Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,540,058 |
T→C |
A592A (GCA→GCG) |
RPPX_20280 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,540,058 | 0 | T | C | 100.0%
| 623.4
/ NA
| 186 | A592A (GCA→GCG) | RPPX_20280 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (92/94); total (92/94) |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
ACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGTGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCG > CP009974/4539941‑4540204
|
accaccGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACctct > 1:3830418/1‑151 (MQ=11)
ccaccGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCtt < 1:3345277/151‑1 (MQ=14)
accGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTgg > 2:2473944/1‑151 (MQ=14)
accGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTgg < 1:4193271/151‑1 (MQ=14)
ccGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGc > 1:5081761/1‑151 (MQ=14)
gCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTa > 1:4954083/1‑151 (MQ=17)
gcGAGGTGAGCGACCCGGGGGAGTTGGGTTTCACGCGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTaaa < 2:4255863/150‑1 (MQ=11)
ccGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTaaa > 1:1999657/1‑151 (MQ=17)
ccGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGGCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTaaa < 1:4747900/151‑1 (MQ=17)
gAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATg > 1:2782916/1‑151 (MQ=18)
aGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATgg > 2:725086/1‑151 (MQ=18)
ggTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGa > 2:299984/1‑151 (MQ=18)
gTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAt < 1:3083774/151‑1 (MQ=21)
gAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAttt < 2:153860/151‑1 (MQ=25)
aGCAACCCACGGAAGTTGGGATTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTAGCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAtttt > 2:1407807/1‑151 (MQ=255)
aGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAtttt < 2:1960859/151‑1 (MQ=25)
aGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAtttt > 1:538669/1‑151 (MQ=25)
aGCAACCCAAGGAAGGTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGAtttt < 2:5113752/151‑1 (MQ=25)
gCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTc < 1:3906109/151‑1 (MQ=25)
cAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTcc > 2:2763921/1‑151 (MQ=18)
cAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTcc > 2:1992434/1‑151 (MQ=18)
cAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCACGCCGCTCTTCCACTCCCGCTGCCCCTCTTCGCTAAATGGCTTTTcc > 2:4405628/1‑151 (MQ=11)
aaCCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCt < 2:16968/151‑1 (MQ=25)
cccAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCttt > 2:3775943/1‑151 (MQ=25)
cccAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTAGGCTAAATGGATTTTCCttt > 1:165005/1‑151 (MQ=255)
aaGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTACATGGCTTTTCCcttccg > 2:3950162/1‑148 (MQ=11)
aaGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATg < 1:3207249/151‑1 (MQ=255)
aGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATgg < 1:4560793/151‑1 (MQ=255)
ggAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGc > 2:2786960/1‑151 (MQ=255)
gAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGcc < 2:1887909/151‑1 (MQ=255)
ttGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGtt < 2:260210/151‑1 (MQ=255)
tGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTc < 2:3342057/151‑1 (MQ=255)
tGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTc < 1:4642714/151‑1 (MQ=255)
tttCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTg < 2:4765704/151‑1 (MQ=255)
ttCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGa < 1:1804628/151‑1 (MQ=255)
cacaCGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGAtt > 2:2682770/1‑151 (MQ=255)
cacaCGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGAtn < 1:4762346/151‑2 (MQ=255)
acgcgcgCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTc < 2:5238413/148‑1 (MQ=255)
acacGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTc > 1:4132153/1‑151 (MQ=255)
acacGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTc > 2:2853849/1‑151 (MQ=255)
cacGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCg > 1:5030328/1‑151 (MQ=255)
acGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGCTTTTCCTTTATGCCCTGTCCGGTGATTCGa > 2:3342065/1‑151 (MQ=255)
cgcgCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGAt > 1:2960906/1‑151 (MQ=255)
gcAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAgc > 2:2621396/1‑151 (MQ=255)
cAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAgcg < 2:1743937/151‑1 (MQ=255)
cAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAgcg > 2:2778320/1‑151 (MQ=255)
ggtggtCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGcgcc > 2:1029929/1‑151 (MQ=255)
gtggtCAGCGCGCTAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGcgccg < 2:3907999/151‑1 (MQ=255)
ggtCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCgccgcc < 2:1287503/151‑1 (MQ=255)
gtCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCa < 1:636852/151‑1 (MQ=255)
gtCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCa < 2:1517286/151‑1 (MQ=255)
cAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGc > 2:712429/1‑151 (MQ=255)
aGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCa > 2:1005921/1‑151 (MQ=255)
cTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAc < 1:1330160/151‑1 (MQ=255)
cTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTGCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAc < 1:3942205/151‑1 (MQ=255)
cTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTGCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAc < 1:3942151/151‑1 (MQ=255)
cGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAccc < 1:2342436/151‑1 (MQ=255)
cGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAccc > 2:4975816/1‑151 (MQ=255)
gATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAcccc < 1:1174303/151‑1 (MQ=255)
gATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAAcccc > 1:844430/1‑151 (MQ=255)
tAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAg < 1:305537/151‑1 (MQ=255)
tAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAg > 1:4286651/1‑151 (MQ=255)
aGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGt < 1:2524727/151‑1 (MQ=255)
cGTGCGGCTCCCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCGCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTtc < 2:3135827/151‑1 (MQ=255)
cGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTtc > 1:2115594/1‑151 (MQ=255)
cGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTtc > 1:376551/1‑151 (MQ=255)
gTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTtct < 2:1710341/151‑1 (MQ=255)
gTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTtct > 1:3681768/1‑151 (MQ=255)
cGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCgg < 2:538669/151‑1 (MQ=255)
cGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCCATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCgg > 2:3589881/1‑151 (MQ=255)
ggCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGc > 2:3055550/1‑151 (MQ=255)
gCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCa < 2:1339803/151‑1 (MQ=255)
gCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCa < 2:4954032/151‑1 (MQ=255)
aCCCGAGGTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTc < 2:3213926/151‑1 (MQ=255)
aCCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTc < 2:1266475/151‑1 (MQ=255)
ccGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGc < 1:1326411/151‑1 (MQ=255)
cGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGcc < 1:5156307/151‑1 (MQ=255)
cGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGcc < 2:1196721/151‑1 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACTTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCt > 2:3081683/1‑151 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGTCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCt < 1:1879334/151‑1 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGctt > 1:2850614/1‑149 (MQ=255)
gagaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCt > 1:608928/1‑151 (MQ=255)
agaTGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTc > 1:1454328/1‑151 (MQ=255)
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AGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGT > SRR10918231.2617531/1‑151 (MQ=60)
AGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGT < SRR10918231.2536326/151‑1 (MQ=60)
ACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGC > SRR10918231.5097638/1‑151 (MQ=60)
ACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTT > SRR10918231.4985833/1‑151 (MQ=60)
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ATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCAC < SRR10918231.2892659/151‑1 (MQ=60)
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AACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGG < SRR10918231.2646445/151‑1 (MQ=60)
TGCGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCGCA < SRR10918231.88523/151‑1 (MQ=60)
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TGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGTGCCATGCCGCTCTTCAAATACCGCTGCACCTCTTGGCTAAATGGATTTTCCTTTATGGCCTGTTCGGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGTGCTTTCTCGGCATTCGCCTCACGCGCTGCCAGCAACACTTGCTGGCGCA > CP009974/4539910‑4540206
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
