Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCGAGTAT > NC_000913/2022237‑2022423
|
TTATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGG < SRR4302532.5755415/94‑1 (MQ=60)
TTATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGG > SRR4302532.4382858/1‑94 (MQ=60)
TATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGAC > SRR4302532.6145812/1‑94 (MQ=60)
TATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGAC < SRR4302532.5462279/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCG > SRR4302532.1191140/1‑94 (MQ=60)
TGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGA > SRR4302532.3556701/1‑94 (MQ=60)
GGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGAT < SRR4302532.3436484/94‑1 (MQ=60)
GCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATA < SRR4302532.5736741/94‑1 (MQ=60)
AATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATC > SRR4302532.3225595/1‑94 (MQ=60)
TTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCT < SRR4302532.4160766/94‑1 (MQ=60)
TTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCT > SRR4302532.1919798/1‑94 (MQ=60)
TTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCT < SRR4302532.5135486/94‑1 (MQ=60)
TGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTT < SRR4302532.2602591/94‑1 (MQ=60)
TGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTT < SRR4302532.1586757/94‑1 (MQ=60)
TGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTT < SRR4302532.6018261/94‑1 (MQ=60)
GCCAATTTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTG < SRR4302532.2795496/94‑1 (MQ=60)
GCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTG > SRR4302532.5717854/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTG > SRR4302532.2930386/1‑94 (MQ=60)
CCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGG < SRR4302532.5132761/94‑1 (MQ=60)
CCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGG > SRR4302532.5531877/1‑94 (MQ=60)
CAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGC < SRR4302532.1817031/94‑1 (MQ=60)
CAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGC > SRR4302532.1817500/1‑94 (MQ=60)
CAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGC > SRR4302532.554245/1‑94 (MQ=60)
AATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCG > SRR4302532.3778160/1‑94 (MQ=60)
AATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATACTTGGCG > SRR4302532.1415016/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGA > SRR4302532.6072053/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGA > SRR4302532.1456180/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGA > SRR4302532.4140011/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCATTGGCGA > SRR4302532.189850/1‑94 (MQ=60)
TGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGAT > SRR4302532.1413326/1‑94 (MQ=60)
TGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGAT > SRR4302532.1624671/1‑94 (MQ=60)
GTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATA > SRR4302532.3385702/1‑94 (MQ=60)
TCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATT < SRR4302532.1178272/94‑1 (MQ=60)
TCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATT < SRR4302532.3964836/94‑1 (MQ=60)
CATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTC > SRR4302532.5775018/1‑94 (MQ=60)
CATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTC < SRR4302532.489132/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCT > SRR4302532.1742815/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCT > SRR4302532.4826042/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCT > SRR4302532.4826204/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCT > SRR4302532.2110661/1‑94 (MQ=60)
TTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTG > SRR4302532.83498/1‑94 (MQ=60)
TTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTG > SRR4302532.4850825/1‑94 (MQ=60)
TTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAA < SRR4302532.4203247/94‑1 (MQ=60)
TTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAA < SRR4302532.2106999/94‑1 (MQ=60)
TTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAA < SRR4302532.137014/94‑1 (MQ=60)
TGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAA > SRR4302532.2085595/1‑94 (MQ=60)
TGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAA > SRR4302532.6105195/1‑94 (MQ=60)
TGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAA < SRR4302532.3020783/94‑1 (MQ=60)
GAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAG < SRR4302532.5512160/94‑1 (MQ=60)
GAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAG < SRR4302532.4049306/94‑1 (MQ=60)
AATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGA > SRR4302532.4313206/1‑94 (MQ=60)
AATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGA > SRR4302532.3302104/1‑94 (MQ=60)
ATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAG > SRR4302532.3459117/1‑94 (MQ=60)
ATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAG < SRR4302532.5824587/94‑1 (MQ=60)
ATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAG > SRR4302532.804248/1‑94 (MQ=60)
ATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAG < SRR4302532.2552874/94‑1 (MQ=60)
TATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGA > SRR4302532.5246584/1‑94 (MQ=60)
TATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGA > SRR4302532.563330/1‑94 (MQ=60)
TATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGA > SRR4302532.475245/1‑94 (MQ=60)
TATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGA > SRR4302532.5640508/1‑94 (MQ=60)
ATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGAC > SRR4302532.4636161/1‑94 (MQ=60)
ATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGAC > SRR4302532.3812505/1‑94 (MQ=60)
ATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGAC > SRR4302532.2725862/1‑94 (MQ=60)
ATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGAC < SRR4302532.3076714/94‑1 (MQ=60)
TCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGTGACA < SRR4302532.3553362/94‑1 (MQ=60)
TCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACA > SRR4302532.3148051/1‑94 (MQ=60)
TCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACA > SRR4302532.6162109/1‑94 (MQ=60)
CTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCTATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAA < SRR4302532.6006193/94‑1 (MQ=60)
CTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAA < SRR4302532.6042351/94‑1 (MQ=60)
TATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAAC > SRR4302532.6141497/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACG > SRR4302532.5872303/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACG > SRR4302532.4482878/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACG > SRR4302532.4410860/1‑94 (MQ=60)
TTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGA < SRR4302532.3235391/94‑1 (MQ=60)
TGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGAT > SRR4302532.4389676/1‑94 (MQ=60)
TGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGAT < SRR4302532.824142/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATA < SRR4302532.2327543/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATA > SRR4302532.755197/1‑94 (MQ=60)
GTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAA < SRR4302532.4516786/94‑1 (MQ=60)
GTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAA > SRR4302532.1964215/1‑94 (MQ=60)
GTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCCACGATATTCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAA > SRR4302532.6319541/1‑94 (MQ=60)
CAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACC > SRR4302532.1206781/1‑94 (MQ=60)
CAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACC < SRR4302532.2806898/94‑1 (MQ=60)
CAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACC < SRR4302532.19147/94‑1 (MQ=60)
AGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCT > SRR4302532.848328/1‑94 (MQ=60)
AGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCT > SRR4302532.5803933/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTC < SRR4302532.1930400/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTCGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCG < SRR4302532.4106914/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCG > SRR4302532.5208008/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCG > SRR4302532.3904550/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCG < SRR4302532.5248421/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGAAAACGATAACCTCG > SRR4302532.3918461/1‑94 (MQ=60)
AAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTT < SRR4302532.4732027/94‑1 (MQ=60)
AAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTT < SRR4302532.4056244/94‑1 (MQ=60)
AATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTT < SRR4302532.1683286/94‑1 (MQ=60)
ATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTT > SRR4302532.4660595/1‑94 (MQ=60)
TTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTA < SRR4302532.852535/94‑1 (MQ=60)
TTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAA < SRR4302532.3161096/94‑1 (MQ=60)
TATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAA > SRR4302532.4254059/1‑94 (MQ=60)
ATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAAT < SRR4302532.4240837/94‑1 (MQ=60)
TTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATA < SRR4302532.2505848/94‑1 (MQ=60)
TTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATA < SRR4302532.4571653/94‑1 (MQ=60)
TGCTCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCCCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATAT > SRR4302532.494373/1‑94 (MQ=60)
TGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATAT > SRR4302532.494374/1‑94 (MQ=60)
TGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATAT < SRR4302532.4065041/94‑1 (MQ=60)
TGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATAT < SRR4302532.2363339/94‑1 (MQ=60)
TGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATAT > SRR4302532.3474858/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATG > SRR4302532.5511751/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATG > SRR4302532.2478819/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGC > SRR4302532.5983319/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGC > SRR4302532.750712/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGC > SRR4302532.5889105/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGC < SRR4302532.3359146/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGC > SRR4302532.3670673/1‑94 (MQ=60)
TCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCC < SRR4302532.1817344/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCTTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCG < SRR4302532.4052675/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCG > SRR4302532.1882243/1‑94 (MQ=60)
AGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGA > SRR4302532.6197385/1‑94 (MQ=60)
GTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGAC < SRR4302532.2735449/94‑1 (MQ=60)
GTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGAC > SRR4302532.6164341/1‑94 (MQ=60)
TTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACG > SRR4302532.5731937/1‑94 (MQ=60)
TTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACG > SRR4302532.538392/1‑94 (MQ=60)
TTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACG > SRR4302532.538393/1‑94 (MQ=60)
CTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTT > SRR4302532.3070189/1‑94 (MQ=60)
CTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTT < SRR4302532.3053603/94‑1 (MQ=60)
CTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTT > SRR4302532.1158580/1‑94 (MQ=60)
TAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTA > SRR4302532.3352318/1‑94 (MQ=60)
TAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTA > SRR4302532.759894/1‑94 (MQ=60)
TAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTA > SRR4302532.4911049/1‑94 (MQ=60)
AAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTAT < SRR4302532.3824528/94‑1 (MQ=60)
ATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCA > SRR4302532.493161/1‑94 (MQ=60)
ATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCA > SRR4302532.3555884/1‑94 (MQ=60)
TCGATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCAT < SRR4302532.5580288/94‑1 (MQ=60)
TCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCAT > SRR4302532.4992594/1‑94 (MQ=60)
TCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCAT < SRR4302532.2440541/94‑1 (MQ=60)
CGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATT > SRR4302532.3516373/1‑94 (MQ=60)
CGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATT < SRR4302532.5817907/94‑1 (MQ=60)
GATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTG > SRR4302532.4315398/1‑94 (MQ=60)
GATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTG > SRR4302532.1013353/1‑94 (MQ=60)
GATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTG > SRR4302532.5715159/1‑94 (MQ=60)
GATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTG > SRR4302532.4399332/1‑94 (MQ=60)
GATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTG < SRR4302532.3041384/94‑1 (MQ=60)
GATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTG > SRR4302532.1921600/1‑94 (MQ=60)
ATTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGA > SRR4302532.908782/1‑94 (MQ=60)
TTAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAG < SRR4302532.6256191/94‑1 (MQ=60)
TTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAG < SRR4302532.5702198/94‑1 (MQ=60)
TAAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGC < SRR4302532.5600935/94‑1 (MQ=60)
AAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCC < SRR4302532.3766894/94‑1 (MQ=60)
AAACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCC < SRR4302532.4340391/94‑1 (MQ=60)
AACCGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCG > SRR4302532.1903833/1‑94 (MQ=60)
AACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCG < SRR4302532.2698845/94‑1 (MQ=60)
AACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCG < SRR4302532.4492949/94‑1 (MQ=60)
CCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAA > SRR4302532.4411825/1‑94 (MQ=60)
CGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAAC > SRR4302532.3989692/1‑94 (MQ=60)
CGGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAAC < SRR4302532.6109495/94‑1 (MQ=60)
CGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAAC > SRR4302532.4856377/1‑94 (MQ=60)
CGGAATCTCGCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATACCCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAAC < SRR4302532.2892732/94‑1 (MQ=60)
GGAATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACC > SRR4302532.4127227/1‑94 (MQ=60)
GGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACC > SRR4302532.3802163/1‑94 (MQ=60)
GGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACC > SRR4302532.4673257/1‑94 (MQ=60)
GGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACC > SRR4302532.6143083/1‑94 (MQ=60)
ATCTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAA > SRR4302532.5970304/1‑94 (MQ=60)
ATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAA > SRR4302532.1641430/1‑94 (MQ=60)
TCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAAT < SRR4302532.4498091/94‑1 (MQ=60)
CTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATC < SRR4302532.1773848/94‑1 (MQ=60)
CTCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATC > SRR4302532.1098138/1‑94 (MQ=60)
CTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATC < SRR4302532.530472/94‑1 (MQ=60)
CCCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCGCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATC < SRR4302532.530471/94‑1 (MQ=60)
TCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCG < SRR4302532.3422303/94‑1 (MQ=60)
TCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCG < SRR4302532.3856165/94‑1 (MQ=60)
TCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCG > SRR4302532.2851653/1‑94 (MQ=60)
TCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCG > SRR4302532.2397420/1‑94 (MQ=60)
TCTCGGCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCG < SRR4302532.5634534/94‑1 (MQ=60)
TCGGCGATATCCTTGGCGATCTTCTGAAAAAAGAAACAACGATAACCTCGTTTTTAAATCTGCCGACGTTATCATTTCGCCGAACCGAATCGAG > SRR4302532.862261/1‑94 (MQ=60)
CGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCGAGT < SRR4302532.5990433/94‑1 (MQ=60)
GACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCGAGTA > SRR4302532.5901431/1‑94 (MQ=60)
GCGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCGAGTAT < SRR4302532.1884696/94‑1 (MQ=60)
|
TTATGGCAATTGCCAATGTTCATTTTGATGAATATCTATTGGTCAGAAAAAATTTATTGATCAGTTCTAAATCGATTAAACCGGAATCTCTCGACGATATCCTTGGCGATATTCTGAAAAAAGAGACAACGATAACCTCGTTTTTAAATATGCCGACGTTATCATTGAGCCGAACCGAATCGAGTAT > NC_000913/2022237‑2022423
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
