Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 1557 total aligned reads displayed.
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|
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CCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCGTC > SRR10918231.921719/1‑151 (MQ=60)
CCACCACTTCGTCGGTGGTGTCGGTCACTTGAACAGTAGCCGCACCGCCCAGTTGCAGGTTCTCGAACGTAGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATACCAAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCGTC < SRR10918231.5019196/151‑1 (MQ=38)
acgacttcatcgagggtgtcggtgacatccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGT > SRR10918231.1359849/40‑151 (MQ=54)
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tcatcgagggtgtcggtgacatccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGT > SRR10918231.851359/34‑151 (MQ=45)
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CGTCGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCGTTGCCGCCCAGTTGCAGGTTCTCGAAGGTCGCACCAGTGGCGTCTACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTA < SRR10918231.2863995/151‑1 (MQ=24)
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ggtgtcggtgacatccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCG > SRR10918231.509601/26‑151 (MQ=45)
gtgtcggtcacttgaaccgaagcgttgccgcccagttgcaggttgtcgaaggtcgcaCCAGTGGCGTCTACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCAC < SRR10918231.2755277/94‑1 (MQ=60)
tgtcggtcacttgaacagtagccgcaccgcccagttgcaggttctcgaacgtagcgcccgtggcgtctgccgccgaattgagactagggttgatctgggtagtatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCACT < SRR10918231.4050387/42‑1 (MQ=21)
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gtcggtgacatccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGGCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGCCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTG > SRR10918231.1239055/23‑151 (MQ=33)
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tcggtgacatccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGG < SRR10918231.727997/130‑1 (MQ=44)
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GGTCACTTGAACAGTAGCCGCACCGCCCAACTGCAGGTTCTCGAACGTTGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATACCAAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTT > SRR10918231.3509011/1‑151 (MQ=45)
gtgacatccgctttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTT < SRR10918231.2976625/133‑1 (MQ=44)
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tgacttgaaccgaagcgttgCCGCCCAATTCCAGGTTCTCGAACGCAGCGCCGGTGGCGTCTACTGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTC < SRR10918231.616603/131‑1 (MQ=6)
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tcacttggaccgaagcgttgccgcccagttgcAGGTTCTCGAACGTTGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATACCAAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTC < SRR10918231.2338054/119‑1 (MQ=30)
TCACTTGAACAGTAGCCGCACCGCCCAGTTGCAGGTTCTCGAACGTAGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATACCAAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTC < SRR10918231.4254790/151‑1 (MQ=29)
gacttgaaccgaagcgttgCCGCCCAATTCCAGGTTCTCGAACGCAGCGCCGGTGGCGTCTACTGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCG > SRR10918231.1004453/20‑151 (MQ=8)
cacttgaaccgaagcgttgccgcccagttgcaggttctcgaaggtcgcaCCAGTGGCGTCTACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCG < SRR10918231.1020720/102‑1 (MQ=60)
acatccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGC < SRR10918231.3730841/136‑1 (MQ=44)
ACTTGAACGGTAGCTGCACCGCCCAACTCAAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCGC < SRR10918231.3075453/151‑1 (MQ=60)
ACTTGAACAGTAGCCGCACCGCCCAGTTGCAGGTTCTCGAACGTTGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGC > SRR10918231.290958/1‑151 (MQ=40)
CTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCGGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATTTCGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACC > SRR10918231.4446404/1‑151 (MQ=60)
atccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCA < SRR10918231.3174670/138‑1 (MQ=44)
TTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCGTCATGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCA < SRR10918231.381175/151‑1 (MQ=60)
tgcaccgaagcgttgCCGCCCAATTCCAGGTTCTCGAACGCAGCGCCGGTGGCGTCTACTGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAG < SRR10918231.3235595/136‑1 (MQ=8)
tgaaccgaagcgttgccgcccagttgcaggttctcgaaggtcgcaCCAGTGGCGTCTACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAG > SRR10918231.2394757/46‑151 (MQ=60)
tccactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGAGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAG > SRR10918231.1582309/13‑151 (MQ=43)
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GGACCGAAGCAGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCTACTGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGC > SRR10918231.1902906/1‑151 (MQ=55)
cactttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCGTCAACCGCCGCGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACTGCGCGCTGGTTTCGCCAGCC > SRR10918231.2538782/11‑151 (MQ=32)
aacagtagccgcaccgcccagttgcAGGTTCTCGAACGTTGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCC < SRR10918231.681329/126‑1 (MQ=48)
ACCGAAGCCGCACCGCCCAACTCAAGGTTCTCGAACGTAGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCT < SRR10918231.1998363/151‑1 (MQ=60)
ACCGAAGCAGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCTACTGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCT < SRR10918231.886420/151‑1 (MQ=56)
ctttcgcgGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCACCAGTGGCATCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTT > SRR10918231.1439086/9‑151 (MQ=60)
ccgaagcgttgccgcccagttgcaggttctcgaaggtcgcaCCAGTGGCGTCTACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAGCCTT > SRR10918231.1259296/42‑151 (MQ=60)
CGAAGCCGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCGTCATGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTG > SRR10918231.4467281/1‑151 (MQ=60)
CGAAGCCGCACCGCCCAACTCAAGGTTCTCGAACGTAGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTG > SRR10918231.656953/1‑151 (MQ=60)
GAAGCAGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCTACTGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCCTGTGCGTCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCTTGA < SRR10918231.2850270/151‑1 (MQ=51)
tagccgcaccgcccagttgcAGGTTCTCGAACGTTGCGCCGGTGGCGTCTACCGCCGAATTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGAT < SRR10918231.3531903/131‑1 (MQ=48)
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GAATTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCA‑‑Gggcggtgt > SRR10918231.4642551/1‑143 (MQ=27)
aattgataccaaggctgatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑Gggcggtgtt < SRR10918231.4327131/117‑10 (MQ=21)
aattgataccaaggctgatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGCCGTGAGttagggcggggtt > SRR10918231.442001/35‑138 (MQ=8)
AGTTGATGCCCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTCCGGCGCGCTGGTCTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTT > SRR10918231.1384536/1‑151 (MQ=2)
TTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGA > SRR10918231.3627034/1‑151 (MQ=40)
TTGATGCCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGA > SRR10918231.2764707/1‑151 (MQ=0)
TGATGCCCAGGCTGATCTGGCCCGCATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcactggtga > SRR10918231.296540/1‑111 (MQ=20)
TGATACCAAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑Gggcggtgttgat < SRR10918231.3220757/151‑13 (MQ=16)
taccaaggctgatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑Gggcggtgttgatgtg > SRR10918231.5146991/29‑136 (MQ=20)
taccaaggctgatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGGCGTGAGCCA‑‑Gggcggggttgatgtg > SRR10918231.3451663/29‑136 (MQ=19)
CCCAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCA > SRR10918231.966966/1‑151 (MQ=0)
CCAAGGCTGATCTGGCCAGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑Gggcggtgttgatgtgca < SRR10918231.3618574/151‑18 (MQ=16)
CCAGACTGATCTGGCCCGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCAC < SRR10918231.1845838/151‑1 (MQ=0)
GGCTGATCTGGCCCGCATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGT < SRR10918231.332601/151‑1 (MQ=0)
GCTGATCTGGCCCGCATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCA‑‑G‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTG > SRR10918231.2072178/1‑151 (MQ=18)
ctgatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑G‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGA > SRR10918231.4604604/21‑151 (MQ=17)
ctgatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑G‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGA > SRR10918231.4973294/21‑151 (MQ=16)
CTGATTTCGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGA > SRR10918231.480205/1‑151 (MQ=28)
tgatctggccagcctcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAA < SRR10918231.5069586/132‑1 (MQ=0)
gatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑Gggcggtgttgatgtgcacggtgaac > SRR10918231.2689373/19‑126 (MQ=21)
gatctggccagcatcgttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAG > SRR10918231.3936173/19‑151 (MQ=0)
GATCTGGCCCGCATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAG > SRR10918231.4273465/1‑151 (MQ=4)
GATCTGGCCCGCATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAG > SRR10918231.4352610/1‑151 (MQ=4)
tctgGCCCGCATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGT > SRR10918231.5174269/5‑151 (MQ=8)
CGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGG > SRR10918231.2588305/1‑151 (MQ=21)
GCCAGCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCGTCATGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGT < SRR10918231.4728452/151‑1 (MQ=14)
GCATCCTGATAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGA < SRR10918231.4161836/151‑1 (MQ=15)
CATCCTGGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGAC > SRR10918231.2722120/1‑151 (MQ=10)
CATCCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGAC < SRR10918231.1542084/151‑1 (MQ=10)
ATCGTTGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACG > SRR10918231.2895253/1‑151 (MQ=30)
CCTGATAGACATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTT < SRR10918231.820428/151‑1 (MQ=6)
gttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGGGCGG‑‑G‑GTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGGTTGACGTTC > SRR10918231.244521/4‑151 (MQ=16)
gttGTAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑G‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTC > SRR10918231.2552112/4‑151 (MQ=15)
TGATAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCT < SRR10918231.1773372/151‑1 (MQ=6)
ATAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGCTTGACGTTCTCA < SRR10918231.4505647/151‑1 (MQ=6)
TAGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCAG > SRR10918231.4709813/1‑151 (MQ=0)
AGACGTCATCGCCTTGCGCCGCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGAGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACTAGGTCGTGAGCCA‑‑G‑GGCGGTGTTGATGTGCACGGTGAACGTCGGTTTGACGTTCTCGGC < SRR10918231.641635/151‑1 (MQ=15)
CATCATCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCAC > SRR10918231.1161278/1‑151 (MQ=1)
TCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAG < SRR10918231.4216427/151‑1 (MQ=16)
TCGCCTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAG > SRR10918231.4773691/1‑151 (MQ=16)
CTTGCGCGTCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTCTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACAGTGAAGGTTGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTG > SRR10918231.4027515/1‑151 (MQ=6)
CTTGCGCGTCATGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCAGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTG < SRR10918231.2202802/151‑1 (MQ=6)
TTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGTACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGG > SRR10918231.1139545/1‑151 (MQ=24)
TTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCGTTGTTGCTCAGGGTCACGACCAAGTCGTGGGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAGGTCTGG > SRR10918231.694528/1‑151 (MQ=0)
GTCGTGGGTGTACGGCGCACTGGTTTCACCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAGGTCTGGTCGGCC > SRR10918231.1338518/1‑151 (MQ=15)
|
GGCCACCACTTCGTCGGTGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAACTCGAGGTTCTCGAACGCAGCGCCAGTGGCGTCCACCGCCGAGTTGATGCCCAGGCTGATTTCGCCCGCATCCTGGTAGACGTCATCGCCTTGCGCATCGTGGGTGTACGGCGCGCTGGTTTCGCCGGCCTTGATGGTGACCTGGGCATTGTTGCTCAGGGTCACGACCAGGTCGTGAGCCA‑‑GCGGCTG‑GTTGACGTGCACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCC > CP009974/1896034‑1896334
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
