Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,756,936 |
T→C |
D390G (GAT→GGT) |
RPPX_16780 ← |
phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,756,936 | 0 | T | C | 99.3%
| 993.3
/ ‑2.9
| 279 | D390G (GAT→GGT) | RPPX_16780 | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (144/133); total (145/134) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
AATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGCACCTTGCGC > CP009974/3756788‑3757082
|
aaTCAGGAATGCCGACGCCAGCGACTGGGCGGCATTCATCCGCGGATCACGATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGGATCCTCGGGGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCg < 2:5828640/151‑1 (MQ=255)
aaTCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCg < 1:6174921/151‑1 (MQ=255)
aaTCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCg < 1:2110508/151‑1 (MQ=255)
tGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATgg < 2:6306257/151‑1 (MQ=255)
gCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGc > 2:544354/1‑151 (MQ=255)
gCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGc > 2:5352076/1‑151 (MQ=255)
ccAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCt < 2:1595185/151‑1 (MQ=255)
cAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTg > 1:4537268/1‑151 (MQ=255)
cAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTg > 1:4573978/1‑151 (MQ=255)
aaCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGc < 1:5063527/151‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGcc > 2:1418198/1‑151 (MQ=255)
aCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGcc > 1:723681/1‑151 (MQ=255)
cTCGAGCGACTGATCGGGATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGccc < 2:5907966/151‑1 (MQ=255)
cccAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCt < 2:885535/150‑1 (MQ=255)
gACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCt > 1:4745612/1‑151 (MQ=255)
cTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTgg > 1:5256315/1‑151 (MQ=255)
gATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtg < 2:2260180/151‑1 (MQ=255)
gATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtg > 2:5214579/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtgt > 2:2575273/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtgt > 2:1545379/1‑151 (MQ=255)
gCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACtt < 2:1012689/151‑1 (MQ=255)
aTTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCCTGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCCGGTGCACTTgg > 2:4670875/1‑151 (MQ=255)
tCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGgaa > 2:3549902/1‑151 (MQ=255)
cATCCGCGTATCATCATTGGTTTGATACCGGTCAGACAACGCATCCGCGGTGATCGGCCGGCCACCGCCGATGCATGCGGTGACGTTCCGCCCAGTCACCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGgaag < 2:729038/151‑1 (MQ=255)
cATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGgaag < 2:4903876/151‑1 (MQ=255)
aTCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGgaaga > 1:701062/1‑151 (MQ=255)
tCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGgaagaa < 2:1127781/151‑1 (MQ=255)
cgcgGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACt < 2:5588880/151‑1 (MQ=255)
gcgGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTg > 1:1887500/1‑151 (MQ=255)
ggATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACGTGGAAGACCTGCt > 2:6128266/1‑151 (MQ=255)
aTCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTc > 1:3752115/1‑151 (MQ=255)
tCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCa > 2:3156607/1‑151 (MQ=255)
acaATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGTGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCAcc < 1:179012/151‑1 (MQ=255)
caATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCt > 2:1782414/1‑151 (MQ=255)
caATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAACAACTGCTTCAccc > 2:3508558/1‑150 (MQ=255)
aTGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCa < 2:4745612/151‑1 (MQ=255)
gggTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATc > 1:1242482/1‑151 (MQ=255)
gtgtGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCa < 2:343716/151‑1 (MQ=255)
ggtgATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAg < 2:5122429/150‑1 (MQ=255)
tACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCt > 2:3774466/1‑151 (MQ=255)
tACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGCGATCGGCCGGGCACCGTCGATACATCCCGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATAGATACCGCCGACATGGCTGTCCTCCGGCTCGAGTACTTGGTGGAACTGCTTTACATATTCCAGAATCt > 2:4077215/1‑151 (MQ=255)
ccGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTgc > 1:1031965/1‑151 (MQ=255)
ggTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTgcgc < 1:2054652/151‑1 (MQ=255)
ggTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTgcgc < 1:4062206/151‑1 (MQ=255)
gTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCa > 2:3327836/1‑151 (MQ=255)
gTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCa > 1:5927586/1‑151 (MQ=255)
tCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCaa > 2:1921302/1‑151 (MQ=255)
aGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCaaaa > 1:3633709/1‑151 (MQ=255)
gACAACGCATCCTGGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAAt < 2:5699640/151‑1 (MQ=255)
aCAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATc < 1:2711537/151‑1 (MQ=255)
cATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGt > 2:2037621/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCtt > 2:6330579/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCtt > 1:3093838/1‑151 (MQ=255)
tCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGt > 1:1466647/1‑151 (MQ=255)
gggggtCGGCAGGGCACCGCAGATGCATTCGGTGACGTTCTGCGCAGTGATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATGGCGGGTCTGGTaa < 2:6037145/146‑1 (MQ=255)
gTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAAc > 1:6006807/1‑151 (MQ=255)
gacGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCgctgct < 1:6343151/149‑1 (MQ=255)
gCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCgctgct < 2:2100932/151‑1 (MQ=255)
ggCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGcc < 2:1241533/151‑1 (MQ=255)
cACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCtt > 1:3888277/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTg > 1:4233374/1‑151 (MQ=255)
ccgccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGa > 1:736997/1‑151 (MQ=255)
ccgccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGa > 1:2103366/1‑151 (MQ=255)
ccgccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGa < 1:6286800/151‑1 (MQ=255)
ccgccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGa < 2:642220/151‑1 (MQ=255)
cgccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGAt > 1:2415909/1‑151 (MQ=255)
ccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTtggtgg > 2:2839422/1‑151 (MQ=255)
cgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGgt > 1:1751625/1‑151 (MQ=255)
gATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGgtg < 2:6241046/151‑1 (MQ=255)
gATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGgtg < 2:4623989/151‑1 (MQ=255)
tGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGtt < 2:3752514/151‑1 (MQ=255)
ttCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCg < 2:249092/151‑1 (MQ=255)
tCGGTCACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGt < 2:4472872/151‑1 (MQ=255)
cGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTg < 2:3633709/151‑1 (MQ=255)
cGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTg > 2:4937244/1‑151 (MQ=255)
ggTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGc > 1:2647043/1‑151 (MQ=255)
gTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCa > 1:5356601/1‑151 (MQ=255)
cgTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCatccg > 1:4973944/2‑149 (MQ=255)
cgTTCTGCCCAGTCATCTCGAGATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCatcgg < 2:5082193/150‑1 (MQ=255)
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gTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCatcgga > 1:1957112/1‑151 (MQ=255)
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CACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTT > SRR10918232.2246042/1‑151 (MQ=60)
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ACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTG > SRR10918232.3608378/1‑151 (MQ=60)
ACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTG > SRR10918232.4251729/1‑151 (MQ=60)
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GCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagtt > SRR10918232.5448295/1‑88 (MQ=60)
CCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGG > SRR10918232.5520872/1‑151 (MQ=60)
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CGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGT < SRR10918232.4960514/151‑1 (MQ=60)
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GATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatg < SRR10918232.1857366/151‑67 (MQ=60)
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ATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcagg > SRR10918232.4174417/1‑84 (MQ=60)
ATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGT > SRR10918232.3935744/1‑151 (MQ=60)
CATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcaga < SRR10918232.375400/151‑71 (MQ=60)
CATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGC > SRR10918232.5384179/1‑151 (MQ=60)
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ttccgatctTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCA < SRR10918232.6366127/142‑1 (MQ=60)
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TTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGAT > SRR10918232.1667214/1‑151 (MQ=60)
TTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGAT > SRR10918232.5556714/1‑151 (MQ=60)
CTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagattgcgacttcagga < SRR10918232.4156102/151‑85 (MQ=60)
CTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgaggcagattgcgact > SRR10918232.6321389/1‑67 (MQ=60)
TGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGG > SRR10918232.3713695/1‑151 (MQ=60)
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CCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGCACCTTGCGCCCCT > SRR10918232.3577157/1‑151 (MQ=60)
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GCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGCACCTTGCGCCCCT > CP009974/3756786‑3757086
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
