Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,540,058 |
T→C |
A592A (GCA→GCG) |
RPPX_20280 ← |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,540,058 | 0 | T | C | 100.0%
| 953.5
/ NA
| 277 | A592A (GCA→GCG) | RPPX_20280 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (127/150); total (127/150) |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
ACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGTGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCGC > CP009974/4539941‑4540205
|
ccgccGCCCGAAGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGCTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCtt < 1:1860685/148‑1 (MQ=9)
caccGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCACATACCGCTGCACCTCTTg > 2:6684614/1‑151 (MQ=14)
accGCCCGAGGTGAGCAACCCGAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTgg < 2:2534464/151‑1 (MQ=14)
cGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCt < 1:1971394/151‑1 (MQ=17)
cGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCt < 2:152369/151‑1 (MQ=17)
cGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCt < 2:160223/151‑1 (MQ=17)
cGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCt > 1:3279729/1‑151 (MQ=14)
ccGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTaaa < 2:6534262/151‑1 (MQ=17)
gAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATg > 1:1467439/1‑151 (MQ=18)
gAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATg > 2:318097/1‑151 (MQ=18)
gAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTCGCTAAATg > 2:3647081/1‑151 (MQ=18)
aGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATgg < 2:4294840/151‑1 (MQ=21)
aGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATgg < 1:5788876/151‑1 (MQ=21)
aGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATgg > 1:5123155/1‑151 (MQ=21)
tGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAtt > 2:2300135/1‑151 (MQ=18)
aGCCACCCAGGGAAGTTGGGTTTCGCACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACGCCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAtttt < 2:2398295/151‑1 (MQ=255)
gCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTc < 1:2580219/151‑1 (MQ=25)
cAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTcc > 2:3955370/1‑151 (MQ=18)
aaCCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCt < 2:2687457/151‑1 (MQ=25)
aCCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCtt > 1:1245764/1‑151 (MQ=37)
cccAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCttt > 2:4700815/1‑151 (MQ=25)
aaGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATg > 2:409601/1‑151 (MQ=255)
ttGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATTGCCTGtt > 1:2133743/1‑151 (MQ=255)
ttGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGtt < 2:6749508/151‑1 (MQ=255)
ttGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGtt > 2:5378194/1‑151 (MQ=255)
ttGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGtt < 2:5990388/151‑1 (MQ=255)
gggTTTCACCCGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCCTGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCg < 2:290030/151‑1 (MQ=255)
gggTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCg < 2:5274453/151‑1 (MQ=255)
ttCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGa > 2:5867563/1‑151 (MQ=255)
ttCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGa < 1:1110759/151‑1 (MQ=255)
ttCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGa > 1:4374319/1‑151 (MQ=255)
cacaCGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGAtt < 2:413994/151‑1 (MQ=255)
cacGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCg < 2:6825608/151‑1 (MQ=255)
cacGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCg > 1:783151/1‑151 (MQ=255)
acGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGa > 1:6453701/1‑151 (MQ=255)
acGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGa < 2:1232381/151‑1 (MQ=255)
gcgcAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATa < 1:3562191/151‑1 (MQ=255)
gcAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAgc < 1:3224354/151‑1 (MQ=255)
gtggtgGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAgcgcg < 1:6990532/151‑1 (MQ=255)
gtggtgGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAgcgcg < 2:3560645/151‑1 (MQ=255)
gtggtCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGcgccg > 1:6501928/1‑151 (MQ=255)
tggtCAGCTCGATCGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGcgccgc < 2:3047492/151‑1 (MQ=255)
gtCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCa < 2:1043249/151‑1 (MQ=255)
tCAGCTCGATGGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAg < 2:6447912/151‑1 (MQ=255)
tCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAg > 1:7154261/1‑151 (MQ=255)
gcAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAg < 2:5750888/150‑1 (MQ=255)
cAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGc < 2:4876956/151‑1 (MQ=255)
cAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGc > 1:725409/1‑151 (MQ=255)
gCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCaa > 2:3765829/1‑151 (MQ=255)
gCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGCCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCaa > 2:737861/1‑151 (MQ=255)
tCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAcc < 2:705130/151‑1 (MQ=255)
tCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAcc < 2:5084844/151‑1 (MQ=255)
gATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAcccc > 1:2699277/1‑151 (MQ=255)
cacCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCt < 2:4860262/151‑1 (MQ=255)
acCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCtt > 2:3053942/1‑151 (MQ=255)
ccGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCttt < 1:4756487/151‑1 (MQ=255)
cGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTtc < 2:6289272/151‑1 (MQ=255)
gCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCCCGGCa > 2:5539179/1‑151 (MQ=255)
cTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCAt > 1:5978876/1‑151 (MQ=255)
aCCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTc < 2:2909003/151‑1 (MQ=255)
aCCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTc < 1:988781/151‑1 (MQ=255)
aCCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTc < 2:2968046/151‑1 (MQ=255)
ccGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGc > 1:1988322/1‑151 (MQ=255)
cGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGcc > 2:3424928/1‑151 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCg < 2:284753/141‑1 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCg > 1:284753/1‑141 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCt < 1:2492527/151‑1 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCt < 1:494886/151‑1 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCt > 2:4812981/1‑151 (MQ=255)
agaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCCCCTc > 1:3751883/1‑151 (MQ=255)
tGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCAcg > 1:589064/1‑151 (MQ=255)
tGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCAcg > 1:2190806/1‑151 (MQ=255)
cgcAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCAcgcg < 2:3460639/151‑1 (MQ=255)
cAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCt > 2:6178695/1‑151 (MQ=255)
aaCGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCCTTCGCCTCACGCGCTg > 2:141630/1‑151 (MQ=255)
aCGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGc > 2:918715/1‑151 (MQ=255)
cGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGcc < 1:83879/151‑1 (MQ=255)
tttCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGc < 2:814424/151‑1 (MQ=255)
tttCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGc > 1:6543154/1‑151 (MQ=255)
tttCATATCTTAAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGc < 1:2303702/151‑1 (MQ=255)
ttCCTCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCAGCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCa < 2:7013482/151‑1 (MQ=255)
ttCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGcc > 1:3865669/1‑150 (MQ=255)
ttCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCa < 2:1313572/151‑1 (MQ=255)
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TTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGA < SRR10918235.1115157/151‑1 (MQ=52)
TTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGA > SRR10918235.4393638/1‑151 (MQ=52)
TTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGA > SRR10918235.6218489/1‑151 (MQ=52)
TTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGA < SRR10918235.1115108/151‑1 (MQ=52)
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GATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCC > SRR10918235.2710890/1‑151 (MQ=60)
TAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAG > SRR10918235.5868466/1‑151 (MQ=60)
AGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGT < SRR10918235.4164472/151‑1 (MQ=60)
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CTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGAGTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCGC > SRR10918235.6182099/1‑151 (MQ=60)
GCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCGCAG < SRR10918235.3079948/151‑1 (MQ=60)
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TTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGTGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCGCAGG > CP009974/4539909‑4540208
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |