Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,930,457 |
Δ1 bp |
coding (1515/1560 nt) |
kup → |
low affinity potassium transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,930,457 | 0 | C | . | 99.6%
| 1201.8
/ ‑2.2
| 258 | coding (1515/1560 nt) | kup | low affinity potassium transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base . (127/129); total (129/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
CCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > NC_000913/3930369‑3930544
|
ccGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTc < 2:5911068/93‑1 (MQ=255)
ggTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGtt > 1:2817561/1‑93 (MQ=255)
gtgtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTa > 2:5324079/1‑93 (MQ=255)
tgtATATGTCGCGTGTAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTaa < 1:4959799/93‑1 (MQ=255)
tgtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTaa < 1:1229007/93‑1 (MQ=255)
tgtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTaa > 2:5922863/1‑93 (MQ=255)
gtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAc > 2:5279800/1‑93 (MQ=255)
gtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAc < 1:3239941/93‑1 (MQ=255)
gtATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAc < 2:3525494/93‑1 (MQ=255)
tataTGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAct > 2:2835672/1‑93 (MQ=255)
tatGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGTTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAActct > 1:3716017/1‑93 (MQ=255)
tatGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAActct > 1:3579871/1‑93 (MQ=255)
atGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTg > 2:132193/1‑93 (MQ=255)
atGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTg > 1:683247/1‑93 (MQ=255)
atGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGACCGGGT‑GATTCTTTTAACTCTg < 2:3627656/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcg > 2:2499377/1‑93 (MQ=255)
gTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcg < 1:1729687/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcg > 1:4645671/1‑93 (MQ=255)
tCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcgc > 1:2585495/1‑93 (MQ=255)
tCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTgcgc < 2:3005524/93‑1 (MQ=255)
gcgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAc > 1:6065460/1‑93 (MQ=255)
gcgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAc < 2:3313278/93‑1 (MQ=255)
gcgTGCAATAAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAc > 1:6241595/1‑93 (MQ=255)
cgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAcc > 1:3885259/1‑93 (MQ=255)
cgTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAcc > 2:4128927/1‑93 (MQ=255)
gTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCg > 1:3926360/1‑93 (MQ=255)
gCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGaa > 1:2248763/1‑93 (MQ=255)
cAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAg < 1:3363507/93‑1 (MQ=255)
aaTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGa < 1:6335325/93‑1 (MQ=255)
aTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAc > 1:5442601/1‑93 (MQ=255)
tCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACg < 1:3864343/93‑1 (MQ=255)
tCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACg > 1:4459124/1‑93 (MQ=255)
tCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACg > 2:4582619/1‑93 (MQ=255)
cAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGc < 2:4701473/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCt < 1:5919678/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCt > 2:845729/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCt > 1:2143226/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCt > 2:399355/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCt > 1:2453644/1‑93 (MQ=255)
aCGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTc > 2:6275995/1‑93 (MQ=255)
cATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCata < 2:5753167/93‑1 (MQ=255)
cATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCata < 1:5620311/93‑1 (MQ=255)
cATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCata < 1:4307119/93‑1 (MQ=255)
aTTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCatat > 2:2351415/1‑93 (MQ=255)
ccTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTcc < 2:6550177/93‑1 (MQ=255)
cTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCa > 2:4809374/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCa < 2:1115164/93‑1 (MQ=255)
tttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAt > 1:1073556/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATa < 2:611556/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATa > 2:125172/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATaa < 1:310169/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAc < 2:6057230/93‑1 (MQ=255)
cTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtc < 2:3045395/93‑1 (MQ=255)
tGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtcc < 2:677835/93‑1 (MQ=255)
tGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGG‑CGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtcc > 1:6439582/1‑93 (MQ=255)
aTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgt > 1:480792/1‑93 (MQ=255)
aTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgt < 1:3312246/93‑1 (MQ=255)
aTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgt < 1:5080086/93‑1 (MQ=255)
aTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgt < 2:6625362/93‑1 (MQ=255)
tGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgtc < 2:3880362/93‑1 (MQ=255)
tGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgtc > 2:1750756/1‑93 (MQ=255)
tGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgtc > 2:2199876/1‑93 (MQ=255)
tGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAcgtccgtc > 1:182641/1‑93 (MQ=255)
gCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCg > 2:3383754/1‑93 (MQ=255)
aTAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCggg > 1:6115710/1‑93 (MQ=255)
tAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGt > 1:4423235/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTa > 2:1485665/1‑93 (MQ=255)
aCCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTAc > 2:3718833/1‑93 (MQ=255)
cTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAg > 2:1031665/1‑93 (MQ=255)
cTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAg < 1:6603816/93‑1 (MQ=255)
cTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAg > 1:5540804/1‑93 (MQ=255)
ttAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGa > 2:2249907/1‑93 (MQ=255)
aaaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAtt > 1:2666160/1‑93 (MQ=255)
aaaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAtt > 2:5840560/1‑93 (MQ=255)
aaaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAtt < 2:323053/93‑1 (MQ=255)
aaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAtta > 1:1449851/1‑92 (MQ=255)
aaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTg > 2:936555/1‑93 (MQ=255)
aaCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTg > 1:1308513/1‑93 (MQ=255)
aCATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCCTATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGa > 2:4498833/1‑93 (MQ=255)
aTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaac > 2:2577256/1‑93 (MQ=255)
aTAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaac < 1:375487/93‑1 (MQ=255)
tAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaaca > 2:5233215/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaacaa < 1:5535251/93‑1 (MQ=255)
aaCAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGaacaa < 1:893986/93‑1 (MQ=255)
cAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACt > 2:1940820/1‑93 (MQ=255)
cAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACt > 1:192617/1‑93 (MQ=255)
aaGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTg > 1:5472593/1‑93 (MQ=255)
aGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGt < 2:2032830/93‑1 (MQ=255)
aGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGt > 1:4910471/1‑93 (MQ=255)
aGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGt < 1:637812/93‑1 (MQ=255)
tATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGc < 1:5323568/93‑1 (MQ=255)
aTTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGcc < 1:2527758/93‑1 (MQ=255)
tGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCa > 2:1514090/1‑93 (MQ=255)
gCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCAc < 2:5051418/93‑1 (MQ=255)
gCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCAc < 2:1534758/93‑1 (MQ=255)
cATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAGAACTGTCGACCACt > 1:4188106/1‑93 (MQ=255)
tGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACttt > 2:4328804/1‑93 (MQ=255)
tGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGGACAGATTGAACAACTGTCGCCCACttt > 2:5496254/1‑93 (MQ=255)
gAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTc > 1:3495252/1‑93 (MQ=255)
gAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTc < 2:27187/93‑1 (MQ=255)
|
CCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTG > NC_000913/3930369‑3930544
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC > NC_000913/3930364‑3930548
|
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTG < SRR4302547.5341113/94‑1 (MQ=60)
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTG > SRR4302547.3429153/1‑94 (MQ=60)
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTG > SRR4302547.1684951/1‑94 (MQ=60)
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTG > SRR4302547.3768077/1‑94 (MQ=60)
CCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCT < SRR4302547.5715623/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTG < SRR4302547.2134919/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGT > SRR4302547.5862217/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTATATGTCGCGTGCACTCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTT > SRR4302547.6618061/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTT > SRR4302547.2873924/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTT > SRR4302547.6478789/1‑94 (MQ=60)
GGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTA < SRR4302547.551472/94‑1 (MQ=60)
GGTGTATATGTCGCGGGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCACTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGCATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGATA > SRR4302547.6228661/1‑94 (MQ=60)
TGTATATGTCGCGTGTAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAC < SRR4302547.5062432/94‑1 (MQ=60)
TGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAAC < SRR4302547.1253800/94‑1 (MQ=60)
GTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACT < SRR4302547.3304615/94‑1 (MQ=60)
TATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTC < SRR4302547.563967/94‑1 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGTTGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT > SRR4302547.3791862/1‑94 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT < SRR4302547.980127/94‑1 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT < SRR4302547.5492828/94‑1 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT > SRR4302547.3652899/1‑94 (MQ=60)
ATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACACAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCT < SRR4302547.2693999/94‑1 (MQ=60)
TATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTG > SRR4302547.6291440/1‑94 (MQ=60)
TATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTG < SRR4302547.6164468/94‑1 (MQ=60)
TATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTG > SRR4302547.695863/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCG > SRR4302547.4741878/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGC > SRR4302547.2637664/1‑94 (MQ=60)
GTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGC < SRR4302547.1763663/94‑1 (MQ=60)
TCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCA < SRR4302547.4441139/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAC > SRR4302547.6191271/1‑94 (MQ=60)
CGCGTGCAATCAACGTCAGTCCCTATGCGCTGATGCATAACCTTAAACATACCAAGGTATTGCATGATCGTGT‑GATTCTGTTAACCCTGCGCAC < SRR4302547.4408554/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGCAATAAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCAC > SRR4302547.6371257/1‑94 (MQ=60)
GCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACC > SRR4302547.3964293/1‑94 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG > SRR4302547.4006208/1‑94 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG < SRR4302547.4292872/94‑1 (MQ=60)
CGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCG < SRR4302547.4969073/94‑1 (MQ=60)
TGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACTGAA > SRR4302547.2915267/1‑94 (MQ=60)
TGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAA > SRR4302547.2294161/1‑94 (MQ=60)
GCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAG < SRR4302547.3520174/94‑1 (MQ=60)
CAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGA < SRR4302547.3431793/94‑1 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC < SRR4302547.3632409/94‑1 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC < SRR4302547.6467234/94‑1 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC > SRR4302547.4712049/1‑94 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC > SRR4302547.319015/1‑94 (MQ=60)
AATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAC > SRR4302547.5555067/1‑94 (MQ=60)
ATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACG > SRR4302547.4551294/1‑94 (MQ=60)
ATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGAAG > SRR4302547.5575792/1‑94 (MQ=60)
TCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGC < SRR4302547.3942967/94‑1 (MQ=60)
CAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCT > SRR4302547.4852118/1‑94 (MQ=60)
CAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCT < SRR4302547.2533157/94‑1 (MQ=60)
CAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCT > SRR4302547.2503230/1‑94 (MQ=60)
CAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCT > SRR4302547.4473167/1‑94 (MQ=60)
CAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCT > SRR4302547.2185978/1‑94 (MQ=60)
CAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCT < SRR4302547.5611961/94‑1 (MQ=60)
AACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTC < SRR4302547.6042362/94‑1 (MQ=60)
AACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTC > SRR4302547.2475275/1‑94 (MQ=60)
CGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCA < SRR4302547.3857651/94‑1 (MQ=60)
CGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCA < SRR4302547.5714808/94‑1 (MQ=60)
GTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCAT < SRR4302547.6467840/94‑1 (MQ=60)
GTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCAT < SRR4302547.2630498/94‑1 (MQ=60)
TCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATA < SRR4302547.1446060/94‑1 (MQ=60)
CATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATAT < SRR4302547.2813055/94‑1 (MQ=60)
CATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATAT < SRR4302547.5736297/94‑1 (MQ=60)
CATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATAT < SRR4302547.4395722/94‑1 (MQ=60)
ATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATG > SRR4302547.255194/1‑94 (MQ=60)
ATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATG < SRR4302547.6236466/94‑1 (MQ=60)
TTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGT < SRR4302547.2299062/94‑1 (MQ=60)
TTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGT > SRR4302547.3890647/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTGCGCTGATGCATAGCCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCC < SRR4302547.6702577/94‑1 (MQ=60)
CCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCC < SRR4302547.5017715/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAT < SRR4302547.3792903/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAT > SRR4302547.1094977/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCAT < SRR4302547.3581205/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAC < SRR4302547.4239962/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAAC < SRR4302547.315942/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTTTGCCCACCGAAGACGCCCCTAATTTCCATAACG > SRR4302547.5366691/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACG < SRR4302547.6542639/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTC > SRR4302547.4530744/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTC < SRR4302547.638775/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCACGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTC > SRR4302547.5061364/1‑94 (MQ=60)
CTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGG‑CGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCC > SRR4302547.6573775/1‑94 (MQ=60)
CTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGG‑AGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCC > SRR4302547.3395338/1‑94 (MQ=60)
GATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGT > SRR4302547.489617/1‑94 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC < SRR4302547.3379045/94‑1 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC < SRR4302547.5184900/94‑1 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC < SRR4302547.473274/94‑1 (MQ=60)
ATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTC > SRR4302547.186070/1‑94 (MQ=60)
GCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGG < SRR4302547.4234830/94‑1 (MQ=60)
GCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGG > SRR4302547.3748323/1‑94 (MQ=60)
GCATAACCTAAAACATAAAAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGG < SRR4302547.5290586/94‑1 (MQ=60)
CATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGG > SRR4302547.6242571/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGT > SRR4302547.4514611/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGT > SRR4302547.5180864/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGT > SRR4302547.3967893/1‑94 (MQ=60)
TAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTA < SRR4302547.1865580/94‑1 (MQ=60)
AACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTAC < SRR4302547.726289/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACA > SRR4302547.706438/1‑94 (MQ=60)
CCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAG > SRR4302547.5655159/1‑94 (MQ=60)
CTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGA < SRR4302547.6741281/94‑1 (MQ=60)
TTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAT > SRR4302547.2938456/1‑94 (MQ=60)
TTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGAT < SRR4302547.1824735/94‑1 (MQ=60)
TAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATT > SRR4302547.2719733/1‑94 (MQ=60)
TAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATT < SRR4302547.3955036/94‑1 (MQ=60)
AAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTG > SRR4302547.1334828/1‑94 (MQ=60)
AAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTG < SRR4302547.1301959/94‑1 (MQ=60)
AAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTG < SRR4302547.4663150/94‑1 (MQ=60)
AAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTA > SRR4302547.1478846/1‑94 (MQ=60)
ACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAA < SRR4302547.3970344/94‑1 (MQ=60)
CATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAC < SRR4302547.2161859/94‑1 (MQ=60)
CATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAC < SRR4302547.1613500/94‑1 (MQ=60)
CATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAC < SRR4302547.1512735/94‑1 (MQ=60)
CATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAC > SRR4302547.6766143/1‑94 (MQ=60)
ATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACA < SRR4302547.382445/94‑1 (MQ=60)
AACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAAC < SRR4302547.911174/94‑1 (MQ=60)
AACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAAC > SRR4302547.6384315/1‑94 (MQ=60)
AACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAAA < SRR4302547.5649491/94‑1 (MQ=60)
ACAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACT > SRR4302547.196226/1‑94 (MQ=60)
CAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTG > SRR4302547.1250273/1‑94 (MQ=60)
CAAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTG > SRR4302547.5585640/1‑94 (MQ=60)
AAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGT > SRR4302547.5012155/1‑94 (MQ=60)
AAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGT > SRR4302547.1853398/1‑94 (MQ=60)
AAGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCAAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGT < SRR4302547.3276733/94‑1 (MQ=60)
AGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTC < SRR4302547.649592/94‑1 (MQ=60)
AGGTATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTC < SRR4302547.2686215/94‑1 (MQ=60)
TATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCC < SRR4302547.5433307/94‑1 (MQ=60)
ATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCC < SRR4302547.2265940/94‑1 (MQ=60)
ATTGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCC < SRR4302547.2578846/94‑1 (MQ=60)
TGCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCAC > SRR4302547.330845/1‑94 (MQ=60)
CCATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAAGAACTGTCGACCACT > SRR4302547.4273499/1‑94 (MQ=60)
CATGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTT > SRR4302547.5741840/1‑94 (MQ=60)
TGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGCACAACTGTCGCCCACTTTC > SRR4302547.3382165/1‑94 (MQ=60)
TGAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTC > SRR4302547.3566583/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCT < SRR4302547.1289334/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCT < SRR4302547.3655305/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCT > SRR4302547.5636423/1‑94 (MQ=60)
CGGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGC > SRR4302547.3381335/1‑94 (MQ=60)
GGGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCG < SRR4302547.1622043/94‑1 (MQ=60)
GGT‑GATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC < SRR4302547.4192004/94‑1 (MQ=60)
|
CGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTCGATTCTGTTAACTCTGCGCACCGAAGACGCTCCATATGTCCATAACGTCCGTCGGGTACAGATTGAACAACTGTCGCCCACTTTCTGGCGC > NC_000913/3930364‑3930548
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
