Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,540,457 |
A→G |
R459R (CGT→CGC) |
RPPX_20280 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,540,457 | 0 | A | G | 100.0%
| 726.3
/ NA
| 229 | R459R (CGT→CGC) | RPPX_20280 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (109/120); total (109/120) |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
AGCGCCCCGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCTGTAGGGGTTATCGAT > CP009974/4540309‑4540603
|
aGCGCCCCGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGATCGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCg < 1:998503/151‑1 (MQ=255)
aGCGCCCCGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCg < 1:3915809/151‑1 (MQ=255)
ccccGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCgg > 1:2883641/1‑151 (MQ=255)
cccGCCAATCCCTCGATCATGTTGTCGCTGGCGCCCAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGATTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGACGCGTCGGt < 1:525140/151‑1 (MQ=17)
gCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCAt > 2:2460511/1‑151 (MQ=255)
gCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCAt < 1:2621396/151‑1 (MQ=255)
ccAATCCCTGGATCACGTTGTGGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATg < 2:2312199/151‑1 (MQ=255)
ccAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATg < 1:2398243/151‑1 (MQ=255)
cccTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCtt < 1:775878/151‑1 (MQ=255)
ccTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGCACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTc < 1:4883631/151‑1 (MQ=255)
ccTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTc < 2:3609756/151‑1 (MQ=255)
cTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCg < 1:4513445/151‑1 (MQ=255)
cGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGt > 1:5134524/1‑151 (MQ=255)
gATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTg > 2:1986821/1‑151 (MQ=255)
gATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTg > 1:3292178/1‑151 (MQ=255)
tCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGcc < 2:2115594/151‑1 (MQ=255)
tCACGTTGGCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGcc < 2:2605527/151‑1 (MQ=255)
ggaggTTGTCGGTGGGGGGGAGCAAGGGGCGGATGGCGTCGGCGTTGTCCTTGAGCGGGTTGAGCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGcc < 2:1318671/147‑1 (MQ=14)
aCGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCgg > 2:1527056/1‑151 (MQ=255)
tGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTGTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGgtgt < 1:3612139/151‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTc > 1:5021804/1‑151 (MQ=255)
tCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCg > 1:3223073/1‑151 (MQ=255)
cGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCgg > 1:4286103/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGc < 2:4396199/151‑1 (MQ=255)
cTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCt < 1:740436/151‑1 (MQ=255)
gcCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGGGTCGGCTGGccc > 2:4599904/1‑151 (MQ=255)
ccGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGcccc > 2:638319/1‑150 (MQ=255)
ccGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCa < 1:3340616/151‑1 (MQ=255)
cGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCAt > 1:2269546/1‑151 (MQ=255)
aaCAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTg > 1:1503011/1‑151 (MQ=255)
aCAAGGAGCCGATGGCGACGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGCTCTTGGGCGCCGGGGGTCGGCTGGCCCAGTgg > 2:4932254/1‑151 (MQ=14)
aaGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGt < 2:2960906/151‑1 (MQ=255)
aGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTg > 2:2327767/1‑151 (MQ=255)
aGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTg < 2:239635/151‑1 (MQ=255)
aGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAAt > 2:1860715/1‑151 (MQ=255)
gCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATc < 1:4692239/151‑1 (MQ=255)
gATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGc < 1:1720105/151‑1 (MQ=255)
ggCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAAc < 2:499276/151‑1 (MQ=255)
gCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACg < 1:1699822/151‑1 (MQ=19)
gCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACg > 1:1377836/1‑151 (MQ=21)
gTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGcc > 2:2561139/1‑151 (MQ=17)
gTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGcc > 1:3842708/1‑151 (MQ=17)
tCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCa > 1:2580482/1‑151 (MQ=9)
gcGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAGCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCa < 2:3681768/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTGGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCCACGCGAg > 1:3701031/1‑151 (MQ=255)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 2:930020/1‑151 (MQ=12)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 1:442648/1‑151 (MQ=12)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 1:442430/1‑151 (MQ=12)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 1:30775/1‑151 (MQ=12)
ttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGAGTGGGCTGGCCGATTGGAGGAATAAGCCACGCTAGCgaga > 2:3153425/1‑151 (MQ=11)
gTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGAtt < 2:3523965/151‑1 (MQ=12)
tCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGAttt < 1:5087942/151‑1 (MQ=12)
ccTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTc > 2:601747/1‑151 (MQ=9)
cTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTcc > 1:4981144/1‑151 (MQ=12)
cTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTcc < 2:3993594/151‑1 (MQ=12)
ttGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCa > 1:4162258/1‑151 (MQ=12)
ttGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCa > 1:2109983/1‑151 (MQ=12)
tGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACTCCAGTGAGATTTCCAg > 1:34152/1‑151 (MQ=12)
tGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAg < 1:2786960/151‑1 (MQ=12)
aaCGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAc < 1:4061860/151‑1 (MQ=17)
aCGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTGGTGCTGGGCCAGCCATGGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAcc < 2:1114619/151‑1 (MQ=255)
aCGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAcc < 1:3051262/151‑1 (MQ=12)
cGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACcg < 1:1911346/151‑1 (MQ=16)
gTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGCCCgcgg > 2:1613993/1‑151 (MQ=255)
ttGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcggg > 1:3924555/1‑151 (MQ=16)
aaCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcgggcgg < 2:1476167/151‑1 (MQ=19)
cgcCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTg > 1:1199041/1‑151 (MQ=19)
aGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTc > 2:4685869/1‑151 (MQ=21)
gCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGt > 2:1174261/1‑151 (MQ=255)
cGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTc > 1:3180805/1‑151 (MQ=255)
ggTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCa < 1:628510/151‑1 (MQ=255)
gtgtAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCAc < 2:1356944/151‑1 (MQ=255)
gtgtAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCAc > 1:4429794/1‑151 (MQ=255)
gtgtAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCAc > 1:3653314/1‑151 (MQ=255)
aGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGt < 2:1659481/151‑1 (MQ=255)
gCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTa < 2:556249/151‑1 (MQ=255)
gggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCTTTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACTGCGGGCGGAGGTGCGTGCGTCACGGTCGGAAc > 1:1273174/1‑151 (MQ=11)
gggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAAc > 2:523182/1‑151 (MQ=255)
ggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACa < 2:3304424/151‑1 (MQ=255)
gCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAg < 1:1797813/151‑1 (MQ=255)
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gTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAg > 2:3849021/1‑151 (MQ=255)
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TGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGTCAGTGAGAT < SRR10918231.3144165/151‑1 (MQ=5)
TGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGAT > SRR10918231.313075/1‑151 (MQ=5)
GTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATATTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATT < SRR10918231.2536442/151‑1 (MQ=5)
TCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTT < SRR10918231.5112777/151‑1 (MQ=5)
CTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCC > SRR10918231.5005250/1‑151 (MQ=5)
TTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCA > SRR10918231.2119460/1‑151 (MQ=5)
TTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCA < SRR10918231.3733416/151‑1 (MQ=5)
TTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCA > SRR10918231.4181930/1‑151 (MQ=5)
TGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACTCCAGTGAGATTTCCAG > SRR10918231.34281/1‑151 (MQ=5)
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TGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAG < SRR10918231.2798993/151‑1 (MQ=5)
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AACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCAAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAC < SRR10918231.2992630/151‑1 (MQ=5)
ACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACC < SRR10918231.3065222/151‑1 (MQ=5)
CGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCG < SRR10918231.1919945/151‑1 (MQ=7)
CGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCG < SRR10918231.1920395/151‑1 (MQ=7)
CGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCG > SRR10918231.3295675/1‑151 (MQ=7)
GTTGAGCGGCGCCAAGGCGTTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGG < SRR10918231.1940618/151‑1 (MQ=17)
GTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGG < SRR10918231.2880318/151‑1 (MQ=18)
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TTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGG > SRR10918231.3942813/1‑151 (MQ=20)
AACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGG < SRR10918231.3968631/151‑1 (MQ=20)
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CGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTG > SRR10918231.4365431/1‑151 (MQ=20)
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AAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTT > SRR10918231.3246176/1‑151 (MQ=20)
gctcttccgatctCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTC < SRR10918231.2524054/138‑1 (MQ=21)
AGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTC > SRR10918231.3625781/1‑151 (MQ=20)
AGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTC < SRR10918231.2864933/151‑1 (MQ=20)
CGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTC > SRR10918231.3195298/1‑151 (MQ=20)
GGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCA < SRR10918231.630869/151‑1 (MQ=22)
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AAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCG > SRR10918231.1622863/1‑151 (MQ=31)
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GGCTGTCTTGTTGGTCGAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACA < SRR10918231.4251355/151‑1 (MQ=28)
GGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGCCCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACA < SRR10918231.2358154/151‑1 (MQ=30)
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CAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCC > SRR10918231.3979655/1‑151 (MQ=31)
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GAAGCGCCCCGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCTGTAGGGGTTATCGATGT > CP009974/4540307‑4540605
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
