Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCACG > NC_000913/4333221‑4333407
|
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CAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAT < SRR4302532.1719977/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAT < SRR4302532.6019270/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGT < SRR4302532.4926774/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGT > SRR4302532.696980/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGT < SRR4302532.4684882/94‑1 (MQ=60)
CCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTA < SRR4302532.2537929/94‑1 (MQ=60)
CCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTA < SRR4302532.5517479/94‑1 (MQ=60)
CCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTA < SRR4302532.135694/94‑1 (MQ=60)
CTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAG > SRR4302532.5885500/1‑94 (MQ=60)
TTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGC > SRR4302532.5985156/1‑94 (MQ=60)
TTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGC > SRR4302532.3057144/1‑94 (MQ=60)
TAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCC < SRR4302532.5222952/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCC < SRR4302532.4764366/94‑1 (MQ=60)
AAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCG < SRR4302532.5782585/94‑1 (MQ=60)
AGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGG < SRR4302532.2212986/94‑1 (MQ=60)
AGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGG < SRR4302532.2254852/94‑1 (MQ=60)
GTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGT < SRR4302532.5895225/94‑1 (MQ=60)
TTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTT > SRR4302532.2771757/1‑94 (MQ=60)
TTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTT < SRR4302532.5517241/94‑1 (MQ=60)
TTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTT > SRR4302532.4327325/1‑94 (MQ=60)
TTCTTAAGGATGGCGTTTAGGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGAATCTAAGGGATACGGGATTTTATGTAGCCGGTT > SRR4302532.704179/1‑94 (MQ=60)
CTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGT > SRR4302532.4781679/1‑94 (MQ=60)
TTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTA < SRR4302532.4252114/94‑1 (MQ=60)
TTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTA > SRR4302532.3493813/1‑94 (MQ=60)
TTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTA > SRR4302532.6133757/1‑94 (MQ=60)
TAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAA > SRR4302532.5559175/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTC < SRR4302532.99687/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCA > SRR4302532.5405220/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCTTTTATGTTTGATGGATTAAGGGGGATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTGTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCA > SRR4302532.3874225/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCTTTTATGTTTGATAGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCATATAGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCA < SRR4302532.5677752/94‑1 (MQ=60)
TTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAG < SRR4302532.1597944/94‑1 (MQ=60)
TTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAG < SRR4302532.3184040/94‑1 (MQ=60)
TGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGC < SRR4302532.4802409/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGC > SRR4302532.5140184/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCA < SRR4302532.5241690/94‑1 (MQ=60)
TTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATA > SRR4302532.866984/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACAT > SRR4302532.402611/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACAT > SRR4302532.402610/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACAT > SRR4302532.5063047/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACAT > SRR4302532.1645343/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACAT < SRR4302532.3305395/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATG < SRR4302532.1213282/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATG < SRR4302532.1123782/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATG < SRR4302532.638417/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGATTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATG > SRR4302532.5781652/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCTTGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGG < SRR4302532.2418967/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGG < SRR4302532.443196/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGG < SRR4302532.738337/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGG < SRR4302532.2064463/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGC > SRR4302532.6036463/1‑94 (MQ=60)
TTCGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGC < SRR4302532.4145432/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCG > SRR4302532.4946043/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCG > SRR4302532.543391/1‑94 (MQ=60)
TTGCGGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCG < SRR4302532.4781702/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGG < SRR4302532.2240525/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGT > SRR4302532.1923911/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTG > SRR4302532.242257/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTG < SRR4302532.65319/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCACACATGGCGGTG > SRR4302532.5783769/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTG > SRR4302532.555513/1‑94 (MQ=60)
GGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGAT < SRR4302532.3709828/94‑1 (MQ=60)
GGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGAT > SRR4302532.4995672/1‑94 (MQ=60)
GGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGAT > SRR4302532.2396250/1‑94 (MQ=60)
GATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATG < SRR4302532.5105116/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGA > SRR4302532.1906502/1‑94 (MQ=60)
ATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGA < SRR4302532.278520/94‑1 (MQ=60)
TAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACC > SRR4302532.6135544/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCTGCGCATACATGGCGGTGATGACC > SRR4302532.3603616/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACC > SRR4302532.6345438/1‑94 (MQ=60)
AAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACtt > SRR4302532.4356410/1‑92 (MQ=60)
AGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCAT < SRR4302532.4603456/94‑1 (MQ=60)
AGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCAT < SRR4302532.3148267/94‑1 (MQ=60)
AGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCAT > SRR4302532.4134213/1‑94 (MQ=60)
GGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATC < SRR4302532.5712674/94‑1 (MQ=60)
GGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCA > SRR4302532.47215/1‑94 (MQ=60)
GGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCA < SRR4302532.3650401/94‑1 (MQ=60)
GGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCA < SRR4302532.346285/94‑1 (MQ=60)
GGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAG < SRR4302532.5551056/94‑1 (MQ=60)
GGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAG < SRR4302532.4192905/94‑1 (MQ=60)
GGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAG < SRR4302532.2347587/94‑1 (MQ=60)
GGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAG < SRR4302532.2001978/94‑1 (MQ=60)
GGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAG > SRR4302532.908842/1‑94 (MQ=60)
GAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGG < SRR4302532.1720122/94‑1 (MQ=60)
GAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGG > SRR4302532.3603748/1‑94 (MQ=60)
GAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGG < SRR4302532.6023169/94‑1 (MQ=60)
AATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGG < SRR4302532.1665034/94‑1 (MQ=60)
AATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGG < SRR4302532.3941472/94‑1 (MQ=60)
AATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGG < SRR4302532.3515850/94‑1 (MQ=60)
ATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGT < SRR4302532.1643332/94‑1 (MQ=60)
ATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGT < SRR4302532.4730639/94‑1 (MQ=60)
TAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGA > SRR4302532.5309688/1‑94 (MQ=60)
ATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACA < SRR4302532.666983/94‑1 (MQ=60)
ATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACA < SRR4302532.1613675/94‑1 (MQ=60)
TCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAA > SRR4302532.423419/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAA > SRR4302532.6108585/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAA > SRR4302532.3455770/1‑94 (MQ=60)
TTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATG < SRR4302532.3106265/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATG < SRR4302532.4739475/94‑1 (MQ=60)
TTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATG < SRR4302532.4785701/94‑1 (MQ=60)
TGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCTGGGTGACAAATGA > SRR4302532.5853902/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGA > SRR4302532.6235684/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGA < SRR4302532.595254/94‑1 (MQ=60)
TGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGA < SRR4302532.3417270/94‑1 (MQ=60)
TCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGAC < SRR4302532.4961546/94‑1 (MQ=60)
GCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGTCGGTGATGACCATCAGGGTGACTAATGAC > SRR4302532.5860947/1‑94 (MQ=60)
GCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGAC > SRR4302532.1398832/1‑94 (MQ=60)
GCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGAC > SRR4302532.4708205/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACC > SRR4302532.2246941/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACC > SRR4302532.361615/1‑94 (MQ=60)
TATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCAC > SRR4302532.1241882/1‑94 (MQ=60)
TATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCAC > SRR4302532.406956/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGGGACAAATGACCACA > SRR4302532.613637/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATA > SRR4302532.2654216/1‑94 (MQ=60)
GGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAA < SRR4302532.2416511/94‑1 (MQ=60)
GTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAAC < SRR4302532.6256559/94‑1 (MQ=60)
GCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCCCATAACCT > SRR4302532.5434293/1‑94 (MQ=60)
CATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTC < SRR4302532.2256871/94‑1 (MQ=60)
CATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTC < SRR4302532.4967435/94‑1 (MQ=60)
ATCTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCT < SRR4302532.4467193/94‑1 (MQ=60)
ATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCT > SRR4302532.2067216/1‑94 (MQ=60)
ATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCT > SRR4302532.2067217/1‑94 (MQ=60)
atacgagatacgggagTTTATGTAGCCGGTTGTAAGTCAGCGTATACATGGCGGTGATGACCATCAGGCAGACAAATGACCACATAACCTCTTT > SRR4302532.1443406/17‑94 (MQ=60)
CTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTT > SRR4302532.5134703/1‑94 (MQ=60)
CTAAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTT < SRR4302532.5801597/94‑1 (MQ=60)
CTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTT > SRR4302532.1443405/1‑94 (MQ=60)
CTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTT > SRR4302532.4175566/1‑94 (MQ=60)
CTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTT > SRR4302532.3719131/1‑94 (MQ=60)
CTAAGGGATACGGGGTTTTGGGTAGCCGGTTGTAATTCAGGGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGAACACATAACCTCTTT > SRR4302532.2535004/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTC < SRR4302532.155593/94‑1 (MQ=60)
TAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTC < SRR4302532.3597700/94‑1 (MQ=60)
AAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCG < SRR4302532.1253635/94‑1 (MQ=60)
AAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCG < SRR4302532.2035402/94‑1 (MQ=60)
AAGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCG < SRR4302532.1862341/94‑1 (MQ=60)
AAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCG < SRR4302532.2744643/94‑1 (MQ=60)
AGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGC > SRR4302532.2798884/1‑94 (MQ=60)
AGGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGC > SRR4302532.715209/1‑94 (MQ=60)
GGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCT < SRR4302532.4425435/94‑1 (MQ=60)
GGGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCT < SRR4302532.2888761/94‑1 (MQ=60)
GGATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTC > SRR4302532.735228/1‑94 (MQ=60)
GATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCC < SRR4302532.4587181/94‑1 (MQ=60)
GATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCC < SRR4302532.3864628/94‑1 (MQ=60)
ATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCGGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCG > SRR4302532.5086214/1‑94 (MQ=60)
ATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCG < SRR4302532.3134711/94‑1 (MQ=60)
ATACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCCCCG > SRR4302532.1633340/1‑94 (MQ=60)
TACGGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGG < SRR4302532.6096777/94‑1 (MQ=60)
GGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACC > SRR4302532.3755846/1‑94 (MQ=60)
GGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACC > SRR4302532.4438559/1‑94 (MQ=60)
GGGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACC > SRR4302532.2531421/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGCGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCC > SRR4302532.2296288/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATCACCACATAACCTCTTTCGCTCC‑GACCCC > SRR4302532.6110738/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCC > SRR4302532.1312737/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTATGTTGCCTGTTTTAATTCAGCGCATACATGGTGGTGATGTCCTTTATGGTGTCATATGACCACTTAACCTCTTTCGCTCCTGACCCT > SRR4302532.5869442/1‑94 (MQ=21)
GTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGCCCCC < SRR4302532.3206796/94‑1 (MQ=60)
TTTGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACC < SRR4302532.5249794/94‑1 (MQ=60)
TGTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCAC > SRR4302532.5052851/1‑94 (MQ=60)
TATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGGGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCAC > SRR4302532.388628/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCACG < SRR4302532.1344518/94‑1 (MQ=60)
ATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCACG > SRR4302532.4692722/1‑94 (MQ=60)
|
CCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCACG > NC_000913/4333221‑4333407
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
