Hadiastri_2021: Solvent_Tolerance_Pputida
Stats |
Metadata |
Mutations |
Converged Mutations |
Fixed Mutations |
Filter
Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I1 R1 | 343 | 268.7 | 10873516 | 97.0% | 10547310 | 150.6 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009974 | 3,148,596 | +GTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCACAGGCACTCCAAATTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCACAGGCACTCCAAATTGTAGGAGCGG | intergenic (+123/+89) | RPPX_14035 → / ← RPPX_14040 | membrane protein/bifunctional glyoxylate/hydroxypyruvate reductase B |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 3148569 = | 57 (0.210) | 90 (0.610) +CGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC |
68/164 | 2.1 | 76.6% | intergenic (+96/+116) | RPPX_14035/RPPX_14040 | membrane protein/bifunctional glyoxylate/hydroxypyruvate reductase B |
| ? | CP009974 | = 3148596 | 44 (0.160) | intergenic (+123/+89) | RPPX_14035/RPPX_14040 | membrane protein/bifunctional glyoxylate/hydroxypyruvate reductase B | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
GGACCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3148718‑3148569‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTCAGC < CP009974/3148596‑3148447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGACCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCC < 1:954190/151‑1 CCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGC < 1:437238/151‑1 CCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGC < 1:3993284/151‑1 AACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCG > 2:5228726/1‑151 ACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGC < 2:3567303/151‑1 CCGCAGGTGTGTAAGGGCGGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGG < 1:3674018/151‑1 GGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAA < 1:3179136/151‑1 TGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAAC > 1:4453379/1‑151 GTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACC < 1:2438686/151‑1 GTGGAAGGGCTGACCGGTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACC < 2:2589999/151‑1 AAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTC < 2:2073087/151‑1 AGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCTCC > 2:1032978/1‑151 ggggGACGGTTTTGGGATGCCTGTGCGGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTA < 2:4887394/147‑1 gtggTTTGGGAGGCGTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATTGGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTT < 2:3024030/147‑1 GTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCCACAATTTGG < 1:3250907/151‑1 TTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAG < 1:3774662/151‑1 TGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTCCACTTTGGAGgg > 1:2919244/1‑149 GGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGC < 1:4504715/151‑1 AATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCT < 1:264428/151‑1 TGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGT < 1:3636260/151‑1 CTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGCGTGCCTGTGCC > 1:1867432/1‑151 GTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGG < 2:1383177/151‑1 TGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGC < 1:394522/151‑1 TCGCGGGTGAACCGGCTCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGG < 2:657869/151‑1 CGGGTAAGCCCGCTCCTACAATGTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAA < 2:4161184/151‑1 CGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTca > 2:875114/1‑149 GGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGTGGAGTGCCTGTGCCGGCGCCTTCGCGGGGAGAGCCGCTCCTACTCGTCGGCGTGCCAGTACAGGCCACTTCGCGGGTAAA > 2:1667044/1‑151 GGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC > 1:278406/1‑151 CCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTC > 1:3104938/1‑151 CCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCCCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGAAACACCGCcc > 2:3450488/1‑149 CCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGTCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA < 2:4114206/151‑1 CCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCCCCTACAATTGGGAGGGCCTGCGCCGCCCCCGTCGCGCGTACCCCCGCCCCaccaa > 2:14039/1‑146 CTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAT < 1:3729443/151‑1 TACAGTTTGGGGTGGCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAGTTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATT < 2:3341922/151‑1 ACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTT < 1:1795419/151‑1 TGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTG > 1:3026524/1‑151 cGTGCCCGTGCTGGCCCCTCCGCGGGTAAGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCT < 2:5189270/150‑1 GCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTG < 2:1245074/151‑1 ccggGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATGTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCT < 2:3803614/147‑1 CTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCT > 1:4929619/1‑151 GTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACTGTCGAGCGCCTCTCCTGc > 2:4530278/1‑150 CCCTTCGCGGGTACAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCG < 2:3728391/151‑1 CTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAATTTGGAGTGTCTGTGCTCGCGTCTTCTCG > 2:630267/1‑151 TTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGG < 1:4574532/151‑1 CGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGT > 1:2326885/1‑151 GCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTA > 2:5376592/1‑151 GCGAGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTA < 