Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,125,900 |
A→G |
Q174R (CAG→CGG) |
yceH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,125,900 | 0 | A | G | 82.8%
| 471.5
/ 93.0
| 204 | Q174R (CAG→CGG) | yceH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (18/17); new base G (83/86); total (101/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.54e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.67e-01 |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAG > NC_000913/1125808‑1125991
|
aaGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGc > 2:1503072/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTCCTTTTGTGGTGTGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGcc > 1:6490309/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGcc > 2:4013267/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGcc < 2:1438256/93‑1 (MQ=255)
aGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGcc < 2:4033581/93‑1 (MQ=255)
tGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATcggccggc > 2:1779254/1‑93 (MQ=255)
tGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATcggccggc > 2:4353737/1‑93 (MQ=255)
tGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATcggccggc > 1:4264855/1‑93 (MQ=255)
tGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATcggccggc < 2:516707/93‑1 (MQ=255)
tGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCcggc < 2:4954318/93‑1 (MQ=255)
ggTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCcggcg > 2:5528319/1‑93 (MQ=255)
ggTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCcggcg < 1:571424/93‑1 (MQ=255)
gTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCcggcgg < 1:5806092/93‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGTGGTGTGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGt < 1:4697716/93‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGt < 2:2600044/93‑1 (MQ=255)
cTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGa < 1:6303596/93‑1 (MQ=255)
cTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGGAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGa > 1:5937094/1‑93 (MQ=255)
ttttGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGAc < 2:3500160/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACgg < 1:3684084/93‑1 (MQ=255)
tggtgCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGata < 2:3147415/93‑1 (MQ=255)
ggtgCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGatat < 1:3039550/93‑1 (MQ=255)
tgCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGt < 2:2072101/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGa < 2:3818013/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGa > 1:1055076/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGaa < 2:1090592/93‑1 (MQ=255)
cTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAc < 2:6013905/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAcg > 2:6183023/1‑93 (MQ=255)
tGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAcg > 1:3373/1‑93 (MQ=255)
ggCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAcgc > 2:199550/1‑93 (MQ=255)
ggCCCACGAACCGAGTAAACGCGACATCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAcgc < 1:6516009/93‑1 (MQ=255)
gCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAcgcg > 2:2689806/1‑93 (MQ=255)
cccGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGTCGGATATGGCGACCGCgg > 1:1903588/1‑93 (MQ=255)
ccGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGt < 1:455548/93‑1 (MQ=255)
ccGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGt < 2:6599377/93‑1 (MQ=255)
ccGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGt < 1:1654868/93‑1 (MQ=255)
cgcgAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGtt < 2:5563991/93‑1 (MQ=255)
cgcgAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGtt < 1:2239355/93‑1 (MQ=255)
gcgAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTg > 1:5857840/1‑93 (MQ=255)
gAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGGTGAc > 1:3884602/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAAGCGGTTGACg > 1:2466757/1‑93 (MQ=255)
ccGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGt < 1:5772226/93‑1 (MQ=255)
cGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTg > 1:6146821/1‑93 (MQ=255)
gggTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGa < 1:5495934/93‑1 (MQ=255)
tAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGAttt > 1:4477047/1‑93 (MQ=255)
aCGGGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGATGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACa < 1:1383026/93‑1 (MQ=255)
cgcgAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGCTTTTCAg > 2:16715/1‑93 (MQ=255)
cgcgAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAg < 1:2758653/93‑1 (MQ=255)
agcgAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAg < 2:1736599/92‑1 (MQ=255)
gcgAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAgg > 1:4966631/1‑93 (MQ=255)
cgAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGc < 2:4624821/93‑1 (MQ=255)
cgAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGGTGACGGTGATTTACAGGc > 2:5508883/1‑93 (MQ=255)
gAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGcc < 1:1517531/93‑1 (MQ=255)
gAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGcc < 2:1418489/93‑1 (MQ=255)
gAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGcc > 2:3514062/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGccc < 2:221180/93‑1 (MQ=255)
aaaaCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGccc < 1:3657105/93‑1 (MQ=255)
aagccGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCcg < 1:68822/90‑1 (MQ=255)
acccGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCcgc < 2:2473992/91‑1 (MQ=255)
aaCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCcgc < 1:41134/93‑1 (MQ=255)
aaCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCcgc < 1:6032428/93‑1 (MQ=255)
cGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTc > 2:4499556/1‑93 (MQ=255)
cGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTc < 2:331085/93‑1 (MQ=255)
cTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGa < 2:4755111/93‑1 (MQ=255)
cTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGa > 2:4527995/1‑93 (MQ=255)
cTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGa > 2:5858437/1‑93 (MQ=255)
cTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGa < 2:3086974/93‑1 (MQ=255)
cTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGa < 2:1014067/93‑1 (MQ=255)
tACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGaa < 2:1425395/93‑1 (MQ=255)
tACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGaa > 1:4762793/1‑93 (MQ=255)
aCATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAg > 2:2057348/1‑93 (MQ=255)
aCATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAg > 2:5339954/1‑93 (MQ=255)
aTGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGcc > 2:735067/1‑93 (MQ=255)
aTGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGcc > 2:1586881/1‑93 (MQ=255)
tGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGccc < 1:5594584/93‑1 (MQ=255)
tGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGccc < 1:5385556/93‑1 (MQ=255)
tGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGGGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGccc > 1:2660507/1‑93 (MQ=255)
gCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCt < 2:2850221/93‑1 (MQ=255)
gCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCt < 1:2837570/93‑1 (MQ=255)
gCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCt < 1:4795752/93‑1 (MQ=255)
gCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCt < 2:5224587/93‑1 (MQ=255)
cATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTg > 1:3537812/1‑93 (MQ=255)
cATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTg < 2:6555328/93‑1 (MQ=255)
aTCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTgg < 2:3009272/93‑1 (MQ=255)
tCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGa < 2:3067826/93‑1 (MQ=255)
cTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGaa > 1:4756115/1‑93 (MQ=255)
cTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGaa < 1:2337979/93‑1 (MQ=255)
ttttCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGaaa > 2:391196/1‑93 (MQ=255)
cAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGa > 1:1570181/1‑93 (MQ=255)
gtggtgAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAg > 2:6370216/1‑93 (MQ=255)
tggtgAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGt < 1:448310/93‑1 (MQ=255)
tggtgAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGt < 2:1937083/93‑1 (MQ=255)
gtgAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTgg < 1:1636692/93‑1 (MQ=255)
tgAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGc > 2:3689783/1‑93 (MQ=255)
gAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCa < 2:5638231/93‑1 (MQ=255)
gAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCa > 1:1761897/1‑93 (MQ=255)
ttGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAAc < 2:3580624/93‑1 (MQ=255)
aaGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGa < 2:5679120/93‑1 (MQ=255)
aGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGaa > 1:6356449/1‑93 (MQ=255)
gATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGaaa < 1:2714154/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAg > 1:2352614/1‑93 (MQ=255)
|
CGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAG > NC_000913/1125808‑1125991
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAGCG > NC_000913/1125808‑1125993
|
CGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGG < SRR4302547.3633596/94‑1 (MQ=60)
AAGATGGTCCTTTTGTGGTGTGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCC > SRR4302547.6625429/1‑94 (MQ=60)
AAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCC < SRR4302547.4167505/94‑1 (MQ=60)
AGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCG < SRR4302547.4863974/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGC > SRR4302547.6123749/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGC > SRR4302547.4352205/1‑94 (MQ=60)
GGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGG < SRR4302547.581696/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGT < SRR4302547.5926214/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGT > SRR4302547.5212481/1‑94 (MQ=60)
TCCTTTTGTGGTGTGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTG < SRR4302547.4795018/94‑1 (MQ=60)
CCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGA < SRR4302547.3192116/94‑1 (MQ=60)
CCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGGAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGA > SRR4302547.6060208/1‑94 (MQ=60)
CTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGAC < SRR4302547.6434634/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGA > SRR4302547.4789342/1‑94 (MQ=60)
TTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGA < SRR4302547.3759291/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTGCGTCTGGCCCGCGAACCGAGTACACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGTTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGAT < SRR4302547.112442/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATG < SRR4302547.3100039/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCTAAATCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTC < SRR4302547.672599/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCCGTGACGGGTATGTCG > SRR4302547.280237/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGA > SRR4302547.1076055/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAA > SRR4302547.6207404/1‑94 (MQ=60)
CTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACG > SRR4302547.3427/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGCGACCCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCG > SRR4302547.6629658/1‑94 (MQ=60)
GGCCCACGAACCGAGTAAACGCGACATCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCG < SRR4302547.6651666/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGTCGGATATGGCGACCGCGG > SRR4302547.1941249/1‑94 (MQ=60)
CCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTT < SRR4302547.463985/94‑1 (MQ=60)
CCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTT < SRR4302547.1687517/94‑1 (MQ=60)
CGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTG < SRR4302547.2284513/94‑1 (MQ=60)
CGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTG > SRR4302547.5979041/1‑94 (MQ=60)
CGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTG < SRR4302547.3029454/94‑1 (MQ=60)
CGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGAC > SRR4302547.1306339/1‑94 (MQ=60)
CGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGGTGAC > SRR4302547.3963621/1‑94 (MQ=60)
GAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAAAGCGGTTGACG > SRR4302547.2516616/1‑94 (MQ=60)
GAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGGCGAACGCGGTTGACG > SRR4302547.5510788/1‑94 (MQ=60)
AACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGG < SRR4302547.97047/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTG > SRR4302547.6274345/1‑94 (MQ=60)
CCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTG < SRR4302547.5891610/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTG > SRR4302547.5959690/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGAT > SRR4302547.4604875/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGAT < SRR4302547.5609410/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTT > SRR4302547.4569537/1‑94 (MQ=60)
GTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTT < SRR4302547.3757099/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTT < SRR4302547.3694247/94‑1 (MQ=60)
GTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATAT > SRR4302547.6551271/1‑94 (MQ=60)
AAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTAC > SRR4302547.5793191/1‑94 (MQ=60)
AACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACA > SRR4302547.5923779/1‑94 (MQ=60)
ACGGGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGATGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAG < SRR4302547.1410729/94‑1 (MQ=60)
CGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGG > SRR4302547.2121214/1‑94 (MQ=60)
CGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGG < SRR4302547.1925941/94‑1 (MQ=60)
CGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGG > SRR4302547.5069409/1‑94 (MQ=60)
CGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGG < SRR4302547.2813947/94‑1 (MQ=60)
CGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCC > SRR4302547.4847181/1‑94 (MQ=60)
GAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCC < SRR4302547.1547761/94‑1 (MQ=60)
GAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCC < SRR4302547.4461248/94‑1 (MQ=60)
AAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCG < SRR4302547.3731719/94‑1 (MQ=60)
AAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCG > SRR4302547.6026782/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGC < SRR4302547.70110/94‑1 (MQ=60)
AAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGC < SRR4302547.2581840/94‑1 (MQ=60)
AAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGC > SRR4302547.5837455/1‑94 (MQ=60)
AACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCG < SRR4302547.6157611/94‑1 (MQ=60)
AACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCG < SRR4302547.41891/94‑1 (MQ=60)
AACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCG > SRR4302547.2504537/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGT > SRR4302547.1443297/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGT > SRR4302547.1773353/1‑94 (MQ=60)
ACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCACGCGT > SRR4302547.5035515/1‑94 (MQ=60)
CCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTC > SRR4302547.424336/1‑94 (MQ=60)
CCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGGTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTC > SRR4302547.222595/1‑94 (MQ=60)
CGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCG > SRR4302547.4573779/1‑94 (MQ=60)
CGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCG > SRR4302547.6487383/1‑94 (MQ=60)
GCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGA > SRR4302547.99682/1‑94 (MQ=60)
GCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGGTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGGTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGCCGA > SRR4302547.2982052/1‑94 (MQ=60)
CTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGTCCGCGTCGAA > SRR4302547.2386411/1‑94 (MQ=60)
CTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAA > SRR4302547.4861463/1‑94 (MQ=60)
ATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGGGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCC > SRR4302547.2713971/1‑94 (MQ=60)
TGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCT < SRR4302547.5496765/94‑1 (MQ=60)
TGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCT < SRR4302547.5709994/94‑1 (MQ=60)
TGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCT < SRR4302547.1591799/94‑1 (MQ=60)
TGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCT > SRR4302547.4860625/1‑94 (MQ=60)
GCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTG < SRR4302547.4895124/94‑1 (MQ=60)
GCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTG < SRR4302547.6283083/94‑1 (MQ=60)
GCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTG < SRR4302547.2894288/94‑1 (MQ=60)
GCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTG > SRR4302547.3610037/1‑94 (MQ=60)
CATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACTGTGATTTCCAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGG < SRR4302547.2373533/94‑1 (MQ=60)
CATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGG < SRR4302547.4427698/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAA > SRR4302547.3893686/1‑94 (MQ=60)
TCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAA > SRR4302547.4854665/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAA < SRR4302547.2385373/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGGGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCACTGGAAA > SRR4302547.2309213/1‑94 (MQ=60)
TCAGTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGA > SRR4302547.1601443/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGT > SRR4302547.1683700/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTG < SRR4302547.456634/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGG < SRR4302547.5610721/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGG > SRR4302547.5550754/1‑94 (MQ=60)
GTGAGGTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGC < SRR4302547.1669050/94‑1 (MQ=60)
TGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCA > SRR4302547.1796841/1‑94 (MQ=60)
GTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAAC < SRR4302547.3479974/94‑1 (MQ=60)
GTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAAC > SRR4302547.5028308/1‑94 (MQ=60)
GTTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAAC < SRR4302547.1603960/94‑1 (MQ=60)
TTGAAGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACT < SRR4302547.600092/94‑1 (MQ=60)
AAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAA > SRR4302547.6488981/1‑94 (MQ=60)
AGATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAA > SRR4302547.2886965/1‑94 (MQ=60)
GATCGGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAAC < SRR4302547.2768636/94‑1 (MQ=60)
GATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAAC > SRR4302547.2754597/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAG > SRR4302547.2400285/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACTGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGGGGCAGAACTGAAACAGAG > SRR4302547.2102532/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAGCG < SRR4302547.331477/94‑1 (MQ=60)
|
CGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATCGAAGTGGCAGAACTGAAACAGCG > NC_000913/1125808‑1125993
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
