Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
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96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 292 total aligned reads displayed.
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|
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ACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTAC < SRR10918231.2338614/151‑1 (MQ=60)
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TTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCG > SRR10918231.3219939/1‑151 (MQ=60)
TGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGG > SRR10918231.906383/1‑151 (MQ=60)
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GTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTG < SRR10918231.2749780/151‑1 (MQ=60)
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TCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAG > SRR10918231.928/1‑151 (MQ=60)
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TCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACAT > SRR10918231.714765/1‑151 (MQ=60)
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GTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTT < SRR10918231.703982/151‑1 (MQ=60)
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GTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTT < SRR10918231.4449460/151‑1 (MQ=60)
gagcgGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACGTCACCGTGGTTGCCGGTGCCCGGGGTACCCGTGCCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAAC < SRR10918231.3118956/146‑1 (MQ=60)
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GTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTG < SRR10918231.2851960/151‑1 (MQ=60)
GCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918231.4627216/151‑1 (MQ=60)
GTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtt > SRR10918231.1303242/1‑149 (MQ=60)
GTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtt < SRR10918231.1372159/151‑3 (MQ=60)
TAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAttt < SRR10918231.1867555/151‑4 (MQ=60)
AATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttg < SRR10918231.1648879/151‑5 (MQ=60)
ACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatc > SRR10918231.3743574/1‑144 (MQ=60)
CCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatca > SRR10918231.4701643/1‑143 (MQ=60)
cggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAAC > SRR10918231.4960629/54‑151 (MQ=0)
CGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcac < SRR10918231.2733379/151‑10 (MQ=60)
CGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcac < SRR10918231.2316803/151‑10 (MQ=60)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918231.3901512/53‑151 (MQ=4)
ggccgtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACC > SRR10918231.3642136/53‑151 (MQ=4)
GACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcaca > SRR10918231.830293/1‑141 (MQ=60)
GACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGCGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcaca > SRR10918231.3461440/1‑141 (MQ=60)
CGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacaga < SRR10918231.1590690/151‑13 (MQ=60)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.4616940/49‑151 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.2725213/49‑151 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.996420/49‑151 (MQ=25)
gtgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGT > SRR10918231.2674727/49‑151 (MQ=25)
GTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagt < SRR10918231.3575556/151‑15 (MQ=60)
GTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagt > SRR10918231.3980919/1‑137 (MQ=60)
tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTC > SRR10918231.4209592/48‑151 (MQ=29)
tgatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTC < SRR10918231.2510151/104‑1 (MQ=29)
TAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtc < SRR10918231.4516439/151‑16 (MQ=60)
gatggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCAGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCG < SRR10918231.1040062/105‑1 (MQ=60)
AGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcg < SRR10918231.1156532/151‑17 (MQ=60)
GTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgt > SRR10918231.4695780/1‑134 (MQ=60)
tggtgaccttgcccagatcgccttcgttgcccggCGTACCGGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTT < SRR10918231.1409057/117‑1 (MQ=60)
tggtgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTT > SRR10918231.2882386/45‑151 (MQ=60)
TGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgtt > SRR10918231.2411439/1‑133 (MQ=60)
tgaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCT < SRR10918231.3691241/110‑1 (MQ=60)
gaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTA < SRR10918231.4476672/111‑1 (MQ=60)
gaccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTA > SRR10918231.2948943/41‑151 (MQ=60)
ATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggta > SRR10918231.4041734/1‑129 (MQ=60)
accttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGGCGTTGCTAC > SRR10918231.3743710/40‑151 (MQ=60)
TCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtac < SRR10918231.2174991/151‑24 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC > SRR10918231.1382149/39‑151 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918231.132249/113‑1 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918231.3473627/113‑1 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC > SRR10918231.2018990/39‑151 (MQ=60)
ccttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACC < SRR10918231.193692/113‑1 (MQ=60)
CACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtacc < SRR10918231.4287022/151‑25 (MQ=57)
cttgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCG < SRR10918231.322175/114‑1 (MQ=60)
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cgtgaccagatcgccttcgttgcccggcgtgcctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTATTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCG < SRR10918231.322279/114‑1 (MQ=60)
CCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACGGCGGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGAtttgatcacagagtcgttggtaccga < SRR10918231.4760824/151‑27 (MQ=49)
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tgaccagatcgccttcgttgcccggcgtacctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGAC < SRR10918231.2291581/116‑1 (MQ=60)
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GTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacag < SRR10918231.2055592/151‑7 (MQ=5)
TACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagt < SRR10918231.4629432/151‑8 (MQ=5)
ACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg > SRR10918231.1562954/1‑143 (MQ=47)
ACCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTG > SRR10918231.780886/1‑151 (MQ=60)
ACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtg < SRR10918231.1432283/151‑9 (MQ=5)
CCTGGCTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtgg < SRR10918231.3924669/151‑10 (MQ=45)
ctggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGC < SRR10918231.2879099/146‑1 (MQ=60)
ccggctcgtcggtgaccgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggc < SRR10918231.3701542/131‑11 (MQ=7)
tggctcgtccgtcaccgacGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTCTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCAA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCA < SRR10918231.1116420/132‑1 (MQ=60)
tggcTCGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCA < SRR10918231.1115383/147‑1 (MQ=60)
cggctcgtcggtgaccgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCTCCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGAGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCA > SRR10918231.3000604/20‑151 (MQ=15)
cggctcgtcggtgaccgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCA > SRR10918231.3987658/20‑151 (MQ=6)
CTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagta > SRR10918231.3479228/1‑137 (MQ=3)
TCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtgacagtggcagtac > SRR10918231.4229121/1‑136 (MQ=4)
CGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCCATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918231.2234494/151‑1 (MQ=1)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC < SRR10918231.1367552/151‑1 (MQ=33)
CGTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACC > SRR10918231.485052/1‑151 (MQ=33)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC > SRR10918231.832851/1‑151 (MQ=0)
GTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCC < SRR10918231.1171709/151‑1 (MQ=0)
GTCGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCC < SRR10918231.550721/151‑1 (MQ=60)
CGGTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCAC < SRR10918231.5171035/151‑1 (MQ=21)
GTCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGG > SRR10918231.4159203/1‑151 (MQ=60)
tgagcgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT < SRR10918231.2921552/143‑1 (MQ=0)
tgaccgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT > SRR10918231.4111223/9‑151 (MQ=0)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT < SRR10918231.3820247/151‑1 (MQ=18)
TCACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGT > SRR10918231.779600/1‑151 (MQ=18)
gaccgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTG < SRR10918231.3824085/144‑1 (MQ=0)
CACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTG < SRR10918231.2488268/151‑1 (MQ=60)
ACCGACGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGC < SRR10918231.3503210/151‑1 (MQ=60)
cgacGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCA < SRR10918231.1958168/147‑1 (MQ=17)
cgacGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCA < SRR10918231.1265164/147‑1 (MQ=60)
gacGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCAT < SRR10918231.3063062/148‑1 (MQ=60)
acGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATT > SRR10918231.66665/3‑151 (MQ=60)
acGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATT < SRR10918231.3433896/149‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTA < SRR10918231.2874658/151‑1 (MQ=19)
CGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTG < SRR10918231.4910959/151‑1 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC < SRR10918231.758500/44‑1 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918231.1849382/1‑44 (MQ=60)
GTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCC > SRR10918231.3908844/1‑44 (MQ=60)
GTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAG < SRR10918231.247412/151‑1 (MQ=19)
GTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGG < SRR10918231.4645402/151‑1 (MQ=60)
TGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGGC < SRR10918231.2124518/151‑1 (MQ=0)
TGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGGC < SRR10918231.98832/151‑1 (MQ=0)
TGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGC > SRR10918231.5220338/1‑151 (MQ=19)
CTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCG > SRR10918231.2719322/1‑151 (MQ=18)
GACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGGCCGGC > SRR10918231.2812909/1‑151 (MQ=0)
GACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGA‑‑‑CATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTGACAGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTGGCCGGC > SRR10918231.3241614/1‑151 (MQ=0)
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GACTTGGCCGCGTTGCTCAGCGTCAGGGTGTACTGGCCGGTTTCACCCTCGGTCAGAGAAGTCGTGCCGGTAATACCGACGGTAGTGACATCACCCTGGTTGCCGGTGCCCGGAGTTCCCGTACCGGGTTCGTCGGTCACCGCGGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGA‑‑‑CATCACAACCGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGC > CP009974/1895594‑1895893
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