2:2618547/151‑1 CGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAA < 1:211720/151‑1 TAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC < 1:4860029/151‑1 AACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCT < 1:138215/151‑1 cCCGCTACTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:2700338/150‑1 ACCGCTCCTCCGTTTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTCCAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:4453379/151‑1 CGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCTCCT > 1:4854352/1‑151 GCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGGGTGCCTGCGCTGGCCTCCTCGCGGGACAACCCGCTCCTc > 2:2773264/1‑150 CCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA < 1:3555592/151‑1 CTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAAA > 1:1550411/1‑151 CAATTTGGTGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAGCCGCTCCTACCATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGG < 1:1667044/151‑1 GGAGTGGCTGTGCCGGGCCCTTCGCGGGGAGAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCA < 2:2020168/151‑1 gGTGCCTGCGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACT < 2:4282037/150‑1 GTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAGGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTG < 2:1576171/151‑1 TGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGC < 2:757511/151‑1 CTGTCCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGCGTAAACCCGCTCCTCCAAAGGGTGTTCCCTGCCCT > 2:4478749/1‑151 TGTGCCGGCCCCTTCGCGGGCAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACTTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCCCCTACAACGGGTGTCCACCCCCCTc > 1:3451093/1‑150 TGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGGGTGCCCTGCCCTGga > 1:2904008/1‑149 gcgGGCCCCTTCGCGGGTGAGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCGGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGGTGTGCACTGCCCTGTAG < 2:2503640/148‑1 CCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGG < 2:2198979/151‑1 CGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGA > 1:4706398/1‑151 GCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGn < 1:1041613/151‑2 TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTT < 1:5298151/151‑1 TCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTT < 1:1974371/151‑1 CGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGCAAACCCGCTTCTACAAAGGGTGTGCACTGCACTGTAGGAGCGGGTTCACC > 2:4727859/1‑151 GTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC > 2:2356035/1‑151 GTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGC > 1:4437059/1‑123 GTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGC < 2:4437134/123‑1 TAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < 1:5393978/151‑1 AAAGCCGCTCCAACACTTTGCAGTGCCTGTACAGGCCCCTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < 2:1946852/151‑1 AAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < 1:1314353/151‑1 aacCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < 1:1201670/148‑1 AACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAAGGGCGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAA > 2:2373509/1‑151 CCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGGTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG < 2:3526316/151‑1 CCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG > 1:2041182/1‑151 CTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGACCGGGGTTACCCCCGAAAGGGACGGC > 1:3529605/1‑151 TGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCAGCTCCTACACTTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAA < 2:4062026/151‑1 GAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGC > 1:750784/1‑151 ggccaTGTGCCGGCCACTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACAATTGGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCAT < 2:1142967/146‑1 GCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCAacc > 1:690592/1‑148 CCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCAC < 1:5376592/151‑1 CCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGCGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAAGGGCCGGACCAGGCAAGCATCcc > 1:5040708/1‑149 gGTGCCGGCCGCTTCGAGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTA < 1:4972492/150‑1 GTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTAT > 1:41141/1‑151 GCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGCGTGCACTGCCCTGTCGGAGCGGGCTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCCCGCAAGCACCACTCTTc > 2:1047985/1‑150 CCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGTTTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTG < 1:950117/151‑1 CCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGAGTGCACTGCCCCGTCGGAGCGGGACTACCCGCGAAAGGGCCCGCCCACGCAAGCAGCACTATAGGGCGAC > 2:2919806/1‑151 CCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGcc > 2:3282885/1‑149 CTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCA < 2:2326885/151‑1 gAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCT < 1:5228726/150‑1 TAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCT < 1:3375670/151‑1 AAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTC < 1:1001669/151‑1 atCCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTCA < 2:3875329/149‑1 ACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCGCTATTTGGCGACCACAACACCCTCAG > 1:2464393/1‑151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGACCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3148718‑3148569‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTCAGC < CP009974/3148596‑3148447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |