Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
2,551,216 |
(G)9→10 |
coding (167/1206 nt) |
RPPX_11370 → |
imidazolonepropionase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 2,551,207 | 1 | . | G | 88.5%
| 786.3
/ 102.3
| 243 | coding (158/1206 nt) | RPPX_11370 | imidazolonepropionase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (12/16); new base G (118/97); total (130/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.14e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
CCCTCTGGCAGCATTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGT > CP009974/2551057‑2551354
|
cccTCTGGCAGCATTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCt > 1:425163/1‑151 (MQ=255)
ctctGGCAGTATTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg > 1:3136263/1‑151 (MQ=255)
tctGGCAGCATTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg‑g < 2:4011485/151‑1 (MQ=255)
tGGCAGCATTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACAGCACGGTTGACCT‑‑gg‑gg‑g > 2:1331272/1‑151 (MQ=255)
gcaTTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGTCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGCGTGACCT‑‑cg‑gg‑gg‑gggg > 1:1729562/1‑150 (MQ=255)
aTTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg‑gg‑gg‑ggggct > 1:29027/1‑148 (MQ=255)
ttGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg‑gg‑gg‑ggggctg < 2:1656251/151‑5 (MQ=255)
ttGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCGGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg‑gg‑gg‑ggggctg < 1:4017815/151‑5 (MQ=255)
tGCCATGTTGCAACAAGGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg‑gg‑gg‑ggggctgg < 1:1342447/151‑6 (MQ=255)
tGCCAGGTTGCAACCGTGGCCGATGGCCGTTACGCGGCCATCGAGGACGCAGCGCTCGTCACCAGCGCGGGGTTGATCGAGTGGGTAGGCCCACGCGCGGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑gg‑gg‑gg‑ggggctgg < 2:5074474/151‑6 (MQ=255)
gCCGTGTTGCAACCATGGCCGAGGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑ggg < 2:3524721/151‑1 (MQ=255)
ccATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGt > 1:4855423/1‑151 (MQ=255)
cATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTc > 1:1482739/1‑151 (MQ=255)
aTGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑ggggcc > 2:2403092/1‑148 (MQ=255)
aTGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCa > 1:363906/1‑151 (MQ=255)
aTGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCa > 1:364171/1‑151 (MQ=255)
gtggCAACCATGGCCGGTGGCCGTTACGCGGCCAGCGAGGAGGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGGGTGGAGAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCAcc < 2:588556/148‑1 (MQ=255)
gTTGCAACCATAGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCAccc > 2:2525373/1‑151 (MQ=255)
tgggaaCCATGGCCGGTGGCCGTTCCTCGGCCATCGGGGGCGCGGCGCTCGTCCCCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCAccc < 2:1851764/147‑1 (MQ=255)
tGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCAcccc > 2:3298949/1‑151 (MQ=255)
gagaCCAGGGCCGGTGGCCGTTGCTCGGCCATGGAGGCCGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGGGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCAccccc < 2:875941/148‑1 (MQ=255)
gCAACCATGGCCGATGGCCGTTCCTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCg < 1:3375648/151‑1 (MQ=255)
aaCCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCgg > 2:383842/1‑151 (MQ=255)
ccATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGc > 1:2681866/1‑151 (MQ=255)
tggccgatggccgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGa > 2:3386300/1‑151 (MQ=255)
gccgatggccgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCg > 2:943625/1‑151 (MQ=255)
gatggccgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGAc > 2:1669199/1‑151 (MQ=255)
tggccgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTg > 1:1964761/1‑151 (MQ=255)
tggccgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGGGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGc < 2:1416939/151‑1 (MQ=255)
ggccgTTGCCCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCCCCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGGGCCGGGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGc < 2:1492377/151‑1 (MQ=255)
gccgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGAGCGACTGcc > 2:4463645/1‑151 (MQ=255)
gccgTTACTCGCCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGcc < 1:859531/151‑1 (MQ=255)
cgTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGGCTGcccc > 2:51511/1‑149 (MQ=255)
tACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACAccc > 1:3083749/1‑151 (MQ=255)
aCTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACAccc < 2:363906/151‑1 (MQ=255)
aCTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCGGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCCCCCCCGGCCTGCTCGACCGCTACcccc > 2:1033582/1‑151 (MQ=255)
cGGCCATGGAGGACGCGGCGAGCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGGGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATg < 2:3939643/151‑1 (MQ=255)
cATCGAGGCCGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGgt < 1:2530004/151‑1 (MQ=255)
aTCGAGGCCGCGGCGATCGTCCCCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTAGACGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGgtg < 1:212044/151‑1 (MQ=255)
cgcgGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTgg > 1:3299311/1‑151 (MQ=255)
cgcgGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTAACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTgg < 1:2219128/151‑1 (MQ=255)
gcggcgATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTGGGG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGGGTTGGGTgg > 1:2442147/1‑151 (MQ=255)
cggcgATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTGGGG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACCCCCATGCGGTGTTCGGTGGc > 2:2314627/1‑151 (MQ=255)
ggcgATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCac > 1:4320957/1‑150 (MQ=255)
cgATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAAcc < 1:1038518/151‑1 (MQ=255)
gcggcACCGGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCa < 2:2698394/147‑1 (MQ=255)
gTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAgc > 1:5048306/1‑151 (MQ=255)
gTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAgc > 1:774793/1‑151 (MQ=255)
gTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGGGTTCGGTGGCAACCGCAgc > 2:2183104/1‑151 (MQ=255)
tcgccAGCGCCGGGGTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGGGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAgcg < 2:3239029/148‑1 (MQ=255)
tCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAgcg < 1:944885/151‑1 (MQ=255)
cggcgcCGGGTTGATCGGGTGGATAGGCCCCCGCGCCGAGCGGGCGCCGGTCGAAGCGGACCGCACGGTTGGCCGG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGa < 2:192425/149‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCGGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGa < 1:1145457/151‑1 (MQ=255)
aGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTGCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAg > 2:688883/1‑151 (MQ=255)
gcCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTc < 1:3439681/151‑1 (MQ=255)
cGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGa > 2:2711718/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGagc > 1:885850/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGagc < 2:1819275/151‑1 (MQ=255)
gTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGCCCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGGGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGCCCGagca > 2:2209273/1‑151 (MQ=255)
tGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGagcagc > 1:3028071/1‑151 (MQ=255)
tGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGagcagc > 2:3723431/1‑151 (MQ=255)
tGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGagcagc < 1:3741736/151‑1 (MQ=255)
aTCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAgcgc < 1:15756/151‑1 (MQ=255)
cGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCCTGGTTGACCT‑‑GG‑GGTGG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCt < 2:5020681/151‑1 (MQ=255)
aGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGc > 2:632775/1‑151 (MQ=255)
tGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAg > 1:1813788/1‑151 (MQ=255)
tGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAg < 1:1994042/151‑1 (MQ=255)
cccACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAg > 1:1284120/1‑151 (MQ=255)
cccACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAg > 2:1088103/1‑151 (MQ=255)
cccACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGc > 1:4493094/1‑151 (MQ=255)
ccACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTGGGG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAg > 2:1555762/1‑151 (MQ=255)
cACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCt < 1:2599463/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTa < 1:2826631/151‑1 (MQ=255)
gcggcgCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGAACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGcc < 2:1315256/146‑1 (MQ=255)
ccGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCg > 2:2248155/1‑151 (MQ=255)
cgggcgggCGCCGGTCGAAGCGGACCGCAGGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGa < 2:205569/145‑1 (MQ=255)
cGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGa > 2:2940127/1‑151 (MQ=255)
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cgcCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCTG‑GG‑GG‑GG‑GGGCT‑GGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATcgccg > 1:547753/1‑151 (MQ=255)
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TGACCTG‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGCGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGCCGGTGGTATCGCGAGTAC > SRR10918231.3530781/1‑151 (MQ=60)
TGACCTG‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTAC < SRR10918231.1045231/151‑1 (MQ=60)
TGACCTG‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTAC > SRR10918231.3530539/1‑151 (MQ=60)
TGACCTG‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTAC > SRR10918231.3026059/1‑151 (MQ=60)
GACCTG‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACC > SRR10918231.1111089/1‑151 (MQ=60)
ncctgGG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCG > SRR10918231.3883679/6‑151 (MQ=60)
G‑‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGGGTACCGTGCG > SRR10918231.3259018/1‑151 (MQ=60)
GGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGTGCGGGCGAC > SRR10918231.2507149/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGTGCGGGCTACC > SRR10918231.562805/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGTGCGGGCTACC < SRR10918231.4818069/151‑1 (MQ=60)
GGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGTGCGGGCTACCC < SRR10918231.3602995/151‑1 (MQ=60)
GGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGTGCGGGCTACCC > SRR10918231.123713/1‑151 (MQ=60)
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GCATTGCCATGTTGCAACCATGGCCGATGGCCGTTACTCGGCCATCGAGGACGCGGCGATCGTCACCAGCGCCGGGTTGATCGAGTGGATAGGCCCACGCGCCGAGCTGGCGCCGGTCGAAGCTGACCGCACGGTTGACCT‑‑GG‑GGGGGGGCTGGGTCACCCCCGGGCTGATCGACTGCCACACCCATGCGGTGTTCGGTGGCAACCGCAGCGGCGAGTTCGAGCAGCGCCTGCAGGGCGTGAGCTATGCCGAAATCGCCGCGCAGGGCGGTGGTATCGCGAGTACCGTGCGGGCTACCC > CP009974/2551067‑2551365
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |