Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 400 total aligned reads displayed.
CGCCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCA > CP009974/3847410‑3847705
|
tgcgggtgttcactggcgtggcggccaacctcttcgggggtaccaacggtcctacacacatcggtcttgggcaaccatcggtggtcgggcacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCAC < SRR10918235.5463343/53‑1 (MQ=0)
CGCCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCAC < SRR10918235.5048667/151‑1 (MQ=60)
GGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCC > SRR10918235.1602701/1‑151 (MQ=60)
ATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCA < SRR10918235.1077056/151‑1 (MQ=60)
ATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCA < SRR10918235.1341858/151‑1 (MQ=60)
GACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACC < SRR10918235.2491511/151‑1 (MQ=60)
cttgcagccgacgtcgtattcgctggtcaaccctcacctgcactgattggtggtcgccacacatcggtggtcggacacagccgCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCatgcactgt < SRR10918235.143924/68‑10 (MQ=4)
CTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGA < SRR10918235.6046033/151‑1 (MQ=60)
gttgcgtcgcgcatgtattcgcgggtacacccgctcctacactgatttgtgatggtcacaaatcggtagttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTT < SRR10918235.5565080/68‑1 (MQ=0)
GCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGATGCC > SRR10918235.3439357/1‑151 (MQ=60)
CGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCC > SRR10918235.6338939/1‑151 (MQ=60)
GCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGC > SRR10918235.2342204/1‑151 (MQ=60)
GGGATCATTCGGTTGCTGGGGGGAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTGGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCC < SRR10918235.3161897/151‑1 (MQ=60)
GGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCG > SRR10918235.2824693/1‑151 (MQ=60)
GGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCG > SRR10918235.5456915/1‑151 (MQ=60)
cccaacgtactcgcgggtactcgcgctcctagacagatcggttgtgcacacacttcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCatgcactgttgctgccgc < SRR10918235.4214061/76‑19 (MQ=0)
GGTCACTAGGTTGGTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGTGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGC < SRR10918235.1003684/151‑1 (MQ=60)
ctgtattcgcggggaaacccgctcctacacagcttggtgatcgacacacattggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCACCCGCCatgcactgttgctgccgccacc < SRR10918235.4481325/80‑23 (MQ=0)
CTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCG > SRR10918235.5862771/1‑151 (MQ=60)
acggcgggaatccaggatggacgaaggttccgggatttccgaaggttgctcgtccgatctagctggcCCTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTA < SRR10918235.1270091/84‑1 (MQ=30)
GGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTAT < SRR10918235.1662779/151‑1 (MQ=60)
GTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATT > SRR10918235.2568493/1‑151 (MQ=60)
GTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATT > SRR10918235.5914711/1‑151 (MQ=60)
TGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCG > SRR10918235.2911693/1‑151 (MQ=60)
cgtaagccccgtaggtggccggatcgcgggtgtgcacacgtccgtgattcggcgcaggtggccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC < SRR10918235.4722594/87‑1 (MQ=21)
GCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC < SRR10918235.5546660/151‑1 (MQ=60)
GCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC > SRR10918235.746682/1‑151 (MQ=60)
TGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGG < SRR10918235.5664932/151‑1 (MQ=60)
GGGGGTAGAGGGTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTGGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGG < SRR10918235.5352582/151‑1 (MQ=60)
GGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGT < SRR10918235.2280462/151‑1 (MQ=60)
GGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGT < SRR10918235.1179704/151‑1 (MQ=60)
GGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCcgctgccgagatcggaagag > SRR10918235.3264715/1‑131 (MQ=60)
GGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTA < SRR10918235.6046739/151‑1 (MQ=60)
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TAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTACAC > SRR10918235.657933/1‑151 (MQ=60)
TAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAAC > SRR10918235.313011/1‑151 (MQ=60)
gatactacgccggatcgggggtggacacggggcggtgagcgggcgcaggcggtggcGTAGGTGCGGGTGTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACC < SRR10918235.3378500/95‑1 (MQ=4)
cgcgggtaggcccgggcgctcacagattggtggtgcacgcagagcggtggttggacacaggccgccgtgTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACC < SRR10918235.6505396/82‑1 (MQ=28)
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GGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGC < SRR10918235.5016183/151‑1 (MQ=60)
GGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATACCCGCGTAAACCCCC > SRR10918235.7276264/1‑151 (MQ=60)
tcctacacagattggtgatggacacacatcggtggttggacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCagccactcactattgctgccgccaacgtattcacggcacacgcctcac > SRR10918235.2056270/50‑103 (MQ=0)
tacgccggatcggggttggtctctggagggggagtgggcatacgccgtcgtcgagggtgacgggagtccggGAAAGGGCCGGCCCGGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTC < SRR10918235.1888102/80‑1 (MQ=8)
CAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > SRR10918235.945830/1‑151 (MQ=60)
acccgctcgtccaccgattggtggtggacactcatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918235.906549/94‑1 (MQ=26)
aagacggcatacgagataaccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatcTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918235.2030271/93‑1 (MQ=25)
aagaacgcatacgagataacggaaggtgactggagttccgacgtgtgctcttccgagcTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918235.1416077/93‑1 (MQ=25)
cgctcctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACC > SRR10918235.3456809/55‑151 (MQ=0)
CTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCC > SRR10918235.1198092/1‑151 (MQ=60)
gctcctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACacca > SRR10918235.5500042/54‑147 (MQ=0)
cgcggtggtggccgccggtcggtggttggtcacaggccgtcgTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCG < SRR10918235.2962111/109‑1 (MQ=0)
TTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacag < SRR10918235.1828237/151‑5 (MQ=60)
cgcctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccag < SRR10918235.1458394/99‑6 (MQ=7)
tcctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGA > SRR10918235.1375031/52‑151 (MQ=4)
ctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagatt > SRR10918235.5845243/50‑143 (MQ=10)
acggcatacgggataaccgaaggtgactggagttcagacgggtgctcttccgctCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGG < SRR10918235.1589710/97‑1 (MQ=13)
acacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattgg < SRR10918235.6720790/104‑11 (MQ=15)
acacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattgg > SRR10918235.5415710/48‑141 (MQ=15)
acacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattgg > SRR10918235.4774044/48‑141 (MQ=15)
ctggagttcagacgtgtgctcttccgatCTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAG < SRR10918235.267191/123‑1 (MQ=42)
acagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattggtg < SRR10918235.3034493/106‑13 (MQ=13)
agattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattggtggt < SRR10918235.4451677/108‑15 (MQ=7)
gagtggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccagattggtggtg < SRR10918235.2785892/109‑16 (MQ=3)
cgcaggtcggtgattgggtccaggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGG < SRR10918235.2427823/121‑1 (MQ=18)
GTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacagattggtggtgga < SRR10918235.6029357/151‑17 (MQ=30)
GTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGTTCGAGGA‑GGA > SRR10918235.2467505/1‑151 (MQ=45)
GTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGGAAACCCGCACCTACacagatttgtggggga > SRR10918235.1476346/1‑135 (MQ=38)
ccttccgatctgttggtcacaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATtggtggtgga < SRR10918235.1428258/122‑11 (MQ=0)
acaggtcggtgattgggcgcaggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGA > SRR10918235.6558565/30‑151 (MQ=10)
GCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacagattggtggtggacac < SRR10918235.2284643/151‑20 (MQ=18)
tggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACatcagaatggaggtggacaca > SRR10918235.1400324/37‑130 (MQ=25)
gtcggtgattgggcgcaggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACA > SRR10918235.2902978/26‑151 (MQ=0)
gtcggtgattgggcgcaggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACA > SRR10918235.5380870/26‑151 (MQ=0)
CTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacagattggtggtggacacag < SRR10918235.2201307/151‑22 (MQ=7)
tcggtgattgggcgcaggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAG > SRR10918235.1975109/25‑151 (MQ=0)
TGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaccgaatggtggatggcccagg > SRR10918235.6908846/1‑129 (MQ=32)
TGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacagattggtggtggacacagg < SRR10918235.6007264/151‑23 (MQ=3)
GAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTACTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcaccttcggttacctcgt > SRR10918235.6803034/1‑102 (MQ=60)
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ggtgtccacaagccgacgtgtaggggcgcttttgcccgcgaagcGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGT < SRR10918235.3108102/107‑1 (MQ=8)
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CCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG < SRR10918235.5099743/151‑1 (MQ=60)
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CGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGC > SRR10918235.7031016/1‑151 (MQ=60)
CGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG > SRR10918235.6678164/1‑151 (MQ=60)
GGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918235.3088882/1‑151 (MQ=48)
GGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918235.5825501/1‑151 (MQ=49)
GCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCGCAGGCCGTCGCGTAGGAGCGGctttcaccgccgggaggcc > SRR10918235.4786802/1‑132 (MQ=47)
GCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC < SRR10918235.2274937/151‑1 (MQ=58)
GCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918235.880417/1‑151 (MQ=60)
CCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCG > SRR10918235.6777085/1‑151 (MQ=56)
CCCTGCTGGCCAATTTGCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTGACCGCGCTCGTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCG < SRR10918235.76041/151‑1 (MQ=59)
CCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < SRR10918235.955156/151‑3 (MQ=54)
CCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATC < SRR10918235.4884471/151‑1 (MQ=55)
CTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCCCTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggc < SRR10918235.5292987/151‑4 (MQ=53)
CTGCGGGCCAAGTTCCTCCCGCCGTGCACCGTTGCCGCTGCTCCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCA < SRR10918235.4970946/151‑1 (MQ=60)
TGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggct > SRR10918235.5061949/1‑147 (MQ=60)
TACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGCCGGATCGGGGATGGACACAGGTCGGTGGtagggggcgggcagccgtgcaggagcggataaccccgctaaagtcccgacc > SRR10918235.3284733/1‑100 (MQ=0)
GCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACGCCGGAACGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGgggccggccc > SRR10918235.6198034/1‑141 (MQ=51)
GCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctc > SRR10918235.6488222/1‑146 (MQ=60)
CTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCGTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAAC < SRR10918235.5768722/151‑1 (MQ=60)
CTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAAC > SRR10918235.3779143/1‑151 (MQ=60)
CTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGAACGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCGCAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCaggctct > SRR10918235.2236327/1‑144 (MQ=60)
CTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTAGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctct < SRR10918235.4107789/151‑7 (MQ=60)
GCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgct > SRR10918235.4588868/1‑142 (MQ=60)
GCCAATCTACACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgct < SRR10918235.66069/151‑10 (MQ=60)
CAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGT < SRR10918235.2787579/151‑1 (MQ=60)
AATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctactggc < SRR10918235.2952259/151‑13 (MQ=55)
AATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCATACGCtggatagctgctgatcggaagtgctgacctcggcactcgagtcagtttcggtgatagtgtacccgctcttctgctcgcccacaaaga > SRR10918235.4465275/1‑64 (MQ=0)
ATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTTTTCGCGTGTAAACCCGCTCCTACGCCTCGTCGAGGCTGGACACGGGTCGGGGGC‑GGGCGCAGGCCCTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGC < SRR10918235.3616996/151‑1 (MQ=60)
ATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGC > SRR10918235.2938625/1‑151 (MQ=60)
ATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggcc < SRR10918235.1151855/151‑14 (MQ=60)
TTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGACGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctgctggcca > SRR10918235.6127652/1‑137 (MQ=20)
TTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCgctgggcggcgcgcacgtgcgggctcccgcccccataggctggcccgtctggcga > SRR10918235.5088424/1‑96 (MQ=38)
TTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctactggcca < SRR10918235.3675611/151‑15 (MQ=60)
TTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCggccctgctggccaa > SRR10918235.4307710/1‑136 (MQ=19)
CTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaa > SRR10918235.1205456/1‑136 (MQ=60)
CTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggccaa < SRR10918235.4696335/151‑16 (MQ=60)
|
CGCCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCA > CP009974/3847410‑3847705
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
