Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,543,809 |
C→T |
A438A (GCG→GCA) |
RPPX_20290 ← |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,543,809 | 0 | C | T | 100.0%
| 204.9
/ NA
| 98 | A438A (GCG→GCA) | RPPX_20290 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (43/55); total (43/55) |
TTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGT > CP009974/4543661‑4543860
|
ttGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCtgc > 1:7168799/1‑151 (MQ=255)
gCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGt < 2:5981284/151‑1 (MQ=255)
gCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGt > 1:5412843/1‑151 (MQ=255)
cccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGTACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGtt < 2:5491151/151‑1 (MQ=11)
cccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGtt < 2:2852822/151‑1 (MQ=11)
ccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGttt > 1:3768570/1‑151 (MQ=255)
ccGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGtgt > 1:1140379/1‑149 (MQ=255)
cGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTa > 2:3925045/1‑151 (MQ=255)
cGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTa < 1:3545702/151‑1 (MQ=11)
cACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTaaa < 1:1564269/151‑1 (MQ=11)
cACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTaaa > 2:1350427/1‑151 (MQ=255)
aCGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAac > 2:1943127/1‑151 (MQ=255)
aCGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAac < 1:1217828/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAac < 1:2804356/151‑1 (MQ=11)
cGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAacc < 1:1758463/151‑1 (MQ=255)
gCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccc > 2:5198129/1‑150 (MQ=255)
tGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCTAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccacc < 1:4268888/151‑1 (MQ=11)
tGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccacc < 2:3554625/151‑1 (MQ=11)
tGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccacc < 2:2631699/151‑1 (MQ=11)
gACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccc > 2:5198662/1‑150 (MQ=11)
aCCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccac < 1:855764/151‑1 (MQ=11)
ccAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccacc < 2:2264227/151‑1 (MQ=11)
ccAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccacc < 2:1344824/151‑1 (MQ=11)
ccAAGGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccacc > 2:5985237/1‑151 (MQ=11)
cAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccacca < 2:1369940/151‑1 (MQ=11)
aaTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCGCCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccac < 2:4092021/151‑1 (MQ=11)
aaTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCCTCCCTGCGTTTAAaccaccaccac > 2:4145769/1‑151 (MQ=255)
aaTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccac < 2:4924872/151‑1 (MQ=11)
aTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccacc < 1:790121/151‑1 (MQ=255)
aTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccacc > 1:825808/1‑151 (MQ=11)
aTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccacc < 2:4494044/151‑1 (MQ=255)
aTGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAaccaccaccacc < 2:4494113/151‑1 (MQ=11)
tGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGTATTCTTTCGTTGATACCGCCACCACCg < 2:3659295/151‑1 (MQ=11)
tGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCg < 2:1574608/151‑1 (MQ=11)
tGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGCTTAAaccaccaccaccc > 2:4589915/1‑150 (MQ=11)
gTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGGACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGc < 2:5883965/151‑1 (MQ=11)
gTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGc > 1:1641032/1‑151 (MQ=255)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc < 1:3604543/151‑1 (MQ=255)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc < 2:4812672/151‑1 (MQ=11)
tCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGcc < 2:6514791/151‑1 (MQ=255)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg > 2:142586/1‑150 (MQ=255)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg < 2:1918648/151‑2 (MQ=11)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg > 2:3561682/1‑150 (MQ=255)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg > 2:3561732/1‑150 (MQ=255)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg < 2:5140870/151‑2 (MQ=11)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg < 2:5141059/151‑2 (MQ=11)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg > 1:1830805/1‑150 (MQ=11)
cgctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccg > 2:7168931/1‑150 (MQ=11)
gctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccgg > 1:5558990/1‑149 (MQ=11)
gctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGccgg > 1:4424133/1‑149 (MQ=255)
ctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGa < 2:6732785/151‑1 (MQ=11)
ctgccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGa < 2:825808/151‑1 (MQ=11)
gccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAgg > 1:7136291/1‑151 (MQ=11)
gccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAgg > 1:2935972/1‑151 (MQ=11)
gccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAgg > 1:3176239/1‑151 (MQ=11)
gccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCCTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTCAACCACAGCATCCCTGCTGTTAAACCACCACCcccgcccgccc > 2:6876058/1‑148 (MQ=11)
ccgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGt < 2:4259689/151‑1 (MQ=11)
cgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCTTTTAAACCACCACCACCGCCGGAtgtg > 1:3535940/1‑151 (MQ=11)
cgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTg > 2:5281516/1‑151 (MQ=11)
cgctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTg < 2:1037055/151‑1 (MQ=11)
gctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGa > 2:2008467/1‑151 (MQ=11)
gctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGa < 1:2144022/151‑1 (MQ=11)
gctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGa > 2:4760152/1‑151 (MQ=11)
gctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGa < 1:6025383/151‑1 (MQ=11)
cctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGa < 1:2155373/150‑1 (MQ=11)
ctgcGCCAATCACCCCGAGCACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAg < 2:162823/151‑1 (MQ=11)
ctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAg < 2:2940390/151‑1 (MQ=11)
ctgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAg < 1:2983987/151‑1 (MQ=11)
tgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAggcgcgc > 2:4991893/1‑146 (MQ=11)
tgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGc < 2:7008495/151‑1 (MQ=11)
tgcGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGc < 1:2795194/151‑1 (MQ=11)
gcgcCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCa > 1:3025397/1‑151 (MQ=11)
cgcCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGCGGTgcgcca > 2:4480950/1‑149 (MQ=11)
cAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTTTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTTCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAAccc > 1:2156531/1‑151 (MQ=11)
cAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAAccc < 2:5606110/151‑1 (MQ=11)
cAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAAccc < 1:1581805/151‑1 (MQ=11)
aaTCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCa > 1:6297041/1‑151 (MQ=11)
aTCACCCCGAACCCAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCaa < 1:4048149/151‑1 (MQ=11)
cACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCCACCCACgg > 2:6625083/1‑151 (MQ=11)
aCCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGa > 1:3705675/1‑151 (MQ=11)
aCCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGa > 1:4151851/1‑151 (MQ=11)
aCCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGa > 1:1031700/1‑151 (MQ=11)
ccccGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGaa < 2:5987872/151‑1 (MQ=11)
ccccGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGaa < 1:4835524/151‑1 (MQ=11)
cccGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAg > 1:1687326/1‑151 (MQ=11)
cccGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAGGCCGTGTTGAGCGATAAGATGTTGAACCACAGCATCCCTGCGTTTAAACCACCACCACCGCCGGAGGTGAGCAACCCAAGGAAg < 2:764206/151‑1 (MQ=11)
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TCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCT > SRR10918235.4328332/1‑151 (MQ=0)
CTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTA < SRR10918235.5875096/151‑1 (MQ=0)
GGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTAC < SRR10918235.6425155/151‑1 (MQ=0)
GCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACC < SRR10918235.1062053/151‑1 (MQ=0)
GCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACC > SRR10918235.4101052/1‑151 (MQ=0)
AGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCG < SRR10918235.661506/151‑1 (MQ=0)
TGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCG < SRR10918235.3591535/151‑1 (MQ=0)
TGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCG < SRR10918235.6015673/151‑1 (MQ=0)
GCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACG < SRR10918235.6103152/151‑1 (MQ=0)
CCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGC > SRR10918235.6134657/1‑151 (MQ=0)
CCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGC > SRR10918235.5029857/1‑151 (MQ=0)
CCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGC < SRR10918235.6786864/151‑1 (MQ=0)
CTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTC < SRR10918235.4657266/151‑1 (MQ=0)
GAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATC > SRR10918235.742446/1‑151 (MQ=0)
GCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTC < SRR10918235.2634423/151‑1 (MQ=0)
GCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTC > SRR10918235.1886391/1‑151 (MQ=0)
GATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTT > SRR10918235.6338587/1‑151 (MQ=0)
TGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTG < SRR10918235.6846014/151‑1 (MQ=0)
GAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCC > SRR10918235.2833049/1‑151 (MQ=0)
GAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCC > SRR10918235.5289790/1‑151 (MQ=0)
GAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCC < SRR10918235.4095333/151‑1 (MQ=0)
AACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCA > SRR10918235.34234/1‑151 (MQ=0)
ACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCAT > SRR10918235.1389916/1‑151 (MQ=0)
CACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCCTGC > SRR10918235.1815859/1‑151 (MQ=0)
CACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGC < SRR10918235.3912799/151‑1 (MQ=0)
ACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCC > SRR10918235.388854/1‑151 (MQ=0)
CAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGGCATGCCG > SRR10918235.1047224/1‑151 (MQ=0)
CAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCG < SRR10918235.1191960/151‑1 (MQ=0)
CAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCG < SRR10918235.4935886/151‑1 (MQ=0)
AGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGTGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGC > SRR10918235.1718311/1‑151 (MQ=0)
CATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGAGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTC < SRR10918235.1450210/151‑1 (MQ=0)
TCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTT > SRR10918235.2001218/1‑151 (MQ=0)
CCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTC < SRR10918235.3945031/151‑1 (MQ=0)
CGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGCGCCATGCCGCTCTTCAAA > SRR10918235.330022/1‑151 (MQ=0)
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CGTTGCCCGCACGCTGACCAATGTCGCTGCCGCTGCGCCAATCACCCCGAACACAGATGAAGCGAACCCCAGGGTGTATTCCGGTGCGTCGCTCTTCTGCAGGCTGTTGTAAGCCGTCTTGAGCGATAGGATGTTGAACCACAGCATCCCCGCGTTTAAACCACCACCACCGCCCGAGGTGAGCAACCCAAGGAAGTTGGGTTTCACACGCGCAGTGGTGGTCAGCTCGATAGACACCGTGCGGCTACCCGAGATGCGCAACGCTTTCATCTCTTCAACCTGTGCCATGCCGCTCTTCAAA > CP009974/4543659‑4543959
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |