Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 383 total aligned reads displayed.
GGACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGC > CP009974/1895593‑1895893
|
GACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTA < SRR10918230.2391813/151‑1 (MQ=60)
GACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCATACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTA > SRR10918230.1001328/1‑151 (MQ=60)
ACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTAC > SRR10918230.5142774/1‑151 (MQ=60)
CTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACC < SRR10918230.5043241/151‑1 (MQ=60)
CTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACC > SRR10918230.1386237/1‑151 (MQ=60)
TGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGG < SRR10918230.4702960/151‑1 (MQ=60)
GGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGG < SRR10918230.4552605/151‑1 (MQ=60)
GCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGG > SRR10918230.4542750/1‑151 (MQ=60)
GCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCT > SRR10918230.1638230/1‑151 (MQ=60)
CGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTT < SRR10918230.2116174/151‑1 (MQ=60)
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GTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCA < SRR10918230.3127445/151‑1 (MQ=60)
GTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCA > SRR10918230.3355513/1‑151 (MQ=60)
TCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAG < SRR10918230.2289298/151‑1 (MQ=60)
GGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTG < SRR10918230.113898/151‑1 (MQ=60)
GGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTG > SRR10918230.2520950/1‑151 (MQ=60)
GTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCG < SRR10918230.3616023/151‑1 (MQ=60)
GTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCG > SRR10918230.2353672/1‑151 (MQ=60)
CTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAAC < SRR10918230.3388454/151‑1 (MQ=60)
GCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGATAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCAGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTG < SRR10918230.162796/151‑1 (MQ=60)
CCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGC < SRR10918230.3506358/151‑1 (MQ=60)
TTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACA < SRR10918230.199864/151‑1 (MQ=60)
TTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACA < SRR10918230.4388659/151‑1 (MQ=60)
CCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGC < SRR10918230.1014843/151‑1 (MQ=60)
CGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACC > SRR10918230.3260300/1‑151 (MQ=60)
CGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACC > SRR10918230.2743537/1‑151 (MQ=60)
GGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCT < SRR10918230.2501381/151‑1 (MQ=60)
CAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCA < SRR10918230.1540238/151‑1 (MQ=60)
AAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGT > SRR10918230.516401/1‑151 (MQ=60)
CGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCG > SRR10918230.3998388/1‑151 (MQ=60)
GTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggac > SRR10918230.3848167/1‑113 (MQ=60)
GCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918230.1737125/151‑1 (MQ=60)
GGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑T < SRR10918230.5003030/151‑1 (MQ=60)
GGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑T < SRR10918230.5002812/151‑1 (MQ=60)
cggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAAC < SRR10918230.4829214/98‑1 (MQ=0)
CGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcac < SRR10918230.1523070/151‑10 (MQ=60)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918230.847711/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918230.3748029/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918230.2614037/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC < SRR10918230.5446080/99‑1 (MQ=4)
gccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCG < SRR10918230.1118010/100‑1 (MQ=8)
ccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGG > SRR10918230.1026973/51‑151 (MQ=13)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG > SRR10918230.234907/50‑151 (MQ=20)
cgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGG < SRR10918230.1700968/102‑1 (MQ=20)
GGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagag > SRR10918230.3805600/1‑138 (MQ=60)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT < SRR10918230.4041196/103‑1 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918230.3627919/49‑151 (MQ=25)
gagttcagacgtgtgctcttccgatctCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtc < SRR10918230.2575007/124‑16 (MQ=39)
AGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcg < SRR10918230.1771262/151‑17 (MQ=60)
tggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTT > SRR10918230.3461583/45‑151 (MQ=60)
tggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTT < SRR10918230.1720922/107‑1 (MQ=60)
ggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTG > SRR10918230.2091771/44‑151 (MQ=60)
gtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGC > SRR10918230.5316211/43‑151 (MQ=60)
ACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagccgttgg > SRR10918230.4581311/1‑131 (MQ=60)
gaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTA < SRR10918230.558998/111‑1 (MQ=60)
ATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggta > SRR10918230.3308176/1‑129 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918230.5216052/113‑1 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918230.3222033/113‑1 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC > SRR10918230.4510750/39‑151 (MQ=60)
CACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtacc > SRR10918230.2834296/1‑127 (MQ=57)
cttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCG < SRR10918230.2674660/114‑1 (MQ=60)
cttgaccagatcgccttcgttgaccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCG < SRR10918230.4857465/114‑1 (MQ=60)
ttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGA < SRR10918230.285670/115‑1 (MQ=60)
gaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACG < SRR10918230.1810637/117‑1 (MQ=60)
accagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAGCTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGT < SRR10918230.3340879/118‑1 (MQ=60)
accagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGT > SRR10918230.601678/34‑151 (MQ=60)
TGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccgacgt < SRR10918230.1989783/151‑30 (MQ=38)
ccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTA > SRR10918230.4919382/33‑151 (MQ=60)
ccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACAGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTA < SRR10918230.2207564/119‑1 (MQ=60)
agatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGA > SRR10918230.54670/31‑151 (MQ=60)
TTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACA‑‑‑GAGTCGTTGGTACCGACGTAGA < SRR10918230.94735/151‑1 (MQ=20)
TTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACA‑‑‑GAGTCGTTGGTACCGACGTAGA < SRR10918230.93681/151‑1 (MQ=20)
gatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC > SRR10918230.3878895/30‑151 (MQ=60)
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TCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGGTCGACCTTGCCGACCTCCGCGCCT > SRR10918230.3820978/1‑72 (MQ=17)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC > SRR10918230.3857885/1‑151 (MQ=33)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918230.263558/151‑1 (MQ=33)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918230.3430302/151‑1 (MQ=0)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCACCGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCC < SRR10918230.4906353/151‑1 (MQ=60)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918230.2030566/151‑1 (MQ=29)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCC > SRR10918230.4334466/1‑151 (MQ=60)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCC > SRR10918230.2467428/1‑151 (MQ=60)
TCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCA < SRR10918230.471912/151‑1 (MQ=0)
TCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCA > SRR10918230.244206/1‑151 (MQ=0)
CGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC > SRR10918230.4464654/1‑151 (MQ=0)
CGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918230.4477083/151‑1 (MQ=21)
CGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCAC < SRR10918230.3725999/151‑1 (MQ=60)
CGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCAC > SRR10918230.5066637/1‑151 (MQ=60)
CGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCAC > SRR10918230.255414/1‑151 (MQ=60)
GGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACG < SRR10918230.2878336/151‑1 (MQ=18)
GGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACG > SRR10918230.4675525/1‑151 (MQ=60)
GTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGG < SRR10918230.2071104/151‑1 (MQ=18)
GTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGG > SRR10918230.3607796/1‑151 (MQ=60)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT > SRR10918230.1346807/1‑151 (MQ=18)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGT < SRR10918230.4777605/151‑1 (MQ=60)
CACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTG > SRR10918230.1250395/1‑151 (MQ=18)
ACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACGGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTTCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGC > SRR10918230.532592/1‑151 (MQ=5)
ACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGGCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGC > SRR10918230.3209831/1‑151 (MQ=0)
ACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC > SRR10918230.4255499/1‑151 (MQ=60)
ccgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCC < SRR10918230.3015045/146‑1 (MQ=0)
ccgacGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCC > SRR10918230.133406/6‑151 (MQ=19)
gacGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCAT > SRR10918230.1240019/4‑151 (MQ=60)
acGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATT < SRR10918230.706208/149‑1 (MQ=0)
acGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATT < SRR10918230.229623/149‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTA > SRR10918230.3479053/1‑151 (MQ=19)
CGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTG < SRR10918230.3755091/151‑1 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGG < SRR10918230.4317028/151‑1 (MQ=0)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918230.1365357/1‑44 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918230.414488/1‑44 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918230.1313980/1‑44 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918230.2946133/1‑44 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTG > SRR10918230.3928162/1‑42 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTT > SRR10918230.2454683/1‑41 (MQ=60)
GTGCTGACCGGAGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTC < SRR10918230.5298091/50‑1 (MQ=59)
TGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCGGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGC > SRR10918230.1205704/1‑151 (MQ=60)
GCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCC < SRR10918230.3665431/151‑1 (MQ=18)
CTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGGCCG > SRR10918230.2010065/1‑151 (MQ=0)
CTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCG > SRR10918230.665680/1‑151 (MQ=18)
TGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGG > SRR10918230.2120105/1‑151 (MQ=16)
TGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGG < SRR10918230.4036299/151‑1 (MQ=60)
GACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGGCCGGC > SRR10918230.103575/1‑151 (MQ=0)
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GGACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGC > CP009974/1895593‑1895893
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
