Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,751,091 |
G→C |
A426P (GCT→CCT) |
recN → |
RecN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,751,091 | 0 | G | C | 100.0%
| 714.9
/ NA
| 195 | A426P (GCT→CCT) | recN | RecN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (98/97); total (98/97) |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA > NC_000913/2751001‑2751180
|
gatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCt > 1:1122846/1‑93 (MQ=255)
atGTTAAAGTTGACGAGCATCCCCTGGGCGCTGACGGTGCCGGTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTa < 2:1708579/93‑1 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGTCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 2:4165653/93‑1 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 1:2562983/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAtt > 2:5012390/1‑93 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg < 1:5640613/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCa > 2:2849577/1‑93 (MQ=255)
aTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaa > 1:5242916/1‑93 (MQ=255)
ttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATCGCCAAAg > 2:1138066/1‑93 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 2:4343969/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt > 1:2735356/1‑93 (MQ=255)
gACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTc < 1:50783/93‑1 (MQ=255)
gAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCa < 1:5805066/93‑1 (MQ=255)
aGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAt > 2:5133847/1‑93 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATc > 1:2624756/1‑93 (MQ=255)
cATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATcc > 1:3432610/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:700981/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:5564337/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:2387202/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg < 1:818413/93‑1 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 1:5037615/1‑93 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggt < 2:5704981/93‑1 (MQ=255)
cccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtg < 1:5965030/92‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg > 2:4012982/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtggt < 2:3337895/93‑1 (MQ=255)
tGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGgtggtg > 2:351499/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGgtggtg > 1:5373075/1‑93 (MQ=255)
gggCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCCCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGa < 2:5351018/93‑1 (MQ=255)
gggCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGa > 2:1843895/1‑93 (MQ=255)
gggCCCTGGCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGa < 1:5337932/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGaa < 2:6077032/93‑1 (MQ=255)
cgcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAtt < 1:1418067/93‑1 (MQ=255)
gcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTg > 1:4420887/1‑93 (MQ=255)
ccTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTg < 1:1498240/92‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc < 2:4421083/93‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGCCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGAGGTGACTTGTc > 2:5739460/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTcc < 2:5867754/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc < 1:3369848/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTccc < 1:638524/93‑1 (MQ=255)
gTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCa < 1:3160040/93‑1 (MQ=255)
gTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCa > 2:4121238/1‑93 (MQ=255)
gTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCa > 2:4873353/1‑93 (MQ=255)
tGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAt > 1:3199070/1‑93 (MQ=255)
ggCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAt < 2:2022162/92‑1 (MQ=255)
gCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATc > 1:4878468/1‑93 (MQ=255)
gCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATc < 2:2416282/93‑1 (MQ=255)
gCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATc < 2:3239597/93‑1 (MQ=255)
gATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCa > 2:2087017/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 2:1739660/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc < 1:5532016/93‑1 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc < 1:270149/93‑1 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 1:3906837/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 1:3938466/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 1:2954860/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 1:4643354/93‑1 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt > 2:4301458/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 1:1155086/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 2:5922241/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 1:4957360/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 2:2568010/1‑93 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg < 1:1360804/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGGGTAACTACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc < 2:3303588/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATcc < 1:3794678/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCa > 1:575360/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCAAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCCCTGGCAATCCa < 1:4003178/93‑1 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg < 1:2341446/93‑1 (MQ=255)
gggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtca > 2:4487626/1‑93 (MQ=255)
gTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatc < 2:2996573/93‑1 (MQ=255)
gTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatc < 2:163307/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAc < 2:3392317/93‑1 (MQ=255)
accaccaccCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACg < 2:3705932/93‑1 (MQ=255)
caccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc < 1:5423951/93‑1 (MQ=255)
accaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcg > 2:386049/1‑93 (MQ=255)
accaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcg > 2:5167157/1‑93 (MQ=255)
aCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTa > 1:4528868/1‑93 (MQ=255)
aCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTa < 1:919613/93‑1 (MQ=255)
cccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaa < 2:5625943/93‑1 (MQ=255)
ccAGGTCAGGCAATGAAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGGGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAGGGCGCGTaaa > 1:4185248/1‑93 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaa > 1:4718295/1‑93 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaa > 2:4621199/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:1085437/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 2:5230662/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:1006510/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 2:1259190/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 2:2813123/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 2:1399200/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:4701349/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGACATCACGGCGCGTAAAAt > 1:3690044/1‑93 (MQ=255)
gTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATgg > 1:3707945/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGa < 2:1213093/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGa < 1:1202698/93‑1 (MQ=255)
cgCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGGGTAAAATGGaaa < 1:1850232/92‑1 (MQ=255)
gCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc < 2:194770/93‑1 (MQ=255)
gCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc > 1:4237/1‑93 (MQ=255)
acaaaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc < 1:1972380/90‑1 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc < 2:4280333/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc > 2:5502941/1‑93 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc < 1:2088222/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcccc < 2:4309410/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg > 2:6139273/1‑93 (MQ=255)
|
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA > NC_000913/2751001‑2751180
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2750998‑2751184
|
ATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACCGAGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACTACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGC > SRR4302532.2440236/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACTAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATGAAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT < SRR4302532.2642827/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302532.1160338/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA > SRR4302532.1467674/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT > SRR4302532.4330753/1‑94 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT < SRR4302532.2648513/94‑1 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT > SRR4302532.612335/1‑94 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG > SRR4302532.5224187/1‑94 (MQ=60)
TTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGC < SRR4302532.5836663/94‑1 (MQ=60)
AATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAA > SRR4302532.5423661/1‑94 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT < SRR4302532.927871/94‑1 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT > SRR4302532.2827291/1‑94 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302532.956047/94‑1 (MQ=60)
GACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCG < SRR4302532.52586/94‑1 (MQ=60)
ACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGGGTTTCGGGGAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGC > SRR4302532.2654745/1‑94 (MQ=60)
ACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGC > SRR4302532.2761712/1‑94 (MQ=60)
CGAGCACCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACAAACCGAGGTCAGTCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCA > SRR4302532.5330975/1‑94 (MQ=60)
GAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAT < SRR4302532.6006789/94‑1 (MQ=60)
AGCATCCCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATC < SRR4302532.4989043/94‑1 (MQ=60)
AGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATC > SRR4302532.2712652/1‑94 (MQ=60)
GCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGTTAACCACCACCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCC < SRR4302532.3265366/94‑1 (MQ=60)
GCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCC > SRR4302532.3547617/1‑94 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGATGGTGCCGGTCGTATTGAGTTTTGGGGAACCACTAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGAATCCG > SRR4302532.5236673/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302532.5882516/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302532.5210399/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGT < SRR4302532.846328/94‑1 (MQ=60)
CCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGG < SRR4302532.6171292/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGG > SRR4302532.430647/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGG < SRR4302532.118409/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG > SRR4302532.5559238/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCCGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGGG > SRR4302532.526655/1‑94 (MQ=60)
ggtttttgtctGTGCCGATCGTATTGTGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGGCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAGCCGGTGGTGAT > SRR4302532.5646903/12‑94 (MQ=60)
GGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAA > SRR4302532.5183874/1‑94 (MQ=60)
GGGCCCTGGCGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAA < SRR4302532.5523077/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG < SRR4302532.1465655/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG > SRR4302532.4571480/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACGGGGCCGATCGTATTGATTTTCGGGTAACCACCAACCCACGTCAGCCAATCCAGCCTATTGCCAAAGTCGCACCCGGTGGCGAATTG > SRR4302532.5452845/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT < SRR4302532.1072855/94‑1 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT > SRR4302532.3831719/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGGGGTCAATTGT > SRR4302532.3986968/1‑94 (MQ=60)
CCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT < SRR4302532.1548773/94‑1 (MQ=60)
CTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTC > SRR4302532.3505156/1‑94 (MQ=60)
TGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCC > SRR4302532.2509195/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC < SRR4302532.2344075/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG < SRR4302532.3482509/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG < SRR4302532.3172603/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG < SRR4302532.660764/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAT > SRR4302532.3305270/1‑94 (MQ=60)
GTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCAT < SRR4302532.3264965/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302532.1196790/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302532.1153981/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC > SRR4302532.5832939/1‑94 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302532.5622785/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC > SRR4302532.5046206/1‑94 (MQ=60)
CCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGC > SRR4302532.3777774/1‑94 (MQ=60)
CCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGC > SRR4302532.1444295/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302532.4071179/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302532.3052788/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302532.4038575/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT < SRR4302532.5723980/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT < SRR4302532.279506/94‑1 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG < SRR4302532.1193622/94‑1 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG < SRR4302532.4801660/94‑1 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302532.6203532/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGG > SRR4302532.5127411/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC < SRR4302532.1406379/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAA > SRR4302532.5111366/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAT > SRR4302532.5588016/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATC < SRR4302532.4617453/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA > SRR4302532.595429/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA < SRR4302532.3922714/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302532.2125117/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCAAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCCCTGGCAATCCAG < SRR4302532.4138039/94‑1 (MQ=60)
TTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGG < SRR4302532.2419492/94‑1 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT > SRR4302532.2877822/1‑94 (MQ=60)
GGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATC > SRR4302532.177276/1‑94 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG < SRR4302532.3362213/94‑1 (MQ=60)
CACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCG < SRR4302532.5611949/94‑1 (MQ=60)
CCAACCAAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTAGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCG > SRR4302532.3893400/1‑94 (MQ=60)
CAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGT > SRR4302532.4791134/1‑94 (MQ=60)
AACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTA > SRR4302532.4683443/1‑94 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA < SRR4302532.951086/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA < SRR4302532.596579/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA < SRR4302532.1949046/94‑1 (MQ=60)
CCCAGGTCAGGCAATGAAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGGGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAGGGCGCGTAAA > SRR4302532.4325648/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAA > SRR4302532.4879281/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAA < SRR4302532.675215/94‑1 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA < SRR4302532.4121314/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302532.1121793/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302532.1040755/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGACATCACGGCGCGTAAAAT > SRR4302532.3813946/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG < SRR4302532.4823490/94‑1 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATAGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG > SRR4302532.4470647/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGG > SRR4302532.3832419/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGA < SRR4302532.2810105/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCATGTCATCACGGCGCGTAAAATGGA < SRR4302532.1405768/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA < SRR4302532.1242931/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA > SRR4302532.5495211/1‑94 (MQ=60)
CGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGGGTAAAATGGAAAC < SRR4302532.1911638/94‑1 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC > SRR4302532.4414/1‑94 (MQ=60)
acaAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACC < SRR4302532.2037897/91‑1 (MQ=60)
AATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCG > SRR4302532.4068555/1‑94 (MQ=60)
AATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCG < SRR4302532.2157859/94‑1 (MQ=60)
GCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCA < SRR4302532.5544058/94‑1 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302532.1790393/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACT > SRR4302532.4155308/1‑94 (MQ=60)
GCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTG < SRR4302532.6066678/94‑1 (MQ=60)
CCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > SRR4302532.4875110/1‑94 (MQ=60)
CCTATTGCCAAAGACGCATCCGGATGAGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACAACACGTAAAATGCAAACCCCGCCACTGA > SRR4302532.1064321/1‑94 (MQ=50)
|
ATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2750998‑2751184
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
