Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,341,061 |
C→A |
67.7% |
Y3* (TAC→TAA) |
ymiB → |
uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,341,061 | 0 | C | A | 67.7%
| 228.6
/ 266.7
| 235 | Y3* (TAC→TAA) | ymiB | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/40); new base A (65/94); total (101/134) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
AAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCGGGGAAATAAACGGCCCATCCA > CP009273/1340912‑1341210
|
aaaCATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAc < 2:2796999/150‑1 (MQ=255)
aCATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACAt > 1:1753628/1‑150 (MQ=255)
ctgctTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAAtt < 1:2645633/150‑1 (MQ=255)
tgctTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTa < 2:194111/150‑1 (MQ=255)
gctTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTaa < 2:3087293/150‑1 (MQ=255)
gctTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTaa < 2:320385/150‑1 (MQ=255)
tttCCGTCAACCGACAGTATGTATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGTGTCCGCGGTTAAATAAAATGAACAACATGACTTACATGAAATTAAcg < 1:2126035/150‑1 (MQ=255)
tCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAAcggc < 1:1122787/150‑1 (MQ=255)
cGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAAcggcgg > 2:4404725/1‑150 (MQ=255)
aCCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGTGAAAGTTGTACAACGTGGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCGGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTaaa < 1:847709/150‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTaaa > 2:1521229/1‑150 (MQ=255)
ccGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAAc < 1:3084243/150‑1 (MQ=255)
ccGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAAc > 1:2569052/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACg < 2:3459088/150‑1 (MQ=255)
cGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACg > 2:2639179/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACg < 2:3293757/150‑1 (MQ=255)
gCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGc > 2:926385/1‑150 (MQ=255)
cattATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGAATCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑t < 2:109789/147‑1 (MQ=255)
cAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑t > 2:1168858/1‑150 (MQ=255)
cAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGGTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCag > 2:1168864/1‑149 (MQ=255)
gTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTg < 1:1442579/150‑1 (MQ=255)
gTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTg > 1:442180/1‑150 (MQ=255)
aTGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGtt < 1:1612878/150‑1 (MQ=255)
tGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGttt < 1:2929386/150‑1 (MQ=255)
gATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGttttt > 2:1816492/1‑150 (MQ=255)
ttGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGttttttt > 2:3403087/1‑150 (MQ=255)
tgtgCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGtttttttt < 2:239725/150‑1 (MQ=255)
tgtgCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGtttttttt < 1:3895135/150‑1 (MQ=255)
gtgCGATCCGAGATTGTTGTTCAACGTTGTTGACTCACTACCGGTTTTCTTGTTGCATATCCTCCGGTTAACAGCGTTGTCCGCGTTTAAATAACTTTAACAACATGACTTAATTGAATTTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTta < 1:1967142/150‑1 (MQ=255)
gtgCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTta > 2:1124758/1‑150 (MQ=255)
tgCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGGA‑TTGTTTTTTTtat > 1:2583878/1‑150 (MQ=255)
tgCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTtat < 1:2861093/150‑1 (MQ=255)
gCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTtata > 2:2154767/1‑150 (MQ=255)
gCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTtata > 2:4466434/1‑150 (MQ=255)
tCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATAtatt < 2:618449/150‑1 (MQ=255)
ccGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATAtattt < 2:2332553/150‑1 (MQ=255)
ccGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATAtattt < 1:413502/150‑1 (MQ=255)
cGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTACCGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATAtattta < 2:2477526/150‑1 (MQ=255)
gagaAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATAtatttat > 2:451589/1‑150 (MQ=255)
gaAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATatttattt < 1:1945896/150‑1 (MQ=255)
acaGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTg > 1:493161/3‑150 (MQ=255)
aGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTa < 1:1042289/150‑1 (MQ=255)
gTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTaa < 1:245285/150‑1 (MQ=255)
ttGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAAt < 2:2794499/150‑1 (MQ=255)
gTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATcc < 2:1655439/150‑1 (MQ=255)
gTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATcc < 2:2448720/150‑1 (MQ=255)
gTAAAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATTATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATcc < 1:3731250/150‑1 (MQ=255)
tACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCa > 2:1995967/1‑150 (MQ=255)
tACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAAATAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCa < 1:3405651/150‑1 (MQ=255)
cGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGtttt > 1:686146/1‑150 (MQ=255)
cGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGtttt > 1:2530172/1‑150 (MQ=255)
gTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTg < 2:2498862/150‑1 (MQ=255)
ttGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTgg > 1:2139324/1‑150 (MQ=255)
aCTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAAc < 1:431227/150‑1 (MQ=255)
cTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACg > 1:3018155/1‑150 (MQ=255)
tCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGc < 2:1230655/150‑1 (MQ=255)
cTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAg < 1:4481164/150‑1 (MQ=255)
cTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAg < 1:4480845/150‑1 (MQ=255)
cTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAg > 1:1253386/1‑150 (MQ=255)
tAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGt < 2:2265869/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑GTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtt > 2:3345345/1‑150 (MQ=255)
cGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtttt > 1:1061145/1‑150 (MQ=255)
cGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtttt < 1:4209482/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTc > 1:575399/1‑150 (MQ=255)
ttttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaa < 2:316850/150‑1 (MQ=255)
ttttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaa > 1:2361445/1‑150 (MQ=255)
tttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaaa > 1:723228/1‑150 (MQ=255)
tttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaaa > 2:1326885/1‑150 (MQ=255)
ttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAAc > 1:3205953/1‑150 (MQ=255)
atgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGaa < 2:2409585/150‑1 (MQ=255)
tgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTc > 2:3776140/1‑150 (MQ=255)
gCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCa < 1:1384603/150‑1 (MQ=255)
cATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAg > 1:3725489/1‑150 (MQ=255)
tatCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGtt > 2:1835301/1‑150 (MQ=255)
atCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTa > 1:619058/1‑150 (MQ=255)
cctccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaa > 2:3835319/1‑150 (MQ=255)
ctccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaaa > 1:3628044/1‑150 (MQ=255)
tccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTaaaaa > 2:2662103/1‑150 (MQ=255)
gTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCt < 1:4205751/150‑1 (MQ=255)
cAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTg < 1:3856828/150‑1 (MQ=255)
cAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTg > 1:2953694/1‑150 (MQ=255)
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ACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAAC < SRR19973072.432217/150‑1 (MQ=60)
CTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACG > SRR19973072.3024537/1‑150 (MQ=60)
CTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACG > SRR19973072.3024563/1‑150 (MQ=60)
CTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAG < SRR19973072.4490624/150‑1 (MQ=60)
CTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAG < SRR19973072.4490620/150‑1 (MQ=60)
CTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAG < SRR19973072.4490305/150‑1 (MQ=60)
CTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAG > SRR19973072.1256084/1‑150 (MQ=60)
CGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTT < SRR19973072.4218278/150‑1 (MQ=60)
CGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTT > SRR19973072.1063418/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTC > SRR19973072.576738/1‑150 (MQ=60)
TTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAA > SRR19973072.2366529/1‑150 (MQ=60)
TTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAA > SRR19973072.724791/1‑150 (MQ=60)
TTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAAC < SRR19973072.4136946/150‑1 (MQ=60)
TTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAAC > SRR19973072.3212728/1‑150 (MQ=60)
TCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACG < SRR19973072.3887154/150‑1 (MQ=60)
TGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAATGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCANTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAA < SRR19973072.4290029/150‑1 (MQ=60)
GCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCA < SRR19973072.1387622/150‑1 (MQ=60)
GCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCA < SRR19973072.1387583/150‑1 (MQ=60)
GCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCA < SRR19973072.1387960/150‑1 (MQ=60)
CATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAG > SRR19973072.3733328/1‑150 (MQ=60)
ATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAATCGAAAGTCAGT > SRR19973072.470732/1‑150 (MQ=60)
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CTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAA > SRR19973072.3635692/1‑150 (MQ=60)
TCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAA > SRR19973072.1154117/1‑150 (MQ=60)
TCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAA < SRR19973072.3256819/150‑1 (MQ=60)
CGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAAT < SRR19973072.759750/150‑1 (MQ=60)
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AGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATA < SRR19973072.1726587/150‑1 (MQ=60)
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TCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTTTTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAA < SRR19973072.1357132/150‑1 (MQ=60)
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CCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACG < SRR19973072.2770579/150‑1 (MQ=60)
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ACATGACTTAAATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCGGGGAAATAAAC > SRR19973072.4439114/1‑150 (MQ=60)
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ACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCA‑TTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGAAAGTCAGTTAAAAAATCTGCCTGGATATAACGAAGGTAGAGCGGGGAAATAAACGGCCC > CP009273/1340914‑1341205
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
