Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,429,483 |
T→C |
E65E (GAA→GAG) |
dedD ← |
putative lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,429,483 | 0 | T | C | 100.0%
| 545.5
/ NA
| 154 | E65E (GAA→GAG) | dedD | putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (79/75); total (79/75) |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
ACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG > NC_000913/2429394‑2429571
|
aCCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCAcctct < 2:5663354/93‑1 (MQ=255)
aCCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCAcctct > 2:2620454/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCAcctct > 1:968414/1‑93 (MQ=255)
ccGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCCACTGCCCGCAcctctc > 1:493606/1‑92 (MQ=255)
ccGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCAcctctt < 2:3777783/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTcc > 1:3170569/1‑93 (MQ=255)
ggTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTcc > 1:5187659/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGc < 1:3109301/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCt > 2:55470/1‑93 (MQ=255)
aGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgc > 2:1375908/1‑93 (MQ=255)
gTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgcgc > 2:2861556/1‑93 (MQ=255)
gTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgcgc > 2:4754073/1‑93 (MQ=255)
gTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgcgc > 2:2477373/1‑93 (MQ=255)
gTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTgcgc > 2:4297239/1‑93 (MQ=255)
ttCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGcc < 1:4418580/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCt > 1:2423899/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTc < 2:1509730/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTc < 1:2493610/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTc > 2:5050479/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTc < 1:358876/93‑1 (MQ=255)
ggTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTcc > 1:1188040/1‑93 (MQ=255)
gTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcg < 1:3807792/93‑1 (MQ=255)
gTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcg > 1:5521442/1‑93 (MQ=255)
ttCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcgg > 1:257500/1‑93 (MQ=255)
tCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCCAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCcggc < 2:5020234/93‑1 (MQ=255)
aaCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCggcggc < 1:1985031/93‑1 (MQ=255)
aaCTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCggcggc < 1:164289/93‑1 (MQ=255)
cTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTg > 2:3970584/1‑93 (MQ=255)
ggTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGt > 1:1003759/1‑93 (MQ=255)
gtgtTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTc > 1:4103000/1‑93 (MQ=255)
gtgtTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCAGGCGGCTGCGTc > 1:1998594/1‑93 (MQ=255)
ttATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCTGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGt > 2:524248/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTa > 2:2564959/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTaa < 1:4572245/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTaa < 1:1689918/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCGGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTaa < 2:2865045/93‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTaag > 1:2941658/1‑92 (MQ=255)
ttGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAAc < 2:2879661/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGc < 1:4631379/93‑1 (MQ=255)
ggCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGc > 2:3328787/1‑93 (MQ=255)
gCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGcc > 1:3749005/1‑93 (MQ=255)
tGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTg > 1:3409433/1‑93 (MQ=255)
cAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTggg < 1:3544086/93‑1 (MQ=255)
cAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTggg < 2:216575/93‑1 (MQ=255)
tAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTgg < 1:5005613/93‑1 (MQ=255)
aGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggc < 1:728972/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCGGATCGATCGACGGTGCTGCGCCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTtgcg < 1:628743/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggcg < 2:5613122/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggcg > 1:1851486/1‑93 (MQ=255)
ggCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggcggc < 1:5718437/93‑1 (MQ=255)
ggCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTggcggc < 2:4632874/93‑1 (MQ=255)
gCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCt < 2:2193061/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTg < 1:2793429/93‑1 (MQ=255)
ggATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGc > 1:5938328/1‑93 (MQ=255)
ggATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGc < 1:1728497/93‑1 (MQ=255)
gATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGca > 1:2630361/1‑93 (MQ=255)
gATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGca < 2:5514276/93‑1 (MQ=255)
gATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGca > 2:4655251/1‑93 (MQ=255)
tCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatc < 1:759593/93‑1 (MQ=255)
cGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCAGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatca < 1:913666/93‑1 (MQ=255)
gAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatcat < 2:1940360/93‑1 (MQ=255)
gAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatcat > 1:3116800/1‑93 (MQ=255)
gAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGcatcat < 1:3919632/93‑1 (MQ=255)
aGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCata < 1:861637/93‑1 (MQ=255)
aGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCata < 1:534322/93‑1 (MQ=255)
aGCGACGGTGCTGAGGCATCACCTGCCCGCGCCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGCCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCata < 1:534321/93‑1 (MQ=255)
cGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATc < 1:3492609/93‑1 (MQ=255)
cGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATc < 2:4455432/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCa < 1:81232/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTAGCATCATATCa > 1:313222/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAg > 1:4192950/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAg > 1:1582839/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAg > 1:4192948/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAg > 2:4502554/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAg < 1:5885331/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGGCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAg > 1:1424172/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGc < 2:3089579/93‑1 (MQ=255)
gctgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATGAGGCtca > 2:2397496/1‑93 (MQ=255)
ctgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcat < 2:702266/93‑1 (MQ=255)
ctgcGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCtcat < 1:3352744/93‑1 (MQ=255)
gcctCACCTCCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGa < 2:1427879/90‑1 (MQ=255)
cATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAt > 1:5011840/1‑93 (MQ=255)
cATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAt > 1:5578322/1‑93 (MQ=255)
cATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAt < 2:5662539/93‑1 (MQ=255)
aTCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATc < 2:1315678/93‑1 (MQ=255)
tCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCg > 2:3563219/1‑93 (MQ=255)
tCACCTCCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCg < 1:1953801/93‑1 (MQ=255)
cccTGCCCGCACCTCTCCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGcc < 2:6092581/92‑1 (MQ=255)
aCCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGcc > 2:5948136/1‑93 (MQ=255)
aCCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACCATCGcc > 2:5948135/1‑93 (MQ=255)
cTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCg < 1:388261/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTTGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATTACGATCACCCGc > 1:1540669/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGc > 2:2983194/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGc > 2:375641/1‑93 (MQ=255)
ccGCGCCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCttt < 2:5888294/93‑1 (MQ=255)
ccGCCCCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCttt < 1:4738303/93‑1 (MQ=255)
cGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTc > 2:5263518/1‑93 (MQ=255)
gCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCg < 2:3759243/93‑1 (MQ=255)
gCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCg < 1:951149/93‑1 (MQ=255)
gCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCg > 1:2887447/1‑93 (MQ=255)
|
ACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG > NC_000913/2429394‑2429571
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > NC_000913/2429393‑2429575
|
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCT > SRR4302532.1001458/1‑94 (MQ=60)
ACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACCGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCCCCTCTT > SRR4302532.510854/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTTCCCGCACCTCTTC < SRR4302532.1657476/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCC > SRR4302532.3275874/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCC < SRR4302532.3428470/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCC < SRR4302532.2022749/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCC > SRR4302532.5366426/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCT < SRR4302532.3212436/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGC > SRR4302532.900426/1‑94 (MQ=60)
TTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCT > SRR4302532.2504458/1‑94 (MQ=60)
TTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCT < SRR4302532.4569098/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCC < SRR4302532.2576740/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCC > SRR4302532.1227760/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCC < SRR4302532.371311/94‑1 (MQ=60)
GGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCG > SRR4302532.5713039/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCG > SRR4302532.776650/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGG > SRR4302532.266434/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGG > SRR4302532.5443685/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGG < SRR4302532.3936347/94‑1 (MQ=60)
TCAAACTCGGTGTTATTGGCTTCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCG > SRR4302532.6139048/1‑94 (MQ=60)
TCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCG < SRR4302532.4884320/94‑1 (MQ=60)
CAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGG > SRR4302532.79020/1‑94 (MQ=60)
AACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCT < SRR4302532.2050972/94‑1 (MQ=60)
AACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCT < SRR4302532.169786/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTG > SRR4302532.977559/1‑94 (MQ=60)
CTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGC > SRR4302532.3978759/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCG > SRR4302532.256483/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGT > SRR4302532.1037923/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTC > SRR4302532.4240720/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCAGGCGGCTGCGTC > SRR4302532.2065188/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAAG > SRR4302532.3039332/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAAC < SRR4302532.1746985/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAAC < SRR4302532.4728185/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGGGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCCGCGGCGTCGGGAAC > SRR4302532.5746367/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCC < SRR4302532.4789287/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCC > SRR4302532.3875036/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCT < SRR4302532.2756099/94‑1 (MQ=60)
CTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTG > SRR4302532.3523610/1‑94 (MQ=60)
CAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGT < SRR4302532.3662651/94‑1 (MQ=60)
AATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTG < SRR4302532.1877772/94‑1 (MQ=60)
ATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGG < SRR4302532.4481594/94‑1 (MQ=60)
ATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGG > SRR4302532.5610015/1‑94 (MQ=60)
TAGTGGCCGGCTCGAGCGACGGTGCTGCCGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGC < SRR4302532.2115211/94‑1 (MQ=60)
TAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGC < SRR4302532.5177176/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCG > SRR4302532.4270513/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCG > SRR4302532.1912923/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCG < SRR4302532.377621/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCG < SRR4302532.753810/94‑1 (MQ=60)
GTGGCCGGATCGATCGACGGTGCTGCGCCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTTGCGG < SRR4302532.650697/94‑1 (MQ=60)
GGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCT < SRR4302532.5917656/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGG < SRR4302532.3913466/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGG < SRR4302532.2887082/94‑1 (MQ=60)
CGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGC > SRR4302532.6143823/1‑94 (MQ=60)
GGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCA < SRR4302532.4084640/94‑1 (MQ=60)
GGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCA < SRR4302532.1786691/94‑1 (MQ=60)
GGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCA > SRR4302532.2718473/1‑94 (MQ=60)
ATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATC > SRR4302532.3542700/1‑94 (MQ=60)
TCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCA < SRR4302532.785699/94‑1 (MQ=60)
CGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGGATCAT > SRR4302532.3220205/1‑94 (MQ=60)
CGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCAT > SRR4302532.3220208/1‑94 (MQ=60)
CGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTCGGTGGCGGCTGGCATCAT > SRR4302532.3648066/1‑94 (MQ=60)
CGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCAGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCAT < SRR4302532.944909/94‑1 (MQ=60)
GAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATA < SRR4302532.4051692/94‑1 (MQ=60)
AGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATAT < SRR4302532.891213/94‑1 (MQ=60)
AGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATAT < SRR4302532.552944/94‑1 (MQ=60)
AGCGACGGTGCTGAGGCATCACCTGCCCGCGCCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGCCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATAT < SRR4302532.552943/94‑1 (MQ=60)
CGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCA < SRR4302532.3609631/94‑1 (MQ=60)
CGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTAGCATCATATCA > SRR4302532.324090/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG > SRR4302532.4333651/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG < SRR4302532.84104/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG > SRR4302532.1636421/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG > SRR4302532.4333653/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGGCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAG > SRR4302532.1471994/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGG < SRR4302532.6089142/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCT < SRR4302532.6175468/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATC < SRR4302532.3464674/94‑1 (MQ=60)
GGCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGA > SRR4302532.3025991/1‑94 (MQ=60)
GCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAT > SRR4302532.5183630/1‑94 (MQ=60)
GCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAT > SRR4302532.5771999/1‑94 (MQ=60)
GCATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGAT < SRR4302532.490572/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATC < SRR4302532.316173/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATC < SRR4302532.3247726/94‑1 (MQ=60)
ATCACCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCC > SRR4302532.1583099/1‑94 (MQ=60)
TCACCTCCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGC < SRR4302532.2018716/94‑1 (MQ=60)
CCCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCC < SRR4302532.1973359/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCG > SRR4302532.1737894/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCGGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCG > SRR4302532.2690734/1‑94 (MQ=60)
CTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTTGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATTACGATCACCCGC > SRR4302532.1592731/1‑94 (MQ=60)
CTGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGC < SRR4302532.401838/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCT > SRR4302532.1356955/1‑94 (MQ=60)
TGCCCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCT > SRR4302532.5307806/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTC < SRR4302532.4900093/94‑1 (MQ=60)
CCGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTC > SRR4302532.4582760/1‑94 (MQ=60)
CGCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCG > SRR4302532.2983921/1‑94 (MQ=60)
GCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGG < SRR4302532.983658/94‑1 (MQ=60)
GCACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGG < SRR4302532.605269/94‑1 (MQ=60)
CACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGC > SRR4302532.1799153/1‑94 (MQ=60)
ACCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGGGGCTGCGTCGGTCACGCCGGGGTGCCGGCTCGCATCgtgtcaagcgcatgaccacggcccgctttcggcc > SRR4302532.341118/1‑60 (MQ=28)
CCTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > SRR4302532.129758/1‑94 (MQ=60)
|
GACCGGTGCAGGTTCCGGTTCAAACTCGGTGTTATTGGCTGCAATAGTGGCCGGATCGAGCGACGGTGCTGCGGCATCACCTGCCCGCACTTCTTCCGCTGCGCCTTCCGGCGGCTGCGTCGGTAACGCCTGGGTGGCGGCTGGCATCATATCAGGCTCATCACGATCGCCCGCTTTCGGCAC > NC_000913/2429393‑2429575
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
