Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,930,457 |
Δ1 bp |
coding (1515/1560 nt) |
kup → |
low affinity potassium transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,930,457 | 0 | C | . | 99.6%
| 1155.8
/ ‑2.9
| 250 | coding (1515/1560 nt) | kup | low affinity potassium transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base . (134/114); total (136/114) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > NC_000913/3930369‑3930544
|
ccGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTc > 2:1917157/1‑93 (MQ=255)
ccGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGAATTGCATGAGCGGGT‑GATTc > 2:294583/1‑93 (MQ=255)
cgcgGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCt < 2:3789087/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTg > 1:4849448/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTg < 1:570503/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTg > 1:2643009/1‑93 (MQ=255)
cgGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGt < 2:5783797/93‑1 (MQ=255)
cgGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGt < 1:1002147/93‑1 (MQ=255)
ggTGTATATGTCGCGTGCAAACAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGtt > 1:5933859/1‑93 (MQ=255)
tgtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTaa < 2:830764/93‑1 (MQ=255)
tgtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTaa < 1:3288429/93‑1 (MQ=255)
tgtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTaa < 2:2108224/93‑1 (MQ=255)
gtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAc < 2:2519405/93‑1 (MQ=255)
tataTGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAct < 1:463187/93‑1 (MQ=255)
atatGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAActc < 1:5124965/93‑1 (MQ=255)
atatGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAActc < 1:2869060/93‑1 (MQ=255)
tatGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAActct < 2:3575662/93‑1 (MQ=255)
tatGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAActct > 2:6085539/1‑93 (MQ=255)
atGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTg > 2:4926064/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCGTGCAATCAACGTCATGCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgc < 1:2758493/93‑1 (MQ=255)
ttCGCGTGCAATCAACGTCATACCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcg < 1:1766827/92‑1 (MQ=255)
gTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcg < 1:4059263/93‑1 (MQ=255)
cgcgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCa < 1:1716879/93‑1 (MQ=255)
gcgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAc > 1:2031228/1‑93 (MQ=255)
cgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAcc < 2:1273214/93‑1 (MQ=255)
gTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCg > 1:6072617/1‑93 (MQ=255)
gTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGAATGAGCGGG‑GGATTCTGTTATCTCTGCGCACCg > 1:5198224/1‑93 (MQ=255)
gCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGaa > 1:924183/1‑93 (MQ=255)
cAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAg > 1:4524516/1‑93 (MQ=255)
aaTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGa < 1:816498/93‑1 (MQ=255)
aaTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGa > 2:1317254/1‑93 (MQ=255)
aaTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGa < 2:3142714/93‑1 (MQ=255)
aTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAc > 1:4465348/1‑93 (MQ=255)
tCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACg > 2:5351662/1‑93 (MQ=255)
tCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACg > 1:2321680/1‑93 (MQ=255)
gTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCa < 2:168651/93‑1 (MQ=255)
gTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCa < 2:4784159/93‑1 (MQ=255)
tCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCat > 2:2239179/1‑93 (MQ=255)
cATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCata < 2:5021501/93‑1 (MQ=255)
aTTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCatat > 1:4911834/1‑93 (MQ=255)
ttCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATg > 2:553619/1‑93 (MQ=255)
ttCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATg > 1:617606/1‑93 (MQ=255)
tCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGt > 2:1119345/1‑93 (MQ=255)
cccTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTc > 1:5342043/1‑93 (MQ=255)
cccTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTc > 2:1483043/1‑93 (MQ=255)
cccTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTc > 2:4277227/1‑93 (MQ=255)
ccTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTcc > 2:5251863/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAt < 2:3281695/93‑1 (MQ=255)
tttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAt < 1:15303/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATa < 2:5997185/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATa > 2:1026651/1‑93 (MQ=255)
gcTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgt < 1:1981892/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgt > 2:4863855/1‑93 (MQ=255)
cTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtc < 2:5098904/93‑1 (MQ=255)
cTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtc < 2:4095136/93‑1 (MQ=255)
cTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtc < 1:4338072/93‑1 (MQ=255)
cTGATGCATAACATTGAACTTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAAAAcgtc < 1:5480545/93‑1 (MQ=255)
tGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtcc > 1:3912705/1‑93 (MQ=255)
gATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccg > 2:3701098/1‑93 (MQ=255)
aTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgt > 1:4676925/1‑93 (MQ=255)
aTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgt < 1:2786929/93‑1 (MQ=255)
tGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgtc < 2:4011328/93‑1 (MQ=255)
gCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCg > 2:2889244/1‑93 (MQ=255)
gCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCg > 1:1377534/1‑93 (MQ=255)
gCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGCCCATAACGTCCGTCg > 2:1576469/1‑93 (MQ=255)
aTAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAAGATCCATATGTCCATAACGTCCGTCggg > 1:2612825/1‑93 (MQ=255)
tAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCgggg > 1:3643373/1‑92 (MQ=255)
tAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGt < 1:1210702/93‑1 (MQ=255)
aaCCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTa > 1:5512409/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTa > 2:4050498/1‑93 (MQ=255)
ccTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACa > 2:2006334/1‑93 (MQ=255)
ccTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACa > 1:507216/1‑93 (MQ=255)
ccTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACa < 2:4383471/93‑1 (MQ=255)
cTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAg < 1:3798391/93‑1 (MQ=255)
ttAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGa < 2:2178476/93‑1 (MQ=255)
tAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAt > 1:1336969/1‑93 (MQ=255)
tAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAt < 1:2214363/93‑1 (MQ=255)
aaaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAtt < 1:1548664/93‑1 (MQ=255)
aCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGa > 1:5723599/1‑93 (MQ=255)
aCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGa > 2:631857/1‑93 (MQ=255)
aTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaac > 1:370103/1‑93 (MQ=255)
aTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaac < 1:6003088/93‑1 (MQ=255)
aTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaaa > 1:4263097/1‑92 (MQ=255)
tAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaaca > 2:3093164/1‑93 (MQ=255)
cAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACt > 1:2802295/1‑93 (MQ=255)
aaGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTg > 1:4113097/1‑93 (MQ=255)
aGGTAGTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTACCTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGt < 2:41471/93‑1 (MQ=255)
ggTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTc < 2:5881495/93‑1 (MQ=255)
ggTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTc < 2:4463137/93‑1 (MQ=255)
ggTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTc < 2:1429490/93‑1 (MQ=255)
tATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGc > 2:261449/1‑93 (MQ=255)
gCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCAc < 2:3518813/93‑1 (MQ=255)
cATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACt > 2:4588642/1‑93 (MQ=255)
gAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTc < 2:3928831/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTTCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCGACTTTCt > 1:3478117/1‑93 (MQ=255)
aGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCt > 1:4317281/1‑93 (MQ=255)
gCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTg < 1:5310395/93‑1 (MQ=255)
gCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTg > 1:849301/1‑93 (MQ=255)
gCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTg < 1:3630622/93‑1 (MQ=255)
gCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTg > 1:238399/1‑93 (MQ=255)
|
CCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > NC_000913/3930369‑3930544
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC > NC_000913/3930364‑3930548
|
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTG < SRR4302532.460306/94‑1 (MQ=60)
GGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GAT < SRR4302532.5441319/94‑1 (MQ=60)
GGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GAT > SRR4302532.331352/1‑94 (MQ=60)
GACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATT > SRR4302532.5540013/1‑94 (MQ=60)
GACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATT < SRR4302532.1110918/94‑1 (MQ=60)
GACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATT > SRR4302532.4134637/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTG > SRR4302532.5016352/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTG > SRR4302532.4090156/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTG > SRR4302532.3439646/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTG > SRR4302532.2731647/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGT < SRR4302532.590412/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTT < SRR4302532.1036263/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTT > SRR4302532.2791587/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTATATGTCGCGTGCAAACAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTT > SRR4302532.6139240/1‑94 (MQ=60)
GGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTA > SRR4302532.1353774/1‑94 (MQ=60)
GTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAA > SRR4302532.4739565/1‑94 (MQ=60)
GTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAA > SRR4302532.1825235/1‑94 (MQ=60)
TGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAC < SRR4302532.3397817/94‑1 (MQ=60)
GTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACT < SRR4302532.1492871/94‑1 (MQ=60)
GTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACT > SRR4302532.3298344/1‑94 (MQ=60)
GTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACT > SRR4302532.1608219/1‑94 (MQ=60)
GTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACT > SRR4302532.3704727/1‑94 (MQ=60)
TATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTC > SRR4302532.1287232/1‑94 (MQ=60)
TATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTC < SRR4302532.479313/94‑1 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT < SRR4302532.5301262/94‑1 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT < SRR4302532.2965015/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGC < SRR4302532.4224463/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGC < SRR4302532.5583319/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCGTGCAATCAACGTCATGCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCG < SRR4302532.2851113/94‑1 (MQ=60)
TTCGCGTGCAATCAACGTCATACCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGC < SRR4302532.1826038/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGC < SRR4302532.4195725/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAC > SRR4302532.2098926/1‑94 (MQ=60)
CGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAC < SRR4302532.1774745/94‑1 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG < SRR4302532.5713612/94‑1 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG > SRR4302532.6275698/1‑94 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG > SRR4302532.6282340/1‑94 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG > SRR4302532.4940671/1‑94 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGAATGAGCGGG‑GGATTCTGTTATCTCTGCGCACCG > SRR4302532.5377441/1‑94 (MQ=60)
GTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGA < SRR4302532.5275076/94‑1 (MQ=60)
TGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAA > SRR4302532.955855/1‑94 (MQ=60)
GCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAG > SRR4302532.4678962/1‑94 (MQ=60)
CAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGA > SRR4302532.3918514/1‑94 (MQ=60)
CAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGA > SRR4302532.4058961/1‑94 (MQ=60)
CAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGA > SRR4302532.1932344/1‑94 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC < SRR4302532.2051016/94‑1 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC < SRR4302532.856359/94‑1 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC < SRR4302532.844346/94‑1 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC > SRR4302532.4617577/1‑94 (MQ=60)
ATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACG > SRR4302532.2398939/1‑94 (MQ=60)
TCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGC < SRR4302532.3563174/94‑1 (MQ=60)
TCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGG‑GGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGACGACGC > SRR4302532.2310877/1‑94 (MQ=60)
CGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCA < SRR4302532.5036903/94‑1 (MQ=60)
GTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCAT < SRR4302532.2860582/94‑1 (MQ=60)
TCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATA > SRR4302532.2885088/1‑94 (MQ=60)
TCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATA > SRR4302532.4577809/1‑94 (MQ=60)
CATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATAT > SRR4302532.5080606/1‑94 (MQ=60)
ATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATG > SRR4302532.639123/1‑94 (MQ=60)
TCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTC > SRR4302532.5527379/1‑94 (MQ=60)
TCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTC > SRR4302532.2498303/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCC > SRR4302532.4473613/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCC > SRR4302532.696862/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCA > SRR4302532.5099154/1‑94 (MQ=60)
TTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATA < SRR4302532.15924/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAC < SRR4302532.5777992/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACG > SRR4302532.910100/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACG < SRR4302532.6154539/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGT > SRR4302532.1017965/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGC > SRR4302532.2213451/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTC < SRR4302532.2047744/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCC < SRR4302532.3892143/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCC < SRR4302532.4484602/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCC > SRR4302532.4044587/1‑94 (MQ=60)
CTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCC < SRR4302532.2323442/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCATAACATTGAACTTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAAAACGTCC < SRR4302532.5670569/94‑1 (MQ=60)
TGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCG < SRR4302532.6224045/94‑1 (MQ=60)
TGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCG > SRR4302532.4671815/1‑94 (MQ=60)
GATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGT > SRR4302532.4836381/1‑94 (MQ=60)
GATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGT < SRR4302532.5114685/94‑1 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC > SRR4302532.2418095/1‑94 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC < SRR4302532.4465607/94‑1 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC < SRR4302532.2880399/94‑1 (MQ=60)
TGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGCCGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCG > SRR4302532.5465698/1‑94 (MQ=60)
TGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCG > SRR4302532.1423706/1‑94 (MQ=60)
TGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCG > SRR4302532.6284435/1‑94 (MQ=60)
GCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGG < SRR4302532.5497551/94‑1 (MQ=60)
CATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGG > SRR4302532.2665670/1‑94 (MQ=60)
CATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGG < SRR4302532.4498693/94‑1 (MQ=60)
CATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAAGATCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGG > SRR4302532.2700230/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGT > SRR4302532.330161/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGG > SRR4302532.3765623/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGA > SRR4302532.3765622/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCCGGT > SRR4302532.2228772/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGAACCGAAGACGCTCCATATGTGCATAAAGTCCGTCGGGT > SRR4302532.408258/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTA > SRR4302532.5703697/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTA < SRR4302532.1251204/94‑1 (MQ=60)
AACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTAC < SRR4302532.2829082/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACA > SRR4302532.524939/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACA > SRR4302532.2700791/1‑94 (MQ=60)
CCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAG < SRR4302532.1106826/94‑1 (MQ=60)
CTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGA > SRR4302532.159252/1‑94 (MQ=60)
CTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGA > SRR4302532.5353535/1‑94 (MQ=60)
CTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGA < SRR4302532.3926566/94‑1 (MQ=60)
CTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAACGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGC > SRR4302532.5353536/1‑94 (MQ=60)
TTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAT > SRR4302532.1381688/1‑94 (MQ=60)
TAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATT < SRR4302532.2287922/94‑1 (MQ=60)
AAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTG < SRR4302532.1998472/94‑1 (MQ=60)
AAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTG < SRR4302532.1600995/94‑1 (MQ=60)
AACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGA > SRR4302532.5943698/1‑94 (MQ=60)
AACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGA > SRR4302532.5922949/1‑94 (MQ=60)
AACATAACAAGGGATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAAGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGCACTGATTGA > SRR4302532.4419645/1‑94 (MQ=60)
ACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAA < SRR4302532.713823/94‑1 (MQ=60)
CATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAC > SRR4302532.382965/1‑94 (MQ=60)
CATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAA > SRR4302532.4406548/1‑94 (MQ=60)
ATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACA < SRR4302532.6210405/94‑1 (MQ=60)
ACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACT < SRR4302532.3962278/94‑1 (MQ=60)
ACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACT < SRR4302532.5540662/94‑1 (MQ=60)
ACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACT > SRR4302532.2896184/1‑94 (MQ=60)
ACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACT > SRR4302532.4376417/1‑94 (MQ=60)
ACAAGGTATTGCATGAGCGAGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGAGTACAGATTGAACCACT < SRR4302532.5678841/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTG > SRR4302532.4251163/1‑94 (MQ=60)
CAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTG > SRR4302532.482396/1‑94 (MQ=60)
AGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTC < SRR4302532.872559/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCG < SRR4302532.1481818/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCG < SRR4302532.4254970/94‑1 (MQ=60)
ATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCC > SRR4302532.2884552/1‑94 (MQ=60)
ATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCC < SRR4302532.6041252/94‑1 (MQ=60)
ATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTT > SRR4302532.1712843/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCT < SRR4302532.1383811/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTTCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCGACTTTCT > SRR4302532.3594617/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCCCTTTCT < SRR4302532.2906772/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCT > SRR4302532.4463221/1‑94 (MQ=60)
AGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG < SRR4302532.4923052/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG < SRR4302532.591325/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > SRR4302532.3771210/1‑94 (MQ=60)
AGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > SRR4302532.878518/1‑94 (MQ=60)
AGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG < SRR4302532.5464790/94‑1 (MQ=60)
AGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > SRR4302532.246609/1‑94 (MQ=60)
GCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGG < SRR4302532.3752398/94‑1 (MQ=60)
GCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGG < SRR4302532.3752399/94‑1 (MQ=60)
GCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGG < SRR4302532.5494034/94‑1 (MQ=60)
CGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGC > SRR4302532.3361186/1‑94 (MQ=60)
CGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGC < SRR4302532.4608740/94‑1 (MQ=60)
CGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGC < SRR4302532.5017213/94‑1 (MQ=60)
GGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGTCG > SRR4302532.6338097/1‑94 (MQ=60)
GGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCG > SRR4302532.2648057/1‑94 (MQ=60)
GGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCG > SRR4302532.3695720/1‑94 (MQ=60)
GGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCG > SRR4302532.1252054/1‑94 (MQ=60)
GGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGCTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCG < SRR4302532.4393252/94‑1 (MQ=60)
GGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC > SRR4302532.5793815/1‑94 (MQ=60)
GGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC > SRR4302532.1178858/1‑94 (MQ=60)
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CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC > NC_000913/3930364‑3930548
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
