Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 257 total aligned reads displayed.
GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGG > CP009974/3994667‑3994967
|
gttaccgccgctgccgtattcgggggtaaaccctctctcacgcagaagcggggatggaaaaaggatgttggtgaggggaaggcagaCGTGTAGGATCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCAC < SRR10918230.4568882/65‑1 (MQ=13)
ggtgacgcaggcaccgtattcttgtgtaaacacgctccagctgcggtttggtagtggtgtccgtgccgtgagtgcgggcaggtgctcttctgGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCAC < SRR10918230.3505675/59‑1 (MQ=8)
GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACC < SRR10918230.2479597/151‑1 (MQ=59)
GTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAAGGGCCGGCTCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCAC > SRR10918230.3026667/1‑151 (MQ=31)
TTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCG > SRR10918230.5447885/1‑151 (MQ=54)
TTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGGGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAACCACCACCCGCCGTTCACCG > SRR10918230.3753752/1‑151 (MQ=50)
tgacgccgccACCGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCG < SRR10918230.320328/141‑1 (MQ=26)
tgacgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCG < SRR10918230.3261260/141‑1 (MQ=30)
CCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCTGGCCAATTACCACACGCCGTTCACCGTT > SRR10918230.3083469/1‑151 (MQ=60)
CGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTGGGCGCGGGTTTAGCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTG > SRR10918230.479441/1‑151 (MQ=60)
CGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgc > SRR10918230.2574257/1‑145 (MQ=23)
CGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGGCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACcgctgc > SRR10918230.2574121/1‑145 (MQ=36)
CGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACGCAGGGAGGTGGTTGGTCACGGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTTCGCGCGGAAGGGCCGGCCTGGCTGGCCAAAAACCACCCGCCGTTCACCGTTG > SRR10918230.2722741/1‑151 (MQ=17)
CTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccc > SRR10918230.617509/1‑143 (MQ=44)
cgcggggagattggggcgtacgccggctctgacggcgaatcgaggatggacgcaggccggtgccgtggcagtggcggtCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCG < SRR10918230.3826453/73‑1 (MQ=7)
cgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCG > SRR10918230.4881998/5‑151 (MQ=22)
gttgccgtattcgcgtgtatttttttttttcaagcagaagacggcatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCCGCGAAAGGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGC < SRR10918230.2015932/55‑1 (MQ=10)
GCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCCGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCCCCGTTGCCGC > SRR10918230.5081441/1‑151 (MQ=60)
GCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGC < SRR10918230.1835408/151‑1 (MQ=19)
ccacggtatgCGCGGGTAACCGCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctg < SRR10918230.2178265/141‑12 (MQ=8)
CTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgct > SRR10918230.1248209/1‑141 (MQ=60)
CTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGCCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCCATTACCACCCGCCGTTCACcgtccccccc > SRR10918230.691631/1‑141 (MQ=60)
CCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgct < SRR10918230.2623246/151‑11 (MQ=21)
TACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgc > SRR10918230.2947589/1‑139 (MQ=26)
ACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCTGC > SRR10918230.4178164/1‑151 (MQ=60)
ACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgct > SRR10918230.5118554/1‑138 (MQ=23)
cccgtaatcgcgggtaaacgcgctgcgacacagattgttggtggacacagctgtggggttggaCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCT < SRR10918230.178404/88‑1 (MQ=12)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACCCAGGGCTGTGGTTGGTAACAGGCCGTAGTGTAGGCGCGGGCTTACATGCCAAAGGGTCGGACCTGCTGGCCAATTAACACCCGCCGTTCACTGTTGccgctgct > SRR10918230.1005093/1‑143 (MQ=5)
CGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgcta < SRR10918230.3590600/151‑15 (MQ=21)
CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgcccctgcta > SRR10918230.1048333/1‑137 (MQ=25)
gtagtcgcgggtaaactcgctcctacaccggattggtggtgttctcttttcgaagcttgagccggcataggagtgtggtgtccgtgtctggagtgcagacgtgtgctcttccggtCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCAC < SRR10918230.2163218/36‑1 (MQ=33)
gggtagggaggtgagagttgtagtgggacgggagggggggggacaaaggtcaattggTGGGCGCAGGCCGACGTGTAGGATCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgctac < SRR10918230.889914/94‑16 (MQ=0)
GTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgctacc > SRR10918230.1574617/1‑135 (MQ=18)
gtggtcgggggtatccgggctcctagccagattggtggtagacacaccgctgggggtggacgcgGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACC < SRR10918230.5133991/87‑1 (MQ=0)
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACC < SRR10918230.3925889/151‑1 (MQ=15)
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACC > SRR10918230.3220290/1‑151 (MQ=60)
ttcgcgggcaagcctccacctacaccgcattcgtggtgcacgcccatcggttacTGGGCGCAGGCCGTGGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGT < SRR10918230.683521/97‑1 (MQ=11)
TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGT < SRR10918230.4916287/151‑1 (MQ=9)
TCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgctaccgtat < SRR10918230.3259014/151‑21 (MQ=0)
CGGGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGTTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGGTGACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCTGGCCAAGTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTAT > SRR10918230.1489556/1‑151 (MQ=41)
CGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTTGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTAT < SRR10918230.3819569/151‑1 (MQ=5)
tcttccgatctGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTC < SRR10918230.3525253/140‑1 (MQ=59)
cggtaaacccgctcctaagcttgattggtggtggacactttttttttttttcaagcagaagacggcatacgagcttgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCG < SRR10918230.130763/34‑1 (MQ=0)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCG > SRR10918230.1854424/1‑151 (MQ=5)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCG > SRR10918230.316202/1‑151 (MQ=5)
GGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC < SRR10918230.5097687/151‑1 (MQ=5)
tcttccgatCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCG < SRR10918230.1352837/142‑1 (MQ=38)
GTGAACCCGCTTCGACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCG < SRR10918230.2353830/151‑1 (MQ=47)
GTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCG > SRR10918230.3060351/1‑151 (MQ=5)
AAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCCCTGCTTGCCAATTACAACCCGCCGTTCACCCTTGCCGCTGCCACCGTACTCGCGGG > SRR10918230.3361165/1‑151 (MQ=5)
AAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGG > SRR10918230.2438563/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGG > SRR10918230.2034658/1‑151 (MQ=60)
AACCCGCTCCTTCGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTAGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGT < SRR10918230.3029145/151‑1 (MQ=5)
AACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGCGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTTACCGTTGACGCCGCCCCCGTATTCGCGGGT > SRR10918230.1254431/1‑151 (MQ=0)
AACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGT > SRR10918230.645552/1‑151 (MQ=5)
gcgtgattcggCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTA < SRR10918230.4715676/140‑1 (MQ=18)
ACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTA < SRR10918230.1714210/151‑1 (MQ=18)
CCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAA > SRR10918230.5310864/1‑151 (MQ=5)
CCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAA > SRR10918230.1850990/1‑151 (MQ=5)
tgctcggACGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAAC < SRR10918230.2552750/144‑1 (MQ=0)
ccacactccttcagagattggtcatagacacacatcggttgttggacacagcccacTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAC < SRR10918230.1686430/95‑1 (MQ=0)
CGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAAC > SRR10918230.4450246/1‑151 (MQ=5)
GCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAACCC > SRR10918230.3409040/1‑151 (MQ=60)
GCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACC > SRR10918230.422056/1‑151 (MQ=58)
ctcatacgcagaagagtGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCATGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918230.3558790/134‑1 (MQ=25)
CTCTTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918230.4381456/151‑1 (MQ=0)
CTCCTACGCCGGATGGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918230.3868252/151‑1 (MQ=6)
CTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCC > SRR10918230.1163133/1‑151 (MQ=5)
tttccccgcagaagtggtcgtccgagattggtgactgggcctggagctccgtgttgggctctgcctatCCGCGAAGGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCT < SRR10918230.294949/83‑1 (MQ=31)
cggCGCCGGATCGCGGGTGGCCACAGGGCGGTGTTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCT < SRR10918230.3588666/148‑1 (MQ=9)
CTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCAagatcggaagagcacacgtctga > SRR10918230.1624220/1‑128 (MQ=4)
CTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGagtcaccccgct > SRR10918230.3799069/1‑139 (MQ=38)
tacagaggattggtggggaaccaaaaTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTC < SRR10918230.2739213/125‑1 (MQ=3)
ACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGTCGCAACTGCCGTATTCGCGCGTAAACCCACTac > SRR10918230.2911339/1‑149 (MQ=14)
cgccgggttggtggtggacacgcctcgttgatgaGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTT < SRR10918230.1654011/117‑1 (MQ=5)
GCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTA > SRR10918230.499598/1‑151 (MQ=23)
GCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCCACCGTATTCGCGGGaacacccgagccaa > SRR10918230.2930888/1‑137 (MQ=16)
aagcagaagacggcatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctgcgaagaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTAC < SRR10918230.290692/79‑1 (MQ=0)
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TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgcggccgaggctacgggggtcgcgcctgcacccgcaccaacctcggaggcgggggcgggcgggatatgagattaggcgaaggaggtcgtgtaggcgcggg > SRR10918230.608847/1‑50 (MQ=4)
