Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,329,673 |
T→C |
V201A (GTT→GCT) |
topA → |
DNA topoisomerase type I omega protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,329,673 | 0 | T | C | 87.2%
| 475.2
/ 54.1
| 180 | V201A (GTT→GCT) | topA | DNA topoisomerase type I omega protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/10); new base C (63/94); total (76/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTG > NC_000913/1329583‑1329762
|
tGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTc > 2:4988434/1‑93 (MQ=255)
ggACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCg > 2:2288909/1‑93 (MQ=255)
gACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGc > 2:6307045/1‑93 (MQ=255)
aCCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGcc > 1:781885/1‑93 (MQ=255)
aCCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGcc < 2:1984445/93‑1 (MQ=255)
cgggtggtgGGGTATATGGTTGCGCGGCTGATATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtg < 1:3640714/90‑1 (MQ=255)
cgcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtg < 1:3230414/93‑1 (MQ=255)
gcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCtgg > 2:415826/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtgg > 2:1805030/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCGCGCCtgg > 2:739068/1‑93 (MQ=255)
cgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggt < 1:446464/93‑1 (MQ=255)
cgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggt < 1:5497170/93‑1 (MQ=255)
tggtggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggtgg < 2:6117354/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggtgg < 2:5663680/93‑1 (MQ=255)
tggaggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggtgg > 1:4818221/1‑93 (MQ=255)
ggtggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTggtggt < 2:688826/93‑1 (MQ=255)
tggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCg < 2:2737103/93‑1 (MQ=255)
gggTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgag > 2:2149330/1‑93 (MQ=255)
gTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcg < 2:1625462/93‑1 (MQ=255)
atatGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtg < 2:2254393/93‑1 (MQ=255)
atGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgag > 1:2684837/1‑93 (MQ=255)
tgttttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgagc < 1:2999840/90‑1 (MQ=255)
gTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgagcgt < 1:1293113/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgagcgt < 2:134086/93‑1 (MQ=255)
tttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGagcgtgagcgtg < 1:1638162/93‑1 (MQ=255)
tttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGagcgtgagcgtg < 1:6135569/93‑1 (MQ=255)
ttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAgcgtgagcgtga < 2:3374676/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaa > 1:2415980/1‑93 (MQ=255)
tCGCCGCTGCTATGGAAAAAGAGCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaa < 1:1926297/93‑1 (MQ=255)
cgccgcTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaaa > 2:4452988/1‑93 (MQ=255)
ccgcTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAAtt < 1:1024084/93‑1 (MQ=255)
cgcTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGCGGTCGAGCGTGAGCGTGCAAGTa > 1:3760511/1‑93 (MQ=255)
ctgctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTaaa < 1:1151271/93‑1 (MQ=255)
ctgctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTaaa < 2:599710/93‑1 (MQ=255)
tgctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAg > 1:4353589/1‑93 (MQ=255)
tctATGGAAAAATATCGCTCTGGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGc < 1:1615529/92‑1 (MQ=255)
gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGGGTGAAATTAAAGc > 2:5368520/1‑93 (MQ=255)
gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGc > 1:4487857/1‑93 (MQ=255)
gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGc < 2:6070859/93‑1 (MQ=255)
gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGAGAGAAATTaaaac > 2:5745054/1‑91 (MQ=255)
tATGGAAAAAGATGGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGt < 1:1693542/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGtt > 1:1398579/1‑93 (MQ=255)
aTGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGtt < 2:4700408/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGGGGTCGAGCGGGGGCGGGAAATTAAAACGtt > 1:2045775/1‑93 (MQ=255)
tGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTc > 1:3934379/1‑93 (MQ=255)
tGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTc < 1:3013152/93‑1 (MQ=255)
tGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTc < 1:5433230/93‑1 (MQ=255)
ggAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCg < 1:3995197/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGt < 2:5823425/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGt < 1:4639925/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTg > 2:2328144/1‑93 (MQ=255)
aaaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGcc > 1:4316633/1‑93 (MQ=255)
aaaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGcc < 2:397847/93‑1 (MQ=255)
aaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCg < 1:2352752/93‑1 (MQ=255)
gATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGa > 2:3638536/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGaa > 1:4829167/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAag < 2:3836635/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAagag > 1:4560510/1‑93 (MQ=255)
cTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGt < 2:6557180/93‑1 (MQ=255)
tCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGtt > 2:6379065/1‑93 (MQ=255)
tCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGtt < 2:3024329/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGGGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCt > 2:1448105/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTg < 2:4926647/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTgg < 2:919565/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTgg < 2:2415997/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTggg < 2:2853088/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTggg > 1:2467382/1‑93 (MQ=255)
cTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGaa > 2:3930378/1‑93 (MQ=255)
cTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGaa > 2:190800/1‑93 (MQ=255)
tGTCTCCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAg < 1:5203732/93‑1 (MQ=255)
gTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGt < 2:2506770/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTCGCGGCTCGCCTGGTGGTCGATCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTc < 1:1528911/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAt < 2:4634286/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAt > 2:4298765/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAt > 1:4967279/1‑93 (MQ=255)
gcGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATg < 1:172877/92‑1 (MQ=255)
ggTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGcc < 2:1140407/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCCGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGcc > 1:6521086/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTAGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGcc > 1:6440993/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCa < 1:6034141/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGTGCAGTCGGTGGCGCCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTTCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCa < 1:5974207/93‑1 (MQ=255)
tCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAg < 1:5808628/93‑1 (MQ=255)
cGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGc < 2:5426310/93‑1 (MQ=255)
gtgtGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCa > 1:5306714/1‑93 (MQ=255)
tgtgCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAc < 1:2714239/93‑1 (MQ=255)
tgtgCAGTCGGTGGCGGCTCGCGTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAc < 2:6417060/93‑1 (MQ=255)
tgtgCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAc < 2:3544803/93‑1 (MQ=255)
gCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGAc < 2:2899613/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGAcc < 1:5729462/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGAcc < 1:637354/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCAc > 1:1935362/1‑93 (MQ=255)
gTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCAc > 2:5203512/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGcc < 2:36952/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGcc > 1:2943926/1‑93 (MQ=255)
cgTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGcc < 1:5271967/92‑1 (MQ=255)
tGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCAt > 1:1010748/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCAt < 2:3486814/93‑1 (MQ=255)
ggcggcTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATc > 1:3157750/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTg > 2:1169158/1‑93 (MQ=255)
cGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCATGCCATCTg < 1:6505135/93‑1 (MQ=255)
|
TGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTG > NC_000913/1329583‑1329762
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTGGTGA > NC_000913/1329580‑1329766
|
TTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGC < SRR4302547.2386473/94‑1 (MQ=60)
TATGGACCGGGTGGTGGGGTATATGGGTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGGGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCT < SRR4302547.1510402/94‑1 (MQ=60)
TATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCT < SRR4302547.2236110/94‑1 (MQ=60)
ATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTC < SRR4302547.378819/94‑1 (MQ=60)
ATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTC < SRR4302547.1439811/94‑1 (MQ=60)
TGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCG < SRR4302547.1563358/94‑1 (MQ=60)
GGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGCAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCCGTGGCGGTTCGC > SRR4302547.3145903/1‑94 (MQ=60)
GACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCC > SRR4302547.796671/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGGTGGGGTATATGGTTGCGCGGCTGATATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGG < SRR4302547.3714971/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGG < SRR4302547.1677566/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGG < SRR4302547.3294889/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGG < SRR4302547.4730083/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTG < SRR4302547.454772/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTG < SRR4302547.5610674/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGG < SRR4302547.5817170/94‑1 (MQ=60)
GTGGAGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGG > SRR4302547.4918073/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTC < SRR4302547.3015228/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTC < SRR4302547.6164732/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGA > SRR4302547.5227269/1‑94 (MQ=60)
GGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGC < SRR4302547.2796957/94‑1 (MQ=60)
TATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTG < SRR4302547.2756514/94‑1 (MQ=60)
ATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGA > SRR4302547.947413/1‑94 (MQ=60)
TATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAG > SRR4302547.2738734/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGC < SRR4302547.4062055/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCG < SRR4302547.3059499/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCG < SRR4302547.2324128/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCG < SRR4302547.5505638/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTG < SRR4302547.1319139/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGA < SRR4302547.6262849/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGA < SRR4302547.1670542/94‑1 (MQ=60)
TTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAA > SRR4302547.2464898/1‑94 (MQ=60)
TCGCCGCTGCTATGGAAAAAGAGCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAA < SRR4302547.1964460/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGGGTGAGCGTGAAAT > SRR4302547.204330/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTA < SRR4302547.1044183/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGCGGTCGAGCGTGAGCGTGCAAGTA > SRR4302547.3837236/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAA < SRR4302547.1973722/94‑1 (MQ=60)
CTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAG > SRR4302547.4443034/1‑94 (MQ=60)
CTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAG < SRR4302547.1174579/94‑1 (MQ=60)
CTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAAATAAAG > SRR4302547.1445824/1‑94 (MQ=60)
TGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGC > SRR4302547.4580552/1‑94 (MQ=60)
TGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGC > SRR4302547.6082469/1‑94 (MQ=60)
TGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGC > SRR4302547.1154407/1‑94 (MQ=60)
TCTATGGAAAAATATCGCTCTGGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCG < SRR4302547.1647515/94‑1 (MQ=60)
CTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCAT > SRR4302547.5359428/1‑94 (MQ=60)
TATGGAAAAAGATGGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTT < SRR4302547.1726851/94‑1 (MQ=60)
TATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTT > SRR4302547.1426561/1‑94 (MQ=60)
TATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTT < SRR4302547.3577596/94‑1 (MQ=60)
TATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGGGGTCGAGCGGGGGCGGGAAATTAAAACGTT > SRR4302547.2086579/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTC > SRR4302547.4014391/1‑94 (MQ=60)
TGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCG < SRR4302547.3073060/94‑1 (MQ=60)
TGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCG < SRR4302547.5545541/94‑1 (MQ=60)
GGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGT < SRR4302547.4076421/94‑1 (MQ=60)
GGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGT < SRR4302547.1381864/94‑1 (MQ=60)
GGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCCTGAGCGTGAAATTAAAGGGTTCGG > SRR4302547.2487877/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTG < SRR4302547.4207193/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTG < SRR4302547.4736026/94‑1 (MQ=60)
AAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCC > SRR4302547.4405475/1‑94 (MQ=60)
AAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGG < SRR4302547.2400426/94‑1 (MQ=60)
GATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAA > SRR4302547.4929289/1‑94 (MQ=60)
TCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGA < SRR4302547.3732899/94‑1 (MQ=60)
CGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAG > SRR4302547.4654858/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTGGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTAGCCTGGTGGTTGAGCGTGAGGGTGAAATTAAAGAGTTCGTGCCGGAAGAGT > SRR4302547.974204/1‑94 (MQ=60)
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TCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTC > SRR4302547.6651286/1‑94 (MQ=60)
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GGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGG > SRR4302547.641143/1‑94 (MQ=60)
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CTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAG < SRR4302547.1265937/94‑1 (MQ=60)
CTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAG > SRR4302547.3246929/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGT > SRR4302547.2603036/1‑94 (MQ=60)
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TCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTCGCGGCTCGCCTGGTGGTCGATCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCG < SRR4302547.1559342/94‑1 (MQ=60)
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TGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAT < SRR4302547.5412079/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGC < SRR4302547.176046/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCC > SRR4302547.5558893/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCCGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCC > SRR4302547.6656846/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTAGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCC > SRR4302547.6575231/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCA > SRR4302547.4495464/1‑94 (MQ=60)
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GTCGTGTGCAGTCGGTGGCGCCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTTCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAG < SRR4302547.6098119/94‑1 (MQ=60)
TCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGC < SRR4302547.5928797/94‑1 (MQ=60)
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CGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCA > SRR4302547.5864074/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTTAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAC > SRR4302547.6579451/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAC > SRR4302547.4900292/1‑94 (MQ=60)
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CAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCA < SRR4302547.649125/94‑1 (MQ=60)
AGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCAC > SRR4302547.1973749/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACG > SRR4302547.1797609/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCC > SRR4302547.3002574/1‑94 (MQ=60)
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TGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATC > SRR4302547.3220549/1‑94 (MQ=60)
GCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTG < SRR4302547.6147542/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTG > SRR4302547.2452482/1‑94 (MQ=60)
CGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCATGCCATCTGG < SRR4302547.6640540/94‑1 (MQ=60)
GGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACACCATCTGGT < SRR4302547.6616761/94‑1 (MQ=60)
GCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTGGTG < SRR4302547.1891472/94‑1 (MQ=60)
GCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTGGTG < SRR4302547.46884/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTGGTGA < SRR4302547.4831935/94‑1 (MQ=60)
|
TTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTGGTGA > NC_000913/1329580‑1329766
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
