Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 593 | 264.2 | 13311096 | 97.8% | 13018251 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,139,669 | +C | coding (233/330 nt) coding (132/159 nt) |
yijI → b4558 ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,667 | 1 | . | C | 99.6% | 931.3 / ‑5.0 | 253 | L77F (TTG→TTC) A45G (GCA→GGA) | yijI b4558 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); major base C (105/146); minor base A (1/0); total (106/147) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT > NC_000913/4139575‑4139754 | gcTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTg < 2:2911366/93‑1 (MQ=255) ttCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑cc > 1:5469836/1‑93 (MQ=255) ttCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑cc > 1:4192213/1‑93 (MQ=255) tCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccc > 2:3549519/1‑92 (MQ=255) tCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccc < 2:5027600/93‑2 (MQ=255) ccTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccct < 2:4477208/93‑3 (MQ=255) cTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccctt < 2:3240543/93‑4 (MQ=255) cTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccctt > 1:4773826/1‑90 (MQ=255) cTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑ccctt < 2:4651587/93‑4 (MQ=255) tGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑cccttg > 2:1307899/1‑89 (MQ=255) tGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑cccttg < 2:3054914/93‑5 (MQ=255) tGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATAAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGACCTTg > 1:1228933/1‑93 (MQ=255) tGTTCGCAGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGGGCAAGGGCCCTTTTGGCGTTG‑cccttg < 1:4473640/93‑5 (MQ=255) tcgtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCgg > 2:4965994/1‑93 (MQ=255) cgtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGt < 1:4322442/93‑1 (MQ=255) gtcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTc > 2:872850/1‑93 (MQ=255) tcgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCa < 1:4102999/93‑1 (MQ=255) cgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAg < 1:3592662/93‑1 (MQ=255) cgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAg < 1:1005526/93‑1 (MQ=255) cgGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAg < 1:1993685/93‑1 (MQ=255) ggCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTCATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGt < 1:5358554/93‑1 (MQ=255) gCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTg > 1:3190247/1‑93 (MQ=255) gCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTg < 1:3071338/93‑1 (MQ=255) gCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTg < 1:5886155/93‑1 (MQ=255) gCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTg < 1:514119/93‑1 (MQ=255) cccGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTgcg > 1:2270202/1‑93 (MQ=255) ggAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGTCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAg > 2:1378495/1‑93 (MQ=255) ggAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAg < 2:3094942/93‑1 (MQ=255) ggAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAg > 2:2129238/1‑93 (MQ=255) gAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAgg > 1:4669774/1‑93 (MQ=255) aTCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTa > 1:5280200/1‑93 (MQ=255) tCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAt < 2:4138190/93‑1 (MQ=255) aGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGc < 1:6320250/93‑1 (MQ=255) aGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGc > 1:1630978/1‑93 (MQ=255) gTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGcc > 1:5148665/1‑93 (MQ=255) aCTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACt < 1:6450874/93‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTc < 2:5656359/93‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTc > 2:2707591/1‑93 (MQ=255) tGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCa < 2:1887354/93‑1 (MQ=255) ggCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCaa < 2:125123/93‑1 (MQ=255) ggCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCaa < 2:6518385/93‑1 (MQ=255) gCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAt > 1:1494048/1‑93 (MQ=255) cAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCCCTCAAtt < 1:680050/93‑1 (MQ=255) gTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtg > 2:4576/1‑93 (MQ=255) gTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtg < 1:6158183/93‑1 (MQ=255) tATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgtg > 2:4029116/1‑93 (MQ=255) aTCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtga < 1:1272825/93‑1 (MQ=255) gcccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgatga > 1:1119423/1‑93 (MQ=255) gcccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGtgatga < 1:2966890/93‑1 (MQ=255) cccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGTAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaa < 1:895653/93‑1 (MQ=255) cccgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaa < 1:6551576/93‑1 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaa > 2:5057866/1‑93 (MQ=255) cgccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaa < 1:2508558/93‑1 (MQ=255) gccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaaa < 1:6061882/93‑1 (MQ=255) gccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaaa < 1:758892/93‑1 (MQ=255) gccAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGaaaaa < 1:2861899/93‑1 (MQ=255) cAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGTCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt > 1:4387734/1‑93 (MQ=255) cAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt > 2:2405758/1‑93 (MQ=255) cAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt > 2:3435722/1‑93 (MQ=255) cAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGt > 2:1690557/1‑93 (MQ=255) gCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAt > 1:6206387/1‑93 (MQ=255) gCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAt > 1:3747757/1‑93 (MQ=255) cGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAtt < 2:557512/93‑1 (MQ=255) gTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTa < 1:4962996/93‑1 (MQ=255) gTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTa < 1:5852411/93‑1 (MQ=255) tATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTac > 1:3618059/1‑93 (MQ=255) tATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTac < 1:3546328/93‑1 (MQ=255) tATCGGCGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCACTTTGTGATGAAAAAGTATTac > 1:2216999/1‑93 (MQ=255) aTCGGTGCCAAGCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTaca < 2:4212006/93‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTacac < 2:544308/93‑1 (MQ=255) cGGTGTCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 2:2567542/93‑1 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAcaca < 1:3808264/93‑1 (MQ=255) ggTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAg < 1:4224027/93‑1 (MQ=255) ggTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAg < 2:6233900/93‑1 (MQ=255) gTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGc < 1:3359228/93‑1 (MQ=255) gTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGc < 2:1133791/93‑1 (MQ=255) gCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGt < 2:2270740/93‑1 (MQ=255) gCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGt < 2:6131874/93‑1 (MQ=255) ccAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGtt > 2:5537384/1‑93 (MQ=255) ccAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGtt > 2:2999442/1‑93 (MQ=255) aaTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTc < 1:6414146/93‑1 (MQ=255) aaTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTc < 1:3898445/93‑1 (MQ=255) aaTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTc > 1:5762033/1‑93 (MQ=255) aTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCa > 2:5721530/1‑93 (MQ=255) aTCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCa > 2:220180/1‑93 (MQ=255) tCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCaa > 2:2362762/1‑93 (MQ=255) cAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAc > 1:2774444/1‑93 (MQ=255) gcgcAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGt < 1:2549069/93‑1 (MQ=255) cgcAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTg > 2:5181161/1‑93 (MQ=255) cAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGc > 2:4780420/1‑93 (MQ=255) aaGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCt < 2:590639/93‑1 (MQ=255) aaGGGCGCTTTTGGCGGTGCCCTTGCGGGCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACCCAGCGGTTCAACGTGGCt < 1:2641237/93‑1 (MQ=255) aGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCtt < 2:1943028/93‑1 (MQ=255) aGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCtt > 2:1991381/1‑93 (MQ=255) ggCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGc < 2:2775905/93‑1 (MQ=255) ggCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGc < 1:1795033/93‑1 (MQ=255) gcTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCgg > 2:712181/1‑93 (MQ=255) cTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGa < 1:3488606/93‑1 (MQ=255) cTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGa < 1:1842588/93‑1 (MQ=255) cGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAt < 2:5341642/93‑1 (MQ=255) | GCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTG‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT > NC_000913/4139575‑4139754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
CTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > NC_000913/4139576‑4139762 | CTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CC > SRR4302547.4277711/1‑94 (MQ=60)CTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CC > SRR4302547.5582835/1‑94 (MQ=60) TTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCC < SRR4302547.2882101/94‑1 (MQ=60) TCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCCT < SRR4302547.3649567/94‑1 (MQ=60) CCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGGCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTCGCGTT‑G‑CCctt > SRR4302547.2188585/1‑91 (MQ=60) CCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCctt < SRR4302547.4946318/94‑4 (MQ=60) CCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCctt > SRR4302547.4872736/1‑91 (MQ=60) CCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCctt < SRR4302547.1642196/94‑4 (MQ=60) CCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCctt > SRR4302547.2590837/1‑91 (MQ=60) CTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATAAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GACCTTG > SRR4302547.1253725/1‑94 (MQ=60) TGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGC > SRR4302547.2769715/1‑94 (MQ=60) TGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGC < SRR4302547.4566068/94‑1 (MQ=60) TGTTCGCAGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGGGCAAGGGCCCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGC < SRR4302547.4566069/94‑1 (MQ=60) GTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCG > SRR4302547.3826725/1‑94 (MQ=60) GTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCG < SRR4302547.3596673/94‑1 (MQ=60) GTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCG < SRR4302547.193500/94‑1 (MQ=60) GTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCG > SRR4302547.3518061/1‑94 (MQ=60) TTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGG < SRR4302547.5978106/94‑1 (MQ=60) TCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGT > SRR4302547.1322403/1‑94 (MQ=60) CGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTC < SRR4302547.3645068/94‑1 (MQ=60) CGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTC < SRR4302547.4411420/94‑1 (MQ=60) CGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTC < SRR4302547.4294965/94‑1 (MQ=60) TCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAG > SRR4302547.122494/1‑94 (MQ=60) TCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAG < SRR4302547.4186415/94‑1 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGT < SRR4302547.1025146/94‑1 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGT < SRR4302547.3665940/94‑1 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGT < SRR4302547.5663712/94‑1 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGT > SRR4302547.4256782/1‑94 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGT < SRR4302547.2033336/94‑1 (MQ=60) CGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGT < SRR4302547.1686684/94‑1 (MQ=60) GGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTG > SRR4302547.6051358/1‑94 (MQ=60) GGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTG > SRR4302547.3253823/1‑94 (MQ=60) GGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTCATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTG < SRR4302547.5469086/94‑1 (MQ=60) GCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGC < SRR4302547.6008022/94‑1 (MQ=60) GCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGC > SRR4302547.1145480/1‑94 (MQ=60) GCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGC < SRR4302547.3132358/94‑1 (MQ=60) GCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGC < SRR4302547.523450/94‑1 (MQ=60) CCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCG > SRR4302547.2316112/1‑94 (MQ=60) CCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCTCGCTAGCGTATCGGTGCCAATCGGCGAAAGGGCGCTTTTGGCGTTCC‑CCTTGTGGTCAGTGCGCA < SRR4302547.5519876/94‑1 (MQ=60) GGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGG < SRR4302547.287349/94‑1 (MQ=60) GGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGG < SRR4302547.3793283/94‑1 (MQ=60) GGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGG > SRR4302547.4766480/1‑94 (MQ=60) GAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GTCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGT > SRR4302547.2613116/1‑94 (MQ=60) GAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGT > SRR4302547.721081/1‑94 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT < SRR4302547.6563353/94‑1 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT < SRR4302547.4602828/94‑1 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT < SRR4302547.634991/94‑1 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGGGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT > SRR4302547.3899377/1‑94 (MQ=60) AAATCAGTAACTGGCAGATATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTT < SRR4302547.4645596/94‑1 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA > SRR4302547.5389107/1‑94 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA > SRR4302547.2586955/1‑94 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA > SRR4302547.2205860/1‑94 (MQ=60) AATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTA > SRR4302547.4465663/1‑94 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT < SRR4302547.6460145/94‑1 (MQ=60) ATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAT > SRR4302547.4854335/1‑94 (MQ=60) TCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATG < SRR4302547.38720/94‑1 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC > SRR4302547.5488306/1‑94 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC > SRR4302547.1663267/1‑94 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC < SRR4302547.3575945/94‑1 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC < SRR4302547.5313076/94‑1 (MQ=60) CAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGC > SRR4302547.5590111/1‑94 (MQ=60) AGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCC > SRR4302547.5254696/1‑94 (MQ=60) AGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCC < SRR4302547.3667131/94‑1 (MQ=60) AGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCC < SRR4302547.6451667/94‑1 (MQ=60) TAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGGGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCAC > SRR4302547.3517341/1‑94 (MQ=60) ACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTC < SRR4302547.6585263/94‑1 (MQ=60) TGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATACCACTCAA < SRR4302547.6444300/94‑1 (MQ=60) GGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAT < SRR4302547.6711515/94‑1 (MQ=60) GGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAT > SRR4302547.708258/1‑94 (MQ=60) GGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAT > SRR4302547.1523854/1‑94 (MQ=60) GGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAAT < SRR4302547.5243032/94‑1 (MQ=60) GCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATT < SRR4302547.4162599/94‑1 (MQ=60) GCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATT < SRR4302547.3202949/94‑1 (MQ=60) CAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCCCTCAATTT < SRR4302547.692583/94‑1 (MQ=60) CAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTT < SRR4302547.6278812/94‑1 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG > SRR4302547.2290915/1‑94 (MQ=60) AGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTG > SRR4302547.2694675/1‑94 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT < SRR4302547.4785672/94‑1 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT > SRR4302547.2994536/1‑94 (MQ=60) GTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGT < SRR4302547.6285989/94‑1 (MQ=60) TTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTG < SRR4302547.1269343/94‑1 (MQ=60) TATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGA < SRR4302547.4381379/94‑1 (MQ=60) TATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGA > SRR4302547.4292919/1‑94 (MQ=60) ATCGCCCTCGAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGAT < SRR4302547.5254375/94‑1 (MQ=60) ATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGAT < SRR4302547.1298455/94‑1 (MQ=60) TCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATG > SRR4302547.310971/1‑94 (MQ=60) TCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATG < SRR4302547.1841606/94‑1 (MQ=60) TCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATG > SRR4302547.1876197/1‑94 (MQ=60) TCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATG > SRR4302547.2482841/1‑94 (MQ=60) CGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGA > SRR4302547.1141983/1‑94 (MQ=60) GCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAA < SRR4302547.3025937/94‑1 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGTAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAA < SRR4302547.912880/94‑1 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAA > SRR4302547.3011156/1‑94 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAA < SRR4302547.6687926/94‑1 (MQ=60) CCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAA > SRR4302547.6569895/1‑94 (MQ=60) CGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAA < SRR4302547.2559274/94‑1 (MQ=60) GCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAG < SRR4302547.773197/94‑1 (MQ=60) GCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAG < SRR4302547.6187622/94‑1 (MQ=60) GCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAG < SRR4302547.2919070/94‑1 (MQ=60) CCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGTCACTCAATTTGTGATGAAAAAGT > SRR4302547.4478012/1‑94 (MQ=60) CCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGT > SRR4302547.3243951/1‑94 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT > SRR4302547.3824261/1‑94 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT > SRR4302547.5946016/1‑94 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT < SRR4302547.4952447/94‑1 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT > SRR4302547.6335241/1‑94 (MQ=60) AGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTAT < SRR4302547.1295142/94‑1 (MQ=60) GCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATT > SRR4302547.2030728/1‑94 (MQ=60) GCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATT < SRR4302547.61984/94‑1 (MQ=60) GCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATT < SRR4302547.1627646/94‑1 (MQ=60) CGTATCGCTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTA < SRR4302547.3975237/94‑1 (MQ=60) GTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAC > SRR4302547.1009865/1‑94 (MQ=60) GTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAC < SRR4302547.5973486/94‑1 (MQ=60) GTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAC < SRR4302547.5065699/94‑1 (MQ=60) GTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAC > SRR4302547.5988827/1‑94 (MQ=60) GTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAC > SRR4302547.3691870/1‑94 (MQ=60) GTATCGGCGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCACTTTGTGATGAAAAAGTATTAC > SRR4302547.2261651/1‑94 (MQ=60) TATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACA < SRR4302547.3618700/94‑1 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC < SRR4302547.2802038/94‑1 (MQ=60) ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACAC < SRR4302547.4347654/94‑1 (MQ=60) CGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAG < SRR4302547.5413696/94‑1 (MQ=60) CGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAG < SRR4302547.3885888/94‑1 (MQ=60) CGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAG < SRR4302547.1703030/94‑1 (MQ=60) GGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGC < SRR4302547.4310328/94‑1 (MQ=60) GGTGCCAATCAGCGAAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGC > SRR4302547.6668253/1‑94 (MQ=60) GTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCG < SRR4302547.3427389/94‑1 (MQ=60) TGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGT > SRR4302547.3667930/1‑94 (MQ=60) TGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGT < SRR4302547.4458919/94‑1 (MQ=60) GCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTT < SRR4302547.5960608/94‑1 (MQ=60) CCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTT < SRR4302547.2441422/94‑1 (MQ=60) CAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTC > SRR4302547.5881193/1‑94 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302547.6547901/94‑1 (MQ=60) AATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCA < SRR4302547.3977709/94‑1 (MQ=60) TCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAC > SRR4302547.2830018/1‑94 (MQ=60) TCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAAC < SRR4302547.1046936/94‑1 (MQ=60) CAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACG > SRR4302547.2646313/1‑94 (MQ=60) CAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACG < SRR4302547.819241/94‑1 (MQ=60) GCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTG < SRR4302547.2600544/94‑1 (MQ=60) CAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCT < SRR4302547.4494819/94‑1 (MQ=60) CAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCT < SRR4302547.1939684/94‑1 (MQ=60) AAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTT < SRR4302547.907860/94‑1 (MQ=60) AAGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGCGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTT < SRR4302547.3577509/94‑1 (MQ=60) AAGGGCGCTTTTGGCGGT‑GCCCTTGCGGGCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACCCAGCGGTTCAACGTGGCTT < SRR4302547.2694396/94‑1 (MQ=60) AGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTG < SRR4302547.6751688/94‑1 (MQ=60) AGGGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTG > SRR4302547.5336850/1‑94 (MQ=60) GGCGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCC < SRR4302547.1830554/94‑1 (MQ=60) CGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGG > SRR4302547.3044471/1‑94 (MQ=60) CGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGG > SRR4302547.6288582/1‑94 (MQ=60) CGCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGG < SRR4302547.1434720/94‑1 (MQ=60) GCTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGA < SRR4302547.5410171/94‑1 (MQ=60) CTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAC < SRR4302547.3559790/94‑1 (MQ=60) CTTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGAC < SRR4302547.1878996/94‑1 (MQ=60) TTTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGCCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACG > SRR4302547.6609774/1‑94 (MQ=60) TTTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGC < SRR4302547.6513583/94‑1 (MQ=60) TTGGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCG < SRR4302547.5073863/94‑1 (MQ=60) GGCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTAAACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCA > SRR4302547.6138586/1‑94 (MQ=60) GCGTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCAT < SRR4302547.4032639/94‑1 (MQ=60) ggttgcCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATG < SRR4302547.1139510/88‑1 (MQ=60) GTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGT > SRR4302547.2111831/1‑94 (MQ=60) GTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGT > SRR4302547.5287487/1‑94 (MQ=60) GTT‑GCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGT > SRR4302547.4989018/1‑94 (MQ=60) 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> SRR4302547.104743/1‑94 (MQ=60) CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCC < SRR4302547.5211286/94‑1 (MQ=60) CTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > SRR4302547.3459937/1‑94 (MQ=60) | CTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGTATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTT‑G‑CCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCG > NC_000913/4139576‑4139762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |