Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 354 total aligned reads displayed.
GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATG > CP009974/1896343‑1896643
|
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CCTTGACCAGCTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCC < SRR10918232.6140997/151‑1 (MQ=60)
CTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCG < SRR10918232.2419181/151‑1 (MQ=60)
CTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCG > SRR10918232.5220662/1‑151 (MQ=60)
TTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGA < SRR10918232.6124019/151‑1 (MQ=22)
TTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGA < SRR10918232.1864340/151‑1 (MQ=60)
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TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGAC > SRR10918232.1738259/1‑151 (MQ=19)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC < SRR10918232.5348811/151‑1 (MQ=60)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC < SRR10918232.4373576/151‑1 (MQ=60)
TGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGAC > SRR10918232.3635565/1‑151 (MQ=60)
GACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACG > SRR10918232.5172178/1‑151 (MQ=16)
GACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACG > SRR10918232.2618487/1‑151 (MQ=16)
GACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACG < SRR10918232.4218290/151‑1 (MQ=16)
GACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACG < SRR10918232.2647370/151‑1 (MQ=16)
GACCAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACG < SRR10918232.1441269/151‑1 (MQ=60)
ACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGT < SRR10918232.1591070/151‑1 (MQ=13)
CCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTA > SRR10918232.3294772/1‑151 (MQ=7)
CAGGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAG > SRR10918232.4690009/1‑151 (MQ=60)
GGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC < SRR10918232.1478486/151‑1 (MQ=1)
GGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGAC < SRR10918232.795161/151‑1 (MQ=1)
GGTCGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGAC < SRR10918232.2556300/151‑1 (MQ=60)
GTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACG > SRR10918232.1571194/1‑151 (MQ=0)
TCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGT > SRR10918232.4854393/1‑151 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTT < SRR10918232.3302219/151‑1 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTT < SRR10918232.1851628/151‑1 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGCGTCAGCTGTTCGAACTTGCCAACGTCCGCACCTTCAACGGTAGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGCTACCGACGTAGACGTT > SRR10918232.732614/1‑151 (MQ=0)
CGCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTT < SRR10918232.2887885/151‑1 (MQ=60)
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GCCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTG < SRR10918232.3624810/151‑1 (MQ=60)
CCTTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGT < SRR10918232.2053423/151‑1 (MQ=60)
TTCGTTGCCAGGGATGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCC > SRR10918232.3233551/1‑151 (MQ=60)
cccggagttcccgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCG > SRR10918232.4903447/37‑151 (MQ=0)
cggagttcccgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGG < SRR10918232.4527703/117‑1 (MQ=1)
ggagttcccgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGG > SRR10918232.3752847/34‑151 (MQ=3)
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agttcccgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCA > SRR10918232.5076857/32‑151 (MQ=7)
gttcccgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAG < SRR10918232.3170394/121‑1 (MQ=9)
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cagggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGT > SRR10918232.4186417/9‑151 (MQ=60)
cagggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGT > SRR10918232.4267622/9‑151 (MQ=60)
agggatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTC > SRR10918232.5579736/8‑151 (MQ=60)
ccgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCAC > SRR10918232.3560561/27‑151 (MQ=20)
gatgCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCcgtcaca > SRR10918232.6159834/5‑144 (MQ=60)
cgtaccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACG < SRR10918232.5259428/126‑1 (MQ=22)
taccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGT < SRR10918232.2335361/128‑1 (MQ=26)
TGCCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGtcacagg > SRR10918232.5865782/1‑144 (MQ=60)
accgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTG < SRR10918232.2958281/129‑1 (MQ=27)
ccgggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGG > SRR10918232.394228/22‑151 (MQ=29)
CCCGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGG > SRR10918232.5722527/1‑151 (MQ=60)
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CGGCTCGTCGGTACCCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCA < SRR10918232.2397257/151‑1 (MQ=60)
ggttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAG > SRR10918232.4888706/19‑151 (MQ=35)
gttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGT < SRR10918232.3112083/134‑1 (MQ=37)
ttcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTG < SRR10918232.490000/135‑1 (MQ=39)
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tcgtcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGC > SRR10918232.353847/16‑151 (MQ=41)
CGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCC > SRR10918232.5645378/1‑151 (MQ=60)
GTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCG < SRR10918232.3376160/151‑1 (MQ=60)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.988575/139‑1 (MQ=46)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.1707548/139‑1 (MQ=46)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.1598457/139‑1 (MQ=46)
tcggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCA < SRR10918232.2670518/139‑1 (MQ=46)
TCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGagatcg > SRR10918232.4127244/1‑145 (MQ=60)
TCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCgg > SRR10918232.2640587/1‑149 (MQ=60)
cggtcacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCAC < SRR10918232.1314873/140‑1 (MQ=48)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGCGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTACACGTTGTCCGGCGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtg > SRR10918232.756742/1‑147 (MQ=60)
GGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggtt > SRR10918232.2503151/1‑147 (MQ=60)
ctggagttcagacgtgtgctcttccgatctTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTG < SRR10918232.3489198/121‑1 (MQ=60)
cacggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTG < SRR10918232.2465178/144‑1 (MQ=53)
acggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGGAGTCACGGTGGCGGTGCCCACGGTGC > SRR10918232.1296710/7‑151 (MQ=49)
cggcggtgcttcCCGGGGTGTTGTCCAGTGTCAGCTCCTCGAACTTGCCGACAGCCGTGCCTGCAACGGTTGCGATCGATTTGCGCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGGCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCC < SRR10918232.5207906/139‑1 (MQ=24)
cggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGCCGTAGACGTTGTCCGTGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCaaccgcgcc > SRR10918232.6388377/6‑142 (MQ=51)
cggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCC > SRR10918232.374487/6‑151 (MQ=53)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCA < SRR10918232.52443/147‑1 (MQ=53)
ggcgGTGCTTACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGCTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCA < SRR10918232.4577488/147‑1 (MQ=53)
CGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccg < SRR10918232.651079/151‑11 (MQ=60)
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ACCTTCAACGGTGGCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTG < SRR10918232.6186477/151‑1 (MQ=57)
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GTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcga < SRR10918232.3858182/151‑78 (MQ=52)
TTGCGATCCATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgat < SRR10918232.3773561/151‑79 (MQ=35)
GCGATCGATTTGATCACAGAGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCG < SRR10918232.670246/151‑1 (MQ=42)
GATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggc < SRR10918232.2417829/151‑83 (MQ=40)
GATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggc < SRR10918232.3599170/151‑83 (MQ=40)
GATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggc < SRR10918232.3360726/151‑83 (MQ=40)
ATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggca > SRR10918232.4877421/1‑68 (MQ=38)
ATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggca < SRR10918232.2824260/151‑84 (MQ=38)
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ATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACAGTGGCAGTGCCggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgatcggcaggcc > SRR10918232.2143491/1‑64 (MQ=28)
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AGGGTCGTTAGCGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACAGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTG < SRR10918232.2867464/151‑1 (MQ=0)
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GTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGG > SRR10918232.3193557/1‑151 (MQ=8)
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TTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCG < SRR10918232.1569295/151‑1 (MQ=6)
GTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGA > SRR10918232.4309171/1‑151 (MQ=0)
TACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGAT < SRR10918232.3138457/151‑1 (MQ=0)
ACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACG > SRR10918232.5478248/1‑151 (MQ=0)
ACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGACG > SRR10918232.3388590/1‑151 (MQ=0)
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GACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCAAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGCCACGGTGGCAGTGCCCACGGTGCCATTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAATGCACTGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATG > CP009974/1896343‑1896643
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
