Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,957,179 |
C→T |
D204D (GAC→GAT) |
RPPX_21945 → |
ATPase AAA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,957,179 | 0 | C | T | 100.0%
| 532.2
/ NA
| 232 | D204D (GAC→GAT) | RPPX_21945 | ATPase AAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (104/128); total (104/128) |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTCACCAGCCAGATGCCGGTGGACAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGACGCGATCCTCGACCGTCTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAA > CP009974/4957031‑4957326
|
tGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATaa < 1:6476437/151‑1 (MQ=255)
gggggCTAGGCGAAGACTGACGGGCTGAGCGTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAAt < 2:5228037/148‑1 (MQ=11)
gCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAAt > 2:2431633/1‑151 (MQ=255)
ccGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATg < 1:1409881/151‑1 (MQ=255)
ccGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATg < 1:4077588/151‑1 (MQ=255)
ggCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGc > 2:1793994/1‑151 (MQ=255)
tGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATgca < 2:5369872/151‑2 (MQ=255)
tGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATgca > 2:1066834/1‑150 (MQ=255)
gACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATc < 1:366141/151‑1 (MQ=255)
aCTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCg < 2:1285010/151‑1 (MQ=255)
aCTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCg < 1:3980387/151‑1 (MQ=255)
aCCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGa < 1:3099024/151‑1 (MQ=255)
ccTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGAt < 1:2584425/151‑1 (MQ=255)
ccTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGAt > 1:518424/1‑151 (MQ=255)
ctgctgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATc > 2:4135704/1‑151 (MQ=255)
gctgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCg > 1:5882283/1‑151 (MQ=255)
ctgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGa > 1:6009542/1‑151 (MQ=255)
tgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGAc < 2:2292160/151‑1 (MQ=255)
gATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGAcc < 1:830274/151‑1 (MQ=255)
tCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCtt > 1:1102969/1‑151 (MQ=255)
cTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTg < 1:322542/151‑1 (MQ=255)
cgacTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGat < 2:4753473/151‑2 (MQ=255)
ccTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGAtgc < 2:5969762/150‑1 (MQ=11)
acTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGatgc > 1:4426118/1‑148 (MQ=255)
tGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGa > 1:1589644/1‑151 (MQ=14)
gggCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCACCCGCTCGACAATGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATc < 1:4036318/151‑1 (MQ=11)
ggCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATcc > 1:6472955/1‑151 (MQ=255)
ccTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTc < 1:6253703/151‑1 (MQ=11)
ccTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTc < 2:3315320/151‑1 (MQ=11)
cTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCg < 2:875787/151‑1 (MQ=11)
tGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGa > 1:5611685/1‑151 (MQ=11)
cACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCg > 2:1669826/1‑151 (MQ=255)
cACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCg > 1:6381299/1‑151 (MQ=255)
gTTTACCGCAGCGCAGCGCCGCGACATGGTGGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttg < 2:4294561/151‑5 (MQ=11)
gTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttg > 2:5664740/1‑147 (MQ=11)
tttACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttgg < 2:922946/151‑6 (MQ=11)
tACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTg > 2:5016161/1‑151 (MQ=11)
cccGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGc < 2:5142039/150‑1 (MQ=11)
ccGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGca > 2:4650719/1‑151 (MQ=11)
gcagcaCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCTCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca < 1:6255764/151‑1 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca < 1:6203099/151‑1 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca < 2:3474249/151‑1 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaaa < 1:1695478/151‑3 (MQ=11)
aGCGGACCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc < 2:197949/151‑1 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc < 1:3646465/151‑1 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc < 1:4772547/151‑1 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc > 2:2985096/1‑151 (MQ=11)
gcgcAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACg < 1:2487384/151‑1 (MQ=11)
gcgcAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACg < 2:3346716/151‑1 (MQ=11)
gcgcAACGCCGCGACATGCGCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACg < 2:3612423/151‑1 (MQ=11)
cAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCtt < 1:3364085/151‑1 (MQ=11)
gCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCaa > 1:914315/1‑151 (MQ=11)
gCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCaa < 1:4324731/151‑1 (MQ=11)
tACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGc < 2:289806/151‑1 (MQ=11)
tACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGc > 1:3042343/1‑151 (MQ=11)
tACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGATGCACAACACTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGc > 1:4193305/1‑151 (MQ=11)
aCGGCACCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg < 2:1242325/151‑1 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg > 1:557149/1‑151 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg < 2:2742840/151‑1 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg > 1:1220745/1‑151 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg < 2:1242374/151‑1 (MQ=11)
gCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGc > 2:3141062/1‑151 (MQ=11)
cAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcg < 1:429652/151‑1 (MQ=11)
cAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcg < 1:1341652/151‑1 (MQ=11)
aaCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcga > 2:5523028/1‑151 (MQ=11)
aCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcgac < 1:2677428/151‑1 (MQ=11)
aCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcgac > 1:241417/1‑151 (MQ=11)
ccGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcgacg < 2:5613481/151‑1 (MQ=11)
cGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATCCGCAAGCGTGcgacga > 1:5437974/1‑151 (MQ=11)
gCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaa < 1:1178153/151‑1 (MQ=14)
cTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaaa < 1:2640279/151‑1 (MQ=14)
cTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaaa < 2:4495085/151‑1 (MQ=14)
cTCGACACTGGTGACCAGACAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaaa < 1:3155829/151‑1 (MQ=11)
tCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAAt < 2:5572763/151‑1 (MQ=14)
gACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTg < 2:1916024/151‑1 (MQ=11)
acacTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGa < 2:6452297/151‑1 (MQ=14)
cacTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAc < 1:4830775/151‑1 (MQ=14)
acTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcg > 1:5505060/1‑151 (MQ=14)
acTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcg < 2:2472107/151‑1 (MQ=11)
tGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcggc < 1:248364/151‑1 (MQ=14)
tGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcggc < 1:3839118/151‑1 (MQ=14)
ggTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcggcg > 1:4694164/1‑151 (MQ=11)
tgaCCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACggcggc > 1:3371996/3‑151 (MQ=14)
gaCCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCa < 2:3943162/150‑1 (MQ=14)
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CAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTT > SRR10918232.17112/1‑151 (MQ=6)
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CAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTT < SRR10918232.3378853/151‑1 (MQ=6)
CAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTT < SRR10918232.3270559/151‑1 (MQ=6)
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ACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTAT < SRR10918232.4307987/151‑1 (MQ=4)
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ATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAG > SRR10918232.5343613/1‑151 (MQ=47)
CCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACT < SRR10918232.6460314/151‑1 (MQ=47)
NGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTA > SRR10918232.1195872/1‑151 (MQ=47)
CGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTA < SRR10918232.1469126/151‑1 (MQ=47)
CGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTA > SRR10918232.5090122/1‑151 (MQ=47)
GGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAA < SRR10918232.6383723/151‑1 (MQ=47)
GGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAA < SRR10918232.6383890/151‑1 (MQ=47)
GGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAA < SRR10918232.5499860/151‑1 (MQ=47)
GGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAA > SRR10918232.2090597/1‑151 (MQ=47)
GGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAA < SRR10918232.2154456/151‑1 (MQ=47)
TGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACA < SRR10918232.1873063/151‑1 (MQ=47)
GATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAAT > SRR10918232.3410611/1‑151 (MQ=48)
TAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGC > SRR10918232.1454838/1‑151 (MQ=48)
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TGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTCACCAGCCAGATGCCGGTGGACAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGACGCGATCCTCGACCGTCTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGC > CP009974/4957031‑4957329
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
