Hadiastri_2021: Solvent_Tolerance_Pputida
Stats |
Metadata |
Mutations |
Converged Mutations |
Fixed Mutations |
Filter
Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A3 F1 I1 R1 | 368 | 332.2 | 13092066 | 97.0% | 12699304 | 150.6 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009974 | 3,148,596 | +GTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCACAGGCACTCCAAATTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCACAGGCACTCCAAATTGTAGGAGCGG | intergenic (+123/+89) | RPPX_14035 → / ← RPPX_14040 | membrane protein/bifunctional glyoxylate/hydroxypyruvate reductase B |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 3148569 = | 39 (0.120) | 109 (0.610) +CGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC |
77/164 | 2.6 | 79.7% | intergenic (+96/+116) | RPPX_14035/RPPX_14040 | membrane protein/bifunctional glyoxylate/hydroxypyruvate reductase B |
| ? | CP009974 | = 3148596 | 63 (0.190) | intergenic (+123/+89) | RPPX_14035/RPPX_14040 | membrane protein/bifunctional glyoxylate/hydroxypyruvate reductase B | |||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
GGACCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3148718‑3148569‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTCAGC < CP009974/3148596‑3148447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGACCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCC < 1:4185225/151‑1 GGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCC < 1:2736834/151‑1 GTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCT > 1:6042224/1‑151 GAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTCCACTTTGGAGTACCTGTGCCGGCCCCTTC > 2:557919/1‑151 GAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTC < 1:5539292/151‑1 AACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCG < 1:3857038/151‑1 AACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCG < 1:912852/151‑1 ACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGC < 2:3790261/151‑1 CCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGG < 1:3600489/151‑1 CAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTA < 1:2067045/151‑1 AGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAA > 1:2373447/1‑151 GGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAA < 1:653036/151‑1 TGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAAC > 1:5412453/1‑151 CCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTT < 1:1304431/151‑1 TTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAG < 2:3570671/151‑1 GAATGCCGGTGCGGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCGTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCC < 2:6094578/151‑1 AATGCCGGTGCTGGCGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCT < 1:3646436/151‑1 GCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTG < 2:53689/151‑1 GCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTG < 2:528837/151‑1 CTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCC > 1:2259503/1‑151 TGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCt > 2:1462129/1‑150 TGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCG < 1:2547350/151‑1 TGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCG < 2:593651/151‑1 GCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTT < 1:1546645/151‑1 cgCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTC < 2:2733803/149‑1 CCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTC < 1:3928107/151‑1 TTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGG < 1:1074496/151‑1 GGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC < 1:3324051/151‑1 AACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGGGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCac > 1:5572776/1‑149 CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 2:2651744/1‑151 CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCCCC > 1:1249575/1‑151 CGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCTGGGAAACCCGCCCCc > 2:1575337/1‑150 CGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT < 2:2442473/151‑1 CGCGCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCGGGCCCCTTGGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT < 2:2016361/151‑1 CTACAATGTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAT < 2:3392084/151‑1 ccttTTTGGAGTGCCGGTGGGGGCCCCCTCCCGGGGAAGACCGGCCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTT < 2:6309601/147‑1 AATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCTCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGG > 1:1932173/1‑151 TTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGT < 2:1300844/151‑1 tggacgGCCGGTGCTGGGCCCTTCGAGGTTAAGACCGCTCCTACATTTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTG < 2:1854323/145‑1 gggGCCTGTGCTGGCCCCCTCCCGGGTAAGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCT < 2:3505164/148‑1 AGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCT < 1:5737161/151‑1 GTGCCTGTGCTGGCGCCTTCGCGGGTAAGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTG < 2:6047474/151‑1 TGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGGGCCTGT > 1:4607819/1‑151 CTGGGCTGGCCCCGTCGCGGGTAAGCCCGCTCCGACAGTTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCT < 2:6133882/151‑1 TGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACTTTGGCGTGCCTGTGCTc > 1:2889210/1‑150 TGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACTTGGAGTGCCTGTGCTG > 1:537745/1‑151 GTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGGGTTCCTGTTCTGG > 1:1807353/1‑151 GTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGG > 1:4090592/1‑151 TGGCCCCTTCGCGGGTAAAGCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCtc < 1:4734720/151‑3 TGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCtc < 1:100040/151‑3 GCCCCTTCGCGGGTAAGGCCGCTCCTGCAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTT < 2:4632132/151‑1 GCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTT > 1:3192248/1‑151 CCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGCGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCG < 1:378439/151‑1 CCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATCTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCCGTGCTGGCCTCTTCG > 2:5805946/1‑151 TTCGCGGGTAAGACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGG < 2:1644153/151‑1 CGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCCGGT > 2:2690523/1‑151 GCGGGTAAAACCGCTCCTACGATGTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTGCGCGGGTAAAACCGCTCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTA < 2:3316301/151‑1 AAAGCCGGTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGGCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG < 2:5066062/151‑1 AAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC > 1:141732/1‑151 ACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGCGTGCCTGTGCTGGCCGCTTCGCGCGTCAACCCGCTC > 2:5414664/1‑151 CGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT < 1:5884971/151‑1 GCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGACCTCTTCGCTGGAAAACCCGCTCCTA > 1:4357366/1‑151 CTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGGAAACTCGCTCCTAC > 1:3129894/1‑151 CTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCCGGTACACCCGCCCCTAC > 2:3633849/1‑151 TCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA < 2:1224620/151‑1 TCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA < 2:1347272/151‑1 gCAAGTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAGCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGG < 2:6395038/150‑1 ACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGG < 1:803270/151‑1 CAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAACGG > 1:5014121/1‑151 TTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGT < 1:6397210/151‑1 GCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCC > 1:6138638/1‑151 GCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCC < 1:5689413/151‑1 TGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTCCACCCGCTCCGCCAAAGGGTGCGCACTCCCCcg > 2:6163625/1‑149 TGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTG < 1:5118134/151‑1 CCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCG < 1:372132/151‑1 CCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCcg > 1:2148987/1‑149 CTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGT < 2:3711978/141‑1 TTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTT < 1:2694784/151‑1 CGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCCAAGGGTGTGCACTGCCCTGCAGGCGCGGGGTTc > 2:3123000/1‑150 GGTAAAACGGCTCCTACGATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG < 2:4120186/151‑1 TAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < 2:2925019/151‑1 cCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCAGTGCGTGCGCTGCCCTATACGAGCGGGCTGACCCGACAAAG > 2:3601055/2‑151 CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGCGCTTACCCGCCAAAGG > 2:4192966/1‑151 CGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGG > 2:4270634/1‑151 GCTCGTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGC < 2:1108384/151‑1 CCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTCCAAAGGGTGTGCACTGCCCTCTAGGACCGAGTTTACCCGCGAAACGTCCGc > 1:4308312/1‑150 CAATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCCCTGCCCTGCAGGCGCGGGCTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCA > 2:1719161/1‑151 AATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAG < 1:3162144/151‑1 ATTTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAACGGCCGGCCCAGG > 2:225038/1‑151 TTGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGCAAGGGCCCGCCCCGGCc > 2:3056966/1‑150 TGGAGTGCCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAA > 1:1680259/1‑151 CCTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGCGTTTACCCGCGAAAGGCCCGCCCCAGGCACGCATCAC > 2:4787628/1‑151 TGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTA < 1:4270634/151‑1 CCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTG < 1:3027802/151‑1 CCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGAC > 2:2548505/1‑151 CCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTA > 2:2748758/1‑61 CCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACC < 1:475189/151‑1 TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACA > 1:2588650/1‑151 AACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCAC > 2:702291/1‑141 CCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTCAGC < 1:3564108/151‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGACCTGGTGAACCCGCAGGTGTGGAAGGGCTGACCGTTTTGGAATGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/3148718‑3148569‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCTCCTACAATTTGGAGTGCCTGTGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGGTGTGCACTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCAGGCAAGCATCACTATTTGGCGACCACAACACCCTCAGC < CP009974/3148596‑3148447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |