Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,747,389 |
Δ1 bp |
coding (572/591 nt) |
b4540 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,747,388 | 0 | C | . | 100.0%
| 863.8
/ NA
| 184 | coding (571/591 nt) | b4540 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (96/88); total (96/88) |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGC > NC_000913/2747296‑2747476
|
ctTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATc > 1:2649043/1‑93 (MQ=255)
tttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATct < 2:687780/93‑2 (MQ=255)
tttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATct > 2:4302978/1‑92 (MQ=255)
tttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATct < 2:5174378/93‑2 (MQ=255)
ttGAGGAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctg < 2:1825254/93‑3 (MQ=255)
ttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctg < 2:2045755/93‑3 (MQ=255)
tGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctgg > 1:2674382/1‑90 (MQ=255)
tGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctgg < 1:4366095/93‑4 (MQ=255)
gAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctgga < 2:662584/93‑5 (MQ=255)
aGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaa > 2:3109385/1‑93 (MQ=255)
aGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaa > 2:2000775/1‑93 (MQ=255)
gCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaa > 1:1728909/1‑93 (MQ=255)
aaaGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaa > 2:4785970/1‑93 (MQ=255)
aaaGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaa > 1:4810898/1‑93 (MQ=255)
aaaGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaa < 2:1153467/93‑1 (MQ=255)
aagaagAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaaa > 2:5587870/1‑93 (MQ=255)
agaagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAt > 2:1130228/1‑93 (MQ=255)
agaagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAt > 1:3709360/1‑93 (MQ=255)
gaagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAta > 2:167738/1‑92 (MQ=255)
gaagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGA‑GCTGGaaaaaagg > 1:5523869/1‑91 (MQ=255)
aagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGa < 1:6147774/93‑1 (MQ=255)
gagTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAcc < 2:6076205/93‑1 (MQ=255)
gagTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAcc > 1:1665489/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCCTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtg < 1:90481/93‑1 (MQ=255)
tGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtg > 2:153899/1‑93 (MQ=255)
gcACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtgatg > 1:305255/1‑93 (MQ=255)
ccTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAc < 1:1785712/92‑1 (MQ=255)
aCTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAc > 1:1183206/1‑93 (MQ=255)
tATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcat < 1:762725/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcat < 1:5093408/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcat < 1:3423012/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcat > 1:2764970/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcatca > 2:4012471/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcatca < 1:1336326/93‑1 (MQ=255)
tCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcatca < 2:5519334/93‑1 (MQ=255)
gTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATg > 2:584834/1‑93 (MQ=255)
tGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATgg > 1:3241646/1‑93 (MQ=255)
tGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATgg < 2:2608581/93‑1 (MQ=255)
gCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGt > 2:1960444/1‑93 (MQ=255)
ccGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGc < 2:5810207/92‑1 (MQ=255)
aCGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGc > 2:2229692/1‑93 (MQ=255)
cGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGcc > 1:5934984/1‑93 (MQ=255)
aaTCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCcgc > 1:4927109/1‑93 (MQ=255)
aTCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGAcgcg > 2:3082684/1‑93 (MQ=255)
tCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCgcgc > 2:4207325/1‑93 (MQ=255)
cACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCa < 1:5733125/93‑1 (MQ=255)
cACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCa > 1:35722/1‑93 (MQ=255)
cACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCa > 1:5357682/1‑93 (MQ=255)
cGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTAAGCACATCATGTTGCCGCGCAgg > 2:2157462/1‑92 (MQ=255)
caAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAAtt < 2:4606154/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTa < 2:4972154/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTAt < 1:5570069/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATc < 2:3002085/93‑1 (MQ=255)
tttCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCg < 2:5703154/93‑1 (MQ=255)
ttCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCgg < 1:2220361/93‑1 (MQ=255)
tCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGt > 2:100943/1‑93 (MQ=255)
tCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGt < 1:5585148/93‑1 (MQ=255)
cccGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTa > 2:5288900/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAt < 2:3872362/93‑1 (MQ=255)
ccGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAt < 2:3436440/93‑1 (MQ=255)
ccGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAt < 1:1401402/93‑1 (MQ=255)
cggcGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGACGCGCAGTGAAATTATCGGTAtt > 1:2415539/4‑93 (MQ=255)
cGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAtt > 1:326072/1‑93 (MQ=255)
gTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTg > 2:5459101/1‑93 (MQ=255)
gTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTg > 1:5386632/1‑93 (MQ=255)
gTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTg > 2:5974932/1‑93 (MQ=255)
tCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGa > 1:3820459/1‑93 (MQ=255)
tCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGa > 1:4687356/1‑93 (MQ=255)
cGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGat < 2:729477/93‑1 (MQ=255)
gCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGata > 2:1385453/1‑93 (MQ=255)
gCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGata < 2:4542475/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATc < 2:2850553/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCa > 2:4701325/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCa > 2:2263145/1‑93 (MQ=255)
tCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCaa > 1:1588154/1‑93 (MQ=255)
tCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCaa > 1:2251930/1‑93 (MQ=255)
tCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCaa < 2:2412709/93‑1 (MQ=255)
aGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACg > 2:2364877/1‑93 (MQ=255)
ggATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGa > 2:890771/1‑93 (MQ=255)
gATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGAt < 1:5621563/93‑1 (MQ=255)
atatGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATg > 1:1752600/1‑93 (MQ=255)
tatGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGa < 1:662101/93‑1 (MQ=255)
gctgctGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCGGGGAAATTATCGGTATTGATATCAACAATGACTg > 2:380471/1‑93 (MQ=255)
gctgctGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTg > 2:3933902/1‑93 (MQ=255)
ctgctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTgg < 2:3569744/93‑1 (MQ=255)
tgctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGa < 1:1962226/93‑1 (MQ=255)
tgctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGa < 1:1012486/93‑1 (MQ=255)
gctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaa < 1:3982331/93‑1 (MQ=255)
gctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaa < 1:4439089/93‑1 (MQ=255)
ctttCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaaa < 1:5200703/90‑1 (MQ=255)
ctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaaa < 1:4889860/93‑1 (MQ=255)
tgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAt < 1:4513873/93‑1 (MQ=255)
gttGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAt < 2:3738705/91‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAt < 1:4041432/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAt < 1:5125274/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAt < 1:851361/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTc > 1:4984710/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTc < 1:292301/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTc > 2:1451125/1‑93 (MQ=255)
tCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTgc > 1:4775785/1‑93 (MQ=255)
|
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGC > NC_000913/2747296‑2747476
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCAAC > NC_000913/2747296‑2747482
|
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCT < SRR4302532.5883236/94‑1 (MQ=60)
TTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGG > SRR4302532.2764145/1‑94 (MQ=60)
TTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGG > SRR4302532.5102563/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGA < SRR4302532.4514190/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGA < SRR4302532.1659246/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAA < SRR4302532.4581485/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAA < SRR4302532.5096740/94‑1 (MQ=60)
AGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAA > SRR4302532.1787114/1‑94 (MQ=60)
CAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAA > SRR4302532.4976570/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAT > SRR4302532.3833874/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAT > SRR4302532.928507/1‑94 (MQ=60)
AAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAT > SRR4302532.2311672/1‑94 (MQ=60)
AGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGA‑GCTGGAAAAAAGG > SRR4302532.5715550/1‑94 (MQ=60)
AAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAC < SRR4302532.5267352/94‑1 (MQ=60)
AAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAC < SRR4302532.6359803/94‑1 (MQ=60)
AGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACC > SRR4302532.1721875/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCCTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACC > SRR4302532.5797415/1‑94 (MQ=60)
GAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCG < SRR4302532.2331727/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTT < SRR4302532.1753644/94‑1 (MQ=60)
tggcaCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGTATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTG < SRR4302532.5953273/89‑1 (MQ=60)
GTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTG < SRR4302532.5400367/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCCTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGA < SRR4302532.93647/94‑1 (MQ=60)
TGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGA < SRR4302532.125424/94‑1 (MQ=60)
CGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATG > SRR4302532.315842/1‑94 (MQ=60)
CGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATG < SRR4302532.1145120/94‑1 (MQ=60)
GCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGC > SRR4302532.5304410/1‑94 (MQ=60)
GCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGA > SRR4302532.2745200/1‑94 (MQ=60)
CACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAC > SRR4302532.1222726/1‑94 (MQ=60)
TCTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACA > SRR4302532.3586199/1‑94 (MQ=60)
CCTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACA < SRR4302532.1845405/94‑1 (MQ=60)
ACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACA > SRR4302532.1005537/1‑94 (MQ=60)
CTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACAT > SRR4302532.2857807/1‑94 (MQ=60)
TATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATC < SRR4302532.789007/94‑1 (MQ=60)
TATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATC < SRR4302532.3537676/94‑1 (MQ=60)
TATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATC < SRR4302532.5268554/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCAT < SRR4302532.1381022/94‑1 (MQ=60)
GTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGG < SRR4302532.5771384/94‑1 (MQ=60)
GTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGG > SRR4302532.3349280/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGG > SRR4302532.4631210/1‑94 (MQ=60)
GCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTG < SRR4302532.4693608/94‑1 (MQ=60)
CACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGC < SRR4302532.822108/94‑1 (MQ=60)
ACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCC > SRR4302532.6140387/1‑94 (MQ=60)
CGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCG > SRR4302532.1859852/1‑94 (MQ=60)
CGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCG > SRR4302532.5022934/1‑94 (MQ=60)
GAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGC > SRR4302532.5096313/1‑94 (MQ=60)
GAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACAGTTGATGACATCATGGTGCCGC > SRR4302532.1834940/1‑94 (MQ=60)
AATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCG > SRR4302532.758253/1‑94 (MQ=60)
TCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCA > SRR4302532.5543454/1‑94 (MQ=60)
TCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCA > SRR4302532.37033/1‑94 (MQ=60)
CACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAG < SRR4302532.5932762/94‑1 (MQ=60)
CTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAA < SRR4302532.2902282/94‑1 (MQ=60)
CTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAA > SRR4302532.5062457/1‑94 (MQ=60)
CAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGCAATTA > SRR4302532.5940223/1‑94 (MQ=60)
CAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTA < SRR4302532.5755903/94‑1 (MQ=60)
AAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTAT > SRR4302532.4942078/1‑94 (MQ=60)
AATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATC < SRR4302532.5763486/94‑1 (MQ=60)
AATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATC > SRR4302532.306263/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGT < SRR4302532.2294073/94‑1 (MQ=60)
TCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTA < SRR4302532.5779042/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATT < SRR4302532.1448350/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATT > SRR4302532.337393/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATT < SRR4302532.5276983/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATT < SRR4302532.4853762/94‑1 (MQ=60)
CCGGCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGACGCGCAGTGAAATTATCGGTATT > SRR4302532.2495878/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTG > SRR4302532.3770804/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTG > SRR4302532.5573218/1‑94 (MQ=60)
GTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGA < SRR4302532.642224/94‑1 (MQ=60)
GTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGA < SRR4302532.4115543/94‑1 (MQ=60)
GTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGA > SRR4302532.4847220/1‑94 (MQ=60)
GTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGA > SRR4302532.3949433/1‑94 (MQ=60)
TCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGAT < SRR4302532.2173311/94‑1 (MQ=60)
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AATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCA > SRR4302532.3834869/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAA > SRR4302532.1403626/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAA > SRR4302532.2326671/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAA > SRR4302532.1641907/1‑94 (MQ=60)
TCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAAC < SRR4302532.5553416/94‑1 (MQ=60)
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AGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGA > SRR4302532.6247320/1‑94 (MQ=60)
AGGATATGCTGCTGCCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGCTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAGTTATCGGTATTGATATCACCGA > SRR4302532.3337991/1‑94 (MQ=60)
GATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATG < SRR4302532.5816630/94‑1 (MQ=60)
GATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATG > SRR4302532.1811464/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGAC > SRR4302532.1526005/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGAC < SRR4302532.684999/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACT < SRR4302532.3365662/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACT > SRR4302532.179147/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGG < SRR4302532.2668728/94‑1 (MQ=60)
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CTTTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAT < SRR4302532.5380029/94‑1 (MQ=60)
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TGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATC < SRR4302532.4667984/94‑1 (MQ=60)
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GGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATT > SRR4302532.4487960/1‑94 (MQ=60)
GTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTC > SRR4302532.5155586/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCT < SRR4302532.302370/94‑1 (MQ=60)
CTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGC > SRR4302532.4940236/1‑94 (MQ=60)
TCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCG > SRR4302532.3988528/1‑94 (MQ=60)
CGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGC > SRR4302532.2786868/1‑94 (MQ=60)
CGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGC < SRR4302532.1874691/94‑1 (MQ=60)
GAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCC > SRR4302532.2488216/1‑94 (MQ=60)
GAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCC < SRR4302532.3319329/94‑1 (MQ=60)
atCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCA > SRR4302532.293571/3‑94 (MQ=60)
atCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCA > SRR4302532.1072955/3‑94 (MQ=60)
TCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCAA > SRR4302532.5458956/1‑94 (MQ=60)
TCTGGAAAAAATGACCGCTGATGACATCATGGGGCCGCGCAGTTAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTATGGGCCAA > SRR4302532.2728926/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCAAC > SRR4302532.1804731/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCAAC > SRR4302532.5380136/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCAAC > SRR4302532.2685691/1‑94 (MQ=60)
|
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCAAC > NC_000913/2747296‑2747482
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
