Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,540,460 |
C→T |
R458R (CGG→CGA) |
RPPX_20280 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,540,460 | 0 | C | T | 99.1%
| 716.7
/ ‑5.1
| 225 | R458R (CGG→CGA) | RPPX_20280 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (107/116); total (108/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CCCCGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCTGTAGGGGTTATCGATGTGTTG > CP009974/4540313‑4540609
|
cccGCCAATCCCTCGATCATGTTGTCGCTGGCGCCCAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGATTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGACGCGTCGGt < 1:525140/151‑1 (MQ=17)
gCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCAt > 2:2460511/1‑151 (MQ=255)
gCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCAt < 1:4630140/151‑1 (MQ=255)
ccAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATg < 2:2312316/151‑1 (MQ=255)
ccAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATg < 1:2398243/151‑1 (MQ=255)
aaTCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGAt > 2:4916324/1‑151 (MQ=255)
ccTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTc < 2:3609756/151‑1 (MQ=255)
gATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTg > 1:3292178/1‑151 (MQ=255)
tCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACGAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGcc < 2:608928/151‑1 (MQ=255)
ggaggTTGTCGGTGGGGGGGAGCAAGGGGCGGATGGCGTCGGCGTTGTCCTTGAGCGGGTTGAGCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGcc < 2:1318671/147‑1 (MQ=14)
aCGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCgg > 2:1527056/1‑151 (MQ=255)
tGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTGTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGgtgt < 1:3612139/151‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTc > 1:5021804/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGc < 2:4396199/151‑1 (MQ=255)
cTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCt < 1:740643/151‑1 (MQ=255)
gggCGCGGAACAAGGGGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGGGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTg < 2:5072906/150‑1 (MQ=14)
gcgcCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTCAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGc < 1:260248/151‑1 (MQ=255)
ccGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGcccc > 2:638319/1‑150 (MQ=255)
ccGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCa > 2:3720670/1‑151 (MQ=255)
ccGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCa < 1:3342065/151‑1 (MQ=255)
cGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCAt > 1:2269546/1‑151 (MQ=255)
gaCAAGGAGCCGAGGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTg < 2:2115172/150‑1 (MQ=255)
aaCAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTg > 1:1503011/1‑151 (MQ=255)
aaGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGt < 2:2960906/151‑1 (MQ=255)
aaGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGt < 1:330213/151‑1 (MQ=255)
aGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTg < 1:5088521/151‑1 (MQ=255)
aGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTg < 1:4116088/151‑1 (MQ=255)
aGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTg > 1:965113/1‑151 (MQ=255)
ggAGCGGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGa < 2:2605002/151‑1 (MQ=255)
ggAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGa < 1:4487040/151‑1 (MQ=255)
ggAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGa < 2:2202149/151‑1 (MQ=255)
aGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAAt > 2:1860715/1‑151 (MQ=255)
gCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATc < 1:4692239/151‑1 (MQ=255)
gATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGc > 1:3604924/1‑151 (MQ=255)
gATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGc < 1:1720105/151‑1 (MQ=255)
tGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCaa < 2:2363870/151‑1 (MQ=255)
gCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACg > 1:1377836/1‑151 (MQ=21)
gcGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAGCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCa < 2:3681768/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTGGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCCACGCGAg > 1:3701031/1‑151 (MQ=255)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 2:930020/1‑151 (MQ=12)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 1:442430/1‑151 (MQ=12)
tttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTgag > 1:30775/1‑151 (MQ=12)
ttGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGAGTGGGCTGGCCGATTGGAGGAATAAGCCACGCTAGCgaga > 2:3153425/1‑151 (MQ=11)
tGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGTCAGTGAGAt < 1:3129875/151‑1 (MQ=9)
gTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGAtt < 2:3523965/151‑1 (MQ=12)
gTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATATTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGAtt < 1:2524842/151‑1 (MQ=9)
cTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTcc < 2:3993594/151‑1 (MQ=12)
cTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTcc > 1:4981144/1‑151 (MQ=12)
tGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACTCCAGTGAGATTTCCAg > 1:34152/1‑151 (MQ=12)
tGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAg < 1:2786960/151‑1 (MQ=12)
aaCGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCAAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAc < 1:2978973/151‑1 (MQ=9)
agtggTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATAATCTTCGGAGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAcc < 2:1650114/148‑1 (MQ=255)
aCGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTGGTGCTGGGCCAGCCATGGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAcc < 2:1114619/151‑1 (MQ=255)
cGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACcg < 1:1911346/151‑1 (MQ=16)
gTTGAGCGGCGCCAAGGCGTTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcgg < 1:1931919/151‑1 (MQ=255)
gTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGCCCgcgg > 2:1613993/1‑151 (MQ=255)
gTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcgg < 1:2867210/151‑1 (MQ=19)
ttGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcggg > 1:3924479/1‑151 (MQ=19)
aaCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcgggcgg < 2:1476133/151‑1 (MQ=255)
aaCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcgggcgg < 1:3950162/151‑1 (MQ=25)
ggCGCCAGGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCGAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAgg < 2:4961846/151‑1 (MQ=255)
cgcCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTg > 1:4344811/1‑151 (MQ=18)
cgcCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTg > 1:1199041/1‑151 (MQ=19)
cAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGt > 1:3864507/1‑151 (MQ=19)
aaGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGtt > 1:3231487/1‑151 (MQ=255)
aGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTc > 2:4685869/1‑151 (MQ=21)
gCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGt > 2:1174261/1‑151 (MQ=255)
ggTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCa < 1:628510/151‑1 (MQ=255)
gtgtAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCAc > 1:3653314/1‑151 (MQ=255)
gtgtAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCAc > 1:4429777/1‑151 (MQ=255)
gtgtAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCAc < 2:1356944/151‑1 (MQ=255)
aaGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCg > 1:1615392/1‑151 (MQ=255)
gCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTa < 2:556249/151‑1 (MQ=255)
cGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGCGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCCGAGGTGCGTTCGCCACggcccttc > 2:2515835/1‑145 (MQ=11)
gggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCTTTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACTGCGGGCGGAGGTGCGTGCGTCACGGTCGGAAc > 1:1273174/1‑151 (MQ=11)
gggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAAc > 2:523182/1‑151 (MQ=255)
ggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACa > 1:4187949/1‑151 (MQ=255)
ggCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACa < 2:3304424/151‑1 (MQ=255)
gCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAg < 1:1797813/151‑1 (MQ=255)
tGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGc > 1:3208952/1‑151 (MQ=25)
gTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGcc < 2:2158074/151‑1 (MQ=255)
gTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGcc > 1:5215872/1‑151 (MQ=255)
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TGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACTCCAGTGAGATTTCCAG > SRR10918231.34281/1‑151 (MQ=5)
TGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAG < SRR10918231.2798993/151‑1 (MQ=5)
TGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAG < SRR10918231.4402984/151‑1 (MQ=5)
TGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAG < SRR10918231.2799738/151‑1 (MQ=5)
GAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGA > SRR10918231.3533370/1‑151 (MQ=5)
AACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAC < SRR10918231.4080950/151‑1 (MQ=5)
AACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCAAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGAC < SRR10918231.2992630/151‑1 (MQ=5)
ACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACC < SRR10918231.3065222/151‑1 (MQ=5)
CGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCG < SRR10918231.1919945/151‑1 (MQ=7)
CGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCG < SRR10918231.1920395/151‑1 (MQ=7)
CGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCG > SRR10918231.3295675/1‑151 (MQ=7)
GTTGAGCGGCGCCAAGGCGTTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGG < SRR10918231.1940618/151‑1 (MQ=17)
GTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGG < SRR10918231.2880318/151‑1 (MQ=18)
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AACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGG < SRR10918231.3968631/151‑1 (MQ=20)
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CGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTG > SRR10918231.1204675/1‑151 (MQ=20)
CCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCG > SRR10918231.653224/1‑151 (MQ=20)
CAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGT > SRR10918231.3882432/1‑151 (MQ=20)
AAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTT > SRR10918231.3246176/1‑151 (MQ=20)
gctcttccgatctCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTC < SRR10918231.2524054/138‑1 (MQ=21)
AGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTC < SRR10918231.2864933/151‑1 (MQ=20)
AGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTC > SRR10918231.3625781/1‑151 (MQ=20)
CGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTC > SRR10918231.3195298/1‑151 (MQ=20)
GGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCA < SRR10918231.630869/151‑1 (MQ=22)
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AAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCG > SRR10918231.1622863/1‑151 (MQ=31)
GGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCTTTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACTGCGGGCGGAGGTGCGTGCGTCACGGTCGGAAC > SRR10918231.1279296/1‑151 (MQ=28)
GGCTGTCTTGTTGGTCGAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACA < SRR10918231.4251355/151‑1 (MQ=28)
GGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGCCCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACA < SRR10918231.2358154/151‑1 (MQ=30)
GGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACA > SRR10918231.4207732/1‑151 (MQ=31)
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CAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCC > SRR10918231.3979655/1‑151 (MQ=31)
GCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCGGCCAG > SRR10918231.5002245/1‑151 (MQ=30)
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ATTGCTCCAGGCGTTTGAAGCGTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGTCGGAGGTGCGTTCGTCACGGACGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCT > SRR10918231.475523/1‑151 (MQ=29)
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GTCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCTGTAGGGGTTATCGATGTGTTG < SRR10918231.867387/151‑1 (MQ=32)
GCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATCGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCTGTAGGGGTTATCGATGTGTTG < SRR10918231.3418012/151‑1 (MQ=5)
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CCCCGCCAATCCCTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGAGCCGATGGCGTCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCGGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCACGGTCGTAACAGGCCAAGGCGGCTGCCAGGCTGTAGGGGTTATCGATGTGTTG > CP009974/4540313‑4540609
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
