Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 593 | 264.2 | 13311096 | 97.8% | 13018251 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,021,157 | C→T | G9G (GGC→GGT) G5G (GGC→GGT) |
tatD → b4556 → |
Mg‑dependent DNase hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,021,157 | 0 | C | T | 84.2% | 755.4 / 111.1 | 291 | G9G (GGC→GGT) G5G (GGC→GGT) | tatD b4556 | Mg‑dependent DNase hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/16); new base T (151/94); total (181/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.83e-03 | |||||||||||
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
GACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGG > NC_000913/4021066‑4021249 | acgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGgtgt > 1:1500319/1‑93 (MQ=255) acgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGgtgt < 1:5290569/93‑1 (MQ=255) acgCAGAAGAAGAAAGCGAAAAACCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGgtgt < 1:1353072/93‑1 (MQ=255) cgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGtt < 1:4162155/93‑1 (MQ=255) cgCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGtt < 2:6385982/93‑1 (MQ=255) gCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTa > 1:3041996/1‑93 (MQ=255) cTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTaa < 2:5264350/93‑1 (MQ=255) cTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTaa > 2:6066567/1‑93 (MQ=255) gCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGa > 2:538680/1‑93 (MQ=255) aGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGAcc > 2:5670431/1‑93 (MQ=255) aGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGAcc < 1:1757858/93‑1 (MQ=255) aGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGAcc > 2:6559406/1‑93 (MQ=255) aaaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAg > 1:4480197/1‑93 (MQ=255) aaaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAg < 1:3584764/93‑1 (MQ=255) aaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGt > 1:1696885/1‑93 (MQ=255) aaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGt > 1:2167468/1‑93 (MQ=255) aaGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGt > 1:5178516/1‑93 (MQ=255) gCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTc > 2:3100053/1‑93 (MQ=255) gCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTc < 1:6611738/93‑1 (MQ=255) cGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTTATTTGACGAGTTCg > 1:4549008/1‑93 (MQ=255) cGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCg > 1:4633765/1‑93 (MQ=255) gAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGc > 1:3886974/1‑93 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCa < 2:5151499/93‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCa > 2:3964923/1‑93 (MQ=255) aagatGAAGAAAAATTGCAACGTCCCGTGG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGTATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAtt < 1:2516843/89‑1 (MQ=255) aaaCTGAAGAATAAATTCACCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAtt < 1:3694217/93‑1 (MQ=255) aaaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAtt < 2:246594/93‑1 (MQ=255) aaCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAAttt < 2:4516130/93‑1 (MQ=255) aCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTg > 2:2386947/1‑93 (MQ=255) cTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGc > 2:4022019/1‑93 (MQ=255) cTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGc < 2:618931/93‑1 (MQ=255) tGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCg > 2:2621902/1‑93 (MQ=255) agaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGaaa < 2:1690526/93‑1 (MQ=255) agaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGaaa > 1:6424652/1‑93 (MQ=255) agaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGCTCGCAATTTGCGaaa > 2:2216077/1‑93 (MQ=255) gaagaaATTCAACCGCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAg < 2:2732985/93‑1 (MQ=255) gaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAg > 2:1124843/1‑93 (MQ=255) gaaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAg > 1:6034817/1‑93 (MQ=255) aaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGa > 2:5932860/1‑93 (MQ=255) aaTAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGa > 2:5472508/1‑93 (MQ=255) aaaaTCCACCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGAcc < 1:1205499/92‑1 (MQ=255) aTTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtg > 1:3768146/1‑93 (MQ=255) ttCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtga > 1:5526542/1‑93 (MQ=255) ttCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtga > 2:4440274/1‑93 (MQ=255) tCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgat > 1:4817421/1‑93 (MQ=255) cAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgatg < 1:5461410/93‑1 (MQ=255) cAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgatg > 2:3930942/1‑93 (MQ=255) cAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGtgatg > 1:3978940/1‑93 (MQ=255) cGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgt > 2:4324687/1‑93 (MQ=255) cGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgt > 1:1588625/1‑93 (MQ=255) gCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 1:6113499/93‑1 (MQ=255) gCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 2:5866278/93‑1 (MQ=255) ccccGTGA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 