Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,077,514 |
Δ1 bp |
intergenic (‑165/+149) |
cmtB ← / ← tktA |
PTS system mannitol‑specific enzyme IIA component/transketolase 1 isozyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,077,513 | 0 | C | . | 100.0%
| 593.5
/ NA
| 125 | intergenic (‑164/+150) | cmtB/tktA | PTS system mannitol‑specific enzyme IIA component/transketolase 1 isozyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (76/49); total (76/49) |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGC > NC_000913/3077421‑3077601
|
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tGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCata < 2:5262980/93‑1 (MQ=255)
tGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCata < 1:6293111/93‑1 (MQ=255)
gAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCatat > 1:5736824/1‑93 (MQ=255)
aGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATc < 2:2694038/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTAAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCatatg > 2:5847525/1‑92 (MQ=255)
gCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCg < 1:5042707/93‑1 (MQ=255)
cAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGt < 2:2046005/93‑1 (MQ=255)
aGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTg < 1:3702762/93‑1 (MQ=255)
ggAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGAt < 1:5790237/93‑1 (MQ=255)
ggAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGAt < 1:3868619/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCa > 1:5972927/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCat > 1:772830/1‑93 (MQ=255)
cGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCatat < 2:5057322/93‑1 (MQ=255)
ggTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATAtt < 1:1844637/93‑1 (MQ=255)
tttGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATa < 2:1403648/93‑1 (MQ=255)
ttGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATaa < 1:3999196/93‑1 (MQ=255)
aaaaCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTg < 1:2802341/93‑1 (MQ=255)
aaaaCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTg < 1:626084/93‑1 (MQ=255)
aaaCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGa < 2:5960059/93‑1 (MQ=255)
aaCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGat > 1:5922133/1‑93 (MQ=255)
aaCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGat < 1:4970581/93‑1 (MQ=255)
aCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGata > 1:4193843/1‑93 (MQ=255)
cAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGatat < 2:4836224/93‑1 (MQ=255)
cAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGatat > 2:698767/1‑93 (MQ=255)
cAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGatat > 2:1897136/1‑93 (MQ=255)
aGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtatt > 1:811473/1‑93 (MQ=255)
aGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtatt > 1:215530/1‑93 (MQ=255)
gTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtattt < 1:783968/93‑1 (MQ=255)
tGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtattta < 1:6268290/93‑1 (MQ=255)
tGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtattta > 2:1314105/1‑93 (MQ=255)
gAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtatttat < 2:3775684/93‑1 (MQ=255)
gAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAtatttat > 1:1746809/1‑93 (MQ=255)
ttattaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGc < 1:4992070/93‑1 (MQ=255)
ttattaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGc > 2:5432118/1‑93 (MQ=255)
tattaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCa < 1:418445/93‑1 (MQ=255)
ttaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCata < 1:2002370/93‑1 (MQ=255)
ttaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCata < 2:5176344/93‑1 (MQ=255)
ttaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCata < 1:5612272/93‑1 (MQ=255)
taTTTCTTATATAACAATGAGTTATAAATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAtata < 1:3263046/92‑1 (MQ=255)
aaTTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAtata < 1:410296/93‑1 (MQ=255)
tttCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATaaa > 2:3199804/1‑93 (MQ=255)
ttCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAat < 1:5777555/93‑1 (MQ=255)
atataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTtg < 1:4671336/93‑1 (MQ=255)
atataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTtg > 2:1893911/1‑93 (MQ=255)
tataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTtgt < 2:1259683/93‑1 (MQ=255)
ataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTtgtg > 1:5106101/1‑93 (MQ=255)
ataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTtgtg < 2:325945/93‑1 (MQ=255)
taACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGa > 1:3092515/1‑93 (MQ=255)
aaCATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGAt < 1:4571532/93‑1 (MQ=255)
aaCATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGAt > 2:2827943/1‑93 (MQ=255)
aCATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATc > 1:4131901/1‑93 (MQ=255)
aCATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATc > 1:4004769/1‑93 (MQ=255)
cATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCt > 1:3117064/1‑93 (MQ=255)
cATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCt > 2:3627112/1‑93 (MQ=255)
cATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCt > 2:6368753/1‑93 (MQ=255)
cATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCt > 1:3230924/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTa > 2:5247307/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTa > 2:4165555/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTa > 2:687718/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTa > 1:5937807/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTac > 1:805263/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTac > 2:5459577/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTac > 1:2180513/1‑93 (MQ=255)
gAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTacaa > 2:1328026/1‑93 (MQ=255)
aGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTacaac > 1:5194670/1‑93 (MQ=255)
ttATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAacac > 1:5215449/1‑93 (MQ=255)
ttATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAacac > 1:6591248/1‑93 (MQ=255)
tataGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACg > 1:6650485/1‑93 (MQ=255)
tataGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACg > 2:2094302/1‑93 (MQ=255)
aGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCt < 1:4262612/93‑1 (MQ=255)
gATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCtt > 1:998000/1‑93 (MQ=255)
gATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCtt > 2:2937145/1‑93 (MQ=255)
gATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCtt > 2:5351250/1‑93 (MQ=255)
gATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCtt > 1:2852892/1‑93 (MQ=255)
atatAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTa > 1:1714668/1‑93 (MQ=255)
tataACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTAt > 1:3017193/1‑93 (MQ=255)
tataACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTAt > 1:1641601/1‑93 (MQ=255)
ataACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATc > 2:7941/1‑93 (MQ=255)
aacaacAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTa < 1:1489295/93‑1 (MQ=255)
aacaacAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTa > 2:5859945/1‑93 (MQ=255)
aacaacAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTa > 1:6171285/1‑93 (MQ=255)
aacaacAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTa < 1:3026092/93‑1 (MQ=255)
acaacaAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAt > 1:5337570/1‑93 (MQ=255)
acaacaAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAt > 1:2498364/1‑93 (MQ=255)
acaacaAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAt < 1:2498522/93‑1 (MQ=255)
acaacaAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAt > 1:2740721/1‑93 (MQ=255)
acaacaAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAt < 2:2145002/93‑1 (MQ=255)
caacaaATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAtt > 1:5414103/1‑93 (MQ=255)
aacaaATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTg > 1:3394979/1‑93 (MQ=255)
aacaaATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTg > 2:2953675/1‑93 (MQ=255)
acaaATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGc > 1:3732458/1‑93 (MQ=255)
acaaATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGc > 2:5141472/1‑93 (MQ=255)
caaATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCt > 2:3103487/1‑93 (MQ=255)
aaaTGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGGtt < 1:2346220/93‑1 (MQ=255)
tGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTc < 1:569043/93‑1 (MQ=255)
gTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTcc > 2:3772008/1‑93 (MQ=255)
gTCAATA‑CGCATATCGTAATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTcc > 2:4730767/1‑93 (MQ=255)
tCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCg < 1:834359/93‑1 (MQ=255)
tCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCg > 1:2614289/1‑93 (MQ=255)
|
GCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGC > NC_000913/3077421‑3077601
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGG > NC_000913/3077426‑3077607
|
TGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATAT < SRR4302547.936108/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATAT > SRR4302547.5855351/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATAT < SRR4302547.6423928/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGT < SRR4302547.5146841/94‑1 (MQ=60)
AGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGA < SRR4302547.3778341/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATG < SRR4302547.3947377/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATA < SRR4302547.5910006/94‑1 (MQ=60)
AAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCA > SRR4302547.6096811/1‑94 (MQ=60)
AAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCA > SRR4302547.3164686/1‑94 (MQ=60)
AACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCAT > SRR4302547.787437/1‑94 (MQ=60)
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TGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGG > NC_000913/3077426‑3077607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
