Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009974 |
5,597,121 |
C→T |
T614T (ACC→ACT) |
RPPX_24915 → |
hypothetical protein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009974 | 5,597,121 | 0 | C | T | 99.7%
| 1009.3
/ NA
| 360 | T614T (ACC→ACT) | RPPX_24915 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (160/199); minor base G (1/0); total (161/199) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
CTTTAGCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACACCCTG > CP009974/5597013‑5597268
|
cTTTAGCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTcc < 2:3837670/151‑1 (MQ=2)
ttAGCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCcgg > 1:976669/1‑151 (MQ=9)
ttAGCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCcgg < 1:2006807/151‑1 (MQ=9)
aGCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCcggcg > 2:3528790/1‑151 (MQ=9)
gCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCcggcgg < 1:1165313/151‑1 (MQ=12)
gCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCcggcgg < 1:1489350/151‑1 (MQ=12)
ggaggTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCggtggg > 1:3281892/1‑150 (MQ=9)
gaggTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCggtggtg < 2:553388/151‑1 (MQ=14)
aggTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCggtggtgg < 2:82606/151‑1 (MQ=12)
aggTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCggtggtgg > 1:3772782/1‑151 (MQ=12)
ggTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCggtggtggt > 1:5019347/1‑151 (MQ=9)
gTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCggtggtggtg > 1:3123340/1‑151 (MQ=12)
cAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGtt > 1:717647/1‑151 (MQ=12)
cAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGtt < 2:2962627/151‑1 (MQ=12)
cAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGtt > 1:2962627/1‑151 (MQ=17)
cAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGGGGGGGTGGtt > 2:1364108/1‑151 (MQ=255)
aGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGttt < 1:4622037/151‑1 (MQ=12)
aGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGttt > 1:2326234/1‑151 (MQ=17)
gCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTa < 1:1750644/151‑1 (MQ=12)
gCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTa > 2:3544373/1‑151 (MQ=12)
cGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTaa < 1:5071947/151‑1 (MQ=12)
ggTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCACGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTaaa > 1:2589601/1‑151 (MQ=9)
gTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAAc < 1:2513210/151‑1 (MQ=12)
gTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAAc > 1:3847999/1‑151 (MQ=9)
tATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACg < 2:1715581/151‑1 (MQ=12)
aTTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGc < 1:2732238/151‑1 (MQ=12)
ttgcggggCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTAGCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAg < 2:5220610/144‑1 (MQ=11)
gAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAggg > 1:645541/1‑151 (MQ=255)
gAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAggg < 2:2107215/151‑1 (MQ=19)
aaGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGa < 2:3292827/151‑1 (MQ=19)
aaGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGa < 1:4124291/151‑1 (MQ=19)
aaGAGCGGCAGGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGa < 2:2674996/151‑1 (MQ=255)
agagCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGAt < 2:87900/151‑1 (MQ=255)
agCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGTGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAGCCCAACTTCCTTGGGTGGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGAtgt < 2:4033870/151‑1 (MQ=255)
ggCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGAtgctgt < 1:5171079/151‑1 (MQ=16)
ggCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGAtgctgt < 1:4857697/151‑1 (MQ=255)
gCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTtgtg > 1:4939500/1‑151 (MQ=255)
aTGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGt > 1:536545/1‑151 (MQ=255)
acaGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAAc > 1:1441182/1‑151 (MQ=255)
caGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACa > 2:2322236/1‑151 (MQ=9)
caGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGCGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACa < 2:3737922/151‑1 (MQ=255)
aGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACAt > 2:1538631/1‑151 (MQ=9)
ggTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATc > 1:3216646/1‑151 (MQ=255)
ttGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCtt < 2:1233205/151‑1 (MQ=255)
tGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTa > 2:3937794/1‑151 (MQ=255)
tGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTa > 2:4798109/1‑151 (MQ=255)
gAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTAt > 2:4714138/1‑151 (MQ=255)
aaGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATc < 1:1267151/151‑1 (MQ=255)
agaTGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCt < 1:1680073/151‑1 (MQ=255)
aTGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCa < 2:3069608/151‑1 (MQ=255)
tGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCaa > 1:3050937/1‑151 (MQ=255)
aaaGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCaaca < 1:425642/151‑3 (MQ=255)
aaaGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGCGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAAACCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCTGCGGGGGTGGTGGGTTAAACGCAGGGATGATGTGGTTAAACCTGTTATCGCTCAAGa > 2:4476117/1‑151 (MQ=11)
aaGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGAc < 1:4012825/151‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACg < 1:1039589/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACgg < 1:1575380/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACgg < 1:4316694/151‑1 (MQ=255)
gTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGcc > 1:4798607/1‑151 (MQ=11)
gTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGcc > 1:4364268/1‑151 (MQ=11)
ttGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCt > 1:4515/1‑151 (MQ=255)
ttGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGGTCAACATCTTATAGCTCAACACGGCCt > 2:4589985/1‑151 (MQ=11)
tGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTa > 2:445453/1‑151 (MQ=11)
cATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTacaac < 2:607126/151‑1 (MQ=11)
ctcGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGc > 1:3369216/1‑151 (MQ=255)
ggTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGc < 2:159013/151‑1 (MQ=255)
gTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCa < 1:831346/151‑1 (MQ=255)
aGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCaga > 2:423475/1‑151 (MQ=11)
aGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGGGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCaga > 2:2477103/1‑151 (MQ=255)
cGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCagaaga < 2:1171626/151‑1 (MQ=255)
cGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCagaaga > 1:2781437/1‑151 (MQ=14)
gCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAagag < 2:4324170/151‑1 (MQ=255)
gCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAagag > 2:3190462/1‑151 (MQ=11)
cACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGt > 2:2756394/1‑151 (MQ=255)
aCGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAagagcg < 2:4906369/151‑3 (MQ=11)
ggTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAagagcgac > 2:2159144/1‑147 (MQ=11)
ggTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAagagcgac > 1:1770307/1‑147 (MQ=11)
gtgtCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGacg > 1:3028783/1‑149 (MQ=11)
tgtCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGc < 2:4182914/151‑1 (MQ=255)
tgtCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGc > 2:4864932/1‑151 (MQ=11)
ggtCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGc < 2:4104649/150‑1 (MQ=11)
tCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCAc > 1:4210738/1‑151 (MQ=255)
tCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCAc > 1:2907308/1‑151 (MQ=11)
tCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCAc > 1:2863537/1‑151 (MQ=11)
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GGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAA < SRR10918231.3812833/151‑1 (MQ=5)
GGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAA < SRR10918231.4856659/151‑1 (MQ=5)
GGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAA < SRR10918231.1718867/151‑1 (MQ=5)
GGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCACGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAA > SRR10918231.2601535/1‑151 (MQ=5)
GTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGGAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAAC < SRR10918231.5236487/151‑1 (MQ=5)
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GTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAAC > SRR10918231.1825982/1‑151 (MQ=5)
GTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAAC < SRR10918231.2524749/151‑1 (MQ=5)
TATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACG < SRR10918231.185204/151‑1 (MQ=5)
ATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGC > SRR10918231.4381392/1‑151 (MQ=5)
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TTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAG > SRR10918231.123958/1‑151 (MQ=9)
TTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAG < SRR10918231.2463197/151‑1 (MQ=9)
TGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGG < SRR10918231.3228861/151‑1 (MQ=16)
GAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGG > SRR10918231.647996/1‑151 (MQ=18)
AAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGA < SRR10918231.4143761/151‑1 (MQ=20)
AAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGA < SRR10918231.517520/151‑1 (MQ=20)
GAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATG < SRR10918231.2781087/151‑1 (MQ=20)
GGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGT < SRR10918231.242357/151‑1 (MQ=22)
GCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCT < SRR10918231.91261/151‑1 (MQ=16)
CGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTG < SRR10918231.2373767/151‑1 (MQ=27)
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GCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTG > SRR10918231.4963346/1‑151 (MQ=31)
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AGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACAT > SRR10918231.4992666/1‑151 (MQ=31)
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AGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACG < SRR10918231.1044256/151‑1 (MQ=41)
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CGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACA > SRR10918231.2558864/1‑151 (MQ=29)
GCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAA > SRR10918231.2681250/1‑151 (MQ=29)
CATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAAC < SRR10918231.4100560/151‑1 (MQ=51)
CATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAAC < SRR10918231.4376746/151‑1 (MQ=51)
ATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACA > SRR10918231.1344782/1‑151 (MQ=29)
CTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGC > SRR10918231.3384493/1‑151 (MQ=29)
CTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGC < SRR10918231.419927/151‑1 (MQ=29)
TCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCC > SRR10918231.2773930/1‑151 (MQ=29)
CGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCT > SRR10918231.2906514/1‑151 (MQ=51)
GGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTG < SRR10918231.1536414/151‑1 (MQ=51)
GGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTG > SRR10918231.2699043/1‑151 (MQ=29)
GTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCA < SRR10918231.834781/151‑1 (MQ=51)
AGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGA < SRR10918231.4249313/151‑1 (MQ=51)
AGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGA > SRR10918231.1466834/1‑151 (MQ=29)
CCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTTTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAG > SRR10918231.1163483/1‑151 (MQ=28)
CGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGA > SRR10918231.728405/1‑151 (MQ=29)
CACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGT < SRR10918231.5005001/151‑1 (MQ=53)
CACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGC < SRR10918231.69424/151‑1 (MQ=27)
ACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTG < SRR10918231.2860563/151‑1 (MQ=55)
ACGGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCG < SRR10918231.4718227/151‑1 (MQ=25)
GGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGcgac > SRR10918231.1778399/1‑147 (MQ=21)
GGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGcgac < SRR10918231.127779/151‑5 (MQ=21)
GGTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGcgac > SRR10918231.2961533/1‑147 (MQ=21)
GTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTTCGGCG > SRR10918231.923138/1‑67 (MQ=0)
GTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATG > SRR10918231.671718/1‑151 (MQ=60)
GTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATG < SRR10918231.3177304/151‑1 (MQ=60)
GTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGcgacg > SRR10918231.3042652/1‑146 (MQ=20)
GTGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGcgacg > SRR10918231.2844041/1‑146 (MQ=20)
TGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGC > SRR10918231.2215690/1‑151 (MQ=60)
TGTCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGC < SRR10918231.4328640/151‑1 (MQ=17)
TCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCAC > SRR10918231.5049659/1‑151 (MQ=60)
TCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGACGCAC > SRR10918231.5049404/1‑151 (MQ=50)
TCTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCAC > SRR10918231.2920592/1‑151 (MQ=8)
CTATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACC < SRR10918231.4710465/151‑1 (MQ=60)
TATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCG > SRR10918231.1552674/1‑151 (MQ=4)
ATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGG > SRR10918231.3758058/1‑151 (MQ=4)
ATCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGG > SRR10918231.2449988/1‑151 (MQ=4)
TCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGA < SRR10918231.1611235/151‑1 (MQ=60)
TCGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGA > SRR10918231.3723596/1‑151 (MQ=4)
CGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAA > SRR10918231.4927072/1‑151 (MQ=60)
CGAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAA < SRR10918231.5084289/151‑1 (MQ=4)
GAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAAT > SRR10918231.3888828/1‑151 (MQ=60)
GAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAAT < SRR10918231.4726052/151‑1 (MQ=4)
GAGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAAT < SRR10918231.4725890/151‑1 (MQ=4)
AGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATA < SRR10918231.1513784/151‑1 (MQ=60)
AGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACCTCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATA > SRR10918231.3087819/1‑151 (MQ=4)
AGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATA < SRR10918231.32783/151‑1 (MQ=4)
AGCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATA < SRR10918231.4636194/151‑1 (MQ=4)
GCTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATAC < SRR10918231.500003/151‑1 (MQ=60)
CTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACA < SRR10918231.3648125/151‑1 (MQ=60)
CTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACA > SRR10918231.1371662/1‑151 (MQ=60)
CTGACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATACA < SRR10918231.2882415/151‑1 (MQ=4)
GACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACACC > SRR10918231.3245990/1‑151 (MQ=60)
ACCACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATACACCC > SRR10918231.1713862/1‑151 (MQ=4)
CACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCATGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACATCCTGCAGAAGATCGACGCACCGGAATACACCCTG > SRR10918231.892760/1‑151 (MQ=3)
CACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACACCCTG < SRR10918231.1898837/151‑1 (MQ=60)
CACTACAGCGCGCGTGAAACCCACCTTCCTTGGCTTGCTCCCGGCCGGCTGTGGTGGTGGTTTAACCGCAGGGATGCTGTTGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATACACCCTG < SRR10918231.37135/151‑1 (MQ=2)
ACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACACCCTGG < SRR10918231.3263473/151‑1 (MQ=60)
ACTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATACACCCTGG < SRR10918231.2823999/151‑1 (MQ=4)
CTACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATACACCCTGGG > SRR10918231.1129455/1‑151 (MQ=4)
TACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACACCCTGGGG > SRR10918231.1005698/1‑151 (MQ=60)
TACTGCGCGCGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGCTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAACACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGCGACGCACCGGAATACACCCTGGGG < SRR10918231.1794094/151‑1 (MQ=4)
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CACGCTATCGAATCACCGAGCAGGCCATTACGGAAAATCCCTTTAGCCAGGAGGTGCAGCGGTATTTGAAGAGCGGCATGGCACAGGTTGAAGAGATGAAAGCGTTGCGCATCTCGGGTAGCCGCACGGTGTCTATCGAGCTGACCACCACTGCGCGTGTGAAACCCAACTTCCTTGGGTTGCTCACCTCCGGCGGTGGTGGTGGTTTAAACGCAGGGATGTTGTGGTTCAACATCTTATCGCTCAAGACGGCCTACAACAGCCTGCAGAAGAGTGATGCACCGGAATACACCCTGGGG > CP009974/5596973‑5597271
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |