Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,013,176 |
C→G |
G182R (GGA→CGA) |
ysgA ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,013,176 | 0 | C | G | 99.5%
| 772.0
/ ‑4.6
| 216 | G182R (GGA→CGA) | ysgA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (114/101); minor base A (1/0); total (115/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > NC_000913/4013092‑4013260
|
ttAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGGCGAGAATCGGCGCGTTa > 1:5731797/1‑93 (MQ=255)
agcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAg < 2:5151982/93‑1 (MQ=255)
cagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGAt < 1:5008949/93‑1 (MQ=255)
agcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATc < 1:1184297/93‑1 (MQ=255)
gcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCg > 2:1641810/1‑93 (MQ=255)
gcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCg < 2:5864933/93‑1 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg > 1:1115129/1‑93 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg > 2:228179/1‑93 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg < 1:3100473/93‑1 (MQ=255)
ccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGt > 2:4585038/1‑93 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt > 2:5316778/1‑93 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 1:2979991/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTg > 2:5955879/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGc > 1:5878407/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGc < 2:539669/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGa < 2:3575168/93‑1 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGTTTTCACCCTTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGCCCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGata < 1:2410790/93‑1 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGata < 1:4872544/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGatat < 2:4979792/93‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGatat > 2:586273/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATc > 1:1822659/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCa > 1:4585146/1‑93 (MQ=255)
gcgcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAAc < 2:1941545/93‑1 (MQ=255)
gcgcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAAc < 2:95904/93‑1 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg > 2:6034990/1‑93 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg > 1:5960750/1‑93 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg > 2:262397/1‑93 (MQ=255)
gcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAg > 2:3630158/1‑93 (MQ=255)
cATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAgg < 1:1452262/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt < 1:4304564/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 1:3920224/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 2:5544064/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 2:3720462/1‑93 (MQ=255)
tttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCACTAGgttggt > 1:1624778/1‑91 (MQ=255)
ttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGttt < 2:4233804/93‑1 (MQ=255)
ttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGttt < 1:2940241/93‑1 (MQ=255)
tCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTc < 1:6087827/93‑1 (MQ=255)
aCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGt > 2:3412803/1‑93 (MQ=255)
aCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGt < 1:4169830/93‑1 (MQ=255)
ctctCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGaa > 1:2164466/1‑93 (MQ=255)
cctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAt < 1:2448043/92‑1 (MQ=255)
ctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAtt < 2:3326606/93‑1 (MQ=255)
ctcCTGCGGAACGCTGTTATCCTGGCCGCCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAtt < 1:1095943/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc > 1:1538954/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc > 1:5352689/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc < 2:3427817/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCa > 2:668920/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCa > 2:1424699/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCa < 2:3555944/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAg > 2:4308571/1‑93 (MQ=255)
tGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc > 2:3033345/1‑93 (MQ=255)
gCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCg < 2:2368425/93‑1 (MQ=255)
cGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGa < 1:5653005/93‑1 (MQ=255)
ggAATGCTGTTATCCTGACCATCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCTGTTGCTATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAGTCAGCGAc > 1:5480763/1‑93 (MQ=255)
ggAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAc > 1:850640/1‑93 (MQ=255)
ggAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAc > 1:180282/1‑93 (MQ=255)
gAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACt < 2:2645868/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACtt < 2:1992835/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTg > 2:1070006/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt < 1:5267999/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt < 1:3067483/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt > 2:5270280/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt < 2:5107974/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt > 1:2048365/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGATGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTc > 1:3353080/1‑93 (MQ=255)
cTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCg < 1:3616102/93‑1 (MQ=255)
tGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGc > 2:3119586/1‑93 (MQ=255)
tGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGc > 2:1728629/1‑93 (MQ=255)
tGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGc > 2:2783334/1‑93 (MQ=255)
tGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGc > 1:3752426/1‑93 (MQ=255)
tGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGc > 2:4757786/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGcc > 2:3876111/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc > 2:2197267/1‑93 (MQ=255)
tATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCg > 1:5990185/1‑93 (MQ=255)
tATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCg > 1:4667985/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGt > 1:5031874/1‑93 (MQ=255)
tCCTGACCACCATATAAGGCGAGAAGCGGCGCGTTAAGATCGGGTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTc < 2:4733300/93‑1 (MQ=255)
ccTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCa > 2:5989354/1‑93 (MQ=255)
tGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGt > 1:3835483/1‑93 (MQ=255)
tGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGt > 1:785597/1‑93 (MQ=255)
tGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGt > 1:3199945/1‑93 (MQ=255)
gACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGtt < 1:1689820/93‑1 (MQ=255)
gccaccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGttt < 2:3914905/92‑1 (MQ=255)
accaccATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGttt < 2:2392404/93‑1 (MQ=255)
accaccATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGttt > 1:5194826/1‑93 (MQ=255)
ccaccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTg > 2:1367537/1‑93 (MQ=255)
ccaccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTg > 2:1793516/1‑93 (MQ=255)
accaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGcc > 2:2889935/1‑93 (MQ=255)
caTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGt > 1:1958441/1‑93 (MQ=255)
caTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGt > 2:32202/1‑93 (MQ=255)
atatAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTa > 1:2673101/1‑93 (MQ=255)
ataAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAcc < 2:4853678/93‑1 (MQ=255)
ataAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAcc < 2:2441847/93‑1 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 2:41708/93‑1 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 2:4343957/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 1:3409851/92‑1 (MQ=255)
gCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGc > 2:1764694/1‑93 (MQ=255)
gCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGc < 2:1243922/93‑1 (MQ=255)
gagaATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAc < 2:5281839/93‑1 (MQ=255)
gagaATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAc < 2:5599431/93‑1 (MQ=255)
|
TTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > NC_000913/4013092‑4013260
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT > NC_000913/4013084‑4013261
|
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGG > SRR4302532.5559094/1‑94 (MQ=60)
TTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAT‑CG‑‑GC < SRR4302532.3581238/94‑1 (MQ=60)
TTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAT‑CG‑‑GC‑‑G < SRR4302532.3843538/94‑1 (MQ=60)
TTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAT‑CG‑‑GC‑‑G < SRR4302532.3843537/94‑1 (MQ=60)
ATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGGCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTA > SRR4302532.5931398/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTA > SRR4302532.932341/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGA > SRR4302532.3899575/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGA > SRR4302532.5180532/1‑94 (MQ=60)
GCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGAT < SRR4302532.4872598/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATC < SRR4302532.5180628/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCG > SRR4302532.3272198/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCG > SRR4302532.5202160/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCG < SRR4302532.1223867/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCG > SRR4302532.3664750/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGG > SRR4302532.1152387/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTAAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGG < SRR4302532.2745873/94‑1 (MQ=60)
CCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAGGCCGCGAATAGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGT > SRR4302532.1495698/1‑94 (MQ=60)
CCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGT < SRR4302532.2204217/94‑1 (MQ=60)
CCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGT < SRR4302532.3203293/94‑1 (MQ=60)
CCGCAGCGCCTGGCGCGTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGCCCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTT < SRR4302532.5640217/94‑1 (MQ=60)
CCGCAGCGCCTGGCGCATGCTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTT < SRR4302532.116620/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTG > SRR4302532.6306328/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTG < SRR4302532.3078560/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTG > SRR4302532.180927/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGC > SRR4302532.6082037/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCG > SRR4302532.5855725/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCG < SRR4302532.4036518/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGA > SRR4302532.6185089/1‑94 (MQ=60)
GCCTGGCGCATGTTTTCACCCTTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGCCCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATAT < SRR4302532.2490987/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATAT < SRR4302532.5040050/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATC > SRR4302532.3067116/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATC > SRR4302532.1883372/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCA > SRR4302532.4741479/1‑94 (MQ=60)
GCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACA < SRR4302532.1738728/94‑1 (MQ=60)
CGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAG > SRR4302532.6166889/1‑94 (MQ=60)
CGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAG < SRR4302532.3995347/94‑1 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT < SRR4302532.1501223/94‑1 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GCTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT > SRR4302532.5803650/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT < SRR4302532.4450117/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT > SRR4302532.4052298/1‑94 (MQ=60)
GGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGT < SRR4302532.3132149/94‑1 (MQ=60)
GTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCActaggttggt > SRR4302532.1679778/1‑84 (MQ=60)
GTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTT < SRR4302532.3503564/94‑1 (MQ=60)
GTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTT > SRR4302532.2491907/1‑94 (MQ=60)
GTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTT > SRR4302532.3185660/1‑94 (MQ=60)
TTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTC < SRR4302532.3037883/94‑1 (MQ=60)
TTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTC < SRR4302532.869664/94‑1 (MQ=60)
TTCAACGCCCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTC < SRR4302532.3738218/94‑1 (MQ=60)
TCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCG < SRR4302532.6298015/94‑1 (MQ=60)
ACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTG < SRR4302532.4972872/94‑1 (MQ=60)
ACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTG < SRR4302532.925080/94‑1 (MQ=60)
ACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTG < SRR4302532.4309675/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGA > SRR4302532.5300752/1‑94 (MQ=60)
cccctccgGCGGACTGCTGGTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGAGCGGTTGCGATATCAACAGTTTGTTTCGGTGAA < SRR4302532.4054929/86‑1 (MQ=60)
GCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAA > SRR4302532.2236864/1‑94 (MQ=60)
TCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATT < SRR4302532.6165817/94‑1 (MQ=60)
CCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATT < SRR4302532.2529441/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC > SRR4302532.1590947/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC > SRR4302532.5538336/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGGAACGCTGTTATCCTGGCCGCCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC < SRR4302532.1132589/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAGCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCA < SRR4302532.248224/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG < SRR4302532.6277515/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG < SRR4302532.4763146/94‑1 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCATCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCTGTTGCTATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAGTCAGCGAC > SRR4302532.5670793/1‑94 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC > SRR4302532.5511510/1‑94 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC > SRR4302532.186347/1‑94 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC > SRR4302532.879902/1‑94 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC < SRR4302532.5849755/94‑1 (MQ=60)
GGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACT > SRR4302532.5411166/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGT > SRR4302532.1865440/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGT > SRR4302532.2116578/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC > SRR4302532.6157267/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC < SRR4302532.5449656/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC < SRR4302532.3168845/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGATGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC > SRR4302532.3465025/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTATCCAGTCCACCATATAAGCCGAGAA‑GCG‑‑GCCAGTTAAGATCGGTCGCGATAACTACAGTTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCG < SRR4302532.5952985/94‑1 (MQ=38)
CTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGC > SRR4302532.422899/1‑94 (MQ=60)
CTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGC > SRR4302532.3878604/1‑94 (MQ=60)
CTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGC < SRR4302532.3737047/94‑1 (MQ=60)
TGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCC > SRR4302532.5970333/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCC < SRR4302532.154244/94‑1 (MQ=60)
TTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCG < SRR4302532.3027359/94‑1 (MQ=60)
TTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCG > SRR4302532.4827137/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCG > SRR4302532.6197139/1‑94 (MQ=60)
TATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGT > SRR4302532.5204457/1‑94 (MQ=60)
TCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCA < SRR4302532.3374741/94‑1 (MQ=60)
CCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAG < SRR4302532.3429048/94‑1 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT > SRR4302532.3306181/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT > SRR4302532.5508749/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT > SRR4302532.3964978/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT > SRR4302532.812577/1‑94 (MQ=60)
GACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTT > SRR4302532.5373882/1‑94 (MQ=60)
GACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTT > SRR4302532.2076433/1‑94 (MQ=60)
GACCACCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTT < SRR4302532.1746886/94‑1 (MQ=60)
GACCACCATATAAGCCGAGAA‑CCGGCGC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCACCAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTT < SRR4302532.1661381/94‑1 (MQ=60)
CCCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCG < SRR4302532.3008926/94‑1 (MQ=60)
CCATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGT > SRR4302532.2023501/1‑94 (MQ=60)
CATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATCTCACCAGGTTGTTTCGGTGAATTCACCGACTTGTCGCCCGCCAGTATGCCCTA > SRR4302532.4660204/1‑94 (MQ=60)
CATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTA > SRR4302532.2762820/1‑94 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302532.1939017/1‑94 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC < SRR4302532.4715872/94‑1 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302532.1659228/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302532.3524038/94‑1 (MQ=60)
AGCCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGC > SRR4302532.1136948/1‑94 (MQ=60)
CCGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCA > SRR4302532.1496392/1‑94 (MQ=60)
CGAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGCACCACGCCAC < SRR4302532.4326196/94‑1 (MQ=60)
GAGAATCGGC‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCCTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT > SRR4302532.3622026/1‑94 (MQ=60)
|
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑‑GC‑‑GTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT > NC_000913/4013084‑4013261
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
