Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,070,265 |
A→T |
31.5% |
intergenic (+30/‑33) |
yeeS → / → yeeT |
CP4‑44 prophage; putative DNA repair protein/CP4‑44 prophage; uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,070,265 | 0 | A | T | 31.5%
| 410.1
/ 273.8
| 270 | intergenic (+30/‑33) | yeeS/yeeT | CP4‑44 prophage; putative DNA repair protein/CP4‑44 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (84/101); new base T (42/43); total (126/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 |
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
GACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCGTAT > CP009273/2070116‑2070411
|
ggCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACttt > 1:2495470/1‑150 (MQ=255)
tATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTAtc > 2:3981808/1‑150 (MQ=255)
aTCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTAtct > 1:4028526/1‑150 (MQ=255)
tCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTAtctt > 2:4632197/1‑150 (MQ=255)
tCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTAtctt < 1:1251555/150‑1 (MQ=255)
tCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTAtctt > 1:3992668/1‑150 (MQ=255)
cACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTAtcttc < 2:2446007/150‑1 (MQ=255)
ccGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTg < 2:3827035/150‑1 (MQ=255)
gAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTc < 2:3058519/150‑1 (MQ=255)
gAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTc < 2:3058082/150‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTc > 2:1750154/1‑150 (MQ=255)
tCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCag < 1:4493122/150‑1 (MQ=255)
cTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCaga > 2:1192468/1‑150 (MQ=255)
cTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCaga > 1:2865456/1‑150 (MQ=255)
cTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCaga < 1:4532397/150‑1 (MQ=255)
ggTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCNGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAgg < 1:4279796/150‑1 (MQ=255)
aCAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTAt < 1:3775278/150‑1 (MQ=255)
aGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATcc > 2:4142356/1‑150 (MQ=255)
gCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCa > 1:3218967/1‑150 (MQ=255)
cACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTNTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCAt < 1:1723093/150‑1 (MQ=255)
aCTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCAtt < 2:220457/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTa < 2:4353753/150‑1 (MQ=255)
tGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTAt > 1:3409865/1‑150 (MQ=255)
gggCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATg < 1:1062697/150‑1 (MQ=255)
tggtggATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAAt < 1:1941314/150‑1 (MQ=255)
ggtggATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAAtt < 2:4461466/150‑1 (MQ=255)
gtggATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTa > 2:2285654/1‑150 (MQ=255)
atatCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCAc < 1:2893524/150‑1 (MQ=255)
tatCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCAcc > 1:4435867/1‑150 (MQ=255)
atCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCAccc < 2:1350390/150‑1 (MQ=255)
tCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTAACCCATTATGAAAATTATCACCCg < 1:1011824/150‑1 (MQ=255)
ccGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgt < 2:3356218/150‑1 (MQ=255)
cGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgtg < 1:2198924/150‑1 (MQ=255)
cGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgtg < 2:390190/150‑1 (MQ=255)
gggTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgtgg < 2:2645733/150‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgtggt < 2:4333097/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgtggtg < 2:3693179/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCgtggtg < 1:1842975/150‑1 (MQ=255)
tGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGa < 1:1890222/150‑1 (MQ=255)
tGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGa < 2:670908/150‑1 (MQ=255)
gCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGaa > 2:2108870/1‑150 (MQ=255)
ccGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAg < 2:3758635/150‑1 (MQ=255)
ggACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGcc > 1:2079920/1‑150 (MQ=255)
gACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCa < 2:3305850/150‑1 (MQ=255)
aCCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCAt > 2:2974565/1‑150 (MQ=255)
ccATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATg > 1:4599026/1‑150 (MQ=255)
cATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGc < 2:3218967/150‑1 (MQ=255)
aTCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACCTCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCg < 2:2827284/150‑1 (MQ=255)
aTCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCg > 2:29029/1‑150 (MQ=255)
aTCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCg < 2:203583/150‑1 (MQ=255)
aTAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTc > 1:3345028/1‑150 (MQ=255)
aGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCAc < 1:218402/150‑1 (MQ=255)
ggTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACcaac > 1:1357604/1‑150 (MQ=255)
gTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACcaaca < 1:4392032/150‑1 (MQ=255)
gTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACcaaca < 2:2517081/150‑1 (MQ=255)
tGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCCCATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACcaacaa < 1:2206511/150‑1 (MQ=255)
aaCCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATc < 1:4351893/150‑1 (MQ=255)
aCCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATcc < 1:1256798/150‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGAc < 2:590783/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACa > 1:2199723/1‑150 (MQ=255)
ttCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATccc < 1:1793358/150‑1 (MQ=255)
tctcCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCg > 2:3128986/1‑150 (MQ=255)
tctcCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCg < 2:3547337/150‑1 (MQ=255)
ctcCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGt > 1:4233072/1‑150 (MQ=255)
ctcCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGt > 1:4233053/1‑150 (MQ=255)
ccTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCt < 1:4105963/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCtt < 1:3389784/150‑1 (MQ=255)
gAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGt > 1:3581284/1‑150 (MQ=255)
aaCATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGtt > 1:604618/1‑150 (MQ=255)
aaCATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGtt < 1:1213198/150‑1 (MQ=255)
aaCATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGtt > 1:2406793/1‑150 (MQ=255)
cATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCt > 1:2326797/1‑150 (MQ=255)
cATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCt > 1:2720457/1‑150 (MQ=255)
tGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGt > 2:275807/1‑150 (MQ=255)
ggTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTa < 1:2160150/150‑1 (MQ=255)
ggTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTa > 1:2804522/1‑150 (MQ=255)
gTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTAc > 2:744486/1‑150 (MQ=255)
gTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTAc > 2:3356922/1‑150 (MQ=255)
tCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTAcc > 1:1623848/1‑150 (MQ=255)
gCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGt > 1:3585172/1‑150 (MQ=255)
gCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGt > 1:932418/1‑150 (MQ=255)
cTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTa < 1:275666/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTa < 1:3575693/150‑1 (MQ=255)
ccTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCg < 1:3824708/150‑1 (MQ=255)
ttCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCt < 2:4085558/150‑1 (MQ=255)
tCACAACCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTg < 2:2314097/150‑1 (MQ=255)
aaCCACATCACACCTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCAc > 2:3623936/1‑150 (MQ=255)
aCCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACg > 2:3375470/1‑150 (MQ=255)
caTCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAg > 1:782046/1‑150 (MQ=255)
cacCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTg > 1:3904957/1‑150 (MQ=255)
agcTGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGa < 2:927184/148‑1 (MQ=255)
cTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAg > 1:3647752/1‑150 (MQ=255)
cTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAg > 1:2555881/1‑150 (MQ=255)
tGTTTTCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGc > 2:1235698/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCg > 2:1472606/1‑150 (MQ=255)
ttttCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTTTCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTTAAGCGt < 1:2275005/150‑1 (MQ=255)
ttttCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCGt < 1:3068945/150‑1 (MQ=255)
tttCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCGta > 2:4104920/1‑150 (MQ=255)
ttCTCTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCGtat > 1:2045701/1‑150 (MQ=255)
ttCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCGtat < 1:876610/150‑1 (MQ=255)
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GACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTTCTCCTTTGCCGAACATGGTCTGCTTTAACCCTTCACAACCACATCACACCTGTTTTCACTTTTATCTTCTGTCTTCAGAGGTATCCCATTATGAAAATTATCACCCGTGGTGAAGCCATGCGTATTCACCAACAACATCCGACATCCCGTCTTTTTCCGTTCTGTACCGGTAAATACCGCTGGCACGGCAGTGCTGAAGCGTAT > CP009273/2070116‑2070411
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
