Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 720 total aligned reads displayed.
CGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACA > CP009974/1898143‑1898440
|
GGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTT < SRR10918235.1603813/151‑1 (MQ=59)
GCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTT > SRR10918235.4609256/1‑151 (MQ=47)
GCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTT > SRR10918235.1425415/1‑151 (MQ=47)
CGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTG > SRR10918235.1388259/1‑151 (MQ=58)
GCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGA < SRR10918235.2153566/151‑1 (MQ=19)
CGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGAC < SRR10918235.2433554/151‑1 (MQ=60)
GCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACC > SRR10918235.5610041/1‑151 (MQ=49)
GCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACG > SRR10918235.2168018/1‑151 (MQ=23)
GCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACG < SRR10918235.6102437/151‑1 (MQ=60)
CTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGA > SRR10918235.1988736/1‑151 (MQ=60)
TGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGAT > SRR10918235.1410244/1‑151 (MQ=26)
TGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGAT < SRR10918235.4991104/151‑1 (MQ=60)
TGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGAT < SRR10918235.720738/151‑1 (MQ=60)
TGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGAT < SRR10918235.2088299/151‑1 (MQ=60)
GGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACcagg < SRR10918235.2989322/151‑5 (MQ=43)
GGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATG > SRR10918235.1751166/1‑151 (MQ=60)
GTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGT < SRR10918235.2863095/151‑1 (MQ=60)
TTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTC > SRR10918235.5934511/1‑151 (MQ=32)
TTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTC < SRR10918235.3817408/151‑1 (MQ=60)
TTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCG < SRR10918235.6630299/151‑1 (MQ=60)
TCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGC < SRR10918235.3121524/151‑1 (MQ=60)
TCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGC < SRR10918235.7053158/151‑1 (MQ=60)
CACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCC > SRR10918235.4095880/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCT > SRR10918235.6076342/1‑151 (MQ=40)
ACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCT < SRR10918235.6326398/151‑1 (MQ=60)
ACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCT > SRR10918235.7044524/1‑151 (MQ=60)
CCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTT < SRR10918235.3686517/151‑1 (MQ=60)
GGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCA > SRR10918235.3196748/1‑151 (MQ=60)
AGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCG > SRR10918235.4044083/1‑151 (MQ=46)
GCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGT > SRR10918235.4256656/1‑151 (MQ=60)
GCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGT < SRR10918235.5178506/151‑1 (MQ=60)
CCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTT > SRR10918235.1079278/1‑151 (MQ=29)
CTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG < SRR10918235.7178222/151‑1 (MQ=60)
CTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCCCCTTCGTTG > SRR10918235.6279794/1‑151 (MQ=60)
TTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGC < SRR10918235.3470212/151‑1 (MQ=60)
TTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGC > SRR10918235.3225532/1‑151 (MQ=60)
TTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGC < SRR10918235.3040675/151‑1 (MQ=60)
TGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCT > SRR10918235.6343942/1‑151 (MQ=31)
GATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCct > SRR10918235.4376599/1‑149 (MQ=60)
GATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCct < SRR10918235.3381796/151‑3 (MQ=60)
GATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCct > SRR10918235.6471662/1‑149 (MQ=60)
GATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTG > SRR10918235.4936958/1‑151 (MQ=33)
GATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGGCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTCCGTTGCTG > SRR10918235.5028173/1‑151 (MQ=31)
GATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCct > SRR10918235.5864943/1‑149 (MQ=45)
ATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctg > SRR10918235.5409296/1‑148 (MQ=60)
ATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctg > SRR10918235.902925/1‑148 (MQ=60)
ATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctg < SRR10918235.1644382/151‑4 (MQ=60)
ATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctg < SRR10918235.3303359/151‑4 (MQ=43)
ATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctg < SRR10918235.2940645/151‑4 (MQ=43)
TGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctgg > SRR10918235.4881419/1‑147 (MQ=60)
GGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggg > SRR10918235.5257036/1‑146 (MQ=60)
GGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggg < SRR10918235.4020694/151‑6 (MQ=60)
GGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggg > SRR10918235.1300795/1‑146 (MQ=60)
GTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctgggg > SRR10918235.4304397/1‑145 (MQ=58)
GTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctgggg > SRR10918235.2598661/1‑145 (MQ=58)
TGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggt < SRR10918235.4978651/151‑8 (MQ=35)
GACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtg < SRR10918235.1866858/151‑9 (MQ=57)
GACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtg < SRR10918235.1860742/151‑9 (MQ=57)
CTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgcca < SRR10918235.1353431/151‑12 (MQ=57)
CTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgcca < SRR10918235.455652/151‑12 (MQ=57)
CTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgcca < SRR10918235.3263569/151‑12 (MQ=57)
TGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccag > SRR10918235.4691791/1‑139 (MQ=57)
GGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggc < SRR10918235.2753117/151‑15 (MQ=55)
GGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggc > SRR10918235.5692862/1‑137 (MQ=55)
GGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTA < SRR10918235.6040011/151‑1 (MQ=58)
GCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggct < SRR10918235.5319646/151‑16 (MQ=53)
GCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggct < SRR10918235.3404568/151‑16 (MQ=53)
GCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACcaggtcgagatcggaagagcacacgtctgaac > SRR10918235.1237087/1‑119 (MQ=60)
GCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggct > SRR10918235.730080/1‑136 (MQ=40)
CGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggctc > SRR10918235.971150/1‑135 (MQ=51)
CGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggctc < SRR10918235.3314951/151‑17 (MQ=51)
CGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggctc > SRR10918235.3177460/1‑135 (MQ=51)
CGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCctggggtgccaggctc < SRR10918235.1201201/151‑17 (MQ=51)
GTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCG > SRR10918235.1906223/1‑151 (MQ=39)
ATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCG < SRR10918235.2282316/151‑1 (MQ=36)
TTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCCCGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTG < SRR10918235.3948664/151‑1 (MQ=60)
TGGTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTC < SRR10918235.6239903/151‑1 (MQ=34)
GTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCG > SRR10918235.4821301/1‑151 (MQ=32)
GTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCG > SRR10918235.2725714/1‑151 (MQ=32)
TTTCTCAGGGGCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGGTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGGCGTTCTCGGCTACCGATGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGG < SRR10918235.3760734/151‑1 (MQ=60)
TTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGG < SRR10918235.6698806/151‑1 (MQ=31)
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TCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggt < SRR10918235.6087770/151‑7 (MQ=36)
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CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact > SRR10918235.4708984/1‑138 (MQ=36)
CAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgact > SRR10918235.630214/1‑138 (MQ=36)
AGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactgg < SRR10918235.599326/151‑16 (MQ=37)
GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggg > SRR10918235.4012509/1‑135 (MQ=36)
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GTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTA < SRR10918235.1017383/151‑1 (MQ=60)
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ACGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGT < SRR10918235.6158207/151‑1 (MQ=60)
ACGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggtttt < SRR10918235.3643444/151‑39 (MQ=18)
CGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttc > SRR10918235.1147972/1‑112 (MQ=17)
CGTGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttc < SRR10918235.2209637/151‑40 (MQ=17)
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GTGCACAGTGAAGGCCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcg < SRR10918235.618386/151‑41 (MQ=13)
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TGCACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcga > SRR10918235.794589/1‑110 (MQ=13)
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GGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaacttc > SRR10918235.1271093/1‑105 (MQ=2)
AGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACTTTGACGATGTCGCCTTCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACctcggtgctgactggagtcttgtccaggttcaggttttcgaacttc < SRR10918235.5336850/151‑47 (MQ=2)
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TGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAG < SRR10918235.4487362/151‑1 (MQ=60)
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TCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCTGTAATTGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGTCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTC > SRR10918235.3476539/1‑151 (MQ=60)
TTGACGTTCGCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACT < SRR10918235.4068643/151‑1 (MQ=60)
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GGCCACCGAAGTCGGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCC < SRR10918235.6266936/151‑1 (MQ=60)
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CAGCAGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGC < SRR10918235.6956099/151‑1 (MQ=60)
AGTAATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATC < SRR10918235.5508646/151‑1 (MQ=60)
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AATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGAC < SRR10918235.1944385/151‑1 (MQ=60)
ATAGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACA > SRR10918235.210454/1‑151 (MQ=60)
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACA > SRR10918235.2655652/1‑151 (MQ=60)
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CGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCAGCAGTAATAGTGACCTTGACGATGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTACCTGGGGTGCCAGGCTCGTCGGTCACGGTAGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGGGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCGCCTTCAACGGTTGCGATCGACATCACA > CP009974/1898143‑1898440
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
