Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,545,868 |
A→G |
K5K (AAA→AAG) |
fimG → |
FimG |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,545,868 | 0 | A | G | 94.0%
| 744.9
/ 27.0
| 234 | K5K (AAA→AAG) | fimG | FimG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (10/4); new base G (117/102); total (127/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
ACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCGC > NC_000913/4545778‑4545960
|
acaGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCg < 2:1426278/93‑1 (MQ=255)
aGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTg > 1:4114496/1‑93 (MQ=255)
gTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTggg < 1:554287/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgta < 1:874132/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgta < 1:5724788/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgta > 1:3224041/1‑93 (MQ=255)
ccTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtat < 2:4687463/93‑1 (MQ=255)
cTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatg < 2:4785183/93‑1 (MQ=255)
cTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatg > 1:3142449/1‑93 (MQ=255)
tGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatgt > 2:5537239/1‑93 (MQ=255)
tGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatgt < 2:3432669/93‑1 (MQ=255)
tGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatgt > 1:5950343/1‑93 (MQ=255)
gTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatgta < 2:4903998/93‑1 (MQ=255)
gTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatgta > 1:879035/1‑93 (MQ=255)
gTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGgtatgta > 1:760299/1‑93 (MQ=255)
gTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGgtatgta > 1:1048147/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTg > 2:1538262/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTg > 2:1253447/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTg > 2:5221225/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTg > 2:4547400/1‑93 (MQ=255)
cGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTggcgg < 1:1695060/93‑1 (MQ=255)
ggCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCaa < 1:2765261/93‑1 (MQ=255)
ggCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCaa > 2:1718315/1‑93 (MQ=255)
ggCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCaa < 1:2648745/93‑1 (MQ=255)
gCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAat < 1:5033796/93‑1 (MQ=255)
cATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTAGCGGCAata > 1:3733684/1‑93 (MQ=255)
atatCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAatat < 2:833743/93‑1 (MQ=255)
atatCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAatat < 1:497570/93‑1 (MQ=255)
tatCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCATGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATAtt > 1:3748951/1‑93 (MQ=255)
tatCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATAtt < 2:5997474/93‑1 (MQ=255)
atCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTg > 1:5471051/1‑93 (MQ=255)
atCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATGTGCGGCCATATTg > 1:292230/1‑93 (MQ=255)
tCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTgg < 1:5157580/93‑1 (MQ=255)
cAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGgc < 1:3505784/93‑1 (MQ=255)
tGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTTgcacc > 1:2153401/1‑90 (MQ=255)
tGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCt < 2:5186643/93‑1 (MQ=255)
gCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTc < 1:1205007/93‑1 (MQ=255)
gCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGGGCAAGGGTGGGAAGGTATTGGGGGAAAAATTGGGGCtg > 2:5749264/1‑92 (MQ=255)
cACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGc < 1:4815668/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCa > 1:90119/1‑93 (MQ=255)
cGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCaa < 1:1000695/93‑1 (MQ=255)
cGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCaa > 2:5947710/1‑93 (MQ=255)
ggCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAg < 1:4523878/93‑1 (MQ=255)
ggCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAg > 1:1967724/1‑93 (MQ=255)
ggCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAg > 2:249306/1‑93 (MQ=255)
gCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAgg > 1:5870964/1‑92 (MQ=255)
gCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGt > 1:3020077/1‑93 (MQ=255)
cTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTg < 2:2695782/93‑1 (MQ=255)
cTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTg > 2:3593264/1‑93 (MQ=255)
tACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGc < 1:3968161/93‑1 (MQ=255)
tACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGc > 2:625989/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGcg > 2:3104673/1‑93 (MQ=255)
ccTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGcga < 1:1947661/93‑1 (MQ=255)
ccTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGcga < 2:1848475/93‑1 (MQ=255)
tCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGcgacga < 1:2538337/93‑1 (MQ=255)
aCTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATa > 2:4052851/1‑93 (MQ=255)
ctctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAc > 2:4867126/1‑93 (MQ=255)
ctctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAc < 1:1613829/93‑1 (MQ=255)
ctctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAc > 1:2629797/1‑93 (MQ=255)
ctctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAc > 1:3932336/1‑93 (MQ=255)
tctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACa < 2:4475876/93‑1 (MQ=255)
tctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACa < 2:413627/93‑1 (MQ=255)
tctTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACa < 1:5793847/93‑1 (MQ=255)
tGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGc < 1:4443933/93‑1 (MQ=255)
tGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGc < 2:2554651/93‑1 (MQ=255)
aaTATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAg > 2:1660089/1‑93 (MQ=255)
tCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGa < 2:1635070/93‑1 (MQ=255)
cAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGAt < 1:536436/93‑1 (MQ=255)
cAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGAt > 1:83510/1‑93 (MQ=255)
tAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACGGGCAGCCGATGTc > 2:2209202/1‑93 (MQ=255)
aCTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCAc < 1:1476806/93‑1 (MQ=255)
aCTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCAc > 2:595209/1‑93 (MQ=255)
cTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCAcc > 1:3098932/1‑93 (MQ=255)
cTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCAcc < 1:1833437/93‑1 (MQ=255)
tGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCa < 2:4087185/93‑1 (MQ=255)
gagaTGCTCATGAAATGGTGCAATCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATAGTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATc < 2:3239613/93‑1 (MQ=255)
gagaTGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATc > 2:240399/1‑93 (MQ=255)
gagaTGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATc > 1:2558444/1‑93 (MQ=255)
agaTGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCa < 2:3758144/93‑1 (MQ=255)
agaTGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCa < 2:1042830/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACg > 1:462310/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACg > 1:4350176/1‑93 (MQ=255)
gCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGt > 1:5702543/1‑93 (MQ=255)
cTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTg > 1:244459/1‑93 (MQ=255)
tCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGa > 1:2865017/1‑93 (MQ=255)
tCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGa < 2:5584627/93‑1 (MQ=255)
cATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGaa < 2:4264768/93‑1 (MQ=255)
cATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGaa > 2:5396524/1‑93 (MQ=255)
cATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGaa > 2:696368/1‑93 (MQ=255)
cATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGaa > 2:906026/1‑93 (MQ=255)
cATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGGGaa > 1:141070/1‑93 (MQ=255)
cATGAAATGGTGCAAGCGGGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGGGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGaa < 2:3924146/93‑1 (MQ=255)
aTGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAAc < 2:4158826/93‑1 (MQ=255)
aTGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAAc > 2:2161239/1‑93 (MQ=255)
aaTGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTa > 1:3316622/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTaa > 2:2067714/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTaa < 1:4223163/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAgg < 2:2441934/93‑1 (MQ=255)
cAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGgtcgt < 1:4091730/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCGc > 2:3009607/1‑93 (MQ=255)
|
ACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCGC > NC_000913/4545778‑4545960
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCG > NC_000913/4545775‑4545959
|
GCCACAGGTGCCTGACACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTGGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAACGGTGCAAA < SRR4302532.3757819/94‑1 (MQ=60)
GACACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAG > SRR4302532.5383404/1‑94 (MQ=60)
GACACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAG > SRR4302532.3827857/1‑94 (MQ=60)
GACACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAG > SRR4302532.6297562/1‑94 (MQ=60)
ACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGT < SRR4302532.4987502/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTG > SRR4302532.4252598/1‑94 (MQ=60)
GTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGT < SRR4302532.1833255/94‑1 (MQ=60)
GTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGT < SRR4302532.573618/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTA > SRR4302532.3331066/1‑94 (MQ=60)
TGACTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGTTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTA < SRR4302532.6330959/94‑1 (MQ=60)
GCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTAT < SRR4302532.904049/94‑1 (MQ=60)
GCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTAT < SRR4302532.5924173/94‑1 (MQ=60)
CCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATG > SRR4302532.3246738/1‑94 (MQ=60)
CTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGT > SRR4302532.6156228/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTA > SRR4302532.909094/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTA > SRR4302532.786465/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTA > SRR4302532.4019086/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTA > SRR4302532.1083480/1‑94 (MQ=60)
GTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTAT < SRR4302532.2826722/94‑1 (MQ=60)
CACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAAAGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTG > SRR4302532.3614825/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGG > SRR4302532.2116355/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGC > SRR4302532.4371151/1‑94 (MQ=60)
TGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCG > SRR4302532.2627610/1‑94 (MQ=60)
TGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCG < SRR4302532.303452/94‑1 (MQ=60)
TGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCG < SRR4302532.92107/94‑1 (MQ=60)
CGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGC < SRR4302532.1752282/94‑1 (MQ=60)
GGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAA > SRR4302532.5917890/1‑94 (MQ=60)
GGCATATCAATGCCACGTCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAAT < SRR4302532.2737442/94‑1 (MQ=60)
GGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAAT < SRR4302532.2858110/94‑1 (MQ=60)
GGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAAT > SRR4302532.3894727/1‑94 (MQ=60)
GGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAAT < SRR4302532.2737606/94‑1 (MQ=60)
GCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATA > SRR4302532.5340032/1‑94 (MQ=60)
GCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATA < SRR4302532.5206452/94‑1 (MQ=60)
GCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATA > SRR4302532.1724378/1‑94 (MQ=60)
GCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTAGCGGCAATA > SRR4302532.3859116/1‑94 (MQ=60)
CATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATAT > SRR4302532.1364217/1‑94 (MQ=60)
CATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATAT < SRR4302532.5735165/94‑1 (MQ=60)
ATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCATGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATT > SRR4302532.3874979/1‑94 (MQ=60)
ATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATT < SRR4302532.514960/94‑1 (MQ=60)
TATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTG > SRR4302532.5660724/1‑94 (MQ=60)
TATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTG > SRR4302532.302295/1‑94 (MQ=60)
TATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTG < SRR4302532.6027764/94‑1 (MQ=60)
TATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATGTGCGGCCATATTG > SRR4302532.302296/1‑94 (MQ=60)
ATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGG > SRR4302532.2668692/1‑94 (MQ=60)
TCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGC < SRR4302532.5335054/94‑1 (MQ=60)
CAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCG < SRR4302532.1963538/94‑1 (MQ=60)
CAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCG > SRR4302532.3662911/1‑94 (MQ=60)
CAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCG < SRR4302532.3623206/94‑1 (MQ=60)
ATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTtgcacc > SRR4302532.2225380/1‑88 (MQ=60)
GCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCG < SRR4302532.1245326/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCA < SRR4302532.4981481/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCA > SRR4302532.93278/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAA > SRR4302532.1717613/1‑94 (MQ=60)
CGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAG < SRR4302532.94953/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAG < SRR4302532.1034764/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAG > SRR4302532.2033095/1‑94 (MQ=60)
GGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGT < SRR4302532.6090718/94‑1 (MQ=60)
GGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGT > SRR4302532.3246785/1‑94 (MQ=60)
GGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGT > SRR4302532.3119715/1‑94 (MQ=60)
GGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGT < SRR4302532.4678293/94‑1 (MQ=60)
GGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGT > SRR4302532.4742430/1‑94 (MQ=60)
GGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGG > SRR4302532.6074407/1‑94 (MQ=60)
CTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGC > SRR4302532.4655021/1‑94 (MQ=60)
CTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAACTGC > SRR4302532.3862396/1‑94 (MQ=60)
CTACCTTCACTCTTGAATATCAGGAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGC > SRR4302532.1975329/1‑94 (MQ=60)
TACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCG < SRR4302532.4101842/94‑1 (MQ=60)
CCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGAC > SRR4302532.1459203/1‑94 (MQ=60)
CCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGAC < SRR4302532.418682/94‑1 (MQ=60)
CCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGAC < SRR4302532.418681/94‑1 (MQ=60)
CCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGAC < SRR4302532.2012409/94‑1 (MQ=60)
CTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCGATATTGGCGCTCGGGAGTGCGGCG > SRR4302532.2016629/1‑94 (MQ=60)
TTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGA > SRR4302532.848698/1‑94 (MQ=60)
TTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGA > SRR4302532.4280818/1‑94 (MQ=60)
TCCCTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGAT < SRR4302532.4081279/94‑1 (MQ=60)
TCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGAT < SRR4302532.2623005/94‑1 (MQ=60)
CACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATA < SRR4302532.4248806/94‑1 (MQ=60)
ACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAC > SRR4302532.3383021/1‑94 (MQ=60)
ACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAC > SRR4302532.2717886/1‑94 (MQ=60)
ACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATAC > SRR4302532.4064848/1‑94 (MQ=60)
CTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACA > SRR4302532.5498140/1‑94 (MQ=60)
CTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACA > SRR4302532.870345/1‑94 (MQ=60)
CTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACA < SRR4302532.1668438/94‑1 (MQ=60)
CTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACA < SRR4302532.5018550/94‑1 (MQ=60)
TCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAG < SRR4302532.5995256/94‑1 (MQ=60)
CTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGG > SRR4302532.5624179/1‑94 (MQ=60)
TGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCA < SRR4302532.4595376/94‑1 (MQ=60)
GAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAG < SRR4302532.5974945/94‑1 (MQ=60)
GAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAG < SRR4302532.2371940/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCC > SRR4302532.2857584/1‑94 (MQ=60)
TCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGAT > SRR4302532.86465/1‑94 (MQ=60)
TCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGAT > SRR4302532.5191502/1‑94 (MQ=60)
CAGTAACTGGAGATGCTCCTGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTCGCGCTCGCAAGGGCGAAGATTCAGGCAGCCGgct > SRR4302532.3186636/1‑91 (MQ=60)
CAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATG < SRR4302532.5740162/94‑1 (MQ=60)
CAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATG < SRR4302532.555127/94‑1 (MQ=60)
TAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCA < SRR4302532.1632884/94‑1 (MQ=60)
AACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCAC < SRR4302532.4779895/94‑1 (MQ=60)
ACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACC < SRR4302532.1526576/94‑1 (MQ=60)
ACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACC > SRR4302532.3201693/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCA > SRR4302532.904755/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCA < SRR4302532.1894410/94‑1 (MQ=60)
TGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCAT < SRR4302532.4426649/94‑1 (MQ=60)
TGGAGATGCACATGAAATGATGCAAGCGTGGGTATGTATTGCCGGCAATATTGCCGCTCGGAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCAT < SRR4302532.2944427/94‑1 (MQ=60)
GGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATC > SRR4302532.2643788/1‑94 (MQ=60)
GAGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCA < SRR4302532.3044145/94‑1 (MQ=60)
AGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCAC < SRR4302532.405760/94‑1 (MQ=60)
AGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCAC > SRR4302532.3203562/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCAC > SRR4302532.494586/1‑94 (MQ=60)
GATGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACG > SRR4302532.478399/1‑94 (MQ=60)
GATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACG > SRR4302532.4497245/1‑94 (MQ=60)
TGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGT > SRR4302532.5901403/1‑94 (MQ=60)
TGCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGT > SRR4302532.1210050/1‑94 (MQ=60)
GCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTG > SRR4302532.252915/1‑94 (MQ=60)
GCTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTG > SRR4302532.2682437/1‑94 (MQ=60)
CTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGA > SRR4302532.2960836/1‑94 (MQ=60)
CTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGA > SRR4302532.871533/1‑94 (MQ=60)
CTCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGA > SRR4302532.2960835/1‑94 (MQ=60)
TCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAA > SRR4302532.5792003/1‑94 (MQ=60)
TCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAA > SRR4302532.145824/1‑94 (MQ=60)
TCATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGGGAA > SRR4302532.145825/1‑94 (MQ=60)
CATGAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAAC > SRR4302532.259933/1‑94 (MQ=60)
GAAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGT < SRR4302532.5950463/94‑1 (MQ=60)
AAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTA > SRR4302532.669033/1‑94 (MQ=60)
AAATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTA > SRR4302532.3427209/1‑94 (MQ=60)
AATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCATCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAA < SRR4302532.2262122/94‑1 (MQ=60)
AATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAA < SRR4302532.4525969/94‑1 (MQ=60)
AATGGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAA < SRR4302532.3570739/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAG < SRR4302532.4364888/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGT < SRR4302532.3247684/94‑1 (MQ=60)
GTGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGGAATATTGGCGCTCGCAAGTGGGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGCACGGTAAGGTG > SRR4302532.5274055/1‑94 (MQ=60)
GGCAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCG < SRR4302532.1080184/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTC < SRR4302532.4229093/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCG < SRR4302532.1508579/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCG > SRR4302532.1731865/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCG < SRR4302532.5155968/94‑1 (MQ=60)
|
GACACAGGTGCCTGTCACTGCGGGGCATATCAATGCCACGGCTACCTTCACTCTTGAATATCAGTAACTGGAGATGCTCATGAAATGGTGCAAACGTGGGTATGTATTGGCGGCAATATTGGCGCTCGCAAGTGCGACGATACAGGCAGCCGATGTCACCATCACGGTGAACGGTAAGGTCGTCG > NC_000913/4545775‑4545959
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
