Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,676,114 |
A→G |
Y726C (TAC→TGC) |
RPPX_16405 → |
beta‑ketoacyl synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,676,114 | 0 | A | G | 90.5%
| 700.8
/ 43.5
| 244 | Y726C (TAC→TGC) | RPPX_16405 | beta‑ketoacyl synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (10/13); new base G (96/124); total (107/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CCGAACTGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTGTCGTCGGTGGCCAGTTGAACGGCGAACGGCTGGACAGCCAGTACT > CP009974/3675967‑3676260
|
cGAACTGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGcc < 1:2215300/151‑1 (MQ=255)
cGAACTGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTCCGcc > 2:4443153/1‑151 (MQ=255)
gAACTGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGAACTGGACTACGCCt > 1:5032622/1‑151 (MQ=255)
aaCTGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCtt > 2:2237382/1‑151 (MQ=255)
tGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCa < 2:1455545/151‑1 (MQ=255)
aaaCTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGCAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACt > 1:770588/1‑151 (MQ=255)
aaaCTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCAcc > 1:4078816/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACt < 2:2359032/151‑1 (MQ=255)
aaCTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTc > 2:744712/1‑151 (MQ=255)
tGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGcc > 1:2715612/1‑151 (MQ=255)
ggATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCg < 1:3286433/151‑1 (MQ=255)
gtGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGc < 2:4760862/150‑1 (MQ=255)
aTGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGGCGCCTGGCCCGGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGc > 2:4964981/1‑151 (MQ=255)
aTGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGc < 1:2376170/151‑1 (MQ=255)
tGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGcc > 1:551045/1‑151 (MQ=255)
tGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGcc > 1:1239660/1‑151 (MQ=255)
ggCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCa < 2:4386240/151‑1 (MQ=255)
gccgccTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCAt < 2:1850338/151‑1 (MQ=255)
ccgccTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATg < 1:3895616/151‑1 (MQ=255)
gccTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGa > 2:1259767/1‑151 (MQ=255)
cTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGAcc > 1:5118853/1‑151 (MQ=255)
tggtggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCTGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCAGGACTACGGCTTCCACTCGCCGGCCATGGAccc > 2:5143881/1‑151 (MQ=255)
tggtggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGAccc < 1:4723601/151‑1 (MQ=255)
tggtggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGAccc > 1:3389394/1‑151 (MQ=255)
tggtggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACACCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGAccc > 2:5042875/1‑151 (MQ=255)
ggtggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCg > 2:2036771/1‑151 (MQ=255)
gtggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGa > 2:4277152/1‑151 (MQ=255)
ggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATc < 2:2215645/151‑1 (MQ=255)
ggtggCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATc > 1:1623397/1‑151 (MQ=255)
cgggcgAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATcaagca < 2:4638556/151‑1 (MQ=255)
ggcgAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATcaagcaag < 1:3099013/151‑1 (MQ=255)
gcgAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCaagcaagc < 1:3206821/151‑1 (MQ=255)
gcgAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCaagcaagc < 1:4851906/151‑1 (MQ=255)
cgAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCg < 1:2773352/151‑1 (MQ=255)
cgAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCg < 2:2463057/151‑1 (MQ=255)
gagaACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCgg < 2:4125981/151‑1 (MQ=255)
gaACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGGCGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTAGTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGtt < 2:2346896/151‑1 (MQ=255)
gaACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTTGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGtt < 1:3613856/151‑1 (MQ=255)
cAGTGCCCGCGGCGCNACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCNGGTATNCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCGTCCACTCGCCGGCCATTGACCCGATCAAGCAAGGGGTGATc > 2:3215337/1‑151 (MQ=255)
aGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCCAGCATGCGGTTAtag > 1:1531473/1‑149 (MQ=255)
aGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATcg < 2:3552273/151‑1 (MQ=255)
aGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATcg > 2:2124143/1‑151 (MQ=255)
tGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATcgac > 2:2613514/1‑151 (MQ=255)
ccGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCgacgac < 1:4456630/151‑1 (MQ=255)
ccGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCgacgac < 1:189776/151‑1 (MQ=255)
ggcgCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTcg < 1:4848283/151‑1 (MQ=255)
cgcCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTcgcg > 2:2443895/1‑151 (MQ=255)
tGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCGGGTATGGGCCCACCGCCGGGCCCTGGGCTGGCCGTTCCACTCGCCAGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCTCCTATc > 2:3421947/1‑151 (MQ=255)
gTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATcc > 1:3541652/1‑151 (MQ=255)
gTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATcc < 1:3002466/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATccg < 2:2969089/151‑1 (MQ=255)
cGCCGGGGAGGGTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAAAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGAACCTACACTGCGCCTTCCACGCGCCGGCAATGGACCCTATCAAGCAAGCGGGTATCGACGACCTCGCGCATATccgc > 2:1592650/1‑151 (MQ=255)
gCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATccgcc < 1:756751/151‑1 (MQ=255)
ggTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATccgcccgc < 2:4795709/151‑1 (MQ=255)
gAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAgg > 2:857304/1‑151 (MQ=255)
aGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGc < 1:1051557/151‑1 (MQ=255)
gTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGACGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTa < 2:4927833/151‑1 (MQ=255)
gTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTa < 1:1145557/151‑1 (MQ=255)
ttGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTAc < 1:24579/151‑1 (MQ=255)
tGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACg < 2:1626266/151‑1 (MQ=255)
cccTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGAt > 1:4994037/1‑151 (MQ=255)
tGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGAACTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATccc < 1:4202921/151‑1 (MQ=255)
gCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGt < 1:1197352/151‑1 (MQ=255)
ctgctgGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCt < 1:3736862/151‑1 (MQ=255)
gctgGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTAc < 2:571292/151‑1 (MQ=255)
ctgGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACt < 1:5026177/151‑1 (MQ=255)
ggAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTcc < 2:4842454/151‑1 (MQ=255)
gAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCa < 1:3882865/151‑1 (MQ=255)
gAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCa < 1:5206910/151‑1 (MQ=255)
cGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTgt > 1:2144100/1‑151 (MQ=255)
cGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTgt < 1:1315858/151‑1 (MQ=255)
ggCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTgtc > 2:1015685/1‑151 (MQ=255)
ggCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTgtc > 1:4237342/1‑151 (MQ=255)
cccTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTgtcgt < 2:551045/151‑1 (MQ=255)
ccTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTgtcgtc < 1:5123269/151‑1 (MQ=255)
cTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTGtcgtcg > 1:870618/1‑151 (MQ=255)
ggAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTGTCGTCGGt > 2:1283726/1‑151 (MQ=255)
gAAGAGCGCCAGGTCTTCGCGCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTGTCGTCGGTg < 2:3166603/151‑1 (MQ=255)
gAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTGTCGTCGGTg > 2:347823/1‑151 (MQ=255)
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TGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATC < SRR10918231.1221751/151‑1 (MQ=60)
GTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCC > SRR10918231.4612712/1‑151 (MQ=60)
GTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCC < SRR10918231.3016223/151‑1 (MQ=60)
GTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTAGCGCATATCC > SRR10918231.3557804/1‑151 (MQ=60)
TCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCG < SRR10918231.864476/151‑1 (MQ=60)
GCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCC < SRR10918231.759778/151‑1 (MQ=60)
CCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCC < SRR10918231.1346028/151‑1 (MQ=60)
GGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGC > SRR10918231.2732776/1‑151 (MQ=60)
TGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAG > SRR10918231.4755237/1‑151 (MQ=60)
AGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGC < SRR10918231.1056300/151‑1 (MQ=60)
GGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCT > SRR10918231.4087001/1‑151 (MQ=60)
GTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTA < SRR10918231.1150873/151‑1 (MQ=60)
GTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTA < SRR10918231.1150859/151‑1 (MQ=60)
TTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTAC < SRR10918231.24666/151‑1 (MQ=60)
GACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGA < SRR10918231.3495011/151‑1 (MQ=60)
ACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAA < SRR10918231.737355/151‑1 (MQ=60)
CGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAG < SRR10918231.1551272/151‑1 (MQ=60)
CGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAG < SRR10918231.421229/151‑1 (MQ=60)
CCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGAT > SRR10918231.5018220/1‑151 (MQ=60)
TGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGAACTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCC < SRR10918231.4648547/151‑1 (MQ=60)
TGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGAACTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCC < SRR10918231.4222768/151‑1 (MQ=60)
GCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGT < SRR10918231.1202977/151‑1 (MQ=60)
ACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTC > SRR10918231.5109162/1‑151 (MQ=60)
CTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCT < SRR10918231.3754015/151‑1 (MQ=60)
CTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACT < SRR10918231.1381263/151‑1 (MQ=60)
CTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACT < SRR10918231.5050610/151‑1 (MQ=60)
CTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACT > SRR10918231.4414094/1‑151 (MQ=60)
TGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTC > SRR10918231.3489971/1‑151 (MQ=60)
GAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCA < SRR10918231.5232609/151‑1 (MQ=60)
GAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCA < SRR10918231.3901070/151‑1 (MQ=60)
GAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCA < SRR10918231.3900911/151‑1 (MQ=60)
AAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGTACTGCGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCAC < SRR10918231.2455537/151‑1 (MQ=60)
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TGCCGAACTGAAACTGGATGGCCGCCTGGTGGTGGCGGGCGAGAACAGTGCCCGCGGCGCCACTGTCGCCGGTGAGGTTGACGCCCTGGCACTGCTGGAAGCGGCCCTGGAAGAGCGCCAGGTATTCGCCCGCCGCCTGGACCTGGACTACGCCTTCCACTCGCCGGCCATGGACCCGATCAAGCAAGCGGTTATCGACGACCTCGCGCATATCCGCCCGCAGGCTACGAAGATCCCGTTCTACTCCACTGTCGTCGGTGGCCAGTTGAACGGCGAACGGCTGGACAGCCAGTACTGGTG > CP009974/3675965‑3676264
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
