Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,809,082 |
T→C |
V42A (GTT→GCT) |
b1729 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,809,082 | 0 | T | C | 88.0%
| 528.7
/ 51.6
| 191 | V42A (GTT→GCT) | b1729 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/14); new base C (80/88); total (89/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TCGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCT > NC_000913/1808992‑1809171
|
tCGTTGTACTTCTGTTTGCGCTGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGctt < 2:773810/93‑1 (MQ=255)
gTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGctttt > 1:849651/1‑93 (MQ=255)
ttGTTCTGCTGTTCGCGCTTCCTCAACCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTTCTGGTGTGTCTGGTGATGGGTGTTGCTTTTg < 1:720963/93‑1 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTg > 1:1081790/1‑93 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTg > 1:93200/1‑93 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTg > 1:310215/1‑93 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTg > 2:5582041/1‑93 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTg > 2:5962542/1‑93 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCTGCCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTg < 2:5750958/93‑1 (MQ=255)
ttGTACTGCTGTTTGCGCGGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTg < 2:5125450/93‑1 (MQ=255)
tGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTgg > 1:6126469/1‑93 (MQ=255)
tcgtgctgTTGGCGGGGGCTCACCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGcc < 2:107839/90‑1 (MQ=255)
tcctgctgTTGGCGGTCGCCCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGcc < 2:2439328/91‑1 (MQ=255)
tctgctgTTTGCGCTGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCt < 1:5283180/92‑1 (MQ=255)
tctgctgTTGGCGCTGCCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCt < 2:1296985/92‑1 (MQ=255)
aCTGTTGTTGGCGCGGACTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCt < 1:320826/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGTTTGCGCTGTCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCt < 1:6160676/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTATgtcaa > 1:3715339/1‑89 (MQ=255)
aCTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGCCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCt > 2:4670281/1‑93 (MQ=255)
ctggtgTTGGCGGTGCCTGACCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCtt < 2:6181297/93‑1 (MQ=255)
ctgctgTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCtt > 1:1022915/1‑93 (MQ=255)
tctgTTTGCGCTGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGc < 1:5587894/92‑1 (MQ=255)
gctgTTTGCGCTGTCTCACCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGc < 1:2035611/93‑1 (MQ=255)
gctgTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGc > 1:2854221/1‑93 (MQ=255)
ctgTTTGCGCTGCCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGcc < 2:1187689/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCGGCCTCGGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGc < 2:6102766/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATa > 1:3046653/1‑93 (MQ=255)
cgcTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATa > 1:1760186/1‑93 (MQ=255)
gcTGCCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATAc < 1:421286/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATAcc > 1:5032731/1‑93 (MQ=255)
tGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCa < 1:6410010/93‑1 (MQ=255)
ggCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCAt < 2:3152863/93‑1 (MQ=255)
ccTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCAtt < 2:3483660/92‑1 (MQ=255)
tCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTa < 1:2515730/93‑1 (MQ=255)
cacccccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTAt < 1:4574522/89‑1 (MQ=255)
cgccccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATg < 2:3258217/90‑1 (MQ=255)
aGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATg > 2:219676/1‑93 (MQ=255)
aGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGGGTGGTGATGGGTGTGGGTTTTGGTCTTGCCCTGCATACCATTTATg > 2:4857125/1‑93 (MQ=255)
gACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATgg > 2:2114638/1‑93 (MQ=255)
gACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATgg > 2:1426696/1‑93 (MQ=255)
aCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGt > 2:3012945/1‑93 (MQ=255)
ccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTc < 1:6000973/93‑1 (MQ=255)
ccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTCATGGTTc < 1:6312676/93‑1 (MQ=255)
ccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGttt > 1:1907452/1‑92 (MQ=255)
ccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTc < 2:784717/93‑1 (MQ=255)
ccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTc > 2:424463/1‑93 (MQ=255)
ccGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTc < 2:706773/93‑1 (MQ=255)
gCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTg < 2:3700787/93‑1 (MQ=255)
gCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTg > 2:1004794/1‑93 (MQ=255)
aTAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACa < 1:1694933/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGc < 2:4349451/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGc < 1:3516098/93‑1 (MQ=255)
aaCAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGATTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGcc < 2:3567555/93‑1 (MQ=255)
aCAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATTGTTCTGACAGCCa > 1:1266919/1‑93 (MQ=255)
aCAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCa < 2:747464/93‑1 (MQ=255)
cAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAg < 1:648266/93‑1 (MQ=255)
aGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAgg < 2:1707443/93‑1 (MQ=255)
aGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAgg < 1:5957051/93‑1 (MQ=255)
gTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGGCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGAGAGCCAGGt > 1:384235/1‑93 (MQ=255)
tGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTa < 1:217186/93‑1 (MQ=255)
tGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTa > 2:658281/1‑93 (MQ=255)
ggAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTAc > 1:3059060/1‑93 (MQ=255)
gAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACt > 2:1918793/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTa < 2:5384414/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTaa < 1:2968917/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTaaa < 2:4030051/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTaaa < 1:1830933/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTaaa < 2:1546042/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTaaa < 2:2750234/93‑1 (MQ=255)
gCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGAt < 2:2286279/93‑1 (MQ=255)
gCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGAt < 1:6210429/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTc > 1:4877282/1‑93 (MQ=255)
gAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTc < 1:3885186/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCt > 1:2634664/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTg > 1:5880545/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTg > 1:6080321/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTa < 2:518499/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTa < 2:2598490/93‑1 (MQ=255)
aaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTAc > 1:1449427/1‑93 (MQ=255)
aaGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTAc > 1:546977/1‑93 (MQ=255)
aGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACa < 1:2870016/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCAGTACa < 1:1990787/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAg > 2:4111441/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGt < 2:623420/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTg > 2:1220478/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTgg > 2:627444/1‑93 (MQ=255)
ggtggGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGtt > 1:5091701/1‑93 (MQ=255)
gggTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTaa > 2:439809/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAAc < 1:4025867/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATc < 1:3290083/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATc > 1:4142188/1‑93 (MQ=255)
gTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGATAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGtt > 1:964153/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTg > 2:5282383/1‑93 (MQ=255)
gATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTgg > 2:1352255/1‑93 (MQ=255)
gATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTgg < 1:1406701/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTa > 2:4976360/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTa < 2:1802612/93‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTaa < 1:1655470/93‑1 (MQ=255)
gtgGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGc < 2:4328259/93‑1 (MQ=255)
tgGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCt > 1:5741523/1‑93 (MQ=255)
|
TCGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCT > NC_000913/1808992‑1809171
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATG > NC_000913/1808993‑1809174
|
tgttttccggcttTTTGCGCGGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTT < SRR4302547.6645958/81‑1 (MQ=60)
CGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTT > SRR4302547.2913025/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTT > SRR4302547.865880/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTT > SRR4302547.767078/1‑94 (MQ=60)
ttttttttcttttttgcgtgcgctccccCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTG < SRR4302547.3977143/66‑1 (MQ=60)
GTTTTACTGTTGTTTGCGCTGGCTCACCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTG < SRR4302547.1810834/94‑1 (MQ=60)
GTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTG > SRR4302547.1103392/1‑94 (MQ=60)
GTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTG > SRR4302547.94940/1‑94 (MQ=60)
GTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTG > SRR4302547.315989/1‑94 (MQ=60)
TTGTTCTGCTGTTCGCGCTTCCTCAACCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTTCTGGTGTGTCTGGTGATGGGTGTTGCTTTTGG < SRR4302547.734380/94‑1 (MQ=50)
TTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGG > SRR4302547.6253557/1‑94 (MQ=60)
gctgctgttgccgcgcccgcagcCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTT < SRR4302547.6503443/71‑1 (MQ=60)
TCTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTT < SRR4302547.5392166/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTGTTGGCGCGGACTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTT < SRR4302547.326789/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGTTTGCGCTGTCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTT < SRR4302547.6288532/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTT > SRR4302547.1042984/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTG > SRR4302547.1574193/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGC > SRR4302547.2911253/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCATTGC > SRR4302547.3133875/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTTGCGCTGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCC < SRR4302547.5703162/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTGCGCTGTCTCACCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCC < SRR4302547.2076178/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGGCTTGCCC > SRR4302547.3614035/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATA > SRR4302547.1795072/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATA > SRR4302547.3107278/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCTCAGACCCACCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATAC > SRR4302547.4282223/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCCCACACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATAC < SRR4302547.4140529/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACC > SRR4302547.2144740/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACC > SRR4302547.5136712/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACC < SRR4302547.429093/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCA > SRR4302547.5697074/1‑94 (MQ=60)
CGGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCA < SRR4302547.6336796/94‑1 (MQ=60)
GGGCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCAT < SRR4302547.6543689/94‑1 (MQ=60)
GCTCAGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTT < SRR4302547.3294982/94‑1 (MQ=60)
ccagcCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTAT < SRR4302547.2566588/89‑1 (MQ=60)
ccagcCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTAT < SRR4302547.1004695/89‑1 (MQ=60)
caagcCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTAT < SRR4302547.393723/89‑1 (MQ=60)
caccCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATG < SRR4302547.4669183/90‑1 (MQ=60)
AGCCCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGG < SRR4302547.1352828/94‑1 (MQ=60)
AGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAATAAGAGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGGATACCATTTATGG > SRR4302547.1495865/1‑94 (MQ=60)
AGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGG > SRR4302547.1913525/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTC > SRR4302547.917116/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTT > SRR4302547.1945201/1‑94 (MQ=60)
CCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCT < SRR4302547.6125504/94‑1 (MQ=60)
CCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTCATGGTTCT < SRR4302547.6443935/94‑1 (MQ=60)
CCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCT < SRR4302547.3390502/94‑1 (MQ=60)
CCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGAC > SRR4302547.6260155/1‑94 (MQ=60)
CCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGAC < SRR4302547.2841557/94‑1 (MQ=60)
CATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACA > SRR4302547.5299189/1‑94 (MQ=60)
CATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACA < SRR4302547.1144872/94‑1 (MQ=60)
ATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAG < SRR4302547.1728262/94‑1 (MQ=60)
AAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCC < SRR4302547.3587879/94‑1 (MQ=60)
AACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATTGTTCTGACAGCCA > SRR4302547.1292434/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGG < SRR4302547.660211/94‑1 (MQ=60)
CAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGG < SRR4302547.4880987/94‑1 (MQ=60)
TGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGT > SRR4302547.5422801/1‑94 (MQ=60)
AGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGT < SRR4302547.960383/94‑1 (MQ=60)
AGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGT < SRR4302547.6080572/94‑1 (MQ=60)
AGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGGCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGAGAGCCAGGT > SRR4302547.391359/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTA < SRR4302547.1474507/94‑1 (MQ=60)
TGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTAC < SRR4302547.221289/94‑1 (MQ=60)
TGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTAC > SRR4302547.3119917/1‑94 (MQ=60)
GGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACT > SRR4302547.3232781/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAA < SRR4302547.440100/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGCGATGGGAGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCTAGGTACTTAA > SRR4302547.2640415/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAA < SRR4302547.3028010/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAG < SRR4302547.1867123/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGAT < SRR4302547.2523586/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATT < SRR4302547.1975112/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATT < SRR4302547.6339384/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTC > SRR4302547.4978329/1‑94 (MQ=60)
CGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTC > SRR4302547.6121059/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCT < SRR4302547.3964219/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCT > SRR4302547.2687726/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTG > SRR4302547.6206440/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTG > SRR4302547.6002301/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGT < SRR4302547.3082775/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTAC > SRR4302547.556853/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTAC > SRR4302547.1478414/1‑94 (MQ=60)
AGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAG < SRR4302547.2927345/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCAGTACAG < SRR4302547.2030332/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGG > SRR4302547.3930066/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTT > SRR4302547.5196719/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTT < SRR4302547.2075625/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTT > SRR4302547.3016478/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACA < SRR4302547.4107662/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGACAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACA > SRR4302547.6191388/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATC > SRR4302547.4226484/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATC > SRR4302547.400965/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCG < SRR4302547.5889312/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCG < SRR4302547.3356136/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGT > SRR4302547.1690692/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGT > SRR4302547.3914665/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGATAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTT > SRR4302547.982879/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTT < SRR4302547.6035828/94‑1 (MQ=60)
GTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTG < SRR4302547.5757941/94‑1 (MQ=60)
GATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGT < SRR4302547.506657/94‑1 (MQ=60)
GATGGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGT < SRR4302547.1434848/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAAC > SRR4302547.1741566/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAAC < SRR4302547.1688127/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACG < SRR4302547.721646/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGG > SRR4302547.3116068/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGG > SRR4302547.6458201/1‑94 (MQ=60)
TGTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGC > SRR4302547.6248015/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCT < SRR4302547.259634/94‑1 (MQ=60)
GTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCT > SRR4302547.5860174/1‑94 (MQ=60)
GTGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCT > SRR4302547.5165692/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTA < SRR4302547.6393586/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGGACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTAT > SRR4302547.822574/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATG > SRR4302547.448305/1‑94 (MQ=60)
|
CGTTGTACTGCTGTTTGCGCTGGCTCAGACCCGCCATAAACAGTGGAGTCTGGCGAAAAAAGTGCTGGTGGGTCTGGTGATGGGTGTGGTTTTTGGCCTTGCCCTGCATACCATTTATGGTTCTGACAGCCAGGTACTTAAAGATTCTGTACAGTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATG > NC_000913/1808993‑1809174
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
