Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 342 total aligned reads displayed.
GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGG > CP009974/3994667‑3994967
|
GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCAC > SRR10918235.418334/1‑151 (MQ=1)
GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGGTTACGCACGAAAG‑GGCCGGCCCTGCCGGGCAACTTCCGCCCGCCGTTCAC > SRR10918235.221117/1‑151 (MQ=43)
TTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCAGCCGCCGTTCACCG > SRR10918235.1996255/1‑151 (MQ=53)
TTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACT < SRR10918235.4566686/151‑1 (MQ=35)
tgccgctgttcccgtattcgcgggtaaactcttttttttcaagcagaagacggcatacgaggtagccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCG < SRR10918235.4531008/46‑1 (MQ=10)
GCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGT > SRR10918235.3405543/1‑151 (MQ=60)
GCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgct < SRR10918235.7197503/151‑5 (MQ=25)
tctctccgccaatactctcggctaacccctCTCCTACGCCGCATCGGGGGGTGACACAGGTCGGAGATTGCGCGCAGGCCGCTGTGTAGGAGTTGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTT < SRR10918235.2199938/121‑1 (MQ=44)
CCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATGGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGGGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACACGCCGTCCACCGTT > SRR10918235.6562629/1‑151 (MQ=60)
CCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctg < SRR10918235.6109617/151‑6 (MQ=25)
CCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTT < SRR10918235.5515031/151‑1 (MQ=22)
cacagattggtggtggacacaggtcggtgattgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGGTCACTGTTG > SRR10918235.6809408/36‑151 (MQ=0)
CGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgc > SRR10918235.3793993/1‑145 (MQ=23)
tccgcggacgactcggttgatatgcctgctgcctcaagggttcaaggctcacctcagttcggtggacctccagtactgcacgtggAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAA‑GGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGC < SRR10918235.214710/66‑1 (MQ=8)
GCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCATGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGC > SRR10918235.5645785/1‑151 (MQ=60)
GCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgcc > SRR10918235.4689470/1‑144 (MQ=21)
ccgccACCGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCC < SRR10918235.6642427/146‑1 (MQ=23)
ccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCC < SRR10918235.159297/146‑1 (MQ=24)
ccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCC < SRR10918235.4497744/146‑1 (MQ=24)
cccgctaccgtattgccgggtaacccggctcgtCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCC < SRR10918235.94065/118‑1 (MQ=60)
acggcatacgatttacgcgaaagtgactggcgaccagacgtgtgttcttccgatctGTCGGTGGTTGGTCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGAC < SRR10918235.1999343/95‑1 (MQ=18)
tgccaccgtaaacgcggcaaaccccgctcccgcgggggaccggggttgggcagagggcggtgacgaGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCG < SRR10918235.5816052/85‑1 (MQ=25)
cgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccc > SRR10918235.6743763/5‑143 (MQ=25)
cgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCG < SRR10918235.3234578/147‑1 (MQ=22)
GCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGC > SRR10918235.3001429/1‑151 (MQ=60)
gccaccgtattcgcgggtaaacccactcttacaccgggatcggaagagcacacctctgaactccagtcaccttcggtcatgtcggagcccgtctaccgcctgaaaagacaGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGC > SRR10918235.2254668/111‑151 (MQ=60)
TACCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCG < SRR10918235.384746/151‑1 (MQ=26)
TACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTG > SRR10918235.6478333/1‑151 (MQ=60)
TACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgc > SRR10918235.5120078/1‑139 (MQ=27)
taaccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatcTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGC < SRR10918235.2817401/109‑1 (MQ=0)
ggtggtggacacaggtcggtgattgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAAA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACACTTGCCGCCGCC > SRR10918235.4462903/28‑151 (MQ=19)
cccgtattcgcgggtaaacccgctcctattttgttttggaagcagaagacggcatacgattgagccgaaggtgacgggagtgcagacgtgtgctcttccggtcGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGC < SRR10918235.1481983/48‑1 (MQ=60)
CCGTATTCGCGGGTATGCCCGCTCGTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATGGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgct < SRR10918235.2572874/151‑14 (MQ=60)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgct < SRR10918235.2573111/151‑14 (MQ=60)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgct < SRR10918235.5884862/151‑14 (MQ=60)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgct > SRR10918235.681152/1‑138 (MQ=60)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgcta < SRR10918235.4690192/151‑15 (MQ=21)
CCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgcta < SRR10918235.5090599/151‑15 (MQ=21)
CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgcta < SRR10918235.2739071/151‑15 (MQ=60)
GTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgctgctac > SRR10918235.4716580/1‑136 (MQ=60)
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGAgatcggaaga > SRR10918235.3930479/1‑141 (MQ=5)
ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgctaccgt > SRR10918235.2229646/1‑133 (MQ=0)
ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgctgccgctgctaccgt > SRR10918235.2230531/1‑133 (MQ=0)
tgggcgggggaacctgcttctgCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGT < SRR10918235.6047048/129‑1 (MQ=60)
TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGT > SRR10918235.4101773/1‑151 (MQ=45)
TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgattggtggtgg < SRR10918235.4250683/151‑20 (MQ=23)
TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTA > SRR10918235.3138774/1‑151 (MQ=60)
CGCGGGTAAACCCGCTCTTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTAT < SRR10918235.4938120/151‑1 (MQ=0)
CGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTAT < SRR10918235.3750696/151‑1 (MQ=5)
CGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTAT < SRR10918235.6908929/151‑1 (MQ=60)
tgggtattccagctcttgtcgcggttcggtggtgccgaaggagaggtgagtgccgtcgggtgctcttgtaaGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTC < SRR10918235.1396263/80‑1 (MQ=7)
CGGGTAAGCCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGAGGGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTC < SRR10918235.4518189/151‑1 (MQ=53)
CGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTC < SRR10918235.1686694/151‑1 (MQ=5)
GGGTAAACCCGCTCGTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCG < SRR10918235.2960478/151‑1 (MQ=5)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATGGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGTCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCG < SRR10918235.1221736/151‑1 (MQ=60)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCG > SRR10918235.5157185/1‑151 (MQ=58)
gggggtaaacccgccccaacacagattgggggtggacacaaattggtggttgggcacagcccacTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCATGCACTGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGC < SRR10918235.1143754/87‑1 (MQ=0)
acgtgtgctcttccgatctcggattggtGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGC < SRR10918235.24073/123‑1 (MQ=9)
GGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC > SRR10918235.2507199/1‑151 (MQ=60)
GTAACCCCGCTCCTCCGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCG < SRR10918235.5419170/151‑1 (MQ=5)
GTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCG < SRR10918235.6943349/151‑1 (MQ=5)
gttcagccgtctgctcttgcgatcgtGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGG < SRR10918235.5532952/125‑1 (MQ=24)
TAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGG > SRR10918235.3240062/1‑151 (MQ=60)
AACCCCGCTCCTGCGCGGGATCGGTGGTGGACAGAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCACTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGG < SRR10918235.802021/151‑1 (MQ=0)
AACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGGTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGG > SRR10918235.276612/1‑151 (MQ=0)
AACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGT < SRR10918235.4561056/151‑1 (MQ=5)
ACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATGGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTA < SRR10918235.7090609/151‑1 (MQ=56)
CCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAA > SRR10918235.1545500/1‑151 (MQ=60)
CCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAA > SRR10918235.7072943/1‑151 (MQ=60)
CCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAA > SRR10918235.6869865/1‑151 (MQ=0)
CCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAA > SRR10918235.3290264/1‑151 (MQ=60)
CCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGCAAA > SRR10918235.5962696/1‑151 (MQ=60)
cgctttttttttttcaagctgatgacggcatacgagtgaaccgaaggtgactggagtgcagacgtgtgctctcccgagctAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAC < SRR10918235.41209/71‑1 (MQ=45)
CGCGCCAACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTGGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAAC < SRR10918235.7264606/151‑1 (MQ=19)
GCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACC > SRR10918235.764550/1‑151 (MQ=0)
GCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACC < SRR10918235.5859428/151‑1 (MQ=0)
gcgcctgcagggagtggggggggacacgcctgtggggTTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCC < SRR10918235.7148277/114‑1 (MQ=3)
CTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918235.5877887/151‑1 (MQ=58)
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TTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTCTGCAGGGGCGGTCCCGCGGGGAAGGgatcggaagag > SRR10918235.7034539/1‑140 (MQ=60)
TTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTCCCACTGCAGGGGCGGTCCCGCGTGcgtgaggtaggaggag > SRR10918235.6449221/1‑135 (MQ=60)
TTTACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGG > SRR10918235.1709647/1‑151 (MQ=60)
TTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGcaaagctcggcagagcacacgtctgaactccagtcaccttcggttatatcgtctgccgtcctcagcctgccaac > SRR10918235.1764942/1‑77 (MQ=9)
ACCCGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTAGAGGATG > SRR10918235.5580525/1‑151 (MQ=60)
ctgcgcagaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAA < SRR10918235.1296104/142‑1 (MQ=60)
CGCGAAGA‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAAT > SRR10918235.889034/1‑151 (MQ=60)
GAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgaagcggctgcgaacgcatccgcaggcaagcccgcttctacgctcgcgggagcggggacccgcgtcggagattggacgcagggggccgcggaggagggggcggcgctg > SRR10918235.2105662/1‑42 (MQ=10)
gaagacGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACA < SRR10918235.531723/145‑1 (MQ=60)
AAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACaccggattggggggagacccacagcggagaatgggcccaggcgaacgtgctggagcggatgaacacac > SRR10918235.4635116/1‑83 (MQ=10)
gaGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAAT < SRR10918235.6918179/149‑1 (MQ=60)
A‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACACTGGATtggtgcgcgatccacttcggttgttgggcccaggccgacgtgtaggagcgggtgaatccacaaa > SRR10918235.1079113/1‑87 (MQ=14)
A‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATG > SRR10918235.2869384/1‑151 (MQ=60)
GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCCTACGCCGGATAGggggtggaccctgatcggggatggtgcccagggcgtcgtgtaggacagggtgtatccgcatag > SRR10918235.2637566/1‑88 (MQ=35)
GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcaccttcggtt > SRR10918235.5293369/1‑109 (MQ=60)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGAC > SRR10918235.5251807/1‑151 (MQ=60)
CCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACT > SRR10918235.4949723/1‑151 (MQ=60)
CGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACACTGGATTGCGGGGCGTTCCTGTTCAGGTGCGGTCCCagatcggaagtgcacacgcctgcactccagtccccttg > SRR10918235.2813154/1‑113 (MQ=28)
CCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGGATAGgagcgcggccccgtgcaggtgcgggcccgagcgccagggcagaagtcgggactccgggtcacattcggg > SRR10918235.3523883/1‑82 (MQ=25)
CCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCG < SRR10918235.4759434/151‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCG < SRR10918235.4758724/151‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGGCCCGCGGGGAAGGgatcggaagagcacacgtctgaacgccagtcc > SRR10918235.5345922/1‑119 (MQ=60)
CTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGG < SRR10918235.2329614/151‑1 (MQ=60)
tgcgggccaatctccaccgcCCGTTCACTGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCGGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGT < SRR10918235.4919038/131‑1 (MQ=60)
CTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTTCAGGTGCGGTCCCGCGTGGATGGACCGGGACAGGATGTATACACATGACTGCCCGGTCC > SRR10918235.2706872/1‑151 (MQ=60)
TGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCC > SRR10918235.6301376/1‑151 (MQ=60)
GGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCG > SRR10918235.1446761/1‑151 (MQ=60)
GGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCG > SRR10918235.559278/1‑151 (MQ=60)
GCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGG < SRR10918235.1390555/151‑1 (MQ=60)
CCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCCCCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATCCAAATGACTGCCCGGTCCCGGA < SRR10918235.1972499/151‑1 (MQ=60)
CCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacctgcggttatctcgtatgccgtcttctgcttgaacaaaaaa > SRR10918235.2301018/1‑76 (MQ=33)
CAATCACCACCCTCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGAT < SRR10918235.3753720/151‑1 (MQ=60)
CCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGgacaagatcggaagagcacacgtctgacctccagtcaccttc > SRR10918235.3809358/1‑109 (MQ=60)
CACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACG > SRR10918235.6130684/1‑151 (MQ=60)
CACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACaccggattgctgcgcgacccacagcggttactgtgccccggccgtcgtccgggaccgggtgtatccaaaaggctgcccggcccgcgagggcttcg > SRR10918235.6219600/1‑56 (MQ=0)
ACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGA < SRR10918235.6659669/151‑1 (MQ=60)
CCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACA < SRR10918235.1031844/151‑1 (MQ=60)
CGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAG > SRR10918235.2627159/1‑151 (MQ=60)
CGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCT < SRR10918235.401649/151‑1 (MQ=60)
TTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTCCCTCTGCAGGGGCGGTCCCGCGGCGGAGGACCGGTACCGGATGAATACACATGGCTGCCCGGTCCgcgggcactacgaaacccggc > SRR10918235.5027749/1‑130 (MQ=60)
TCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCA > SRR10918235.6236125/1‑151 (MQ=60)
CACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGatccagagatcggaagagcacacgtctgtactctagtcaccttcggatatccggtatggcgtcctctgcttgtaaactaacacccccact > SRR10918235.6416663/1‑61 (MQ=60)
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GTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCGGCGCGTTCCTGTGCAGGTGCGGTCCCGCGTGGAAGGACCGGTACAGGATGAATACAAATGACTGCCCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGG > CP009974/3994667‑3994967
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
