Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,152,247 |
+C |
intergenic (+10/+29) |
yghB → / ← yqhC |
hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,152,244 | 1 | . | C | 99.5%
| 702.9
/ ‑3.9
| 195 | intergenic (+7/+32) | yghB/yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (118/76); total (119/76) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.08e-01 |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAG > NC_000913/3152152‑3152333
|
tgatgaTCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑tttt > 2:3706261/1‑93 (MQ=255)
gatgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c > 2:5510428/1‑93 (MQ=255)
gatgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c > 1:210843/1‑93 (MQ=255)
atgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑c > 1:1079364/1‑93 (MQ=255)
tgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑cc > 1:385940/1‑93 (MQ=255)
tgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑cc < 1:105531/93‑1 (MQ=255)
tatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑ccc > 1:1717534/2‑92 (MQ=255)
gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑ccc > 2:6022736/1‑92 (MQ=255)
gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACACCTGACGA‑TTtt‑c‑ccc > 2:2144499/1‑92 (MQ=255)
atCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑ctcg > 1:792475/1‑90 (MQ=255)
atCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTtt‑c‑cccg > 1:4461648/1‑91 (MQ=255)
tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTACAAAAAAATACTGTCACGCCTGGAGA‑TTTt‑caccgttcc > 2:2580922/1‑93 (MQ=255)
tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTtcc‑ccgttcc > 2:5103073/1‑93 (MQ=255)
gCCAATTGCCTTGTTACCCGCTGGCTTGTTAGCCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTtcc‑ccgttccc < 2:229134/93‑1 (MQ=255)
gCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTtcc‑ccgttccc > 2:2010374/1‑93 (MQ=255)
gCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTtcc‑ccgttccc < 1:3512872/93‑1 (MQ=255)
cAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGGCTGACGC‑TTTTCC‑CCGTTTCCgg > 1:493641/1‑93 (MQ=255)
cAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTtcc‑ccgttccccg > 1:2522497/1‑91 (MQ=255)
aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTCAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTACCGGt > 2:5889406/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGt < 2:2598033/93‑1 (MQ=255)
aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGt > 1:1120731/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCTGTTGc < 2:1749417/93‑1 (MQ=255)
tGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGc < 2:1920422/93‑1 (MQ=255)
gCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCt > 1:2299100/1‑93 (MQ=255)
gCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGGTGCt > 2:300977/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGt < 1:2211580/93‑1 (MQ=255)
cTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCCGTTGCTGt > 2:14399/1‑93 (MQ=255)
ttGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTa < 2:4540306/93‑1 (MQ=255)
tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAc > 1:3236387/1‑93 (MQ=255)
tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAc > 2:1514706/1‑93 (MQ=255)
gTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCCCGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAcc < 2:4771897/93‑1 (MQ=255)
gTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAcc < 2:5064090/93‑1 (MQ=255)
ttAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCg < 2:4599402/93‑1 (MQ=255)
ttAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCg < 1:5854329/93‑1 (MQ=255)
ttAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCg < 1:5520727/93‑1 (MQ=255)
tAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCgg > 2:3980872/1‑93 (MQ=255)
tAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCgg < 2:663521/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGaa > 2:1152713/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGaa > 2:555181/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCTTGTTACGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAAc < 1:2818126/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGGACGt > 2:818885/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGt > 2:4795754/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTTCCGGGTGCTGGACCGGGAACgct > 1:1771259/1‑91 (MQ=255)
ggCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAt < 1:513091/93‑1 (MQ=255)
ggCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAt < 2:5329007/93‑1 (MQ=255)
ggCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAt < 1:3608064/93‑1 (MQ=255)
gCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTCCCGGGGACGTAtt > 2:1305224/1‑93 (MQ=255)
tGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTaa < 1:5071121/93‑1 (MQ=255)
ttAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAAtt > 2:5629205/1‑93 (MQ=255)
ttAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAAtt > 2:3194165/1‑93 (MQ=255)
tAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTAACGGGAACGCATTTAAttt > 2:1278623/1‑92 (MQ=255)
ggCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTccc > 1:2239019/1‑93 (MQ=255)
ggCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTccc < 1:4381082/93‑1 (MQ=255)
cACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCt > 1:5740842/1‑93 (MQ=255)
cACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCt < 2:2488711/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCa < 1:2665606/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 2:4294787/1‑93 (MQ=255)
tttGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGc > 2:2913531/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGcc > 1:4125573/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGccc > 1:3264147/1‑93 (MQ=255)
tggtgATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGc > 2:3914000/1‑93 (MQ=255)
ggtgATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCa < 2:418751/93‑1 (MQ=255)
ggtgATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCa < 1:5293627/93‑1 (MQ=255)
tgATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAtt < 2:2444368/93‑1 (MQ=255)
tgATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAtt < 1:991308/93‑1 (MQ=255)
tgATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAtt > 1:5381381/1‑93 (MQ=255)
gATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTc < 2:1593219/93‑1 (MQ=255)
gATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGGTGCTGTCCCCGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCCCCCCCCTTc > 1:1400573/1‑93 (MQ=255)
ttAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGAGTTTC‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCtt > 1:3885857/1‑93 (MQ=255)
ttAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCCTCACCCGCATTCtt > 1:5564019/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaaaTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGcc > 1:3032936/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGc < 1:377834/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGc > 2:5765113/1‑93 (MQ=255)
aaaaTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCAt > 1:4698442/1‑93 (MQ=255)
aaTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 2:5012532/93‑1 (MQ=255)
aaTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt > 2:5951992/1‑93 (MQ=255)
aTACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCtt > 1:2420269/1‑93 (MQ=255)
cTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc < 1:4654375/93‑1 (MQ=255)
tGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc > 1:903459/1‑93 (MQ=255)
tGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc < 2:3511319/93‑1 (MQ=255)
tGTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc > 2:5233507/1‑93 (MQ=255)
gaaaCGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccccc < 2:3153930/91‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccccc > 1:5413373/1‑93 (MQ=255)
gTAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccccc < 1:1568983/93‑1 (MQ=255)
tAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGGACTTATTTAATTCCGCTGCATCGCCCGCAGTCTTGCCGCATCTTCCCCCg > 2:486755/1‑93 (MQ=255)
tAACGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCCGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCg < 1:4804838/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCgg < 2:366668/93‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCcgcg > 1:2785055/1‑93 (MQ=255)
gCCTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGt < 1:5276247/93‑1 (MQ=255)
ccTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTc > 2:2867284/1‑93 (MQ=255)
ccTGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCCGTTGCTGTACCCGGAAAGCATTTAATTTTCCCTCATCCCCCGCATTCTTGCCTCATCTTTCCCCGGCCTc > 1:3511552/1‑93 (MQ=255)
tGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 1:859787/1‑93 (MQ=255)
tGACGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 1:3114765/1‑93 (MQ=255)
aCGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac > 1:2009123/1‑93 (MQ=255)
aCGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac > 1:1903087/1‑93 (MQ=255)
aCGA‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac > 1:1677116/1‑93 (MQ=255)
attttc‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGa < 1:1195999/91‑1 (MQ=255)
a‑TTTTCC‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCCCCACCCCGa > 1:678965/1‑93 (MQ=255)
ttttc‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGaa < 1:4084125/92‑1 (MQ=255)
ttttc‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGaa < 2:898709/92‑1 (MQ=255)
|
TGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑C‑CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAG > NC_000913/3152152‑3152333
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTT > NC_000913/3152154‑3152340
|
ATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCC > SRR4302532.1723253/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCC > SRR4302532.399445/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑CTTT‑CCC > SRR4302532.5575070/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCC > SRR4302532.1775417/1‑94 (MQ=60)
TGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCC < SRR4302532.109175/94‑1 (MQ=60)
TGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCC < SRR4302532.2870386/94‑1 (MQ=60)
TGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCC < SRR4302532.1817155/94‑1 (MQ=60)
GATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCcg > SRR4302532.4613735/1‑92 (MQ=60)
GATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCcg > SRR4302532.5451086/1‑92 (MQ=60)
GATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCcg < SRR4302532.5179704/94‑3 (MQ=60)
TCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTT > SRR4302532.734091/1‑94 (MQ=60)
CTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTTGCTTGGTAGGCACGCTGTTTTTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCcgtttc > SRR4302532.4933860/1‑88 (MQ=60)
CTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCC > SRR4302532.5025114/1‑94 (MQ=60)
CTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCC > SRR4302532.3952347/1‑94 (MQ=60)
GCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCG < SRR4302532.3630505/94‑1 (MQ=60)
GCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCG < SRR4302532.3630504/94‑1 (MQ=60)
GCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCCTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCG > SRR4302532.977199/1‑94 (MQ=60)
CCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGGCTGACGC‑TTTTCCCCGTTTCCGG > SRR4302532.510890/1‑94 (MQ=60)
CCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCCG > SRR4302532.2606677/1‑94 (MQ=60)
CAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTCGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGCTCCCGGT > SRR4302532.556746/1‑94 (MQ=60)
CAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGT > SRR4302532.837644/1‑94 (MQ=60)
CAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGT > SRR4302532.1158152/1‑94 (MQ=60)
TGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCT > SRR4302532.2375481/1‑94 (MQ=60)
GCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTG > SRR4302532.3347599/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTA < SRR4302532.1715/94‑1 (MQ=60)
CTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTA < SRR4302532.2285075/94‑1 (MQ=60)
CTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTA > SRR4302532.1154295/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTC > SRR4302532.3983303/1‑94 (MQ=60)
TTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTAC > SRR4302532.3343835/1‑94 (MQ=60)
TGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACC > SRR4302532.3385986/1‑94 (MQ=60)
taTAACCGCTGGTTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTCCCG < SRR4302532.754183/92‑1 (MQ=60)
GTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCG < SRR4302532.3993782/94‑1 (MQ=60)
TTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGG < SRR4302532.6057365/94‑1 (MQ=60)
TTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGG < SRR4302532.2301889/94‑1 (MQ=60)
TTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGG < SRR4302532.5712307/94‑1 (MQ=60)
TAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGG < SRR4302532.1479186/94‑1 (MQ=60)
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CGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACG > SRR4302532.5447229/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCccgtgccggctgatgtaccgggaacg > SRR4302532.5756183/1‑68 (MQ=60)
CGCTGGCTTGTTACGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACG < SRR4302532.2912453/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTT‑CCCGTTTCCTGTTGCTGTtcccggaaaggt > SRR4302532.3771459/1‑82 (MQ=60)
CTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTTCCGGGTGCTGGACCGGGAACGct > SRR4302532.1830601/1‑92 (MQ=60)
GGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATT < SRR4302532.3728675/94‑1 (MQ=60)
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GGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATT < SRR4302532.531001/94‑1 (MQ=60)
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TGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAAT > SRR4302532.2233959/1‑94 (MQ=60)
GTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGACT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATT < SRR4302532.3612169/94‑1 (MQ=60)
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TTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTC < SRR4302532.1122833/94‑1 (MQ=60)
AGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCC > SRR4302532.2313318/1‑94 (MQ=60)
GGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCC < SRR4302532.4529906/94‑1 (MQ=60)
GCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCT > SRR4302532.5940698/1‑94 (MQ=60)
GCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCT < SRR4302532.2041406/94‑1 (MQ=60)
CACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTTCCCGTTGCTGTACCcggcacggattttatttccccg > SRR4302532.2552228/1‑72 (MQ=60)
GCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCAT > SRR4302532.1810575/1‑94 (MQ=60)
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GCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGGTGCTGTACCGGGGACGTATTTTATTTCCCTGCAT > SRR4302532.5605272/1‑94 (MQ=60)
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GTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATT > SRR4302532.5567778/1‑94 (MQ=60)
GTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATT < SRR4302532.1103886/94‑1 (MQ=60)
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ATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCCTTCTT > SRR4302532.4817815/1‑94 (MQ=60)
TT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTG > SRR4302532.1182113/1‑94 (MQ=60)
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AAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGGTGCTGTACCGGGGACGTATTTAATTTCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCG > SRR4302532.36508/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGC < SRR4302532.3146538/94‑1 (MQ=60)
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CTGTAACGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCC < SRR4302532.4813047/94‑1 (MQ=60)
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CGCCTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCTCGGCGT > SRR4302532.2279755/1‑94 (MQ=60)
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CTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCAC > SRR4302532.3218119/1‑94 (MQ=60)
CTGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCAC > SRR4302532.3218118/1‑94 (MQ=60)
TGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGGACGGATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCCGCGTCACC > SRR4302532.3703313/1‑94 (MQ=60)
TGACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACA > SRR4302532.2360638/1‑94 (MQ=60)
GACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAC > SRR4302532.1966199/1‑94 (MQ=60)
GACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAC > SRR4302532.2076131/1‑94 (MQ=60)
GACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAC > SRR4302532.1733819/1‑94 (MQ=60)
GACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAC > SRR4302532.6046832/1‑94 (MQ=60)
ACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACC < SRR4302532.4650045/94‑1 (MQ=60)
ACGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACC < SRR4302532.621558/94‑1 (MQ=60)
CGA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCG < SRR4302532.2039920/94‑1 (MQ=60)
GA‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCcccaccccga > SRR4302532.702320/1‑84 (MQ=60)
A‑TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAA < SRR4302532.1235983/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAG < SRR4302532.1004963/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAG < SRR4302532.4221241/94‑1 (MQ=60)
C‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTTCCCCGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCCAAGGAAC > SRR4302532.409708/1‑94 (MQ=60)
C‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAAC < SRR4302532.4202504/94‑1 (MQ=60)
C‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAAC > SRR4302532.2178675/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACG < SRR4302532.6189633/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACG < SRR4302532.4310939/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACG < SRR4302532.5520654/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGT > SRR4302532.2817819/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGT > SRR4302532.5835760/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTT > SRR4302532.4191277/1‑94 (MQ=60)
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ATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGA‑TTTT‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTT > NC_000913/3152154‑3152340
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
