Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 309 total aligned reads displayed.
GGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCTTTTGAGT > CP009974/3847469‑3847765
|
ccctgcacagtttggtggtggccacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACACCAGA < SRR10918230.1519256/100‑1 (MQ=24)
GGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGG > SRR10918230.866939/1‑151 (MQ=60)
ggtggtggacacaggtcggtggttggtcacaggccgtggTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGAT < SRR10918230.3376398/112‑1 (MQ=9)
gttcagacgtgtgctcttccgatctTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACA < SRR10918230.5395323/126‑1 (MQ=0)
gcacaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCGCTGCCGGCCAATTTTCACCCGCCGGTCCCTGTTGCCCCCGCTGCCGCATTCGC‑GGGTAAACCCACTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGG > SRR10918230.4144157/14‑151 (MQ=22)
GGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTCATGGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGC > SRR10918230.4075616/1‑151 (MQ=60)
aggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGcgc > SRR10918230.785482/10‑148 (MQ=59)
gggcgtcgTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCAC < SRR10918230.2814991/143‑1 (MQ=4)
ggccgtcggAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCCCCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAG < SRR10918230.4955527/142‑1 (MQ=26)
cgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGcgcaggc > SRR10918230.4589397/6‑144 (MQ=60)
gtcgTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCGCAGGG > SRR10918230.289396/5‑151 (MQ=2)
ccgtcGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGG < SRR10918230.3433933/146‑1 (MQ=27)
CGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCG > SRR10918230.3301213/1‑151 (MQ=46)
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TGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTC < SRR10918230.3695073/151‑1 (MQ=30)
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GTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGagatcggaagagcac > SRR10918230.261407/1‑136 (MQ=2)
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AGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGG > SRR10918230.2254185/1‑151 (MQ=9)
AGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTG > SRR10918230.2424053/1‑151 (MQ=36)
GAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTAACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTA > SRR10918230.4082114/1‑151 (MQ=38)
GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCCACCGTATTCGC‑GGGGAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACATGTCGGTGGCtgggcgcctgccgcgcggtacg > SRR10918230.1121283/1‑129 (MQ=1)
GCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGA > SRR10918230.667468/1‑151 (MQ=60)
TGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGA < SRR10918230.334775/151‑1 (MQ=44)
GGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGC < SRR10918230.4711740/151‑1 (MQ=57)
GTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGCTCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCG > SRR10918230.3457717/1‑151 (MQ=43)
gttgtccgtgacgggggtcggcccgggtgcccttccaacctgggtcgtcccgctccgccgctgattgggggtgggcaggggacgcggctggggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG < SRR10918230.2955666/58‑1 (MQ=25)
tcacgcggaaaagggccggcgctgttggcgtccgggactggagtgcacacgGTTGCCGCTCCTACCTTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGT < SRR10918230.4986841/100‑1 (MQ=60)
TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT > SRR10918230.721321/1‑151 (MQ=60)
TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT > SRR10918230.725787/1‑151 (MQ=60)
cgCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGGTGGCCAATCACCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCTCCACTGTATTCGC‑GGGTACTCCCGCTGATACGCCGGATCGAGGATGGACAAAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTT < SRR10918230.5097210/149‑1 (MQ=48)
ACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.4523921/151‑1 (MQ=60)
atctCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.4504388/147‑1 (MQ=60)
CCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.2734966/151‑1 (MQ=46)
CCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGCCCGCCGTGTAGagccgggttt > SRR10918230.4651802/1‑141 (MQ=23)
tccgcggttaacgaatgccagcgcttcggcatctgcgggaaaacccgcacctacacagactggtggtggccacaggtcggtgatcgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918230.3145546/63‑1 (MQ=8)
CCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTA > SRR10918230.1032893/1‑151 (MQ=48)
CCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAC > SRR10918230.2609922/1‑151 (MQ=60)
CCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTA > SRR10918230.3129952/1‑151 (MQ=60)
ccgaacaGGCCGGCCCTCCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTTCCGGCTTCGC‑GGGCAACCCCGATCCGACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGCGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACC < SRR10918230.1628459/144‑1 (MQ=51)
GCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGCAAACCCGCTCCTACGCCGGTTCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCCGCGTGTACGAGCGGCATTACC > SRR10918230.2494732/1‑151 (MQ=34)
CGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < SRR10918230.1749367/151‑1 (MQ=54)
CGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < SRR10918230.1642122/151‑1 (MQ=56)
GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG < SRR10918230.964529/151‑1 (MQ=60)
AACGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < SRR10918230.4200656/151‑1 (MQ=39)
agaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGcgccgggcgtcggggaggagcggggttaaccgcga > SRR10918230.3633849/4‑116 (MQ=24)
AAGGGCCGGCCCTGCTGGCTGATCTTCATCCGCCGTGCACCGGTGCCGCCGCTGCCGTATTGGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < SRR10918230.3095104/151‑1 (MQ=60)
AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGCGCGGGGTTAGCCGCGA > SRR10918230.4322130/1‑151 (MQ=40)
AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < SRR10918230.1544670/151‑1 (MQ=60)
gaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGGGTAGGggccgggaagaccacag > SRR10918230.3009908/3‑134 (MQ=53)
GGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > SRR10918230.2079356/1‑151 (MQ=60)
GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAG > SRR10918230.1971291/1‑151 (MQ=60)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGgcatgccgttgggtaggagcgggttttccctcgaaatg > SRR10918230.2279151/1‑113 (MQ=32)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA < SRR10918230.4721144/151‑1 (MQ=60)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG > SRR10918230.4407743/1‑151 (MQ=44)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA > SRR10918230.1310585/1‑151 (MQ=60)
CGGGCCCTCCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG < SRR10918230.5449193/151‑1 (MQ=56)
CCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGTTGCCGTATTCGC‑GGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG < SRR10918230.4383720/151‑1 (MQ=57)
CGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAAGAGCGGGATTACCCGCGAAGAGG > SRR10918230.2147566/1‑151 (MQ=60)
CGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG > SRR10918230.963049/1‑151 (MQ=60)
CGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGC > SRR10918230.1600342/1‑151 (MQ=60)
GGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918230.766028/1‑151 (MQ=49)
cgCCTGCTGGCCAATTTCCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCGCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCA < SRR10918230.5274489/149‑1 (MQ=60)
CCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCagatcggaagagc > SRR10918230.106615/1‑138 (MQ=26)
CCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGGAGAGGCCAT > SRR10918230.4366019/1‑151 (MQ=26)
CCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATC < SRR10918230.430691/151‑1 (MQ=55)
CCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > SRR10918230.3395729/1‑149 (MQ=60)
CTGCTGGCCAGTTTTCACCCGCCGTTCACGGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑AGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggc < SRR10918230.324710/151‑4 (MQ=51)
GCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctc > SRR10918230.4754100/1‑146 (MQ=60)
GCTGCCCAATTTCCCCCCCCCGTGCAGTGTTGACGCCGCTGCCGTATTGGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGACCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccc < SRR10918230.2016906/151‑6 (MQ=60)
TGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACC < SRR10918230.134804/151‑1 (MQ=60)
TGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctg > SRR10918230.255553/1‑144 (MQ=60)
GGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTagatcggaagagcacacgtctgaact > SRR10918230.2593519/1‑125 (MQ=27)
GGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctac > SRR10918230.3518126/1‑143 (MQ=55)
GGCCAAGTTTCACCCGCCGTTCGCTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTGACCCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctac < SRR10918230.3570537/151‑9 (MQ=49)
gccactcttcccccgtCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGCATTCGC‑GGTTCATCCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctact < SRR10918230.3994377/135‑10 (MQ=60)
GCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgct > SRR10918230.2232355/1‑142 (MQ=60)
CCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGcgccaggccgccttgtagggccgggttaaccgccgaagagcccgcccctactg > SRR10918230.1322014/1‑98 (MQ=33)