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TACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTACCTGTGCAGGTCCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGAT > SRR10918230.3694121/1‑151 (MQ=60)
CCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcac > SRR10918230.754119/1‑117 (MQ=45)
CCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTtgattgcgggtgcagcagcaccgatgtctggactccagccgttgtgatcaagctggtttt > SRR10918230.346439/1‑91 (MQ=60)
CGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAAT > SRR10918230.1375264/1‑151 (MQ=60)
GCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATA < SRR10918230.337056/151‑1 (MQ=60)
CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCgagactagaagagcatactgctgaacaccagtcactgacatggagcaggcagtcgggcaggggctggataacca > SRR10918230.3358628/1‑77 (MQ=6)
GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaattagacct > SRR10918230.2318654/1‑67 (MQ=46)
AGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATG < SRR10918230.320917/151‑1 (MQ=60)
GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGA > SRR10918230.2755767/1‑151 (MQ=60)
gccatccccgccggccaatctacaccagccgcagACTGTTGACGCCGCCACCGGCGTGGCGGGTAAACCCGCTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGAC < SRR10918230.5462113/117‑1 (MQ=60)
CGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTG > SRR10918230.2290430/1‑151 (MQ=60)
CGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTG > SRR10918230.4682737/1‑151 (MQ=60)
GGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGC > SRR10918230.1523192/1‑151 (MQ=60)
GCCTGCTGGCCAAGCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCAATCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCC < SRR10918230.1686404/151‑1 (MQ=60)
CCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCCTACACTGGATtggggggggttcctgttcggggattgggcggagtgggtggtgtgggagagggtttatccgagaggaggccg > SRR10918230.3424746/1‑80 (MQ=20)
CCTTCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGTCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCG < SRR10918230.714940/151‑1 (MQ=60)
GCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTC > SRR10918230.5250823/1‑151 (MQ=60)
CTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATTGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCTTTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACATATGACTGCCTGGTGC > SRR10918230.480976/1‑151 (MQ=60)
CTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCC > SRR10918230.2844045/1‑151 (MQ=60)
TGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACACTGGATtgggggtggttccacagcggtggtggggcgcagggggtggtgcgggagcgggttaacccacgtggaggcccggtctg > SRR10918230.4543307/1‑74 (MQ=13)
TGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCC > SRR10918230.2845146/1‑151 (MQ=60)
TGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCC < SRR10918230.2834843/151‑1 (MQ=60)
TGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCC < SRR10918230.5089151/151‑1 (MQ=60)
GGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCG > SRR10918230.773285/1‑151 (MQ=60)
ccaatctcccCCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGA < SRR10918230.520238/141‑1 (MQ=60)
CAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGAT < SRR10918230.1183946/151‑1 (MQ=60)
aatctCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATG < SRR10918230.3307344/146‑1 (MQ=60)
aatctCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATG > SRR10918230.3134460/6‑151 (MQ=60)
ctCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACT > SRR10918230.4122552/3‑151 (MQ=60)
ACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACACTGGATAGgggggggttccagttcgggggcgggccgcaggcggaggagcgggagcgggtgtatacgaatggatgcccgccccggggggccag > SRR10918230.2505124/1‑67 (MQ=38)
CCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTAC < SRR10918230.1699317/151‑1 (MQ=60)
CACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACG < SRR10918230.1728374/151‑1 (MQ=60)
CACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACG < SRR10918230.3967215/151‑1 (MQ=60)
CCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACatcggcaccggacacgtcgggaccacagtccggggcatcgtcccaggatgccgtgtagtgccgggaaaacacacgaagaggccggccctgctggccaagcccc > SRR10918230.3561027/1‑48 (MQ=9)
CCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGAC > SRR10918230.1777323/1‑151 (MQ=60)
CCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACA > SRR10918230.107805/1‑151 (MQ=60)
CGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAG > SRR10918230.4055646/1‑151 (MQ=60)
CGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAG < SRR10918230.3720397/151‑1 (MQ=60)
CGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCCTACGCTGGATtggggcgggacccagagccgggatggtgcccagggcgtggagggggagcggatgaatacacgaagagccggagcgcacacgcctgtaccccagca > SRR10918230.2884304/1‑56 (MQ=19)
TTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCC < SRR10918230.1367514/151‑1 (MQ=60)
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GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGG > CP009974/3994667‑3994967
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |