Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 573 total aligned reads displayed.
GACCCACA‑‑TCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCG > CP009974/3994571‑3994870
|
gatctagA‑‑TCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATTGGTGGT < SRR10918235.2737918/144‑1 (MQ=0)
gacacaggttgatgttttGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATTGGTGGT < SRR10918235.562195/133‑1 (MQ=0)
cacacaggtcggtggcggggcaCAGGCCGTCGTGGAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGT < SRR10918235.1735708/129‑1 (MQ=41)
cacaggtcggtggcggggcaCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTACTACGCCGGATCGGGGGTGG > SRR10918235.951237/21‑151 (MQ=32)
CACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGG < SRR10918235.204596/151‑1 (MQ=0)
acagggcggtgattggcaggtggccgtgcTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCGGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGA < SRR10918235.932244/122‑1 (MQ=37)
caggccggtggcggggcaCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGAC < SRR10918235.5034780/133‑1 (MQ=37)
gggCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATTGGTGGTGGACCC < SRR10918235.4735749/148‑1 (MQ=18)
gtcggtggcggggcaCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACA < SRR10918235.68499/136‑1 (MQ=43)
tggtggttgggcaaaggaCGTCGTGGAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGCGGCCGTCCCTGCGGGCCAATTTTCGCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGG < SRR10918235.5142082/133‑1 (MQ=17)
gtggtgggtcaCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTC < SRR10918235.7112907/140‑1 (MQ=15)
gggttggtcaCAGGCCGTCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCG < SRR10918235.5253152/141‑1 (MQ=6)
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ggggtaCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGA < SRR10918235.2199692/145‑1 (MQ=60)
GGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGA > SRR10918235.6094467/1‑151 (MQ=58)
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GCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGCGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCCGTGATTG > SRR10918235.4602949/1‑151 (MQ=56)
gacggggcgtgGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGG < SRR10918235.910598/140‑1 (MQ=9)
CGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGG > SRR10918235.4361227/1‑151 (MQ=60)
CACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGgcggg < SRR10918235.5954892/151‑6 (MQ=6)
ACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGgcgggg > SRR10918235.6945188/1‑145 (MQ=4)
cgtgtggtcttgcgatctCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGC < SRR10918235.400859/133‑1 (MQ=52)
CAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGC < SRR10918235.3285700/151‑1 (MQ=60)
gccagtggcgtaggatcgattgtccccgcgaagagccggagccggctggcccctaacctcccggcgttcaccacTGCCGCTGCTCCCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCCGATCCGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGC < SRR10918235.3498353/77‑1 (MQ=0)
actccTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCTCGGAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGC < SRR10918235.1238688/146‑1 (MQ=53)
GTCGTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCA < SRR10918235.1975148/151‑1 (MQ=20)
GGCGTCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCA < SRR10918235.1640690/151‑1 (MQ=37)
GCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCA > SRR10918235.274978/1‑151 (MQ=60)
gcgtgggttcaggGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAG < SRR10918235.770844/138‑1 (MQ=19)
CCGTCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAG < SRR10918235.2670529/151‑1 (MQ=20)
CCGTCGCGTACGAGCGGGCTTACCCGGGCAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAG < SRR10918235.5237478/151‑1 (MQ=24)
GTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGC < SRR10918235.4157308/151‑1 (MQ=28)
GTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGC < SRR10918235.3993663/151‑1 (MQ=60)
TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCC > SRR10918235.7019014/1‑151 (MQ=60)
TGTAGGAGAGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTCGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCAGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTC < SRR10918235.1462195/151‑1 (MQ=19)
GTAGGAGCGGGTTTACCCGGGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCG < SRR10918235.5163615/151‑1 (MQ=18)
TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGT < SRR10918235.5691701/151‑1 (MQ=18)
AGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTG < SRR10918235.2355078/151‑1 (MQ=18)
AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGgtggggtcagggccgccgag > SRR10918235.108785/1‑131 (MQ=48)
AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGGGGACACACGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGGCGTG > SRR10918235.3912790/1‑151 (MQ=9)
AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCTGCTACCGTATTCGCGGGTACACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACACGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGttgtg > SRR10918235.1905899/1‑146 (MQ=17)
AGGAGCGGGTTCACGCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCggta < SRR10918235.2556493/151‑5 (MQ=30)
GGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGT < SRR10918235.4970552/151‑1 (MQ=56)
gaaagggtttcgccgcgaagaggccgggccgacgggcgaattaccccgCGCCGTTCATTGTTGCCGCTGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTA < SRR10918235.1272877/103‑1 (MQ=10)
GAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTA > SRR10918235.290786/1‑151 (MQ=60)
GCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGAGACAGGTCGGggacggggctgaagcccaggtgcagt > SRR10918235.393591/1‑125 (MQ=0)
CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGC‑‑GGTAGGAGC > SRR10918235.4864942/1‑151 (MQ=39)
CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGA < SRR10918235.970744/151‑1 (MQ=27)
GGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACCCAGGTCGGGGATTGGGCGCCGGCCGACGTGTAGGAG > SRR10918235.3303605/1‑151 (MQ=13)
gggttccgacgGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGC‑‑GGTAGGAGCGG < SRR10918235.4802943/140‑1 (MQ=8)
GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACGCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGTAGC > SRR10918235.7052518/1‑151 (MQ=55)
GTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCG < SRR10918235.1953498/151‑1 (MQ=60)
TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCggtaggagcggcc < SRR10918235.4564081/151‑14 (MQ=27)
TTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGG < SRR10918235.2824779/151‑1 (MQ=60)
TTGACGCGCGAAGAGGTCGGCCCTGCTGGCCAGTGTCCACCCGCCGTCCCCTCCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGG < SRR10918235.614639/151‑1 (MQ=35)
TTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGG > SRR10918235.3546465/1‑151 (MQ=60)
TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG < SRR10918235.1482343/151‑1 (MQ=27)
TACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGAGGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGT > SRR10918235.3001728/1‑151 (MQ=60)
CCCGCGAAGAGGCCGGCCGTGCTGGGCAATTTCCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTT < SRR10918235.6223257/151‑1 (MQ=60)
CCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCggtaggagcggccttgt < SRR10918235.5271452/151‑18 (MQ=7)
CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACCCACGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAtcgggagtgccc > SRR10918235.2536067/1‑139 (MQ=16)
CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC > SRR10918235.5938240/1‑151 (MQ=36)
gaaggggccggacgttctggcttgtgacctccgGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG < SRR10918235.6660303/118‑1 (MQ=51)
GAAGAGGCCGGCCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG > SRR10918235.445498/1‑151 (MQ=60)
agGGCCGGCACTGCTGGCCAATTACCCCCCGCCATTCACCGTTGCCGCTGATACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGAAACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < SRR10918235.1790580/149‑1 (MQ=22)
GAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCtgtaggggcggccgtctgtgtcaca > SRR10918235.2322861/1‑126 (MQ=23)
ggggcgggcgggtTGGCCAATTTACACCCGCAGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACAAAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAG < SRR10918235.337495/138‑1 (MQ=34)
ggcgagcacaactcggcatacgagctcagcggaggtgtctggagtgcagacgtgtgctctcgcgtacgggtgatggggCGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAA < SRR10918235.4523835/73‑1 (MQ=60)
gtcgggcctactgccgaattcccgctcgccgtacgttactggcgctgagacgtgttttgcgccgatctccggttCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG < SRR10918235.244097/77‑1 (MQ=60)
CCGGCGCTGCGGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgag < SRR10918235.6705902/151‑4 (MQ=15)
CCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgag < SRR10918235.6291859/151‑4 (MQ=43)
CCGGCCCTGCTGGCCAATCACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAgag < SRR10918235.2778513/151‑4 (MQ=23)
gggccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC < SRR10918235.1157848/143‑1 (MQ=28)
ggccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGCGCGGGTTTATCCGCGAAGAGGCCG > SRR10918235.4068616/8‑151 (MQ=6)
GCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCTTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCGGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCC > SRR10918235.59059/1‑151 (MQ=53)
gccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGG > SRR10918235.3899554/7‑151 (MQ=31)
CCCTACTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCGCGGGCCGCCGTGTGGGAGCGGGTTGCCCCACGAAAGGGCCC > SRR10918235.1007598/1‑151 (MQ=22)
ccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGC < SRR10918235.4171515/146‑1 (MQ=33)
ccggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGC < SRR10918235.490433/146‑1 (MQ=33)
cggtTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCC < SRR10918235.2628334/147‑1 (MQ=34)
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TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACcgttgccgattggtggtgg < SRR10918235.4250683/151‑20 (MQ=23)
TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTA > SRR10918235.3138774/1‑151 (MQ=60)
CGCGGGTAAACCCGCTCTTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTAT < SRR10918235.4938120/151‑1 (MQ=0)
CGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTAT < SRR10918235.3750696/151‑1 (MQ=5)
CGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTC < SRR10918235.2509963/151‑1 (MQ=0)
CGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGTTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTC < SRR10918235.4692757/151‑1 (MQ=60)
CGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCTCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTC < SRR10918235.4277109/151‑1 (MQ=17)
GGGTAAACCCGCTCGTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCG < SRR10918235.2960478/151‑1 (MQ=5)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATGGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGTCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCG < SRR10918235.1221736/151‑1 (MQ=60)
GTAACCCCGCTCCTCCGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCG < SRR10918235.5419170/151‑1 (MQ=5)
TAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGG > SRR10918235.3240062/1‑151 (MQ=60)
AACCCCGCTCCTGCGCGGGATCGGTGGTGGACAGAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGG < SRR10918235.802021/151‑1 (MQ=0)
AACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATagatcgga > SRR10918235.7169539/1‑143 (MQ=19)
AACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGGTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGG > SRR10918235.276612/1‑151 (MQ=0)
ACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTA > SRR10918235.2470374/1‑151 (MQ=0)
ACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTA > SRR10918235.4651830/1‑151 (MQ=56)
ACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATGGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTA < SRR10918235.7090609/151‑1 (MQ=56)
ggtgattgggCGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcaccttcggttatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaataacgtatttgcgggtaa > SRR10918235.3047399/11‑56 (MQ=0)
CCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAA > SRR10918235.1545500/1‑151 (MQ=60)
CCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAA > SRR10918235.7072943/1‑151 (MQ=60)
CACGCTCCTACGCGGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAA < SRR10918235.6208965/151‑1 (MQ=49)
CCGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCtgctaccgaagtcgaggcgaaa > SRR10918235.6142602/1‑129 (MQ=32)
CGCTCCTACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAAC > SRR10918235.5064501/1‑151 (MQ=5)
GCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGGCACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCCTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACC < SRR10918235.2922921/151‑1 (MQ=16)
CTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918235.5877887/151‑1 (MQ=58)
CTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCCGGTAAACCC > SRR10918235.1511283/1‑151 (MQ=60)
CTCCTACGCCGGAGTGGTGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918235.5773973/151‑1 (MQ=14)
CTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACT > SRR10918235.2236506/1‑151 (MQ=2)
TACGCCGGATCGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTC > SRR10918235.5591102/1‑151 (MQ=32)
TACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTC > SRR10918235.5826041/1‑151 (MQ=34)
CGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > SRR10918235.5563557/1‑151 (MQ=26)
CGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACGGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGC > SRR10918235.3416682/1‑81 (MQ=0)
CGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAG > SRR10918235.6620961/1‑56 (MQ=0)
CGCCGGATCGAGGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGACGTGTAGGAGCGGGTTTTC > SRR10918235.210815/1‑65 (MQ=0)
CCGGATTGGTGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTAC < SRR10918235.5202513/151‑1 (MQ=2)
CCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918235.6537736/151‑1 (MQ=19)
CGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG > SRR10918235.4507253/1‑151 (MQ=22)
CGGAGCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATGGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG < SRR10918235.7258336/151‑1 (MQ=9)
GTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGGGCGGGTTGACCCGCCGACAGGCCGGCCCTCCCGGCCAGTCTCCACCCGCCCTTCACTCTTGATGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCgctcctacaccggatt > SRR10918235.1287294/1‑135 (MQ=1)
GGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCgctcctacgcctgatc > SRR10918235.2598836/1‑135 (MQ=1)
GGTGGACACACGTCGGTGATTGGGCGTAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCgctcctacaccggattgg < SRR10918235.6083456/151‑19 (MQ=0)
GTGGACCCACATCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCG < SRR10918235.6514211/151‑1 (MQ=14)
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GACCCACA‑‑TCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACTGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACTCTTACGCTGGATAGCG > CP009974/3994571‑3994870
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