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ggacacaggtcggtgattgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGTCAAACCCCGCCCAAAAAAAAAATTTTTTCAAAGTACCCCTTGAAAGCATT > SRR10918230.326433/22‑151 (MQ=43)
CGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccgttcaccgttgccgccaccaccgtat > SRR10918230.1088532/1‑98 (MQ=54)
CGC‑GGGTAAACACGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccattccccgttgactccaccaccgtat > SRR10918230.1088223/1‑98 (MQ=60)
GC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGCTGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctactggccaattaccacccgccgttcactgttgccgctgctaccgtatc > SRR10918230.1546022/1‑97 (MQ=0)
GA‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCC < SRR10918230.2153147/151‑1 (MQ=60)
C‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCC > SRR10918230.4858185/1‑151 (MQ=60)
C‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccgttcaccgttgccgccaccaccgtattc > SRR10918230.998354/1‑96 (MQ=55)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCT < SRR10918230.3693781/151‑1 (MQ=60)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGG > SRR10918230.1146606/1‑30 (MQ=0)
GGTAAACCCGCTCCTACGCGGGATCGAGGATGGACACAGGTGGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctactggccaattaccacccgccgttcactgttgccgctgctaccgtattcgc < SRR10918230.764505/151‑58 (MQ=2)
GGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccgttcaccgttgccgccaccaccgtattcgc > SRR10918230.3702657/1‑94 (MQ=53)
GGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccgttcaccgttgccgccaccaccgtattcgc > SRR10918230.3202625/1‑94 (MQ=53)
GGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctcccggccaagtaccacccgccgttcactgtagccgctgccaccgtgttcgc > SRR10918230.2759663/1‑94 (MQ=60)
GTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCG > SRR10918230.234709/1‑151 (MQ=60)
GTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctactggccaattaccacccgccgttcactcttgccgctgctaccgtattcgcg > SRR10918230.4812496/1‑93 (MQ=15)
TAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctactggccaattaccacccgccgttcactgttgccgctgctaccgtattcgcgg < SRR10918230.2671416/151‑60 (MQ=0)
AAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGC > SRR10918230.3483437/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccgttcaccgttgccgccaccaccgtattcgcggg > SRR10918230.3346685/1‑91 (MQ=25)
AACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaatctccacccgccgttcaccgttgccgccaccaccgtattcgcgggt > SRR10918230.206054/1‑90 (MQ=23)
CCCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACGGCCCATGGTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCC < SRR10918230.3967388/89‑1 (MQ=7)
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CCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggaca > SRR10918230.1696690/1‑112 (MQ=60)
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CGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC < SRR10918230.4282832/86‑1 (MQ=24)
GCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATC < SRR10918230.1986169/151‑1 (MQ=60)
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CTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCT < SRR10918230.2212790/151‑1 (MQ=60)
CTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCT > SRR10918230.3902349/1‑151 (MQ=60)
CCTACGCGGGACGGAGGATGGACACGGGTGGGTGG‑GGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCTTT < SRR10918230.4602740/151‑1 (MQ=60)
CTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCTTTT > SRR10918230.5348029/1‑151 (MQ=60)
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ggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAgccaaccagatcgaaagaccacacgcgtgaactccagccgcggccaccaaattcgtaggccgtcttctgc > SRR10918230.3479432/3‑81 (MQ=12)
TACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCTTTTG > SRR10918230.95534/1‑151 (MQ=60)
ACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCAATTCCCTCGGCCATATCTTTTGA > SRR10918230.1608878/1‑151 (MQ=60)
CGCCGGATCGAGGGTGGCCACAGCTCGGTGGTTGGGCACAGCCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCC < SRR10918230.3489979/78‑1 (MQ=0)
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CGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918230.287408/1‑78 (MQ=0)
GCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918230.5433353/1‑77 (MQ=0)
CGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918230.4552003/1‑75 (MQ=3)
GGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918230.631315/1‑74 (MQ=5)
GGAGCGAGGATGTACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC < SRR10918230.47341/74‑1 (MQ=5)
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GGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCTTGAAAGCATTTCCCTCGGCCATATCTTTTGAGT > CP009974/3847469‑3847765
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |