147434/94‑1 (MQ=60)
GAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCAC < SRR4302532.4001764/94‑1 (MQ=60)
AGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACT > SRR4302532.2877745/1‑94 (MQ=60)
GATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTG < SRR4302532.5454701/94‑1 (MQ=60)
GATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTG > SRR4302532.3927841/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGA < SRR4302532.6231555/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGA > SRR4302532.4742614/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGA > SRR4302532.5144745/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGAC < SRR4302532.6293204/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGAC > SRR4302532.5565553/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTCAATTGTGCCACTGAC < SRR4302532.2281905/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACC > SRR4302532.5089122/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCC > SRR4302532.1186711/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCG > SRR4302532.5351339/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGAACAATCCGCGTCAGGCCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATG < SRR4302532.3124923/94‑1 (MQ=60)
GCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGT > SRR4302532.2191351/1‑94 (MQ=60)
CTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTG < SRR4302532.5419674/94‑1 (MQ=60)
TGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGA < SRR4302532.2995299/94‑1 (MQ=60)
TGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGA > SRR4302532.1376794/1‑94 (MQ=60)
GGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGAT > SRR4302532.5074502/1‑94 (MQ=60)
GAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATG < SRR4302532.3548060/94‑1 (MQ=60)
GAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATG < SRR4302532.2413757/94‑1 (MQ=60)
GAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATG < SRR4302532.1968698/94‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAG > SRR4302532.1064514/1‑94 (MQ=60)
ATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGA < SRR4302532.2580351/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAAC < SRR4302532.3999282/94‑1 (MQ=60)
GCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACC < SRR4302532.5370895/94‑1 (MQ=60)
GCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACC < SRR4302532.6123347/94‑1 (MQ=60)
GCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACC < SRR4302532.799366/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACCTCACTTAATTATGCCACTGAACCGCTATGTGATGGCAGAAACCAT > SRR4302532.3143848/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAT > SRR4302532.4708042/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAT > SRR4302532.1054368/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAT > SRR4302532.6334829/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCAT > SRR4302532.4729349/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCG < SRR4302532.1534929/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAG < SRR4302532.3805863/94‑1 (MQ=60)
TGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGC < SRR4302532.1985785/94‑1 (MQ=60)
TGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGC > SRR4302532.3409069/1‑94 (MQ=60)
GGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCG < SRR4302532.4933016/94‑1 (MQ=60)
GATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCTC > SRR4302532.1325159/1‑94 (MQ=60)
TTCACCGAAAGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCAT < SRR4302532.905135/94‑1 (MQ=60)
TCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATG < SRR4302532.1495012/94‑1 (MQ=60)
TCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATG < SRR4302532.5320887/94‑1 (MQ=60)
CACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGT > SRR4302532.3033303/1‑94 (MQ=60)
ACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTT < SRR4302532.2050060/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTT < SRR4302532.4080062/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTT > SRR4302532.2957864/1‑94 (MQ=60)
CCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTT > SRR4302532.225809/1‑94 (MQ=60)
CCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTT > SRR4302532.4293492/1‑94 (MQ=60)
CGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTT < SRR4302532.4920617/94‑1 (MQ=60)
GGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTC < SRR4302532.4859251/94‑1 (MQ=60)
GGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTC > SRR4302532.3917637/1‑94 (MQ=60)
GATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCC < SRR4302532.3451570/94‑1 (MQ=60)
GATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCC < SRR4302532.1977122/94‑1 (MQ=60)
GATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCC < SRR4302532.391421/94‑1 (MQ=60)
GATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCC < SRR4302532.3451572/94‑1 (MQ=60)
ATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCC < SRR4302532.4312042/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCG > SRR4302532.828896/1‑94 (MQ=60)
TGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCG < SRR4302532.1818334/94‑1 (MQ=60)
TGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAAGCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGAT > SRR4302532.3564434/1‑94 (MQ=60)
TGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGAT < SRR4302532.3740244/94‑1 (MQ=60)
TGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGAT > SRR4302532.1306201/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATG < SRR4302532.1547941/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATG < SRR4302532.1547939/94‑1 (MQ=60)
TTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGA < SRR4302532.5044179/94‑1 (MQ=60)
TTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGA > SRR4302532.1706599/1‑94 (MQ=60)
TTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAG < SRR4302532.5096430/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAG > SRR4302532.1118130/1‑94 (MQ=60)
TATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGT > SRR4302532.88252/1‑94 (MQ=60)
TATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGT < SRR4302532.1555126/94‑1 (MQ=60)
ATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTA > SRR4302532.2414272/1‑94 (MQ=60)
ATTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTA < SRR4302532.3438871/94‑1 (MQ=60)
TTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAG < SRR4302532.5075946/94‑1 (MQ=60)
TTCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAG < SRR4302532.3456205/94‑1 (MQ=60)
TCCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGT < SRR4302532.4753185/94‑1 (MQ=60)
CCTATCGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTC > SRR4302532.5375645/1‑94 (MQ=60)
CGCGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTT < SRR4302532.1455842/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCA > SRR4302532.2919192/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCA > SRR4302532.5916663/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCAT < SRR4302532.4665157/94‑1 (MQ=60)
GAAGAACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATG > SRR4302532.2716580/1‑94 (MQ=60)
AACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGG < SRR4302532.1671672/94‑1 (MQ=60)
ACATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGC > SRR4302532.1319083/1‑94 (MQ=60)
CATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCA < SRR4302532.761788/94‑1 (MQ=60)
CATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCA > SRR4302532.1018035/1‑94 (MQ=60)
ATCACTTCATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGAAGCAAGTTTCATGTTGGCAT > SRR4302532.964626/1‑94 (MQ=60)
ATCACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCAT > SRR4302532.2853972/1‑94 (MQ=60)
CACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTA > SRR4302532.770077/1‑94 (MQ=60)
ACTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAA < SRR4302532.5811348/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCTCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAAC < SRR4302532.1091028/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAAC < SRR4302532.2026363/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAAC < SRR4302532.1860688/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAAC < SRR4302532.1040024/94‑1 (MQ=60)
|
ATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAAC > NC_000913/1897338‑1897524
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
