Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,543,054 |
G→T |
36.3% |
G466V (GGT→GTT) |
fdnG → |
formate dehydrogenase‑N, alpha subunit, nitrate‑inducible |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,543,054 | 0 | G | T | 36.3%
| 485.6
/ inf
| 319 | G466V (GGT→GTT) | fdnG | formate dehydrogenase‑N, alpha subunit, nitrate‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (96/107); new base T (54/62); total (150/169) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01 |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
TGTGGGTGCGCAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATG > CP009273/1542905‑1543203
|
gtgGGTGCGCAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGt < 1:1226548/150‑1 (MQ=255)
ggTGCGCAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTAt > 2:4445945/1‑150 (MQ=255)
tGCGCAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCt > 2:479649/1‑150 (MQ=255)
gcAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGAc < 2:1565139/150‑1 (MQ=255)
cAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACg > 1:4444533/1‑150 (MQ=255)
aCATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGc > 1:60119/1‑150 (MQ=255)
cATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGcc < 2:755206/150‑1 (MQ=255)
cATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGcc < 2:3160682/150‑1 (MQ=255)
aTCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCg > 1:672982/1‑150 (MQ=255)
ccGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTc > 2:669654/1‑150 (MQ=255)
cGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCa < 1:3954923/150‑1 (MQ=255)
gTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAg < 2:702685/150‑1 (MQ=255)
tACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGa < 2:525220/150‑1 (MQ=255)
ctaagtcGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTATACCATCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGaaa > 2:1644310/7‑150 (MQ=255)
tATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGaaaa > 2:1009450/1‑150 (MQ=255)
ggCGATGCTCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACa < 2:1741632/150‑1 (MQ=255)
ggCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACa < 1:1888769/150‑1 (MQ=255)
ggCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACa < 1:250084/150‑1 (MQ=255)
gCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAg < 2:2788809/150‑1 (MQ=255)
gatgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGt > 1:105528/1‑150 (MQ=255)
gatgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGt < 2:188103/150‑1 (MQ=255)
tgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTg < 1:3233928/150‑1 (MQ=255)
tCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGAtt > 2:3219674/1‑150 (MQ=255)
tCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGAtt > 2:1991959/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGAttt < 1:2778691/150‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGAttt < 2:2149343/150‑1 (MQ=255)
cAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTg < 2:4564898/150‑1 (MQ=255)
cAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTg < 1:2663013/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAg < 1:2692082/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAg < 1:1728883/150‑1 (MQ=255)
tgctgcTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGt < 2:1106109/150‑1 (MQ=255)
tgctgcTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGt > 2:3345573/1‑150 (MQ=255)
tgctCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGt < 1:2331355/150‑1 (MQ=255)
ctCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTAt < 2:1544114/150‑1 (MQ=255)
ctCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTAt < 2:1479807/150‑1 (MQ=255)
tAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGa > 2:3115116/1‑150 (MQ=255)
tAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGa > 1:149115/1‑150 (MQ=255)
aaCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGaa > 2:2549053/1‑150 (MQ=255)
aaCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGaa > 1:1684357/1‑150 (MQ=255)
aCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAg < 1:4277480/150‑1 (MQ=255)
cATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGc < 1:1630378/150‑1 (MQ=255)
tGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGa < 2:3081275/150‑1 (MQ=255)
ggCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGcc < 1:2535580/150‑1 (MQ=255)
ggcgTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACg > 2:3746566/1‑150 (MQ=255)
ggcgTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACg > 1:3061790/1‑150 (MQ=255)
ggcgTGAACGCATTGCGTGGGCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGGTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGATAGCGACg > 2:2356242/1‑150 (MQ=255)
gcgTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgc < 1:3805678/150‑1 (MQ=255)
cgTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgct > 2:405081/1‑150 (MQ=255)
gTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctg > 2:3996219/1‑150 (MQ=255)
tGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctgg > 2:3074617/1‑150 (MQ=255)
tGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctgg > 2:3827534/1‑150 (MQ=255)
tGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctgg > 1:737932/1‑150 (MQ=255)
gAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctggc > 1:290840/1‑150 (MQ=255)
gAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctggc > 2:611899/1‑150 (MQ=255)
gCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGAt < 1:1180863/150‑1 (MQ=255)
cGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTg < 1:2938845/150‑1 (MQ=255)
gTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGa < 1:4551650/150‑1 (MQ=255)
ggTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAac < 2:3005856/150‑1 (MQ=255)
ggTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAac < 2:1813154/150‑1 (MQ=255)
aCTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAactact < 2:678488/150‑1 (MQ=255)
aCTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACCCGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAactact < 1:2239536/150‑1 (MQ=255)
aCTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAactact > 2:2841806/1‑150 (MQ=255)
ccAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGa > 1:1643068/1‑150 (MQ=255)
ccAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGa > 1:843981/1‑150 (MQ=255)
aCATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCa > 1:3617535/1‑150 (MQ=255)
cATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCaa > 2:3848095/1‑150 (MQ=255)
cATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCaa > 1:1177238/1‑150 (MQ=255)
cATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCaa < 1:3607174/150‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAAc > 1:1460620/1‑150 (MQ=255)
ttCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACt < 1:812971/150‑1 (MQ=255)
ttCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACt < 2:129926/150‑1 (MQ=255)
cAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTAt > 1:2992200/1‑150 (MQ=255)
cAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTAt < 2:3624839/150‑1 (MQ=255)
aGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATc < 2:3569538/150‑1 (MQ=255)
gggCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCTAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATcc < 1:1275449/150‑1 (MQ=255)
cTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGaa > 2:1713423/1‑150 (MQ=255)
ttGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAg > 2:2170403/1‑150 (MQ=255)
tgactgacTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGt > 2:914989/1‑150 (MQ=255)
gactgactTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGtt < 1:237431/150‑1 (MQ=255)
gactgactTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGtt > 2:2514020/1‑150 (MQ=255)
ctgactTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGttct < 2:83417/150‑1 (MQ=255)
ccTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCt < 1:2030600/150‑1 (MQ=255)
gCTCTCTACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgat < 2:2128116/150‑1 (MQ=255)
ctctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgatg < 1:3174382/150‑1 (MQ=255)
tctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGTTTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgatga < 1:2353946/150‑1 (MQ=255)
ctctACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaa > 1:3857713/1‑150 (MQ=255)
tctACCAGCCTGCCAGTTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa < 1:1325580/150‑1 (MQ=255)
tctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa < 1:4393466/150‑1 (MQ=255)
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tctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa > 2:540448/1‑150 (MQ=255)
ccAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCtt < 1:200334/150‑1 (MQ=255)
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aGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGa > 1:2321968/1‑150 (MQ=255)
aGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGa < 2:419490/150‑1 (MQ=255)
gTTATCTGACGCTGCCGTCATAAAAACTGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATg < 1:88423/150‑1 (MQ=255)
|
TGTGGGTGCGCAGAACATCCGTACTATGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATG > CP009273/1542905‑1543203
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
