Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,551,066 |
A→G |
V199V (GTA→GTG) |
uxuB → |
D‑mannonate oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,551,066 | 0 | A | G | 85.5%
| 683.6
/ 96.2
| 269 | V199V (GTA→GTG) | uxuB | D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/17); new base G (130/100); total (152/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCC > NC_000913/4550977‑4551158
|
cgtctgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTg > 1:2550951/1‑93 (MQ=255)
gtctgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTgg < 2:5871931/93‑1 (MQ=255)
gtctgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTgg < 1:2659879/93‑1 (MQ=255)
tctgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTggg > 1:1247253/1‑93 (MQ=255)
tctgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTggg > 2:249723/1‑93 (MQ=255)
ctgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTgggg > 2:1290360/1‑93 (MQ=255)
tgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGggc < 2:6056816/93‑1 (MQ=255)
tgcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGggc > 1:709832/1‑93 (MQ=255)
gcgtcGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGggct > 2:1192536/1‑93 (MQ=255)
cgtcgtGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGggctg < 2:3096174/93‑1 (MQ=255)
gtcgtGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATACCGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGggctgg > 2:4308483/1‑93 (MQ=255)
tcgtGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGGCGCGGTGCTGGggctggc > 2:3659701/1‑93 (MQ=255)
gtGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTc < 1:5112863/93‑1 (MQ=255)
gtGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTc > 2:446312/1‑93 (MQ=255)
gtGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTc > 1:2109198/1‑93 (MQ=255)
tGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCa > 1:3055917/1‑93 (MQ=255)
tGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCa > 1:1397132/1‑93 (MQ=255)
tGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCa < 1:1919776/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAGGGTTAAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTTCTGGggctggcgccg > 1:1454843/1‑89 (MQ=255)
aaaaGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGgc > 2:3377885/1‑93 (MQ=255)
aaGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGgcgc > 2:738730/1‑93 (MQ=255)
aGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGcgcg > 1:64892/1‑93 (MQ=255)
gggTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGcgcgg > 2:3805719/1‑92 (MQ=255)
gggTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGt > 1:1790704/1‑93 (MQ=255)
gggTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGt < 2:5641806/93‑1 (MQ=255)
gggTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGt > 1:2245310/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGAc > 1:1640793/1‑93 (MQ=255)
gAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGAccc > 2:389603/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGc > 1:3867012/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGc > 2:1940447/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCa > 2:3312816/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCa > 1:503478/1‑93 (MQ=255)
gCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAg < 1:111230/93‑1 (MQ=255)
cGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGc < 1:40286/93‑1 (MQ=255)
gTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCt > 1:4569481/1‑93 (MQ=255)
tttACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTg > 2:5376177/1‑93 (MQ=255)
ttACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTgg < 2:232648/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTggc < 1:4490103/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTggc > 2:1630374/1‑93 (MQ=255)
gTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGAAGCTGGCGGCa > 1:1496682/1‑93 (MQ=255)
tGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCAt < 1:3687396/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCAt > 1:942359/1‑93 (MQ=255)
gATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATg > 2:643639/1‑93 (MQ=255)
gATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATg < 1:2090203/93‑1 (MQ=255)
aTGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATgg > 1:4141671/1‑93 (MQ=255)
aTGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATgg < 2:628377/93‑1 (MQ=255)
aTGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATgg > 2:2832689/1‑93 (MQ=255)
tGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGa < 2:4269350/93‑1 (MQ=255)
tGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGa < 2:6584047/93‑1 (MQ=255)
tGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGa < 2:1175215/93‑1 (MQ=255)
tGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGa > 2:4705000/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGAtt > 2:3010356/1‑93 (MQ=255)
cTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTga < 2:5948983/93‑1 (MQ=255)
tGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTgaa > 1:771051/1‑93 (MQ=255)
tGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTgaa < 1:628902/93‑1 (MQ=255)
gATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTgaagaa > 1:5464175/1‑93 (MQ=255)
gATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTgaagaa > 1:5917891/1‑93 (MQ=255)
gATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTgaagaa > 1:3351451/1‑93 (MQ=255)
aTAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGaaa > 2:2563012/1‑93 (MQ=255)
tAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGaaaa > 2:2201916/1‑93 (MQ=255)
tAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGaaaa > 2:638981/1‑93 (MQ=255)
tAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGaaaa > 1:3455442/1‑93 (MQ=255)
tAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTAGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGaaaa > 2:4491083/1‑93 (MQ=255)
aCGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATg > 1:6190209/1‑93 (MQ=255)
aCGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTCGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTTGCGGCATTGATTGAAGAAAATg > 1:2958882/1‑93 (MQ=255)
cgtgcgtgAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGt < 2:40380/93‑1 (MQ=255)
gtgcgtgAAAACGGTCACGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTc < 1:3778966/93‑1 (MQ=255)
tgcgtgAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTcc > 2:1728189/1‑92 (MQ=255)
tgAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCtt < 2:3193816/93‑1 (MQ=255)
gAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTc < 2:4141671/93‑1 (MQ=255)
aaaaCGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTcc > 1:6543011/1‑93 (MQ=255)
aaaaCGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTcc > 2:4870740/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCg > 1:5718527/1‑93 (MQ=255)
ggTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGc < 2:1543298/93‑1 (MQ=255)
ggTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGGTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGc < 2:3844892/93‑1 (MQ=255)
gTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGcc > 2:453709/1‑92 (MQ=255)
gTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCa < 2:2106520/93‑1 (MQ=255)
gTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCa > 2:5824413/1‑93 (MQ=255)
tCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCAc < 2:4958514/93‑1 (MQ=255)
tCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCAc < 1:4716487/93‑1 (MQ=255)
tCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCAc > 1:2316485/1‑93 (MQ=255)
cATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCAcc > 2:2390895/1‑93 (MQ=255)
aTGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCa < 2:260209/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCAt < 1:4223038/93‑1 (MQ=255)
tgGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATgg < 2:1854872/93‑1 (MQ=255)
tgGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATgg > 2:5558360/1‑93 (MQ=255)
cGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTg < 1:5755352/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGa < 1:4688541/93‑1 (MQ=255)
aaGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGAc > 2:518436/1‑93 (MQ=255)
gTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGc > 2:5029525/1‑93 (MQ=255)
cgcgGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCAt < 2:5351664/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCAt < 1:482595/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATc > 2:5122515/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATc > 2:4196811/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATc < 1:3193498/93‑1 (MQ=255)
cgGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCg < 1:1074795/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGt < 1:6078021/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGt < 2:6174461/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGt < 2:2726064/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGt < 2:873987/93‑1 (MQ=255)
|
CGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCC > NC_000913/4550977‑4551158
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTGCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCG > NC_000913/4550973‑4551159
|
GTTGCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTG > SRR4302547.199417/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTG > SRR4302547.2599539/1‑94 (MQ=60)
TGCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCT < SRR4302547.5471964/94‑1 (MQ=60)
TGCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCT < SRR4302547.2314676/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTG > SRR4302547.2602464/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGCGCCGTGAAAAAGGGTTGAAATCCTTTACGGTGATGTCGTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGG < SRR4302547.4562343/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGG > SRR4302547.2926364/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGG > SRR4302547.4647588/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGG > SRR4302547.1819893/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGG < SRR4302547.752160/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGG > SRR4302547.1272428/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGG > SRR4302547.3453161/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGG < SRR4302547.2713333/94‑1 (MQ=60)
TCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGG > SRR4302547.3995328/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGC > SRR4302547.722958/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGC > SRR4302547.6289105/1‑94 (MQ=60)
TGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCT < SRR4302547.2569072/94‑1 (MQ=60)
TGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCT < SRR4302547.1195625/94‑1 (MQ=60)
tccTCGTGAAAAAGCGTTGAAAGCGTGTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAACCGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTG < SRR4302547.1708364/91‑1 (MQ=60)
GTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGC > SRR4302547.5452433/1‑94 (MQ=60)
CGTGAAAAAGTGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTC < SRR4302547.73300/94‑1 (MQ=60)
CGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTC > SRR4302547.2151213/1‑94 (MQ=60)
CGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTC > SRR4302547.2610517/1‑94 (MQ=60)
CGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTC < SRR4302547.338471/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCA < SRR4302547.5218228/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCA > SRR4302547.3116729/1‑94 (MQ=60)
GTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCA > SRR4302547.1425082/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAG < SRR4302547.1957798/94‑1 (MQ=60)
TGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAG > SRR4302547.6726511/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAG < SRR4302547.685313/94‑1 (MQ=60)
TGAAAAAGGGTTAAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTTCTGGGGCTGGCgccg > SRR4302547.1483927/1‑90 (MQ=60)
AAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTGGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGC > SRR4302547.1439693/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGC < SRR4302547.4159014/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCG > SRR4302547.4785841/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCG > SRR4302547.3874609/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCG < SRR4302547.5579964/94‑1 (MQ=60)
AAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCG < SRR4302547.863290/94‑1 (MQ=60)
AAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCG > SRR4302547.66110/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGT > SRR4302547.2290608/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGT > SRR4302547.1826160/1‑94 (MQ=60)
GGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGA > SRR4302547.3787612/1‑94 (MQ=60)
GTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGAC > SRR4302547.1673217/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCG > SRR4302547.220663/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGC > SRR4302547.3945738/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCA > SRR4302547.512641/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCA > SRR4302547.4789675/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCA > SRR4302547.1500672/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGC > SRR4302547.2346234/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGC < SRR4302547.113257/94‑1 (MQ=60)
CGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCT > SRR4302547.2252349/1‑94 (MQ=60)
CGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCT > SRR4302547.4252782/1‑94 (MQ=60)
CGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCT > SRR4302547.4664031/1‑94 (MQ=60)
CGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCT < SRR4302547.41029/94‑1 (MQ=60)
GTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTG < SRR4302547.2080849/94‑1 (MQ=60)
TTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGC > SRR4302547.470900/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCG < SRR4302547.4582859/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGATCTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGGCCCGCAGCTGGCGG < SRR4302547.1640064/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGC > SRR4302547.1478048/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGC > SRR4302547.4470056/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGAAGCTGGCGGCA > SRR4302547.1526539/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGCCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTAGCGGCA > SRR4302547.1302096/1‑94 (MQ=60)
GTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCAT < SRR4302547.3914072/94‑1 (MQ=60)
GTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCAT > SRR4302547.960622/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATG < SRR4302547.3762673/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGG < SRR4302547.2131871/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGG > SRR4302547.4225961/1‑94 (MQ=60)
ATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGA < SRR4302547.6311060/94‑1 (MQ=60)
ATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGA < SRR4302547.3125176/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTGCGATAACGTCCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGA < SRR4302547.1841195/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTGCGATGACGTGCGTGAAAACGTTCATGGAGCAAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCGCTGCCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGAT < SRR4302547.6179733/94‑1 (MQ=53)
TGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGAT < SRR4302547.2344892/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGAT < SRR4302547.1112183/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTG < SRR4302547.2138925/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCCTGGATTGA > SRR4302547.5866054/1‑94 (MQ=60)
CTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAA > SRR4302547.785619/1‑94 (MQ=60)
TGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAG < SRR4302547.6138322/94‑1 (MQ=60)
TGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAG < SRR4302547.640512/94‑1 (MQ=60)
CGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAA > SRR4302547.6040530/1‑94 (MQ=60)
CGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAA > SRR4302547.5577052/1‑94 (MQ=60)
CGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAA > SRR4302547.3419413/1‑94 (MQ=60)
ATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAA > SRR4302547.3525885/1‑94 (MQ=60)
ATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTCATCCGCACCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAA > SRR4302547.3081871/1‑94 (MQ=60)
TAACGTGCGTGAAAGCGGTCATGTGGCGAAGGTCACGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAAT < SRR4302547.3033368/94‑1 (MQ=60)
TAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAAT > SRR4302547.4111615/1‑94 (MQ=60)
AACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATG < SRR4302547.3658324/94‑1 (MQ=60)
AACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATG > SRR4302547.6318709/1‑94 (MQ=60)
AACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTCGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTTGCGGCATTGATTGAAGAAAATG > SRR4302547.3017773/1‑94 (MQ=60)
ACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGT < SRR4302547.2370692/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTA > SRR4302547.4943891/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCA < SRR4302547.120655/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCA > SRR4302547.6348457/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTGAAAACGGTCACGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCA < SRR4302547.3856026/94‑1 (MQ=60)
GCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACC < SRR4302547.5175133/94‑1 (MQ=60)
CGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCT > SRR4302547.4820219/1‑94 (MQ=60)
GTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTT < SRR4302547.6654798/94‑1 (MQ=60)
GAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCC > SRR4302547.6679190/1‑94 (MQ=60)
AAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCC > SRR4302547.6371204/1‑94 (MQ=60)
AAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCG < SRR4302547.4627509/94‑1 (MQ=60)
AAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCG > SRR4302547.5836647/1‑94 (MQ=60)
AAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCG < SRR4302547.82364/94‑1 (MQ=60)
CGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGC > SRR4302547.4814226/1‑94 (MQ=60)
GGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCA > SRR4302547.192344/1‑94 (MQ=60)
GGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCA < SRR4302547.5914677/94‑1 (MQ=60)
GTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCAC > SRR4302547.2363443/1‑94 (MQ=60)
TCATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACC < SRR4302547.4814161/94‑1 (MQ=60)
CATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCA > SRR4302547.3788820/1‑94 (MQ=60)
ATGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCAT < SRR4302547.5013647/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATG < SRR4302547.4309292/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTT > SRR4302547.5869825/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTT > SRR4302547.5295844/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTT > SRR4302547.6523543/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTT > SRR4302547.6444363/1‑94 (MQ=60)
CGAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGA < SRR4302547.5874341/94‑1 (MQ=60)
GAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGAC > SRR4302547.3343012/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGAC < SRR4302547.3726840/94‑1 (MQ=60)
GAAGGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACACGCAGCTGGCGGCATGGGTTGAAGAAAATGTCACCTTCCGGTGCACCATGGTTGAC > SRR4302547.2089323/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGAC > SRR4302547.4275365/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGAC < SRR4302547.4785648/94‑1 (MQ=60)
GAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGAC > SRR4302547.58943/1‑94 (MQ=60)
AAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACC < SRR4302547.1388765/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGC > SRR4302547.32015/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATC < SRR4302547.491446/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCG < SRR4302547.3257136/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGT < SRR4302547.1096245/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTT > SRR4302547.4267567/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTT > SRR4302547.3573094/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTT < SRR4302547.2794127/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTT < SRR4302547.6204100/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCC > SRR4302547.2836734/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCC > SRR4302547.6370453/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCG < SRR4302547.6550441/94‑1 (MQ=60)
ACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCG < SRR4302547.1588903/94‑1 (MQ=60)
|
GTTGCGTCTGCGTCGTGAAAAAGGGTTGAAAGCGTTTACGGTGATGTCCTGCGATAACGTGCGTGAAAACGGTCATGTGGCGAAGGTCGCGGTACTGGGGCTGGCTCAGGCGCGTGACCCGCAGCTGGCGGCATGGATTGAAGAAAATGTCACCTTCCCGTGCACCATGGTTGACCGCATCGTTCCG > NC_000913/4550973‑4551159
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