1:3616029/92‑1 (MQ=255) cccGTCAGGGGGGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgtt < 1:1195272/93‑1 (MQ=255) cccGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgttg > 1:2383987/1‑93 (MQ=255) ccGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgttgt > 2:4649546/1‑93 (MQ=255) ccGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAtgttgt > 1:1959950/1‑93 (MQ=255) gTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAg < 2:5585796/93‑1 (MQ=255) tCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGc < 2:4994193/93‑1 (MQ=255) tCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGc > 2:1928920/1‑93 (MQ=255) tCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGc > 1:4028268/1‑93 (MQ=255) cA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCg < 1:4668341/93‑1 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 1:2666464/1‑93 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 2:1829999/1‑93 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 1:212909/1‑93 (MQ=255) a‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGt > 2:3764979/1‑93 (MQ=255) gggCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTg > 1:813465/1‑93 (MQ=255) ggCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTgc > 2:34027/1‑93 (MQ=255) gTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCtt > 1:1925556/1‑93 (MQ=255) gTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCtt > 1:953281/1‑93 (MQ=255) ttGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCttt < 2:5351060/93‑1 (MQ=255) gTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTg > 2:5423252/1‑93 (MQ=255) tCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGa > 1:6247757/1‑93 (MQ=255) cATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAc > 1:3520849/1‑93 (MQ=255) cATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAc > 1:860896/1‑93 (MQ=255) tatGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAcgc < 1:5390563/93‑1 (MQ=255) tatGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAcgc < 1:2846920/93‑1 (MQ=255) atGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAcgcg < 2:3817690/93‑1 (MQ=255) ggAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCggg > 1:5628888/1‑93 (MQ=255) ggAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCggg < 2:358045/93‑1 (MQ=255) aGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAg < 1:43033/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 2:2641950/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 2:4794321/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 2:2798987/93‑1 (MQ=255) gTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGt < 1:4118834/93‑1 (MQ=255) tACAGTATGTTGTATATCGGTGGTAATATGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTTATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGtt < 1:5707010/93‑1 (MQ=255) aGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAAt > 2:4192375/1‑93 (MQ=255) ggATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATg < 2:1500319/93‑1 (MQ=255) aTGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGGTAATggg > 1:5916446/1‑93 (MQ=255) gTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCt > 1:315557/1‑93 (MQ=255) ttGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATTGGCTAc < 2:5749204/93‑1 (MQ=255) ttGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAc < 1:5797276/93‑1 (MQ=255) ttGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAc < 2:1573515/93‑1 (MQ=255) ttGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGCAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAc < 1:1475889/93‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtca < 1:1309208/93‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtca > 1:1012322/1‑93 (MQ=255) atatCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtca < 1:5101765/93‑1 (MQ=255) tatCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtcat > 2:890296/1‑93 (MQ=255) atCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtcatc > 2:3218307/1‑93 (MQ=255) atCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACtcatc < 2:721475/93‑1 (MQ=255) | GACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGG > NC_000913/4021066‑4021249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
ACGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGGC > NC_000913/4021064‑4021250 | ACGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGT > SRR4302547.4214415/1‑94 (MQ=60) CGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTG < SRR4302547.1749097/94‑1 (MQ=60) CGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTG < SRR4302547.3268484/94‑1 (MQ=60) CGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTG < SRR4302547.3084794/94‑1 (MQ=60) CGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCG > SRR4302547.3840919/1‑94 (MQ=60) gacgataaagaagaaagaaAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGT < SRR4302547.3795187/75‑1 (MQ=60) GACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGT > SRR4302547.1530240/1‑94 (MQ=60) GACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGT > SRR4302547.1770367/1‑94 (MQ=60) ccatgaaagaaaaaaccaaaaaaacgaaaaaaaaaacccaccccCCCGTCG‑GGGGGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTT < SRR4302547.2356327/50‑1 (MQ=48) ACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTT < SRR4302547.5399706/94‑1 (MQ=60) ACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTT < SRR4302547.5548793/94‑1 (MQ=60) ACGCAGAAGAAGAAAGCGAAAAACCTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTT < SRR4302547.1380238/94‑1 (MQ=60) CGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTA > SRR4302547.3102540/1‑94 (MQ=60) CGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTA < SRR4302547.4428360/94‑1 (MQ=60) CGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTA < SRR4302547.4246945/94‑1 (MQ=60) GCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAA < SRR4302547.2128999/94‑1 (MQ=60) CTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAAT > SRR4302547.5808214/1‑94 (MQ=60) CTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAAT > SRR4302547.4501827/1‑94 (MQ=60) TGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATT < SRR4302547.313795/94‑1 (MQ=60) TGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATT > SRR4302547.6110127/1‑94 (MQ=60) GAAACAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTT < SRR4302547.2504107/94‑1 (MQ=60) AGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGA < SRR4302547.5545877/94‑1 (MQ=60) GCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGAC > SRR4302547.5385670/1‑94 (MQ=60) CAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACC > SRR4302547.4214147/1‑94 (MQ=60) aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacccccccccccccggggggggGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACC < SRR4302547.1194771/48‑1 (MQ=60) AGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCA > SRR4302547.4087629/1‑94 (MQ=60) AGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCA > SRR4302547.3702971/1‑94 (MQ=60) AGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCA < SRR4302547.1792670/94‑1 (MQ=60) AGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCA > SRR4302547.2009891/1‑94 (MQ=60) AGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCA > SRR4302547.5626801/1‑94 (MQ=60) GAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAG > SRR4302547.1531742/1‑94 (MQ=60) GAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAG > SRR4302547.4572753/1‑94 (MQ=60) AAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGT > SRR4302547.2210815/1‑94 (MQ=60) AAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGT > SRR4302547.5285111/1‑94 (MQ=60) AAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGT < SRR4302547.3657904/94‑1 (MQ=60) AAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGT > SRR4302547.1730248/1‑94 (MQ=60) AGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTC > SRR4302547.2735193/1‑94 (MQ=60) GCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTTATTTGACGAGTTCG > SRR4302547.4643090/1‑94 (MQ=60) GCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCG < SRR4302547.6749359/94‑1 (MQ=60) GCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCG > SRR4302547.4729755/1‑94 (MQ=60) GCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCG < SRR4302547.2324074/94‑1 (MQ=60) CGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGC > SRR4302547.888086/1‑94 (MQ=60) CGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGC > SRR4302547.3966040/1‑94 (MQ=60) GAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCA > SRR4302547.1314398/1‑94 (MQ=60) aaaaaaaaaaaaaaaaaaatcaccccgcccgtggggggGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCA < SRR4302547.1215096/56‑1 (MQ=60) AAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAA > SRR4302547.4632002/1‑94 (MQ=60) AAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATT > SRR4302547.5219045/1‑94 (MQ=60) AAACTGAAGAATAAATTCACCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTT < SRR4302547.3769630/94‑1 (MQ=60) AAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTT > SRR4302547.1509483/1‑94 (MQ=60) AAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTT > SRR4302547.5157218/1‑94 (MQ=60) AAACTGAAAAATAAATACACCCGCCCGTCA‑GGGCTGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTT < SRR4302547.460562/94‑1 (MQ=60) aagatgaagaaaaattgcaacgtcccgtggGGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGTATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTT < SRR4302547.2567722/64‑1 (MQ=60) AACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTG < SRR4302547.2196662/94‑1 (MQ=60) AACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTG > SRR4302547.5889323/1‑94 (MQ=60) ACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGC > SRR4302547.122513/1‑94 (MQ=60) ACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGC > SRR4302547.1982354/1‑94 (MQ=60) ACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGC > SRR4302547.6180506/1‑94 (MQ=60) ACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGC > SRR4302547.4369709/1‑94 (MQ=60) CTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATAAGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCG > SRR4302547.4061529/1‑94 (MQ=60) TGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGA > SRR4302547.1355613/1‑94 (MQ=60) AAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAA > SRR4302547.5211942/1‑94 (MQ=60) AAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAA > SRR4302547.6558594/1‑94 (MQ=60) AAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAA > SRR4302547.3594501/1‑94 (MQ=60) AGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAG > SRR4302547.6160050/1‑94 (MQ=60) AGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAG > SRR4302547.675776/1‑94 (MQ=60) AGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAG < SRR4302547.1605441/94‑1 (MQ=60) AGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAG > SRR4302547.9687/1‑94 (MQ=60) GAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGA < SRR4302547.2173253/94‑1 (MQ=60) AAATAAATTCACCCCCCCGTCG‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGA < SRR4302547.4732941/94‑1 (MQ=60) ATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACC < SRR4302547.5479125/94‑1 (MQ=60) aaaatccacCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCG < SRR4302547.1229822/85‑1 (MQ=60) TAAATTCAACCGGCTGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGAGATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCG < SRR4302547.1882568/94‑1 (MQ=60) TAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCG > SRR4302547.5980282/1‑94 (MQ=60) TAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCG > SRR4302547.6365193/1‑94 (MQ=60) AAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGT > SRR4302547.403413/1‑94 (MQ=60) aatcaacCCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTG < SRR4302547.3710164/87‑1 (MQ=60) AATTCCCCCGCCCGTCG‑GGCCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTG < SRR4302547.1338427/94‑1 (MQ=60) AATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTG < SRR4302547.1406463/94‑1 (MQ=60) AATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTG > SRR4302547.3844998/1‑94 (MQ=60) ATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGA > SRR4302547.505305/1‑94 (MQ=60) ATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGA > SRR4302547.5640598/1‑94 (MQ=60) TTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGAT > SRR4302547.4917260/1‑94 (MQ=60) TTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGAT > SRR4302547.2644530/1‑94 (MQ=60) TCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATG > SRR4302547.4059848/1‑94 (MQ=60) TCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATG > SRR4302547.1273629/1‑94 (MQ=60) CAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGA < SRR4302547.5574233/94‑1 (MQ=60) CAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGA < SRR4302547.1701118/94‑1 (MQ=60) AACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAT > SRR4302547.273544/1‑94 (MQ=60) AACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAT < SRR4302547.1850391/94‑1 (MQ=60) AACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGCACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGAT > SRR4302547.6392340/1‑94 (MQ=60) 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GCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTG > SRR4302547.3648258/1‑94 (MQ=60) GCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTG < SRR4302547.6240313/94‑1 (MQ=60) GCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTG > SRR4302547.2432284/1‑94 (MQ=60) GCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTG > SRR4302547.839927/1‑94 (MQ=60) CCCCGTGA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTG < SRR4302547.3689801/94‑1 (MQ=60) CCCGTCAGGGGGGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTG < SRR4302547.1219396/94‑1 (MQ=60) CCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGT > SRR4302547.3830549/1‑94 (MQ=60) CCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGT > SRR4302547.1998863/1‑94 (MQ=60) CCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGT > SRR4302547.2981679/1‑94 (MQ=60) CCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGT > SRR4302547.738355/1‑94 (MQ=60) GCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTA > SRR4302547.3912456/1‑94 (MQ=60) CGGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTA < SRR4302547.12211/94‑1 (MQ=60) CCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTA > SRR4302547.4141774/1‑94 (MQ=60) CGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAG > SRR4302547.3558688/1‑94 (MQ=60) GTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGC > SRR4302547.5961609/1‑94 (MQ=60) GTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGC > SRR4302547.4110103/1‑94 (MQ=60) CA‑TGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGT < SRR4302547.470691/94‑1 (MQ=60) CA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGT < SRR4302547.4765019/94‑1 (MQ=60) CA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGT > SRR4302547.216928/1‑94 (MQ=60) CA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGT > SRR4302547.2720044/1‑94 (MQ=60) A‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTG > SRR4302547.143681/1‑94 (MQ=60) A‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTG > SRR4302547.828911/1‑94 (MQ=60) A‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTG < SRR4302547.6618581/94‑1 (MQ=60) GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGC > SRR4302547.472896/1‑94 (MQ=60) GCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGC < SRR4302547.1514392/94‑1 (MQ=60) GCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGC > SRR4302547.5728159/1‑94 (MQ=60) GCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGC < SRR4302547.6743390/94‑1 (MQ=60) GGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTT < SRR4302547.6343622/94‑1 (MQ=60) GGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTT > SRR4302547.3389876/1‑94 (MQ=60) GGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTT > SRR4302547.1963703/1‑94 (MQ=60) GGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTT < SRR4302547.2325022/94‑1 (MQ=60) GGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTT > SRR4302547.971797/1‑94 (MQ=60) TTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTT < SRR4302547.838328/94‑1 (MQ=60) TTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTT > SRR4302547.6185158/1‑94 (MQ=60) GTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGA > SRR4302547.6377538/1‑94 (MQ=60) GTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGA < SRR4302547.2613529/94‑1 (MQ=60) TCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAC > SRR4302547.877345/1‑94 (MQ=60) TCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAC > SRR4302547.567027/1‑94 (MQ=60) TCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGAC > SRR4302547.3592717/1‑94 (MQ=60) ATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGC > SRR4302547.1782240/1‑94 (MQ=60) ATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGC > SRR4302547.5452025/1‑94 (MQ=60) TATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCG < SRR4302547.2903804/94‑1 (MQ=60) TATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCG > SRR4302547.367634/1‑94 (MQ=60) TATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCG < SRR4302547.5501893/94‑1 (MQ=60) TATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCG < SRR4302547.2434634/94‑1 (MQ=60) TGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGG > SRR4302547.5745047/1‑94 (MQ=60) GGAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGAGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGA > SRR4302547.6692382/1‑94 (MQ=60) GAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAG < SRR4302547.5827256/94‑1 (MQ=60) GAGTACAGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAG < SRR4302547.4216298/94‑1 (MQ=60) AGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGT < SRR4302547.43825/94‑1 (MQ=60) GTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTT < SRR4302547.4202550/94‑1 (MQ=60) TACAGTATGTTGTATATCGGTGGTAATATGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTTATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTA < SRR4302547.5824899/94‑1 (MQ=60) ACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCCGGAGTTAA > SRR4302547.4313333/1‑94 (MQ=60) AGGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATG < SRR4302547.1984045/94‑1 (MQ=60) AGGATGTTTGATATCGGTGTTAATCTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATG < SRR4302547.4864598/94‑1 (MQ=60) AGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATG > SRR4302547.640770/1‑94 (MQ=60) TGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGGCGCGGGAGTTAATGG < SRR4302547.365162/94‑1 (MQ=60) GGATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGG < SRR4302547.317939/94‑1 (MQ=60) GATGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGGTAATGGG > SRR4302547.6039037/1‑94 (MQ=60) GATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGG < SRR4302547.1717071/94‑1 (MQ=60) TGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCT > SRR4302547.321435/1‑94 (MQ=60) TGTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCT > SRR4302547.5312216/1‑94 (MQ=60) GTTTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTA < SRR4302547.5748548/94‑1 (MQ=60) TTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTAC > SRR4302547.4179539/1‑94 (MQ=60) TTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACT < SRR4302547.5917191/94‑1 (MQ=60) TTGATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACT > SRR4302547.1205003/1‑94 (MQ=60) TTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGCAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACT < SRR4302547.1505373/94‑1 (MQ=60) GATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCA > SRR4302547.1032112/1‑94 (MQ=60) ATCTCGGTGTTAATTTGACCAGTTCCCCATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCAT < SRR4302547.4689852/94‑1 (MQ=60) ATATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCAT < SRR4302547.1335539/94‑1 (MQ=60) ATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCAT < SRR4302547.5206936/94‑1 (MQ=60) TATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGGAAGACCGTGATGATGTTGTAGAGTGCGCTTTTGACGCGCGAGGTAATCGGCTACTCATC > SRR4302547.6133855/1‑94 (MQ=60) ATCGGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCA < SRR4302547.5608581/94‑1 (MQ=60) CGGTGTTAATTTCACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACC > SRR4302547.1732656/1‑94 (MQ=60) GGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCG < SRR4302547.5096205/94‑1 (MQ=60) GGTGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCG > SRR4302547.278588/1‑94 (MQ=60) TGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGGC < SRR4302547.3722686/94‑1 (MQ=60) TGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGGC > SRR4302547.1876782/1‑94 (MQ=60) CGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGGC < SRR4302547.4824754/94‑1 (MQ=60) | ACGACGCTGAAGCAGAAAGCGAAAAAACTGAAGAATAAATTCAACCGCCCGTCA‑GGGCGGTTGTCATATGGAGTACAGGATGTTTGATATCGGCGTTAATTTGACCAGTTCGCAATTTGCGAAAGACCGTGATGATGTTGTAGCGTGCGCTTTTGACGCGGGAGTTAATGGGCTACTCATCACCGGC > NC_000913/4021064‑4021250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |