Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCTGGT > NC_000913/1512543‑1512729
|
GCTAAGTGGTTCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCC < SRR4302532.1634244/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTCCCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCG < SRR4302532.3146011/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTG > SRR4302532.3662769/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTG > SRR4302532.3011327/1‑94 (MQ=60)
ATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGT > SRR4302532.5756498/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGTGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGAT > SRR4302532.1242958/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTT < SRR4302532.1987375/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTT < SRR4302532.5377286/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTT < SRR4302532.2546511/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTG < SRR4302532.590496/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTG < SRR4302532.4041302/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGG < SRR4302532.1198403/94‑1 (MQ=60)
GTTCTGCCGCCGGCAATCCCGGGTATGGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCGCTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTC < SRR4302532.1697336/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCC < SRR4302532.6145748/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTGCT > SRR4302532.5068409/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCT < SRR4302532.227420/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTC < SRR4302532.2344482/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCC < SRR4302532.2028669/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCA < SRR4302532.1456201/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCA < SRR4302532.2467927/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCA < SRR4302532.930534/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCA < SRR4302532.5081536/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTATCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCA > SRR4302532.3247153/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAG < SRR4302532.5592615/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAG > SRR4302532.755817/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGCAATCCCGGGGATTGCCGCTGCCTCTGTCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTCGCTCCTCCAG > SRR4302532.2938682/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGG > SRR4302532.3889/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGAT < SRR4302532.655317/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGAT < SRR4302532.1259394/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGAT < SRR4302532.4105071/94‑1 (MQ=60)
TGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATA > SRR4302532.4558572/1‑94 (MQ=60)
GGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTTCCTTCACACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATAG < SRR4302532.5180082/94‑1 (MQ=60)
GGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATAT < SRR4302532.5366999/94‑1 (MQ=60)
GGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATAT > SRR4302532.1148387/1‑94 (MQ=60)
GGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATAT < SRR4302532.5327002/94‑1 (MQ=60)
AATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTT > SRR4302532.1866614/1‑94 (MQ=60)
AATCCCGGGAATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTT > SRR4302532.5339351/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTA < SRR4302532.556478/94‑1 (MQ=60)
TCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTAT < SRR4302532.724442/94‑1 (MQ=60)
TCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTAT < SRR4302532.5604377/94‑1 (MQ=60)
TCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTAT < SRR4302532.1608290/94‑1 (MQ=60)
TCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTAT > SRR4302532.5912481/1‑94 (MQ=60)
CCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATC > SRR4302532.2613203/1‑94 (MQ=60)
CCGGGTATTGCCGTTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCG < SRR4302532.5571726/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCG > SRR4302532.1272714/1‑94 (MQ=60)
CCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCG > SRR4302532.3110178/1‑94 (MQ=60)
CCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCG > SRR4302532.443899/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGG < SRR4302532.314391/94‑1 (MQ=60)
GGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGC > SRR4302532.114753/1‑94 (MQ=60)
GGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGC < SRR4302532.2351331/94‑1 (MQ=60)
GGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGC > SRR4302532.6045950/1‑94 (MQ=60)
GTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAA > SRR4302532.6119302/1‑94 (MQ=60)
GAATTACCGCAGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAA > SRR4302532.4247339/1‑94 (MQ=60)
TATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAAT < SRR4302532.208314/94‑1 (MQ=60)
TATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAAT < SRR4302532.4817530/94‑1 (MQ=60)
TATTGCCGATGGCTATATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAAT < SRR4302532.4817531/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATA < SRR4302532.2803572/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATA > SRR4302532.1606866/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATAT < SRR4302532.644609/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCGCAGTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATG < SRR4302532.3437327/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATG < SRR4302532.5322695/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGT > SRR4302532.6091913/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGT < SRR4302532.1295634/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCCCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGGAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGT < SRR4302532.1295632/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTT < SRR4302532.3923385/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTT < SRR4302532.3923380/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTT < SRR4302532.608739/94‑1 (MQ=60)
TGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTAT < SRR4302532.2752332/94‑1 (MQ=60)
TGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTAT > SRR4302532.144677/1‑94 (MQ=60)
TGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTAT > SRR4302532.144675/1‑94 (MQ=60)
TGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTAT < SRR4302532.5466707/94‑1 (MQ=60)
GGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATT < SRR4302532.5912482/94‑1 (MQ=60)
CTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCC > SRR4302532.4701594/1‑94 (MQ=60)
CTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCC < SRR4302532.2133533/94‑1 (MQ=60)
CTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCC > SRR4302532.4918471/1‑94 (MQ=60)
TCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCC < SRR4302532.397532/94‑1 (MQ=60)
TCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCC > SRR4302532.2255815/1‑94 (MQ=60)
TCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCC > SRR4302532.4530554/1‑94 (MQ=60)
TCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCC > SRR4302532.4530553/1‑94 (MQ=60)
TCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGAAGATTTTATCCTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTTCC > SRR4302532.4530551/1‑94 (MQ=60)
CTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCA < SRR4302532.4026104/94‑1 (MQ=60)
TATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAG < SRR4302532.2855791/94‑1 (MQ=60)
TAGCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAG < SRR4302532.2793021/94‑1 (MQ=60)
ATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGC > SRR4302532.5510065/1‑94 (MQ=60)
CTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAG > SRR4302532.6210062/1‑94 (MQ=60)
CTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAG > SRR4302532.2311029/1‑94 (MQ=60)
TTTACCTTCTCACTCACACTGTGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCTGCAATATGGTTTtttttcagcatg > SRR4302532.3725382/1‑82 (MQ=60)
TTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGG < SRR4302532.3394766/94‑1 (MQ=60)
TACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGG < SRR4302532.5403653/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGG < SRR4302532.2680208/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGG > SRR4302532.3848212/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGC > SRR4302532.6008095/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCG > SRR4302532.2102950/1‑94 (MQ=60)
TTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGA > SRR4302532.3209325/1‑94 (MQ=60)
TCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGAT > SRR4302532.3746228/1‑94 (MQ=60)
TCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGAT > SRR4302532.4320788/1‑94 (MQ=60)
TCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTG > SRR4302532.144283/1‑94 (MQ=60)
CACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGG > SRR4302532.1536417/1‑94 (MQ=60)
CACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGG > SRR4302532.460716/1‑94 (MQ=60)
CACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGG > SRR4302532.127472/1‑94 (MQ=60)
ACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGC > SRR4302532.1958893/1‑94 (MQ=60)
CTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCA > SRR4302532.6251023/1‑94 (MQ=60)
CTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCA < SRR4302532.3491020/94‑1 (MQ=60)
CTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCA > SRR4302532.6348887/1‑94 (MQ=60)
CTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTCTCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGAGATTGGCA > SRR4302532.1675619/1‑94 (MQ=60)
CACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAAT < SRR4302532.3962060/94‑1 (MQ=60)
CACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAAT > SRR4302532.3574396/1‑94 (MQ=60)
CCACTGGGCGATTTTATTGCCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCCATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATA < SRR4302532.1807005/94‑1 (MQ=60)
ACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATA > SRR4302532.74759/1‑94 (MQ=60)
CACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATAT < SRR4302532.98904/94‑1 (MQ=60)
CACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATAT < SRR4302532.4019549/94‑1 (MQ=60)
CACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATAT > SRR4302532.5472107/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATG > SRR4302532.3097258/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATG > SRR4302532.5586423/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGC > SRR4302532.831799/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGC < SRR4302532.173447/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCC > SRR4302532.1150301/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCC < SRR4302532.1854611/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCC > SRR4302532.363690/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCC < SRR4302532.3981428/94‑1 (MQ=60)
ggtctATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCG < SRR4302532.5757142/89‑1 (MQ=60)
GGCGATTTTATCATCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTATATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATCTGCAGA < SRR4302532.5681168/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGAT < SRR4302532.3815476/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGAT < SRR4302532.1917322/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGAT < SRR4302532.3312325/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGAG > SRR4302532.1593590/1‑94 (MQ=60)
CGATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATG < SRR4302532.987783/94‑1 (MQ=60)
GATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGG > SRR4302532.19734/1‑94 (MQ=60)
GATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGG > SRR4302532.3272740/1‑94 (MQ=60)
CATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGG < SRR4302532.1676353/94‑1 (MQ=60)
ATTTTATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGC < SRR4302532.1126477/94‑1 (MQ=60)
TTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGC < SRR4302532.6183743/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGCTATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGACG > SRR4302532.2214124/1‑94 (MQ=60)
TATCGTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCG < SRR4302532.5692527/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCAT < SRR4302532.6113467/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCAT < SRR4302532.3322428/94‑1 (MQ=60)
GTCCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCAT < SRR4302532.5164904/94‑1 (MQ=60)
CCCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTC < SRR4302532.3804040/94‑1 (MQ=60)
CCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCA > SRR4302532.1111680/1‑94 (MQ=60)
CCGCAGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCA < SRR4302532.3408499/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACC < SRR4302532.2903305/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCC < SRR4302532.2506869/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCT < SRR4302532.5357336/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCGATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCT < SRR4302532.3658509/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCT < SRR4302532.4196918/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCTGG < SRR4302532.5749345/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCTGGT > SRR4302532.4693554/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCTGGT < SRR4302532.4617744/94‑1 (MQ=60)
|
GCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTACCTTCTCACTCACACTGGGCGATTTTATCGTCCCGCAGCTGGTTGGTCCTCCAGGATATTTTATCGGCAATATGGTTTATTCCCAGCAGGGGGCGATTGGCAATATGCCGATGGCGGCGGCATTCACCCTGGT > NC_000913/1512543‑1512729
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
