Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
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404 |
265.1 |
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96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 328 total aligned reads displayed.
CAGCGCCGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCG > CP009974/3756759‑3757056
|
CGCCGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCT > SRR10918231.1832981/1‑151 (MQ=60)
CCGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGC > SRR10918231.2829259/1‑151 (MQ=60)
CCGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGC > SRR10918231.2829273/1‑151 (MQ=60)
CGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCC < SRR10918231.661686/151‑1 (MQ=60)
CACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCA > SRR10918231.3963381/1‑151 (MQ=60)
CACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCA > SRR10918231.4617907/1‑151 (MQ=60)
GCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCAT < SRR10918231.2583622/151‑1 (MQ=60)
TGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTC < SRR10918231.4081151/151‑1 (MQ=60)
CGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGAT < SRR10918231.2992098/151‑1 (MQ=60)
GCAAGCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATAC < SRR10918231.3595773/151‑1 (MQ=60)
CAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACC > SRR10918231.1566611/1‑151 (MQ=60)
ATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTATGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGC < SRR10918231.1781277/151‑1 (MQ=60)
ggcctcctgaagtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATG < SRR10918231.1347819/76‑1 (MQ=60)
ggcctcctgaagtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATG < SRR10918231.1993404/76‑1 (MQ=60)
AATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCAT > SRR10918231.1180081/1‑151 (MQ=60)
AACGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCAT < SRR10918231.4865774/151‑1 (MQ=60)
gcctcctgaagtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGG < SRR10918231.192024/77‑1 (MQ=60)
gcctcctgaagtcgcaatctgcgtcgcctgaactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGG > SRR10918231.5213802/75‑151 (MQ=60)
ATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATG < SRR10918231.533363/151‑1 (MQ=60)
TGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGG > SRR10918231.3991082/1‑151 (MQ=60)
tcctgaagtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATATGGATATCGCCGGCATGGCTG > SRR10918231.2537687/72‑151 (MQ=60)
tcctgaagtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTG < SRR10918231.2113243/80‑1 (MQ=60)
tgaagtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCC < SRR10918231.831463/83‑1 (MQ=60)
gaagtcgcaatctgcgtcgcctgaactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCT > SRR10918231.3930445/68‑151 (MQ=60)
CTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCC > SRR10918231.1230573/1‑151 (MQ=60)
cgatctaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCG < SRR10918231.5019629/86‑1 (MQ=60)
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CCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTC > SRR10918231.4510657/1‑151 (MQ=60)
gtcgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGG < SRR10918231.3951804/87‑1 (MQ=60)
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cgcaatctgcgtcgcctggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCC > SRR10918231.1319608/63‑151 (MQ=60)
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GACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCT > SRR10918231.3440130/1‑151 (MQ=60)
GACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCT > SRR10918231.503321/1‑151 (MQ=60)
GACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCT > SRR10918231.3440084/1‑151 (MQ=60)
aatctgcgtcgcctgaactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGG > SRR10918231.1873794/60‑151 (MQ=60)
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TCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAA > SRR10918231.869972/1‑151 (MQ=60)
TCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAA < SRR10918231.1595832/151‑1 (MQ=60)
ggactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAA > SRR10918231.4576771/46‑151 (MQ=60)
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aactaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAAC < SRR10918231.1639356/107‑1 (MQ=60)
TCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAA > SRR10918231.4747910/1‑151 (MQ=60)
TCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAA < SRR10918231.3372767/151‑1 (MQ=60)
actaccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACG > SRR10918231.1907913/44‑151 (MQ=60)
CCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAAC > SRR10918231.263580/1‑151 (MQ=60)
CGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACT < SRR10918231.3796825/151‑1 (MQ=60)
taccgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAAC‑GCT < SRR10918231.721034/110‑1 (MQ=60)
accgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctc < SRR10918231.2900161/111‑5 (MQ=60)
cgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctctt < SRR10918231.2867241/113‑7 (MQ=60)
cgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctctt < SRR10918231.3447677/113‑7 (MQ=60)
cgcgcgcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctctt < SRR10918231.1558130/113‑7 (MQ=60)
TCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCA > SRR10918231.2425169/1‑151 (MQ=60)
tcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctct > SRR10918231.2946270/34‑140 (MQ=60)
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gcttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctct < SRR10918231.2940269/118‑12 (MQ=60)
cttagaagcaagatcaaaagcgagaagcgaatTCGGTGATCGGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctctt < SRR10918231.2139879/119‑13 (MQ=60)
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GGCC‑GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcg < SRR10918231.3286191/151‑54 (MQ=60)
CGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgc > SRR10918231.98612/1‑95 (MQ=60)
GGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcg < SRR10918231.126297/151‑58 (MQ=60)
GCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcgg > SRR10918231.3310033/1‑93 (MQ=60)
GCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCT > SRR10918231.2722097/1‑151 (MQ=60)
GCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCT < SRR10918231.1369134/151‑1 (MQ=60)
CACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTT < SRR10918231.5194572/151‑1 (MQ=60)
ACCGCCTATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggta > SRR10918231.458456/1‑91 (MQ=60)
ACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcag < SRR10918231.3365526/151‑61 (MQ=60)
ACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGGCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTG > SRR10918231.1796418/1‑151 (MQ=60)
CGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagt > SRR10918231.1592848/1‑89 (MQ=60)
GCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATG > SRR10918231.4772620/1‑151 (MQ=60)
CCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcga > SRR10918231.4820068/1‑87 (MQ=60)
CGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgat > SRR10918231.715818/1‑86 (MQ=60)
CGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgat < SRR10918231.4806963/151‑66 (MQ=60)
ATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGT > SRR10918231.1351998/1‑151 (MQ=60)
ATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGT > SRR10918231.21178/1‑151 (MQ=60)
TGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgca < SRR10918231.3911191/151‑69 (MQ=60)
CATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcga < SRR10918231.4244760/151‑71 (MQ=60)
CATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGC < SRR10918231.4095280/151‑1 (MQ=60)
ATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTagatcggaagag > SRR10918231.2951805/1‑139 (MQ=60)
ATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCC < SRR10918231.3056927/151‑1 (MQ=60)
TTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagatt > SRR10918231.1140181/1‑79 (MQ=60)
TTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagatt < SRR10918231.1135829/151‑73 (MQ=60)
TTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCG < SRR10918231.4761192/151‑1 (MQ=60)
TCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGT > SRR10918231.2068577/1‑151 (MQ=60)
GGTGAGGTTCTGCCCGGTCAGCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgattctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagattgag < SRR10918231.1542613/151‑76 (MQ=60)
GGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGC < SRR10918231.2230728/151‑1 (MQ=60)
GGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGC > SRR10918231.244861/1‑151 (MQ=60)
GTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagattgcga < SRR10918231.3139666/151‑77 (MQ=60)
GTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcaga < SRR10918231.1092382/151‑77 (MQ=60)
GTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcaga > SRR10918231.4676247/1‑75 (MQ=60)
AGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagattgcgactt > SRR10918231.1461613/1‑72 (MQ=60)
AGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAGAACgctcttgctcttgctcttgctcttgctttggattttgcttttgcttctaagcgcgcggtagttcaggcgatgcagattg > SRR10918231.1689733/1‑72 (MQ=60)
ACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCG < SRR10918231.2521055/151‑1 (MQ=60)
|
CAGCGCCGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCG > CP009974/3756759‑3757056
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
