Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,433,484 |
A→G |
Y386H (TAC→CAC) |
RPPX_15320 ← |
glycerol‑3‑phosphate acyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,433,484 | 0 | A | G | 99.6%
| 908.2
/ ‑5.0
| 253 | Y386H (TAC→CAC) | RPPX_15320 | glycerol‑3‑phosphate acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (110/142); total (111/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TCGAGCACGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTACTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATG > CP009974/3433336‑3433632
|
tCGAGCACGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCt < 1:1210549/151‑1 (MQ=255)
gAGCACGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCg > 1:4575334/1‑151 (MQ=255)
gCACGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGAc > 2:2987837/1‑151 (MQ=255)
aCGGGCTCGGAGCCGATGGACACCGGCACGAACACGATCGGCGGACGCGGCGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTGATGGCCAGCATCCCGGGGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGGACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCg < 2:3416818/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCg > 1:3798076/1‑151 (MQ=255)
aCGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCg < 1:3623980/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCgg < 1:1104119/151‑1 (MQ=255)
gcTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGaa > 1:2510058/1‑151 (MQ=255)
aGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCtt < 1:514882/151‑1 (MQ=255)
ccGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCCTCCCGGTGCGCGGCTGAAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTgg < 2:1498936/151‑1 (MQ=255)
ttGTACAGCGGAACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGgtgt < 2:1058362/150‑1 (MQ=255)
aTGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGgtgt > 1:2214554/1‑151 (MQ=255)
aTGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGgtgt > 2:2013313/1‑151 (MQ=255)
tACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACa > 1:1970197/1‑151 (MQ=255)
tACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACa < 1:1044853/151‑1 (MQ=255)
acacCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAg > 1:1870494/1‑151 (MQ=255)
acCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAggg < 1:3574944/151‑1 (MQ=255)
ccGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGGCGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGgt < 2:2576454/151‑1 (MQ=255)
cACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGc > 1:3475702/1‑151 (MQ=255)
cACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGc < 2:3475702/151‑1 (MQ=255)
cGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAg < 2:3798076/151‑1 (MQ=255)
cGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAg > 1:847428/1‑151 (MQ=255)
gAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAgg > 1:3923181/1‑151 (MQ=255)
gAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAgg > 2:1661237/1‑151 (MQ=255)
aaCACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGt < 1:1460930/151‑1 (MQ=255)
gATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCg > 1:1811288/1‑151 (MQ=255)
gATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCg < 2:5180843/151‑1 (MQ=255)
ttGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGtt < 1:2619591/151‑1 (MQ=255)
gTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAaca < 2:585045/151‑1 (MQ=255)
tACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAacac < 1:5237931/151‑1 (MQ=255)
tACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAacac > 2:421389/1‑151 (MQ=255)
aCGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACt < 1:2108582/151‑1 (MQ=255)
aCGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACt < 1:3739443/151‑1 (MQ=255)
gcgACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGc > 2:681122/1‑151 (MQ=255)
gacgaGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCg < 2:1227839/151‑1 (MQ=255)
acgaGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCgt < 2:260384/151‑1 (MQ=255)
gaGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCgtgt < 2:1225330/151‑1 (MQ=255)
gaGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCgtgt > 2:2288632/1‑151 (MQ=255)
gaGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCgtgt > 2:2788667/1‑151 (MQ=255)
ggcgcAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTa < 2:3937949/150‑1 (MQ=255)
aGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCAGTGTAAAGCg > 2:5145252/1‑151 (MQ=255)
aaGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGt > 1:1612908/1‑151 (MQ=255)
aGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGtt < 2:3555454/151‑1 (MQ=255)
cgcAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCt < 2:3659533/151‑1 (MQ=255)
cgcAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCt < 1:2954940/151‑1 (MQ=255)
gcAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGCAGCCCTTGGTGTACAGGCTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTCCCGCGCAAAGCGCGCTGCCCtt > 2:4187437/1‑151 (MQ=255)
gcAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCtt > 2:4534517/1‑151 (MQ=255)
gcAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCtt < 1:797180/151‑1 (MQ=255)
aGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAgg > 1:3650985/1‑111 (MQ=255)
gggTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGaa > 1:1462383/1‑151 (MQ=255)
gggTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGaa > 1:658852/1‑151 (MQ=255)
gTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACg < 2:110447/151‑1 (MQ=255)
aaTGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTg > 1:721668/1‑151 (MQ=255)
gCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTgcggc < 1:4394717/151‑1 (MQ=255)
ccAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTgcggcg > 2:1854076/1‑151 (MQ=255)
aGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGTCGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCGTTGAACGTGGCGCGCa > 2:1447055/1‑151 (MQ=255)
aGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCa < 2:3069142/151‑1 (MQ=255)
aGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCa > 1:418986/1‑151 (MQ=255)
gCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGGCGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCAt < 2:2378624/151‑1 (MQ=255)
gCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCAt < 1:2720694/151‑1 (MQ=255)
gCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCAt < 1:4110558/151‑1 (MQ=255)
aTCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATga < 1:2635391/151‑1 (MQ=255)
aTCCAGGTGCGAGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGGGCGGCCGCCTTCGGCAAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATga < 1:2484924/151‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATgaagaa > 1:4501767/1‑151 (MQ=255)
ggTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGaagaag < 1:2046627/151‑1 (MQ=255)
ggTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGaagaag < 2:1811288/151‑1 (MQ=255)
gcgcGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGgcg < 1:3389064/151‑1 (MQ=255)
cgcgGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGgcgc > 2:1744547/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGccac > 1:3254907/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGccac > 2:374819/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTCTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGACGGCGccac > 2:5060486/1‑151 (MQ=255)
gCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGccacc > 1:5203467/1‑151 (MQ=255)
gCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGccacc < 1:2184102/151‑1 (MQ=255)
aaCATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGc < 1:1501985/151‑1 (MQ=255)
aCATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCg < 1:3503575/151‑1 (MQ=255)
aCATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCg > 1:3958402/1‑151 (MQ=255)
tGCGCCCAGTACGCGAGCGGGCGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAg < 2:4428450/151‑1 (MQ=255)
cgcgcCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGAGGACGTGCTCGAACGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAg < 2:3701667/150‑1 (MQ=255)
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CGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCAT > SRR10918231.4636736/1‑151 (MQ=60)
CGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCAT < SRR10918231.4108286/151‑1 (MQ=60)
CGCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCAT < SRR10918231.5193231/151‑1 (MQ=60)
GCCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATG < SRR10918231.340943/151‑1 (MQ=60)
CCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGT > SRR10918231.5092879/1‑151 (MQ=60)
CCTTCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGT > SRR10918231.4169378/1‑151 (MQ=60)
TCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGA < SRR10918231.557470/151‑1 (MQ=60)
TCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGA < SRR10918231.2686055/151‑1 (MQ=60)
TCGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGA < SRR10918231.2729874/151‑1 (MQ=60)
CGACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAG > SRR10918231.1903520/1‑151 (MQ=60)
GACGAAGTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGG < SRR10918231.478023/151‑1 (MQ=60)
GTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATG < SRR10918231.3372466/151‑1 (MQ=60)
GTGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATG > SRR10918231.4416493/1‑151 (MQ=60)
GTACTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATG > SRR10918231.4942689/1‑151 (MQ=60)
TGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATGC < SRR10918231.2363852/151‑1 (MQ=60)
TGCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATGC < SRR10918231.2363757/151‑1 (MQ=60)
GCTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATGCC < SRR10918231.4286405/151‑1 (MQ=60)
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CTTCGAGCACGCGCTCGTAGCCGATGTACACCGGCACGAACACGATTGGCGTACGCGACGAGCGCAGGAAGCTGCGCAGGGTAATGGCCAGCATCCCGGTGCGCGGCTGCAACATGCGCCCAGTACGCGAGCGGCCGCCTTCGACGAAGTACTCGACCGGGAAGCCCTTGGTGTACAGGGTGTGCAGGTACTCGTTGAACACTGCCGTGTAAAGCGGGTTGCCCTTGAACGTGCGGCGCATGAAGAAGGCGCCACCACGGCGTAGCAGGTTACCGACCACCGGCATGTTGAGGTTGATGCC > CP009974/3433334‑3433634
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |