Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATCGGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATGGTAAGACCTCGCTGCTCGACTACA > CP009974/3016833‑3017131
|
CATCGGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCG < SRR10918232.3161516/151‑1 (MQ=60)
CATCGGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCG > SRR10918232.38050/1‑151 (MQ=60)
ATCGGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGG > SRR10918232.4781133/1‑151 (MQ=60)
tgctcttccgatctacccTCTCCGAGCTCGCCCACCCGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAATTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGG < SRR10918232.2593985/133‑1 (MQ=60)
TCGGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGG > SRR10918232.3069812/1‑151 (MQ=60)
GGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCC < SRR10918232.2606768/151‑1 (MQ=60)
GGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCC < SRR10918232.3928284/151‑1 (MQ=60)
GCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCTAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCA > SRR10918232.4946944/1‑151 (MQ=60)
GCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCGAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCA > SRR10918232.4949462/1‑151 (MQ=60)
CGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCAC > SRR10918232.5035087/1‑151 (MQ=60)
AGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAA < SRR10918232.3165271/151‑1 (MQ=60)
CCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGT < SRR10918232.718941/151‑1 (MQ=60)
CATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTC < SRR10918232.3834418/151‑1 (MQ=60)
ATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCA < SRR10918232.436185/151‑1 (MQ=60)
ATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCA > SRR10918232.3436243/1‑151 (MQ=60)
TCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCAC > SRR10918232.3955786/1‑151 (MQ=60)
TCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCAC > SRR10918232.6492264/1‑151 (MQ=60)
TCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGT < SRR10918232.6225662/151‑1 (MQ=60)
gtgtgctcttccgatctAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTC < SRR10918232.328070/134‑1 (MQ=60)
TCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCA > SRR10918232.4316111/1‑151 (MQ=60)
TCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCA < SRR10918232.6464074/151‑1 (MQ=60)
TCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCA > SRR10918232.1938557/1‑151 (MQ=60)
CGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGC < SRR10918232.1011306/151‑1 (MQ=60)
CGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGC < SRR10918232.2866315/151‑1 (MQ=60)
CGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGC < SRR10918232.4012567/151‑1 (MQ=60)
CGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGC < SRR10918232.2538086/151‑1 (MQ=60)
GAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCG < SRR10918232.5286594/151‑1 (MQ=60)
GAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCG < SRR10918232.6477243/151‑1 (MQ=60)
GAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCG < SRR10918232.1540787/151‑1 (MQ=60)
AGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGA < SRR10918232.4226123/151‑1 (MQ=60)
GCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCG > SRR10918232.2910112/1‑151 (MQ=60)
CCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGC > SRR10918232.715290/1‑151 (MQ=60)
CCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGC > SRR10918232.1632931/1‑151 (MQ=60)
CCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGC < SRR10918232.2832317/151‑1 (MQ=60)
ACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCT < SRR10918232.2808245/151‑1 (MQ=60)
CAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGG < SRR10918232.3568227/151‑1 (MQ=60)
CAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGG > SRR10918232.3787960/1‑151 (MQ=60)
AGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGCCCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGA < SRR10918232.4662009/151‑1 (MQ=60)
ATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAG < SRR10918232.5050/151‑1 (MQ=60)
GTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGAC < SRR10918232.5898746/151‑1 (MQ=60)
TCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACT > SRR10918232.3885030/1‑151 (MQ=60)
TCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACT > SRR10918232.829162/1‑151 (MQ=60)
CCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACGATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTC < SRR10918232.3845564/151‑1 (MQ=60)
CCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTC > SRR10918232.2357589/1‑151 (MQ=60)
CCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTC > SRR10918232.4106649/1‑151 (MQ=60)
CCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTC > SRR10918232.6068348/1‑151 (MQ=60)
CCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTC < SRR10918232.6243288/151‑1 (MQ=60)
CGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCC > SRR10918232.3932999/1‑151 (MQ=60)
GTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCC < SRR10918232.3925032/151‑1 (MQ=60)
TCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCT < SRR10918232.2080574/151‑1 (MQ=60)
GCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCT < SRR10918232.6000809/151‑1 (MQ=60)
CAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTG < SRR10918232.318676/151‑1 (MQ=60)
CAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTG > SRR10918232.2192746/1‑151 (MQ=60)
GGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCGAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCC > SRR10918232.6567409/1‑151 (MQ=60)
GGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCC < SRR10918232.2987602/151‑1 (MQ=60)
GGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCG < SRR10918232.3452849/151‑1 (MQ=60)
GGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCG < SRR10918232.4175133/151‑1 (MQ=60)
GGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCG > SRR10918232.2950149/1‑151 (MQ=60)
GCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGA < SRR10918232.5286093/151‑1 (MQ=60)
GCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAAT > SRR10918232.2419646/1‑151 (MQ=60)
CTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATC < SRR10918232.711790/151‑1 (MQ=60)
TGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCG > SRR10918232.2894964/1‑151 (MQ=60)
TGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCG > SRR10918232.1463815/1‑151 (MQ=60)
GAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGC > SRR10918232.2701588/1‑151 (MQ=60)
TGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAA < SRR10918232.1945970/151‑1 (MQ=60)
GTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGT < SRR10918232.5588053/151‑1 (MQ=60)
CAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTC < SRR10918232.4767167/151‑1 (MQ=60)
CAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTC > SRR10918232.368275/1‑151 (MQ=60)
CAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTC < SRR10918232.5507348/151‑1 (MQ=60)
AAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCG > SRR10918232.809539/1‑151 (MQ=60)
GTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAA < SRR10918232.5023099/151‑1 (MQ=60)
GTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAA < SRR10918232.2795794/151‑1 (MQ=60)
GTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAA < SRR10918232.2794852/151‑1 (MQ=60)
TTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAG < SRR10918232.3712891/151‑1 (MQ=60)
GTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAG > SRR10918232.5263880/1‑151 (MQ=60)
CAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACC < SRR10918232.2337824/151‑1 (MQ=60)
CAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACC > SRR10918232.4036121/1‑151 (MQ=60)
CAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACC < SRR10918232.3986665/151‑1 (MQ=60)
AAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCG > SRR10918232.798689/1‑151 (MQ=60)
AAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCG < SRR10918232.6446629/151‑1 (MQ=60)
GATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAACCCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAG < SRR10918232.932765/151‑1 (MQ=60)
ATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGT > SRR10918232.2342162/1‑151 (MQ=60)
GGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCTCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCG > SRR10918232.5322530/1‑151 (MQ=60)
GGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCG > SRR10918232.5770712/1‑151 (MQ=60)
GGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCG > SRR10918232.3199745/1‑151 (MQ=60)
GGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGC > SRR10918232.5232843/1‑151 (MQ=60)
GACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGT < SRR10918232.5198379/151‑1 (MQ=60)
ACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTG < SRR10918232.1470876/151‑1 (MQ=60)
ACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTAGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTG < SRR10918232.2905429/151‑1 (MQ=60)
CCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGC > SRR10918232.1904260/1‑151 (MQ=60)
CCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGC < SRR10918232.33809/151‑1 (MQ=60)
CCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGC > SRR10918232.5719178/1‑151 (MQ=60)
CCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGAagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggaatgtcatctcgt > SRR10918232.697681/1‑102 (MQ=60)
CCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCG < SRR10918232.1872300/151‑1 (MQ=60)
CCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGACCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGC > SRR10918232.5962216/1‑151 (MQ=60)
CGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCC > SRR10918232.3297217/1‑151 (MQ=60)
CGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCC < SRR10918232.2262905/151‑1 (MQ=60)
CGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCC > SRR10918232.2067697/1‑151 (MQ=60)
CGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCC < SRR10918232.2896312/151‑1 (MQ=60)
CGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCC > SRR10918232.5048184/1‑151 (MQ=60)
GGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGATGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGCCACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCG > SRR10918232.2735986/1‑151 (MQ=60)
GGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCG < SRR10918232.1015484/151‑1 (MQ=60)
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TCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGT > SRR10918232.634265/1‑151 (MQ=60)
ACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGG > SRR10918232.6563334/1‑151 (MQ=60)
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CATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTT < SRR10918232.5434242/151‑1 (MQ=60)
ATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAACCCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTA < SRR10918232.2299523/151‑1 (MQ=60)
ATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTA > SRR10918232.274725/1‑151 (MQ=60)
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GATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACG > SRR10918232.3031094/1‑151 (MQ=60)
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GAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACC < SRR10918232.5226028/151‑1 (MQ=60)
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ACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATG < SRR10918232.2701673/151‑1 (MQ=60)
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AAGAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATGGTAAGACCTCGCTGCTCGA > SRR10918232.2999355/1‑151 (MQ=60)
GAGCCGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATGGTAAGACCTCGCTGCTCGACT < SRR10918232.4406401/151‑1 (MQ=60)
GCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATGGTAAGACCTCGCTGCTCGACTAC < SRR10918232.4193355/151‑1 (MQ=60)
CTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATGGTAAGACCTCGCTGCTCGACTACA > SRR10918232.3250551/1‑151 (MQ=60)
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CATCGGCGAGACCATCACCGTCTCCGAGCTGGCCAACCAGATGTCCGTCAAGGGCGCTGAAGTGGTCAAGTTCATGTTCAAGATGGGGACCCCGGTCACCATCAACCAGGTGCTCGATCAGGAAACCGCTCAGCTGATCGCCGAAGAGCTGGGCCACAAGGTCACGCTGGTCAGCGACACCGCCCTGGAAGACTCCCTGGCCGAATCGCTGAAGTTCGAAGGCCAGACCGAGTCGCGTGCGCCGGTGGTTACCGTCATGGGTCACGTTGACCATGGTAAGACCTCGCTGCTCGACTACA > CP009974/3016833‑3017131
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
